FuNGI

A0A5C5G393

Protein Details

Accession

A0A5C5G393

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
244-268	ESVVARSPDRPRAKRRKTEPVVLCS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
236-260	GRGQRRKTESVVARSPDRPRAKRRK

Subcellular Location(s)

cyto 12, cyto_nucl 10.333, cyto_mito 8.833, nucl 7.5, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MWLEKRATDGKTLLVVRIWDEAGPTVLLPESALSIRVVVEVDVIDQCFADPTSASLFLRLSRPPTFEAVAVRQPGERQPWPQQVPWIDAEHARVAGYASCALRLELRTRGEFDTLLVAADKAGLPRVVRSSMSIIAHPRVDDEGLAAFHTWLLKLDFRVAFQLEKLVRNGLVHAARAVSLRDMVDFYIVEKGGRATERILDLFADRLGGLDRTSSQKVDTEGEIAKENKALGVAPGRGQRRKTESVVARSPDRPRAKRRKTEPVVLCSDSNSSDSSGSSDDDVLVVGATLPSFRGIATEHASHLSIAELRTLLDRALADSASLGQLLGRADDSKLVRQVTITPTRILLAGPVLADTNTVVRTSGHSQNFITVSVRNEDGSRLNDRNTGLLDLRFKPLFRQGFELGGRGWQFLAWSSSGLKNGSCFFVSPYAHEGRLITPASIHRSIGDFAGTPTGLVPAKYMARIAQAFSSSKPTLELAVEQILDIPDIESRSGSCFSDGVGLVSPQLAADVVRALNLKLGARQKAPTCFQFRIGGAKGMLQVDPSLEGKVVALRPSQIKFSSALTHLEISGIFEAGQAFLNRPLVTLLEGLGIPAQRFLDLQSKATRAIRKARMTLPFAVELLRDWNLAPITSFTSTLSFLAQRSSTATEAFVNPFVVRCLDAAVVHALRDIKYSARIPLPGCYNVVGVLDVDGCLAADEVYVRIARSDSSTEYLEGTVAISRSPTNHPGDLRLVEAVGRLSRGVGERIRGLTNCVVFSCQGERSLPSMLAGGDLDGDVYLLLTQQSGLVPSPERISAPAAYNPSPTVQLDREVTVSDGADFFFEFVTRDRTGLVATRQLHLADAYAEGLFHPDCLKLAQLHSDCVDSAKSGSFVPYDALPRVPQRGWPDFLTNDSPDSYRSPRALGQLYRGISEEALVTAPRTGTADDPLSDVDPYRALTRALSSISLPSLPSSRLPPPSPALVTRFRGYLPSFSSELSKLLPLSLKSGLDEEALFLSISLGTNKVDKNEKLGLSRRREQAGELFALVRPLIRDGDGADGGDGAEDGAQGTANAVCSAWSAWHAAVEESEDRGKGRAGASGSTRLVGLRTWGWLALGVLVEQLQAAEKEYAEVIVLDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.27
3	0.24
4	0.25
5	0.23
6	0.17
7	0.17
8	0.16
9	0.15
10	0.15
11	0.13
12	0.11
13	0.1
14	0.1
15	0.09
16	0.08
17	0.09
18	0.09
19	0.1
20	0.09
21	0.1
22	0.1
23	0.11
24	0.11
25	0.08
26	0.09
27	0.08
28	0.1
29	0.11
30	0.11
31	0.1
32	0.09
33	0.1
34	0.1
35	0.1
36	0.09
37	0.08
38	0.09
39	0.13
40	0.16
41	0.16
42	0.16
43	0.17
44	0.19
45	0.23
46	0.24
47	0.26
48	0.28
49	0.31
50	0.32
51	0.36
52	0.35
53	0.33
54	0.35
55	0.35
56	0.37
57	0.36
58	0.34
59	0.31
60	0.32
61	0.35
62	0.37
63	0.37
64	0.37
65	0.44
66	0.54
67	0.57
68	0.57
69	0.59
70	0.55
71	0.54
72	0.51
73	0.45
74	0.37
75	0.34
76	0.34
77	0.29
78	0.26
79	0.21
80	0.18
81	0.16
82	0.15
83	0.15
84	0.16
85	0.14
86	0.15
87	0.15
88	0.15
89	0.18
90	0.2
91	0.22
92	0.24
93	0.28
94	0.3
95	0.33
96	0.34
97	0.32
98	0.3
99	0.27
100	0.24
101	0.2
102	0.18
103	0.15
104	0.12
105	0.1
106	0.11
107	0.11
108	0.08
109	0.1
110	0.11
111	0.11
112	0.15
113	0.19
114	0.2
115	0.2
116	0.22
117	0.24
118	0.27
119	0.28
120	0.28
121	0.28
122	0.29
123	0.3
124	0.28
125	0.25
126	0.22
127	0.21
128	0.17
129	0.14
130	0.13
131	0.12
132	0.12
133	0.11
134	0.09
135	0.1
136	0.1
137	0.09
138	0.09
139	0.11
140	0.13
141	0.14
142	0.21
143	0.21
144	0.21
145	0.25
146	0.25
147	0.23
148	0.21
149	0.28
150	0.24
151	0.26
152	0.26
153	0.25
154	0.24
155	0.23
156	0.24
157	0.23
158	0.22
159	0.2
160	0.19
161	0.17
162	0.17
163	0.18
164	0.18
