Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FT15

Protein Details
Accession A0A5C5FT15    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-127DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
262-281ADEKKKRGCHRCGQPGHHSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
411-427KRREAEERQDRAEKRRR
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 13.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSRKYPRIVSSVAEEHAVTVVRDGVEESIPVDTSGPNPNGEEFDCLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPKTEEDMMIEVFAYTERVVAMVRPRKLLMMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEKEDDRQNAIKELEAMGKEVSDEYRNEKGWDSNAITPGTPFMDLLAKSLRYWVRKKINEDPGWAGLEVIISDASVPGEGEHKIMDFIRRQRVHPSHDPNTKHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFRVLREDVFADEKKKRGCHRCGQPGHHSSQCTGEVKKPEADLTPKGAPSVPKPFIFLDVAVLREYLAVELSAPVHSFPFSLERALDDWVFLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLMGIWKSNLDRMGGYLTEHGKVRLERAQIILEQLAMREDEIFRKRREAEERQDRAEKRRRIDREQRETPQQRSARSVQASAAPANDYVEVNANGTAAVTAAPTSTAPGGLPAKPQWAADEAKKDDDKEKAAKAMTGGNKSIVQNRMALRMANLSAAEMMKAQLAAGDDAAAAAPAAEEVDDPEMKQEQEAEEAGRAEAARNADAAAKLKAELLASSEGDADATSPRGTKRSADVDAAEMQDAADADPENDEDEDEATVNAFLESSLTAPEPAMVAGLNIREPPPLKLMGNNVVEQDDTVKLWEPGYKERYYRSKFGVELSDVEFRKKVVKCYVEGLCWVLEYYYQGTPSWQWYYPYHFSPFASDFVDLASLDIKFDKGQPFKPYEQLMGVFPAASRVHLPEPFQQLMINEDSPILDFYPEEFHIDMNGKKMLWQGVALLPFIDQKRLLDAMATKYPELSEFEVARNTLGTDALIVGNKHPLYDYLEGLYGKKKATEPVPLDTKRSKGIAGAVLPDDSLPGSTFDSPLPSLPDIINDESISAVFAFPPQKTPHRSVLLPGAKLERSVLTPHEKEQVRRGAGERTESNGFHAMRQRDQSGPGFAKMDNRGGGGRGGYGGGYGGGQGGQGGYGSGYNTPGSGYGTPSGYGTPSGYGTPNGGATPQGGRDPYAGYGYGGGGGGGGGYGGYNAPPPQQSAYGGYAPPTGYMAPPVPGGYRPPPPQAYGAYVPPQAQAGPGGARYPGQPQQPPPPGYGGYGGYGGQGQGQGQGGGYGGYGGQHTRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.61
3 0.61
4 0.58
5 0.52
6 0.49
7 0.47
8 0.42
9 0.33
10 0.29
11 0.24
12 0.24
13 0.22
14 0.14
15 0.11
16 0.12
17 0.11
18 0.11
19 0.12
20 0.12
21 0.11
22 0.12
23 0.11
24 0.1
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.1
29 0.12
30 0.2
31 0.2
32 0.2
33 0.21
34 0.23
35 0.25
36 0.25
37 0.27
38 0.21
39 0.22
40 0.21
41 0.2
42 0.19
43 0.16
44 0.15
45 0.11
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.13
53 0.17
54 0.2
55 0.2
56 0.27
57 0.35
58 0.43
59 0.5
60 0.53
61 0.54
62 0.53
63 0.57
64 0.52
65 0.51
66 0.44
67 0.38
68 0.33
69 0.27
70 0.24
71 0.2
72 0.17
73 0.1
74 0.09
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.1
81 0.2
82 0.27
83 0.29
84 0.32
85 0.33
86 0.34
87 0.34
88 0.35
89 0.28
90 0.25
91 0.23
92 0.21
93 0.22
94 0.2
95 0.21
96 0.18
97 0.15
98 0.1
99 0.13
100 0.19
101 0.26
102 0.37
103 0.46
104 0.55
105 0.66
106 0.74
107 0.8
108 0.82
109 0.79
110 0.76
111 0.77
112 0.77
113 0.75
114 0.78
115 0.72
116 0.69
117 0.72
118 0.66
119 0.61
120 0.59
121 0.54
122 0.5
123 0.52
124 0.49
125 0.46
126 0.45
127 0.4
128 0.32
129 0.31
130 0.29
131 0.22
132 0.22
133 0.17
134 0.16
135 0.15
136 0.15
137 0.15
138 0.13
139 0.14
140 0.18
141 0.24
142 0.26
143 0.27
144 0.28
145 0.29
146 0.28
147 0.33
