Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FN71

Protein Details
Accession A0A5C5FN71    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1058-1087SAMPPAPHRRGLRPKKDTPCKYFKSRMGCDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
654-664SGPKPPPPPPP
689-712RRTGKPTGKPGGTAGNGGGPRVRK
Subcellular Location(s) extr 8, nucl 6, mito 6, cyto 6, cyto_nucl 6, cyto_mito 6, mito_nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPLLPGALSVHHSLRHLAKTAWDVEFLSNPTFASWTQGHVGADPPKKDEHLVDYVRARIPSRPSPYAPSASDLPPLPSITLSSSSPSPASSPPASPAPASAPAPAPPADANSMSFDGGFDDVLDMSSYAADEPSGLDDGANAFVDHSMDQFRTHSPVEPLFSSVQGAHLRAPSPFATYPGAVAPFTAPGTFYSRHATPPSTSLADATVAASSLAATADLIHQGRAQGAQPPQWNGFFASSAASSAGPAAPAAVAPGALFHAGAGQPGGPTMTITPSAISAPPPASSSASASRESTPRPAAPAAAKKLAASTSSSSSSSKTVRSASPAVPAALKRSAPSPASTYSPEHWTSFLPKIRTYLDSKRLQRAPVAAAQFLVRNLHGLFTYADRSSTASPWGDASDVPPEGRAEVLSAVASYGRDEFWRAWVDEGMAAPSTGGSGKGKEKEKSAHAEGAKSDGLELLQCWLEGASQRIAASSKDKEAGAAHKGSASKERKVIELEHATLLALLKVFAKLPLTFDHLRAHTGIPKRVKRISDRATDSVVKRAAADLVTKWSKVQVAARAGSAGAAMSSSSTAKRKADEKDGPAKKAKTGTSATTTASSSTAKKPAPAPAPNPLAKAGMPSFKKQPSATSASGGAGGSSALMEAIAKLKAGSGPKPPPPPPPPAPAPGPTAVGAGAGAASSTHVAPRRTGKPTGKPGGTAGNGGGPRVRKSVKWAPDDELEKVKLIEKAVYGDENGDEGAGALGESLDESLHLMQEQEGLSLAMHFEDEFEELIDWYEPVAVTLPESPEFELLSEPKQSHELELYPASDSASMDVDMPSESLAEPPEASQDAASTPEPDDKTKRIQLSADMANDPEVLQTIEDAQMSRAGAFASSDQISALLSQLTANGIVAGLDATAFGGAPGATDGTTMTTPHAPPFGAGPAAGPQVQPPPGQISAEALDALRSYPPEQVAAIVQANPAMAAGLDLAALGLVPGAAAGPQGGFDVPPHMQQRPAYVPPGFAAAQPYDGYVPPSAQPSAWGAPPPAADLYSGYQPPSHAHGHPPSTPYGRAAPTSAMPPAPHRRGLRPKKDTPCKYFKSRMGCDWGDKCAFSHDM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.32
3 0.32
4 0.3
5 0.32
6 0.35
7 0.39
8 0.36
9 0.31
10 0.29
11 0.28
12 0.31
13 0.29
14 0.25
15 0.21
16 0.19
17 0.18
18 0.19
19 0.16
20 0.18
21 0.16
22 0.18
23 0.2
24 0.23
25 0.23
26 0.22
27 0.28
28 0.3
29 0.36
30 0.35
31 0.35
32 0.35
33 0.36
34 0.38
35 0.36
36 0.33
37 0.36
38 0.37
39 0.4
40 0.41
41 0.44
42 0.45
43 0.44
44 0.39
45 0.36
46 0.4
47 0.44
48 0.48
49 0.5
50 0.5
51 0.55
52 0.59
53 0.59
54 0.53
55 0.49
56 0.45
57 0.4
58 0.4
59 0.34
60 0.31
61 0.27
62 0.27
63 0.23
64 0.19
65 0.19
66 0.18
67 0.2
68 0.18
69 0.18
70 0.18
71 0.2
72 0.2
73 0.19
74 0.19
75 0.18
76 0.24
77 0.23
78 0.24
79 0.26
80 0.29
81 0.3
82 0.27
83 0.27
84 0.25
85 0.27
86 0.27
87 0.25
88 0.23
89 0.23
90 0.26
91 0.24
92 0.22
93 0.18
94 0.19
95 0.2
96 0.19
97 0.19
98 0.2
99 0.21
100 0.19
101 0.18
102 0.16
103 0.14
104 0.13
105 0.11
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.11
127 0.1
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.11
136 0.12
137 0.14
138 0.15
139 0.19
140 0.2
141 0.22
142 0.24
143 0.27
144 0.29
145 0.28
146 0.29
147 0.26
148 0.25
149 0.23
150 0.19
151 0.2
152 0.19
153 0.19
154 0.19
155 0.2
156 0.21
157 0.19
158 0.23
159 0.18
160 0.21
161 0.21
162 0.21
163 0.21
164 0.21
165 0.21
166 0.21
167 0.21
168 0.16
169 0.16
170 0.13
171 0.12
172 0.13
173 0.11
174 0.1
175 0.1
176 0.16
177 0.17
178 0.18
179 0.21
180 0.22
181 0.26
182 0.29
183 0.3
184 0.26
185 0.28