165	0.12
166	0.12
167	0.12
168	0.12
169	0.12
170	0.11
171	0.12
172	0.11
173	0.11
174	0.13
175	0.13
176	0.12
177	0.12
178	0.12
179	0.14
180	0.16
181	0.16
182	0.13
183	0.16
184	0.19
185	0.19
186	0.19
187	0.16
188	0.16
189	0.16
190	0.14
191	0.11
192	0.08
193	0.08
194	0.09
195	0.09
196	0.08
197	0.08
198	0.1
199	0.15
200	0.17
201	0.18
202	0.17
203	0.19
204	0.22
205	0.23
206	0.22
207	0.2
208	0.2
209	0.21
210	0.24
211	0.22
212	0.21
213	0.19
214	0.18
215	0.15
216	0.14
217	0.12
218	0.1
219	0.14
220	0.15
221	0.18
222	0.24
223	0.3
224	0.35
225	0.37
226	0.42
227	0.45
228	0.49
229	0.49
230	0.52
231	0.53
232	0.56
233	0.61
234	0.57
235	0.54
236	0.54
237	0.55
238	0.55
239	0.58
240	0.57
241	0.62
242	0.7
243	0.76
244	0.8
245	0.84
246	0.86
247	0.82
248	0.85
249	0.81
250	0.77
251	0.73
252	0.65
253	0.57
254	0.47
255	0.41
256	0.32
257	0.26
258	0.2
259	0.14
260	0.12
261	0.12
262	0.13
263	0.12
264	0.12
265	0.11
266	0.11
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.07
271	0.05
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.03
276	0.03
277	0.04
278	0.04
279	0.05
280	0.04
281	0.05
282	0.07
283	0.1
284	0.14
285	0.15
286	0.15
287	0.16
288	0.17
289	0.16
290	0.15
291	0.12
292	0.1
293	0.09
294	0.1
295	0.08
296	0.08
297	0.1
298	0.1
299	0.09
300	0.09
301	0.08
302	0.09
303	0.1
304	0.09
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.07
309	0.07
310	0.05
311	0.04
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.07
318	0.12
319	0.14
320	0.15
321	0.19
322	0.19
323	0.19
324	0.19
325	0.23
326	0.25
327	0.31
328	0.3
329	0.27
330	0.27
331	0.27
332	0.27
333	0.22
334	0.16
335	0.09
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.07
348	0.1
349	0.15
350	0.23
351	0.23
352	0.25
353	0.25
354	0.28
355	0.28
356	0.26
357	0.22
358	0.16
359	0.16
360	0.16
361	0.17
362	0.14
363	0.13
364	0.14
365	0.16
366	0.17
367	0.21
368	0.21
369	0.21
370	0.24
371	0.24
372	0.24
373	0.22
374	0.21
375	0.16
376	0.17
377	0.2
378	0.19
379	0.22
380	0.22
381	0.21
382	0.21
383	0.27
384	0.29
385	0.26
386	0.29
387	0.27
388	0.31
389	0.31
390	0.3
391	0.22
392	0.22
393	0.21
394	0.16
395	0.14
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.1
400	0.07
401	0.08
402	0.1
403	0.11
404	0.13
405	0.13
406	0.12
407	0.12
408	0.13
409	0.14
410	0.12
411	0.11
412	0.11
413	0.16
414	0.16
415	0.16
416	0.19
417	0.2
418	0.2
419	0.2
420	0.19
421	0.14
422	0.18
423	0.17
424	0.13
425	0.12
426	0.14
427	0.19
428	0.19
429	0.18
430	0.15
431	0.16
432	0.16
433	0.15
434	0.13
435	0.08
436	0.08
437	0.09
438	0.09
439	0.07
440	0.06
441	0.08
442	0.08
443	0.07
444	0.08
445	0.08
446	0.09
447	0.09
448	0.1
449	0.08
450	0.11
451	0.12
452	0.12
453	0.11
454	0.13
455	0.13
456	0.14
457	0.19
458	0.16
459	0.16
460	0.16
461	0.15
462	0.14
463	0.14
464	0.14
465	0.09
466	0.1
467	0.1
468	0.09
469	0.09
470	0.08
471	0.07
472	0.06
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.06
477	0.05
478	0.05
479	0.08
480	0.09
