Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5G8B0

Protein Details
Accession A0A5C5G8B0    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-34MVNVPKTRRTYCKGKQCRKHTPHKVTQYKTGKASHydrophilic
53-75QTKPVFHKKAKTTKKVVLRLECTHydrophilic
226-253AAAVPSKAKQPRKPRQRKGKAPKPGGAEHydrophilic
466-491TPHFQVPPSKNPNRNRRKPKGGAAQDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
231-250SKAKQPRKPRQRKGKAPKPG
477-485PNRNRRKPK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 7.5, cyto_nucl 7.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030390  MeTrfase_TrmA_AS  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR000552  Ribosomal_L44e  
IPR011332  Ribosomal_zn-bd  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR025795  tRNA_(uracil-5-)_MeTrfase  
IPR010280  U5_MeTrfase_fam  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0030697  F:S-adenosylmethionine-dependent tRNA (m5U54) methyltransferase activity  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00935  Ribosomal_L44  
PF05958  tRNA_U5-meth_tr  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01172  RIBOSOMAL_L44E  
PS51687  SAM_MT_RNA_M5U  
PS51622  SAM_MT_RNA_M5U_2  
PS01230  TRMA_1  
Amino Acid Sequences MVNVPKTRRTYCKGKQCRKHTPHKVTQYKTGKASLFAQGKRRYDRKQSGYGGQTKPVFHKKAKTTKKVVLRLECTVCKYKMQMSLKRCKHFELGGDKKQKGQALQDGRRAVGLSWAPRRMLVRAARSLVCFPRPLQLQLQLSRAARPAMSAPAPAAPPKRPLSTSPPPAAAAPPAAPAAAADHPDSKRVKLAVEDPVSVPPVLVEQPVPPSASATASASEPAPAAAAAVPSKAKQPRKPRQRKGKAPKPGGAEEAGAFDVIALLGQERVDELRRLQEDEARDWVAEAEREWGRGAEGKDLEVEVVGWTDHGDGLALLTPSGPGSDGKPTRLVSIPFALQGERVRIHVHRHEPDYFMSHADLLDILEPSPRRQADVSELPGRVLDDKTRSRLDAVRAKFGNRVQCQYFGECSGCQYQPLAYDEQLEMKREVVRRAFANFSGLDPSLVPAVGPTLPSPLEYGYRTKLTPHFQVPPSKNPNRNRRKPKGGAAQDQPPQGEDKEWEVTIGFEQKGRKRIVDIEECVIATGVINRAMVGERAKVKADISAYKRGATILLRDSLPPRPEGTDVRPPCYSPSSEEHICVTDHHETVREQVGEVEFLQKAGSFFQNNASILPSLMDAVKAAIGPKPADSKRYLVDAYCGSGLFAISLADLFDRVEGIEIDKASIVWARKNALYNHAEGRGEVGFRDGKAEDIFGSIEFPRDQTTVLIDPPRKGCDDAFLRQLLALNPATVIYVSCNVRSQARDIGWLLEHSRRDEDKSGSGKRGYWIESLRAADLFAQTHHAEGVAILRREV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.86
3 0.88
4 0.92
5 0.91
6 0.93
7 0.92
8 0.92
9 0.92
10 0.92
11 0.92
12 0.86
13 0.87
14 0.85
15 0.8
16 0.74
17 0.7
18 0.61
19 0.54
20 0.52
21 0.5
22 0.5
23 0.48
24 0.53
25 0.54
26 0.6
27 0.66
28 0.71
29 0.7
30 0.72
31 0.78
32 0.76
33 0.78
34 0.77
35 0.76
36 0.76
37 0.77
38 0.69
39 0.65
40 0.62
41 0.55
42 0.57
43 0.58
44 0.56
45 0.52
46 0.59
47 0.62
48 0.69
49 0.77
50 0.78
51 0.77
52 0.79
53 0.84
54 0.83
55 0.82
56 0.81
57 0.75
58 0.73
59 0.71
60 0.66
61 0.62
62 0.6
63 0.52
64 0.46
65 0.44
66 0.42
67 0.45
68 0.5
69 0.53
70 0.55
71 0.64
72 0.7
73 0.75
74 0.71
75 0.66
76 0.62
77 0.58
78 0.56
79 0.56
80 0.57
81 0.58
82 0.65
83 0.62
84 0.61
85 0.62
86 0.57
87 0.5
88 0.47
89 0.46
90 0.49
91 0.55
92 0.57
93 0.54
94 0.51
95 0.49
96 0.43
97 0.34
98 0.3
99 0.27
100 0.27
101 0.32
102 0.35
103 0.34
104 0.36
105 0.38
106 0.33
107 0.36
108 0.36
109 0.36
110 0.39
111 0.43
112 0.42
113 0.43
114 0.46
115 0.43
116 0.39
117 0.34