148 0.32
149 0.3
150 0.33
151 0.32
152 0.3
153 0.27
154 0.27
155 0.22
156 0.18
157 0.13
158 0.1
159 0.14
160 0.14
161 0.16
162 0.19
163 0.19
164 0.18
165 0.25
166 0.3
167 0.32
168 0.37
169 0.45
170 0.51
171 0.57
172 0.64
173 0.67
174 0.73
175 0.69
176 0.7
177 0.64
178 0.57
179 0.52
180 0.44
181 0.34
182 0.23
183 0.19
184 0.14
185 0.1
186 0.06
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.1
200 0.11
201 0.16
202 0.2
203 0.27
204 0.37
205 0.39
206 0.41
207 0.5
208 0.55
209 0.58
210 0.62
211 0.64
212 0.64
213 0.69
214 0.71
215 0.64
216 0.66
217 0.58
218 0.48
219 0.41
220 0.33
221 0.26
222 0.26
223 0.22
224 0.15
225 0.14
226 0.13
227 0.11
228 0.09
229 0.08
230 0.04
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.08
237 0.09
238 0.14
239 0.16
240 0.16
241 0.2
242 0.22
243 0.24
244 0.25
245 0.25
246 0.22
247 0.25
248 0.27
249 0.28
250 0.29
251 0.31
252 0.34
253 0.4
254 0.47
255 0.52
256 0.58
257 0.63
258 0.7
259 0.76
260 0.79
261 0.8
262 0.8
263 0.76
264 0.73
265 0.67
266 0.58
267 0.48
268 0.44
269 0.42
270 0.35
271 0.31
272 0.31
273 0.32
274 0.34
275 0.36
276 0.32
277 0.29
278 0.3
279 0.32
280 0.29
281 0.3
282 0.3
283 0.28
284 0.28
285 0.28
286 0.26
287 0.27
288 0.33
289 0.31
290 0.28
291 0.31
292 0.31
293 0.32
294 0.31
295 0.25
296 0.21
297 0.18
298 0.19
299 0.16
300 0.15
301 0.12
302 0.11
303 0.11
304 0.07
305 0.06
306 0.05
307 0.04
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.1
318 0.11
319 0.12
320 0.12
321 0.13
322 0.14
323 0.15
324 0.14
325 0.1
326 0.1
327 0.09
328 0.09
329 0.07
330 0.06
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.12
345 0.12
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.11
351 0.1
352 0.06
353 0.05
354 0.05
355 0.06
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.08
360 0.08
361 0.11
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.12
366 0.14
367 0.12
368 0.12
369 0.13
370 0.14
371 0.15
372 0.15
373 0.15
374 0.16
375 0.16
376 0.19
377 0.2
378 0.21
379 0.2
380 0.22
381 0.23
382 0.2
383 0.21
384 0.18
385 0.14
386 0.12
387 0.1
388 0.09
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.13
394 0.19
395 0.24
396 0.24
397 0.29
398 0.31
399 0.36
400 0.44
401 0.47
402 0.51
403 0.58
404 0.61
405 0.6
406 0.66
407 0.62
408 0.63
409 0.64
410 0.59
411 0.54
412 0.6
413 0.62
414 0.64
415 0.72
416 0.74
417 0.74
418 0.76
419 0.75
420 0.76
421 0.76
422 0.69
423 0.68
424 0.6
425 0.52
426 0.49
427 0.47
428 0.43
429 0.39
430 0.37
431 0.28
432 0.29
433 0.29
434 0.24
435 0.21
436 0.15
437 0.13
438 0.13
439 0.13
440 0.09
441 0.07
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.04
451 0.04
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.07
462 0.09
463 0.1
464 0.12
465 0.12
466 0.14
467 0.15
468 0.15
469 0.13
470 0.15
471 0.16
472 0.17
473 0.23
474 0.22
475 0.26
476 0.26
477 0.27
478 0.26
479 0.27
480 0.28
481 0.25
482 0.25
483 0.24
484 0.24
485 0.23
486 0.21
487 0.24
488 0.24
489 0.23
490 0.22
491 0.2
492 0.22
493 0.23
494 0.27
495 0.23
496 0.19