481	0.09
482	0.09
483	0.08
484	0.08
485	0.11
486	0.11
487	0.09
488	0.08
489	0.08
490	0.08
491	0.08
492	0.07
493	0.04
494	0.04
495	0.03
496	0.03
497	0.03
498	0.04
499	0.04
500	0.05
501	0.06
502	0.06
503	0.07
504	0.08
505	0.08
506	0.11
507	0.15
508	0.17
509	0.18
510	0.21
511	0.22
512	0.26
513	0.29
514	0.3
515	0.31
516	0.3
517	0.31
518	0.31
519	0.29
520	0.29
521	0.28
522	0.24
523	0.18
524	0.18
525	0.18
526	0.15
527	0.15
528	0.1
529	0.09
530	0.07
531	0.08
532	0.08
533	0.07
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.08
538	0.08
539	0.08
540	0.08
541	0.09
542	0.12
543	0.13
544	0.15
545	0.13
546	0.14
547	0.14
548	0.15
549	0.16
550	0.15
551	0.15
552	0.14
553	0.14
554	0.13
555	0.12
556	0.1
557	0.08
558	0.07
559	0.06
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.06
565	0.05
566	0.06
567	0.07
568	0.09
569	0.08
570	0.08
571	0.08
572	0.07
573	0.08
574	0.07
575	0.07
576	0.06
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.06
581	0.05
582	0.06
583	0.06
584	0.05
585	0.05
586	0.08
587	0.14
588	0.14
589	0.16
590	0.18
591	0.19
592	0.21
593	0.25
594	0.27
595	0.23
596	0.32
597	0.37
598	0.38
599	0.41
600	0.44
601	0.46
602	0.45
603	0.44
604	0.37
605	0.3
606	0.27
607	0.23
608	0.18
609	0.13
610	0.12
611	0.1
612	0.08
613	0.07
614	0.09
615	0.09
616	0.09
617	0.09
618	0.08
619	0.09
620	0.1
621	0.1
622	0.09
623	0.1
624	0.1
625	0.11
626	0.11
627	0.09
628	0.09
629	0.1
630	0.1
631	0.09
632	0.1
633	0.12
634	0.12
635	0.11
636	0.12
637	0.11
638	0.12
639	0.13
640	0.12
641	0.1
642	0.1
643	0.1
644	0.09
645	0.08
646	0.08
647	0.07
648	0.07
649	0.07
650	0.07
651	0.07
652	0.09
653	0.09
654	0.08
655	0.1
656	0.09
657	0.09
658	0.1
659	0.1
660	0.08
661	0.12
662	0.13
663	0.15
664	0.16
665	0.19
666	0.19
667	0.21
668	0.24
669	0.22
670	0.21
671	0.19
672	0.17
673	0.15
674	0.14
675	0.11
676	0.07
677	0.06
678	0.06
679	0.05
680	0.04
681	0.04
682	0.03
683	0.03
684	0.03
685	0.03
686	0.03
687	0.03
688	0.03
689	0.04
690	0.05
691	0.05
692	0.05
693	0.06
694	0.06
695	0.08
696	0.1
697	0.11
698	0.13
699	0.14
700	0.14
701	0.14
702	0.14
703	0.12
704	0.1
705	0.09
706	0.07
707	0.07
708	0.06
709	0.06
710	0.06
711	0.09
712	0.12
713	0.17
714	0.2
715	0.23
716	0.23
717	0.26
718	0.29
719	0.27
720	0.24
721	0.19
722	0.16
723	0.13
724	0.13
725	0.11
726	0.08
727	0.07
728	0.06
729	0.06
730	0.08
731	0.09
732	0.12
733	0.12
734	0.14
735	0.15
736	0.18
737	0.2
738	0.18
739	0.2
740	0.2
741	0.2
742	0.19
743	0.17
744	0.16
745	0.14
746	0.16
747	0.15
748	0.13
749	0.13
750	0.13
751	0.14
752	0.15
753	0.17
754	0.15
755	0.12
756	0.12
757	0.11
758	0.1
759	0.09
760	0.07
761	0.05
762	0.05
763	0.05
764	0.04
765	0.04
766	0.03
767	0.03
768	0.03
769	0.03
770	0.03
771	0.03
772	0.03
773	0.04
774	0.04
775	0.05
776	0.06
777	0.07
778	0.08
779	0.1
780	0.11
781	0.11
782	0.11
783	0.12
784	0.14
785	0.15
786	0.16
787	0.19
788	0.21
789	0.21
790	0.22
791	0.22
792	0.2
793	0.2
794	0.18
795	0.18
796	0.15