118 0.29
119 0.33
120 0.34
121 0.35
122 0.34
123 0.37
124 0.41
125 0.42
126 0.44
127 0.42
128 0.39
129 0.38
130 0.36
131 0.29
132 0.23
133 0.21
134 0.2
135 0.19
136 0.2
137 0.18
138 0.17
139 0.18
140 0.2
141 0.23
142 0.25
143 0.22
144 0.28
145 0.32
146 0.35
147 0.34
148 0.38
149 0.43
150 0.49
151 0.54
152 0.51
153 0.49
154 0.46
155 0.44
156 0.41
157 0.33
158 0.25
159 0.17
160 0.15
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.09
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.17
170 0.18
171 0.24
172 0.25
173 0.23
174 0.26
175 0.25
176 0.25
177 0.23
178 0.27
179 0.3
180 0.31
181 0.32
182 0.28
183 0.29
184 0.29
185 0.26
186 0.21
187 0.12
188 0.11
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.12
194 0.13
195 0.14
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.13
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.07
209 0.07
210 0.05
211 0.06
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.15
219 0.23
220 0.3
221 0.37
222 0.48
223 0.58
224 0.69
225 0.8
226 0.84
227 0.88
228 0.91
229 0.94
230 0.94
231 0.94
232 0.92
233 0.88
234 0.83
235 0.77
236 0.69
237 0.6
238 0.49
239 0.4
240 0.3
241 0.24
242 0.19
243 0.13
244 0.1
245 0.07
246 0.06
247 0.05
248 0.04
249 0.02
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.05
256 0.07
257 0.08
258 0.09
259 0.15
260 0.16
261 0.19
262 0.19
263 0.22
264 0.23
265 0.24
266 0.26
267 0.21
268 0.19
269 0.17
270 0.17
271 0.14
272 0.12
273 0.1
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.12
279 0.11
280 0.16
281 0.16
282 0.16
283 0.16
284 0.16
285 0.16
286 0.16
287 0.15
288 0.1
289 0.1
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.03
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.06
311 0.14
312 0.15
313 0.16
314 0.2
315 0.2
316 0.22
317 0.24
318 0.24
319 0.19
320 0.2
321 0.19
322 0.16
323 0.16
324 0.14
325 0.13
326 0.13
327 0.13
328 0.12
329 0.12
330 0.13
331 0.14
332 0.19
333 0.24
334 0.3
335 0.31
336 0.34
337 0.35
338 0.35
339 0.34
340 0.32
341 0.27
342 0.2
343 0.17
344 0.13
345 0.11
346 0.1
347 0.09
348 0.06
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.07
353 0.07
354 0.08
355 0.13
356 0.13
357 0.14
358 0.14
359 0.15
360 0.19
361 0.23
362 0.27
363 0.26
364 0.26
365 0.25
366 0.24
367 0.23
368 0.19
369 0.15
370 0.13
371 0.14
372 0.16
373 0.2
374 0.21
375 0.21
376 0.22
377 0.24
378 0.29
379 0.31
380 0.3
381 0.33
382 0.33
383 0.34
384 0.35
385 0.35
386 0.37
387 0.31
388 0.33
389 0.28
390 0.3
391 0.3
392 0.28
393 0.26
394 0.19
395 0.18
396 0.14
397 0.15
398 0.16
399 0.14
400 0.13
401 0.12
402 0.11
403 0.12
404 0.14
405 0.14
406 0.11
407 0.12
408 0.12
409 0.17
410 0.18
411 0.17
412 0.15
413 0.15
414 0.19
415 0.19
416 0.22
417 0.19
418 0.2
419 0.2
420 0.22
421 0.23
422 0.19
423 0.2
424 0.16
425 0.15
426 0.15
427 0.14
428 0.12
429 0.1
430 0.1
431 0.08
432 0.07
433 0.06
434 0.04
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.07
441 0.07
442 0.08
443 0.08
444 0.1
445 0.11
446 0.13
447 0.14
448 0.16
449 0.16
450 0.19