497 0.21
498 0.21
499 0.24
500 0.22
501 0.21
502 0.17
503 0.16
504 0.16
505 0.12
506 0.11
507 0.07
508 0.08
509 0.07
510 0.07
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.04
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.04
522 0.04
523 0.04
524 0.03
525 0.02
526 0.02
527 0.02
528 0.02
529 0.02
530 0.02
531 0.02
532 0.03
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.06
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.08
541 0.06
542 0.08
543 0.08
544 0.08
545 0.07
546 0.08
547 0.08
548 0.07
549 0.07
550 0.06
551 0.07
552 0.08
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.08
557 0.09
558 0.1
559 0.08
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.08
568 0.08
569 0.08
570 0.08
571 0.07
572 0.07
573 0.06
574 0.05
575 0.04
576 0.05
577 0.05
578 0.06
579 0.07
580 0.09
581 0.1
582 0.1
583 0.14
584 0.18
585 0.2
586 0.2
587 0.2
588 0.2
589 0.21
590 0.2
591 0.16
592 0.11
593 0.09
594 0.08
595 0.07
596 0.05
597 0.04
598 0.04
599 0.04
600 0.04
601 0.05
602 0.05
603 0.05
604 0.05
605 0.04
606 0.05
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.04
611 0.04
612 0.04
613 0.04
614 0.03
615 0.03
616 0.03
617 0.03
618 0.04
619 0.04
620 0.04
621 0.05
622 0.05
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.04
627 0.04
628 0.03
629 0.04
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.06
634 0.07
635 0.08
636 0.1
637 0.11
638 0.13
639 0.13
640 0.14
641 0.17
642 0.23
643 0.24
644 0.23
645 0.21
646 0.2
647 0.19
648 0.17
649 0.15
650 0.09
651 0.07
652 0.07
653 0.07
654 0.07
655 0.08
656 0.11
657 0.11
658 0.17
659 0.22
660 0.24
661 0.24
662 0.29
663 0.39
664 0.41
665 0.42
666 0.4
667 0.39
668 0.37
669 0.38
670 0.36
671 0.27
672 0.25
673 0.24
674 0.26
675 0.23
676 0.23
677 0.21
678 0.18
679 0.25
680 0.25
681 0.26
682 0.27
683 0.3
684 0.3
685 0.36
686 0.38
687 0.31
688 0.3
689 0.26
690 0.19
691 0.16
692 0.14
693 0.09
694 0.07
695 0.07
696 0.09
697 0.09
698 0.09
699 0.09
700 0.1
701 0.11
702 0.15
703 0.17
704 0.15
705 0.17
706 0.18
707 0.26
708 0.28
709 0.3
710 0.3
711 0.28
712 0.27
713 0.28
714 0.28
715 0.23
716 0.21
717 0.18
718 0.15
719 0.13
720 0.14
721 0.1
722 0.08
723 0.07
724 0.06
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.06
729 0.1
730 0.17
731 0.19
732 0.23
733 0.28
734 0.33
735 0.35
736 0.39
737 0.37
738 0.32
739 0.3
740 0.27
741 0.23
742 0.19
743 0.17
744 0.13
745 0.11
746 0.13
747 0.11
748 0.11
749 0.11
750 0.12
751 0.14
752 0.16
753 0.19
754 0.21
755 0.27
756 0.27
757 0.27
758 0.25
759 0.22
760 0.23
761 0.23
762 0.18
763 0.12
764 0.11
765 0.11
766 0.11
767 0.11
768 0.08
769 0.06
770 0.06
771 0.06
772 0.1
773 0.1
774 0.12
775 0.11
776 0.11
777 0.13
778 0.16
779 0.15
780 0.15
781 0.16
782 0.13
783 0.14
784 0.17
785 0.17
786 0.15
787 0.14
788 0.13
789 0.15
790 0.16
791 0.15
792 0.12
793 0.11
794 0.14
795 0.15
796 0.15
797 0.12
798 0.11
799 0.14
800 0.15
801 0.15
802 0.13
803 0.15
804 0.18
805 0.22
806 0.23
807 0.19
808 0.19
809 0.19
810 0.19
811 0.19
