Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FTP6

Protein Details
Accession A0A5C5FTP6    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-106DEAEGKKRVRGPNKEKKVKDPNABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-76KKRGRKS
87-109EGKKRVRGPNKEKKVKDPNAPKR
200-206KKRSRKS
221-235APKKKEKAKATPVKK
266-281PPKKSAAKASKKKSAK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 7.5, cyto_mito 5.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MAPQKKAAVVNAISHLANVHKELAKAHKQASAAVLEYAKELEQEDGDKSLLATFPPLFAFAGDEAAPATKKRGRKSAAAGDDDDEAEGKKRVRGPNKEKKVKDPNAPKRPASAYLEYQNSVRDEYRQQFPDMAYSEVLKKIGATWQSMSDAEKEPWQQITAAKTTDYLARKDEYAKGQGSPEAAAAAGEVVATEAQAEPKKRSRKSEASGAAASADIPVEAPKKKEKAKATPVKKAATPSASSDSSDASDDSSSSEDESESEATPPPKKSAAKASKKKSAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.24
3 0.19
4 0.18
5 0.17
6 0.18
7 0.18
8 0.19
9 0.23
10 0.31
11 0.37
12 0.4
13 0.41
14 0.4
15 0.38
16 0.39
17 0.38
18 0.32
19 0.25
20 0.22
21 0.2
22 0.17
23 0.17
24 0.16
25 0.12
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.1
30 0.11
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.09
39 0.11
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.1
45 0.1
46 0.12
47 0.09
48 0.11
49 0.09
50 0.09
51 0.08
52 0.09
53 0.1
54 0.09
55 0.13
56 0.16
57 0.22
58 0.27
59 0.36
60 0.38
61 0.44
62 0.52
63 0.56
64 0.59
65 0.56
66 0.52
67 0.44
68 0.41
69 0.35
70 0.27
71 0.17
72 0.11
73 0.09
74 0.11
75 0.11
76 0.13
77 0.19
78 0.27
79 0.36
80 0.47
81 0.56
82 0.64
83 0.75
84 0.81
85 0.77
86 0.79
87 0.81
88 0.77
89 0.76
90 0.76
91 0.77
92 0.77
93 0.8
94 0.7
95 0.64
96 0.59
97 0.54
98 0.48
99 0.41
100 0.34
101 0.34
102 0.35
103 0.31
104 0.29
105 0.26
106 0.22
107 0.19
108 0.16
109 0.14
110 0.17
111 0.2
112 0.26
113 0.25
114 0.25
115 0.25
116 0.25
117 0.26
118 0.23
119 0.2
120 0.14
121 0.13
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.09
126 0.07
127 0.07
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.14
138 0.13
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.14
144 0.13
145 0.13
146 0.15
147 0.15
148 0.14
149 0.13
150 0.13
151 0.14
152 0.18
153 0.18
154 0.17
155 0.17
156 0.17
157 0.18
158 0.2
159 0.23
160 0.21
161 0.23
162 0.23
163 0.22
164 0.22
165 0.22
166 0.2
167 0.17
168 0.13
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.06
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.07
183 0.1
184 0.13
185 0.17
186 0.26
187 0.35
188 0.39
189 0.47
190 0.53
191 0.6
192 0.63
193 0.68
194 0.65
195 0.62
196 0.57
197 0.5
198 0.41
199 0.31
200 0.26
201 0.16
202 0.1
203 0.05
204 0.04
205 0.07
206 0.1
207 0.12
208 0.15
209 0.22
210 0.3
211 0.36
212 0.44
213 0.51
214 0.57
215 0.67
216 0.74
217 0.75
218 0.79
219 0.79
220 0.74
221 0.68
222 0.63
223 0.58
224 0.52
225 0.46
226 0.41
227 0.4
228 0.38
229 0.36
230 0.32
231 0.27
232 0.23
233 0.22
234 0.17
235 0.13
236 0.12
237 0.11
238 0.12
239 0.12
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.1
244 0.1
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.14
249 0.17
250 0.21
251 0.26
252 0.28
253 0.29
254 0.35
255 0.37
256 0.41
257 0.48
258 0.55
259 0.61
260 0.68
261 0.74