797	0.18
798	0.19
799	0.19
800	0.18
801	0.17
802	0.17
803	0.14
804	0.13
805	0.1
806	0.09
807	0.08
808	0.07
809	0.07
810	0.06
811	0.05
812	0.05
813	0.06
814	0.07
815	0.12
816	0.12
817	0.13
818	0.13
819	0.13
820	0.14
821	0.17
822	0.18
823	0.2
824	0.21
825	0.22
826	0.23
827	0.22
828	0.22
829	0.18
830	0.16
831	0.1
832	0.09
833	0.08
834	0.07
835	0.07
836	0.06
837	0.08
838	0.07
839	0.07
840	0.08
841	0.07
842	0.08
843	0.08
844	0.1
845	0.1
846	0.12
847	0.19
848	0.19
849	0.21
850	0.22
851	0.22
852	0.2
853	0.19
854	0.19
855	0.11
856	0.11
857	0.1
858	0.1
859	0.1
860	0.11
861	0.1
862	0.1
863	0.11
864	0.12
865	0.14
866	0.14
867	0.16
868	0.17
869	0.2
870	0.24
871	0.23
872	0.26
873	0.31
874	0.35
875	0.37
876	0.37
877	0.39
878	0.35
879	0.39
880	0.38
881	0.32
882	0.28
883	0.25
884	0.23
885	0.21
886	0.24
887	0.25
888	0.25
889	0.25
890	0.26
891	0.28
892	0.33
893	0.37
894	0.34
895	0.36
896	0.38
897	0.37
898	0.35
899	0.33
900	0.28
901	0.21
902	0.2
903	0.15
904	0.09
905	0.09
906	0.08
907	0.08
908	0.08
909	0.08
910	0.08
911	0.09
912	0.09
913	0.1
914	0.13
915	0.15
916	0.15
917	0.16
918	0.16
919	0.16
920	0.16
921	0.15
922	0.12
923	0.11
924	0.12
925	0.12
926	0.13
927	0.12
928	0.13
929	0.14
930	0.16
931	0.16
932	0.16
933	0.15
934	0.15
935	0.16
936	0.16
937	0.14
938	0.13
939	0.14
940	0.15
941	0.16
942	0.19
943	0.24
944	0.3
945	0.32
946	0.35
947	0.36
948	0.4
949	0.41
950	0.4
951	0.39
952	0.39
953	0.41
954	0.39
955	0.36
956	0.31
957	0.33
958	0.32
959	0.32
960	0.29
961	0.29
962	0.28
963	0.28
964	0.3
965	0.26
966	0.26
967	0.21
968	0.2
969	0.15
970	0.17
971	0.2
972	0.17
973	0.2
974	0.22
975	0.21
976	0.2
977	0.21
978	0.2
979	0.17
980	0.17
981	0.14
982	0.11
983	0.11
984	0.1
985	0.09
986	0.08
987	0.08
988	0.09
989	0.08
990	0.09
991	0.09
992	0.14
993	0.15
994	0.19
995	0.26
996	0.26
997	0.32
998	0.37
999	0.4
1000	0.42
1001	0.5
1002	0.55
1003	0.56
1004	0.64
1005	0.63
1006	0.61
1007	0.59
1008	0.55
1009	0.53
1010	0.49
1011	0.42
1012	0.35
1013	0.3
1014	0.26
1015	0.26
1016	0.23
1017	0.17
1018	0.12
1019	0.13
1020	0.13
1021	0.12
1022	0.12
1023	0.12
1024	0.17
1025	0.17
1026	0.16
1027	0.14
1028	0.13
1029	0.12
1030	0.11
1031	0.1
1032	0.05
1033	0.04
1034	0.04
1035	0.04
1036	0.04
1037	0.04
1038	0.04
1039	0.05
1040	0.06
1041	0.07
1042	0.07
1043	0.07
1044	0.07
1045	0.08
1046	0.09
1047	0.09
1048	0.09
1049	0.11
1050	0.11
1051	0.13
1052	0.14
1053	0.13
1054	0.13
1055	0.17
1056	0.17
1057	0.17
1058	0.19
1059	0.18
1060	0.18
1061	0.18
1062	0.19
1063	0.18
1064	0.18
1065	0.19
1066	0.2
1067	0.23
1068	0.26
1069	0.32
1070	0.31
1071	0.29
1072	0.28
1073	0.24
1074	0.22
1075	0.19
1076	0.19
1077	0.14
1078	0.15
1079	0.16
1080	0.16
1081	0.16
1082	0.16
1083	0.16
1084	0.14
1085	0.12
1086	0.1
1087	0.09
1088	0.09
1089	0.09
1090	0.07
1091	0.07
1092	0.07
1093	0.07
1094	0.1
1095	0.11
1096	0.11
1097	0.12
1098	0.12
1099	0.12
1100	0.11

A0A5C5G393

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer