Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5G6N0

Protein Details
Accession A0A5C5G6N0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
336-363GTEPLSKRQEKLRKRAERGDPRVQMRRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
342-363KRQEKLRKRAERGDPRVQMRRG
Subcellular Location(s) mito 8, extr 7, plas 5, cyto 4, nucl 1, pero 1, E.R. 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR006722  Sedlin  
IPR008506  SND2/TMEM208  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0006888  P:endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF04628  Sedlin_N  
PF05620  TMEM208_SND2  
CDD cd14825  TRAPPC2_sedlin  
Amino Acid Sequences MSYYCVLVDTRDCPLYEAFLTSSKAAASTTISVTSPSPALPTAFSIFGATLPTAANTPSSAQLGAGGHGHSTVGYGTKTGPNGRHVMQLVAHASLDVVEDVQWTNGGMYLKSIDKFHEWTVSAWLTPGGVKILLLHELKNDDGIRLFLQEVWESYVKTLLNPFHELNAPIRSPTFDARAGANSKRIAASNARTLQQLQLGFLVSGGIHLLHFLVFSSGRTYRRVLLFAVTEAVAVGLWNQLRAMARNGTELDGSKGLVSYAFDILYVTWFVHVATALISAQFWKLYWVIPLYATYRLLSFALPYISPSLAALVSGASSSSAGAGAAGADAQGAGAGTEPLSKRQEKLRKRAERGDPRVQMRRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.22
4 0.22
5 0.19
6 0.2
7 0.22
8 0.2
9 0.2
10 0.16
11 0.16
12 0.14
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.14
17 0.15
18 0.15
19 0.16
20 0.17
21 0.18
22 0.15
23 0.13
24 0.13
25 0.12
26 0.13
27 0.13
28 0.16
29 0.16
30 0.16
31 0.16
32 0.15
33 0.14
34 0.13
35 0.14
36 0.11
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.1
45 0.11
46 0.12
47 0.12
48 0.11
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.13
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.1
64 0.13
65 0.16
66 0.2
67 0.22
68 0.25
69 0.28
70 0.29
71 0.32
72 0.3
73 0.29
74 0.25
75 0.26
76 0.23
77 0.2
78 0.18
79 0.12
80 0.11
81 0.1
82 0.09
83 0.06
84 0.05
85 0.04
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.08
96 0.1
97 0.12
98 0.13
99 0.14
100 0.13
101 0.15
102 0.18
103 0.19
104 0.21
105 0.2
106 0.2
107 0.24
108 0.22
109 0.19
110 0.17
111 0.16
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.07
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.12
124 0.13
125 0.13
126 0.15
127 0.15
128 0.11
129 0.1
130 0.11
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.11
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.13
143 0.11
144 0.12
145 0.14
146 0.13
147 0.15
148 0.19
149 0.19
150 0.17
151 0.19
152 0.19
153 0.18
154 0.19
155 0.16
156 0.13
157 0.13
158 0.13
159 0.14
160 0.14
161 0.15
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.17
166 0.19
167 0.18
168 0.2
169 0.17
170 0.17
171 0.17
172 0.16
173 0.15
174 0.16
175 0.18
176 0.22
177 0.24
178 0.24
179 0.24
180 0.24
181 0.23
182 0.23
183 0.2
184 0.13
185 0.12
186 0.11
187 0.1
188 0.09
189 0.08
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.08
204 0.12
205 0.14
206 0.16
207 0.17
208 0.2
209 0.22
210 0.23
211 0.2
212 0.19
213 0.18
214 0.16
215 0.16
216 0.12
217 0.1
218 0.08
219 0.08
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.05
227 0.08
228 0.08
229 0.1
230 0.13
231 0.14
232 0.14
233 0.17
234 0.18
235 0.16
236 0.17
237 0.16
238 0.15
239 0.13
240 0.13
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.16
278 0.15
279 0.18
280 0.18
281 0.16
282 0.15
283 0.15
284 0.15
285 0.13
286 0.12
287 0.11
288 0.12
289 0.11
290 0.12
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.12
295 0.11
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.04
323 0.04
324 0.1
325 0.11
326 0.16
327 0.23
328 0.25
329 0.28
330 0.38
331 0.49
332 0.54
333 0.64
334 0.69
335 0.74
336 0.81
337 0.88
338 0.88
339 0.89
340 0.88
341 0.88
342 0.85
343 0.83