812 0.16
813 0.16
814 0.16
815 0.18
816 0.19
817 0.19
818 0.18
819 0.15
820 0.13
821 0.09
822 0.08
823 0.07
824 0.05
825 0.06
826 0.07
827 0.08
828 0.08
829 0.09
830 0.14
831 0.14
832 0.13
833 0.13
834 0.13
835 0.17
836 0.19
837 0.19
838 0.15
839 0.18
840 0.18
841 0.19
842 0.21
843 0.18
844 0.16
845 0.18
846 0.18
847 0.21
848 0.24
849 0.32
850 0.32
851 0.37
852 0.46
853 0.44
854 0.49
855 0.47
856 0.46
857 0.4
858 0.38
859 0.31
860 0.23
861 0.26
862 0.25
863 0.23
864 0.23
865 0.2
866 0.19
867 0.19
868 0.17
869 0.13
870 0.09
871 0.08
872 0.06
873 0.07
874 0.09
875 0.09
876 0.11
877 0.11
878 0.13
879 0.13
880 0.14
881 0.16
882 0.15
883 0.16
884 0.15
885 0.17
886 0.18
887 0.19
888 0.2
889 0.16
890 0.15
891 0.14
892 0.14
893 0.12
894 0.08
895 0.06
896 0.05
897 0.08
898 0.11
899 0.11
900 0.17
901 0.21
902 0.28
903 0.34
904 0.39
905 0.44
906 0.46
907 0.47
908 0.45
909 0.51
910 0.49
911 0.44
912 0.41
913 0.37
914 0.32
915 0.32
916 0.3
917 0.21
918 0.17
919 0.19
920 0.21
921 0.25
922 0.27
923 0.29
924 0.36
925 0.38
926 0.39
927 0.45
928 0.49
929 0.43
930 0.44
931 0.44
932 0.43
933 0.42
934 0.45
935 0.38
936 0.34
937 0.36
938 0.33
939 0.34
940 0.33
941 0.31
942 0.29
943 0.35
944 0.34
945 0.35
946 0.39
947 0.4
948 0.35
949 0.39
950 0.38
951 0.39
952 0.37
953 0.34
954 0.32
955 0.29
956 0.34
957 0.32
958 0.33
959 0.26
960 0.25
961 0.24
962 0.23
963 0.24
964 0.18
965 0.15
966 0.12
967 0.11
968 0.09
969 0.08
970 0.07
971 0.06
972 0.05
973 0.05
974 0.04
975 0.04
976 0.04
977 0.04
978 0.04
979 0.04
980 0.04
981 0.04
982 0.04
983 0.05
984 0.06
985 0.06
986 0.08
987 0.08
988 0.08
989 0.08
990 0.09
991 0.11
992 0.11
993 0.13
994 0.15
995 0.16
996 0.16
997 0.16
998 0.16
999 0.14
1000 0.14
1001 0.12
1002 0.11
1003 0.12
1004 0.13
1005 0.14
1006 0.14
1007 0.15
1008 0.15
1009 0.15
1010 0.13
1011 0.13
1012 0.11
1013 0.12
1014 0.14
1015 0.14
1016 0.16
1017 0.16
1018 0.17
1019 0.18
1020 0.19
1021 0.19
1022 0.19
1023 0.17
1024 0.14
1025 0.14
1026 0.13
1027 0.13
1028 0.11
1029 0.09
1030 0.06
1031 0.06
1032 0.05
1033 0.04
1034 0.03
1035 0.02
1036 0.02
1037 0.03
1038 0.03
1039 0.04
1040 0.06
1041 0.07
1042 0.11
1043 0.12
1044 0.15
1045 0.17
1046 0.19
1047 0.21
1048 0.24
1049 0.27
1050 0.28
1051 0.27
1052 0.26
1053 0.25
1054 0.23
1055 0.22
1056 0.19
1057 0.15
1058 0.12
1059 0.15
1060 0.16
1061 0.14
1062 0.15
1063 0.16
1064 0.16
1065 0.17
1066 0.22
1067 0.24
1068 0.31
1069 0.35
1070 0.41
1071 0.43
1072 0.44
1073 0.47
1074 0.44
1075 0.45
1076 0.4
1077 0.41
1078 0.38
1079 0.37
1080 0.35
1081 0.32
1082 0.3
1083 0.23
1084 0.2
1085 0.16
1086 0.14
1087 0.14
1088 0.14
1089 0.14
1090 0.14
1091 0.15
1092 0.16
1093 0.21
1094 0.24
1095 0.3
1096 0.35
1097 0.4
1098 0.5
1099 0.58
1100 0.59
1101 0.54
1102 0.53
1103 0.47
1104 0.43
1105 0.41
1106 0.32
1107 0.24
1108 0.23
1109 0.21
1110 0.16
1111 0.15
1112 0.13
1113 0.11
1114 0.11
1115 0.1
1116 0.11
1117 0.12
1118 0.11
1119 0.11
1120 0.11
1121 0.1
1122 0.09
1123 0.08
1124 0.06
1125 0.05
1126 0.06
1127 0.07