451 0.23
452 0.25
453 0.28
454 0.3
455 0.33
456 0.35
457 0.44
458 0.45
459 0.49
460 0.55
461 0.58
462 0.62
463 0.65
464 0.72
465 0.74
466 0.81
467 0.82
468 0.83
469 0.85
470 0.83
471 0.83
472 0.83
473 0.8
474 0.77
475 0.7
476 0.67
477 0.61
478 0.57
479 0.47
480 0.37
481 0.31
482 0.24
483 0.21
484 0.15
485 0.14
486 0.15
487 0.14
488 0.14
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.15
493 0.12
494 0.12
495 0.18
496 0.22
497 0.29
498 0.3
499 0.29
500 0.28
501 0.34
502 0.38
503 0.4
504 0.38
505 0.33
506 0.32
507 0.31
508 0.29
509 0.23
510 0.16
511 0.09
512 0.08
513 0.07
514 0.07
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.08
519 0.09
520 0.09
521 0.12
522 0.14
523 0.16
524 0.17
525 0.17
526 0.16
527 0.18
528 0.2
529 0.23
530 0.25
531 0.32
532 0.32
533 0.32
534 0.32
535 0.3
536 0.29
537 0.23
538 0.22
539 0.16
540 0.18
541 0.18
542 0.19
543 0.21
544 0.25
545 0.25
546 0.23
547 0.21
548 0.21
549 0.23
550 0.26
551 0.3
552 0.35
553 0.35
554 0.38
555 0.37
556 0.36
557 0.36
558 0.35
559 0.31
560 0.24
561 0.27
562 0.3
563 0.31
564 0.31
565 0.29
566 0.27
567 0.26
568 0.22
569 0.22
570 0.19
571 0.18
572 0.18
573 0.19
574 0.17
575 0.2
576 0.25
577 0.2
578 0.16
579 0.18
580 0.18
581 0.17
582 0.18
583 0.17
584 0.12
585 0.12
586 0.12
587 0.1
588 0.1
589 0.11
590 0.14
591 0.12
592 0.13
593 0.17
594 0.22
595 0.21
596 0.21
597 0.21
598 0.17
599 0.16
600 0.16
601 0.12
602 0.09
603 0.08
604 0.08
605 0.06
606 0.06
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.08
611 0.1
612 0.11
613 0.13
614 0.21
615 0.22
616 0.26
617 0.28
618 0.3
619 0.3
620 0.34
621 0.33
622 0.25
623 0.27
624 0.24
625 0.24
626 0.21
627 0.19
628 0.14
629 0.13
630 0.12
631 0.08
632 0.07
633 0.05
634 0.04
635 0.04
636 0.05
637 0.04
638 0.05
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.05
643 0.06
644 0.06
645 0.08
646 0.1
647 0.1
648 0.11
649 0.11
650 0.1
651 0.1
652 0.14
653 0.14
654 0.15
655 0.18
656 0.2
657 0.24
658 0.29
659 0.31
660 0.35
661 0.36
662 0.36
663 0.37
664 0.38
665 0.35
666 0.3
667 0.3
668 0.24
669 0.21
670 0.18
671 0.17
672 0.15
673 0.15
674 0.18
675 0.16
676 0.16
677 0.16
678 0.17
679 0.14
680 0.13
681 0.14
682 0.1
683 0.13
684 0.11
685 0.13
686 0.13
687 0.13
688 0.15
689 0.15
690 0.15
691 0.14
692 0.18
693 0.18
694 0.21
695 0.28
696 0.28
697 0.33
698 0.36
699 0.38
700 0.36
701 0.36
702 0.32
703 0.34
704 0.37
705 0.37
706 0.39
707 0.36
708 0.34
709 0.33
710 0.35
711 0.27
712 0.25
713 0.21
714 0.16
715 0.15
716 0.14
717 0.14
718 0.12
719 0.11
720 0.09
721 0.14
722 0.16
723 0.17
724 0.2
725 0.21
726 0.26
727 0.28
728 0.29
729 0.31
730 0.3
731 0.33
732 0.32
733 0.33
734 0.3
735 0.31
736 0.31
737 0.29
738 0.31
739 0.29
740 0.35
741 0.35
742 0.38
743 0.41
744 0.42
745 0.45
746 0.51
747 0.53
748 0.53
749 0.53
750 0.5
751 0.49
752 0.5
753 0.45
754 0.42
755 0.4
756 0.38
757 0.41
758 0.41
759 0.38
760 0.32
761 0.29
762 0.25
763 0.23
764 0.2
765 0.15
766 0.18
767 0.17
768 0.17
769 0.17
770 0.15
771 0.12
772 0.12
773 0.18
774 0.2