186 0.3
187 0.27
188 0.26
189 0.22
190 0.2
191 0.18
192 0.17
193 0.14
194 0.09
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.13
213 0.15
214 0.18
215 0.23
216 0.26
217 0.29
218 0.31
219 0.3
220 0.31
221 0.26
222 0.25
223 0.2
224 0.17
225 0.14
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.13
271 0.14
272 0.14
273 0.17
274 0.21
275 0.23
276 0.24
277 0.24
278 0.26
279 0.27
280 0.29
281 0.3
282 0.28
283 0.26
284 0.28
285 0.27
286 0.27
287 0.3
288 0.36
289 0.35
290 0.34
291 0.33
292 0.3
293 0.31
294 0.29
295 0.23
296 0.18
297 0.16
298 0.16
299 0.18
300 0.2
301 0.19
302 0.19
303 0.22
304 0.21
305 0.21
306 0.21
307 0.22
308 0.22
309 0.26
310 0.29
311 0.27
312 0.3
313 0.29
314 0.27
315 0.26
316 0.25
317 0.24
318 0.22
319 0.22
320 0.17
321 0.18
322 0.21
323 0.2
324 0.21
325 0.21
326 0.2
327 0.22
328 0.24
329 0.26
330 0.24
331 0.28
332 0.28
333 0.25
334 0.24
335 0.23
336 0.25
337 0.28
338 0.31
339 0.28
340 0.27
341 0.29
342 0.31
343 0.33
344 0.34
345 0.36
346 0.41
347 0.47
348 0.5
349 0.56
350 0.56
351 0.54
352 0.5
353 0.44
354 0.39
355 0.35
356 0.33
357 0.24
358 0.21
359 0.21
360 0.19
361 0.17
362 0.15
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.13
372 0.11
373 0.11
374 0.11
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.15
379 0.12
380 0.12
381 0.13
382 0.13
383 0.11
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.09
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.08
407 0.08
408 0.11
409 0.14
410 0.14
411 0.14
412 0.14
413 0.14
414 0.13
415 0.13
416 0.11
417 0.08
418 0.07
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.04
423 0.05
424 0.05
425 0.07
426 0.12
427 0.18
428 0.23
429 0.24
430 0.27
431 0.31
432 0.34
433 0.38
434 0.37
435 0.37
436 0.34
437 0.34
438 0.31
439 0.3
440 0.26
441 0.19
442 0.16
443 0.1
444 0.09
445 0.07
446 0.07
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.06
454 0.08
455 0.07
456 0.08
457 0.08
458 0.09
459 0.1
460 0.1
461 0.13
462 0.13
463 0.14
464 0.15
465 0.15
466 0.15
467 0.16
468 0.18
469 0.17
470 0.16
471 0.15
472 0.15
473 0.17
474 0.17
475 0.24
476 0.25
477 0.24
478 0.28
479 0.29
480 0.28
481 0.29
482 0.3
483 0.27
484 0.26
485 0.25
486 0.21
487 0.2
488 0.18
489 0.17
490 0.15
491 0.09
492 0.05
493 0.04
494 0.04
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.1
502 0.15
503 0.16
504 0.17
505 0.2
506 0.19
507 0.2
508 0.2
509 0.19
510 0.19
511 0.21
512 0.26
513 0.3
514 0.33
515 0.37
516 0.4
517 0.43
518 0.43
519 0.49
520 0.49
521 0.49
522 0.51
523 0.48
524 0.47
525 0.47
526 0.42
527 0.37
528 0.32
529 0.24
530 0.19
531 0.18
532 0.15
533 0.12
534 0.12
535 0.08
536 0.12
537 0.13
538 0.13
539 0.13
540 0.13
541 0.13
542 0.14
543 0.16
544 0.16
545 0.19
546 0.19
547 0.19
548 0.18
549 0.17
550 0.16
551 0.13
552 0.07
553 0.03
554 0.03
555 0.03
556 0.02
557 0.03
558 0.04
559 0.06
560 0.08
561 0.1
562 0.11
563 0.14
564 0.19
565 0.22
566 0.3
567 0.34
568 0.38
569 0.46
570 0.49
571 0.5
572 0.51
573 0.48
574 0.41
575 0.41
576 0.36
577 0.31
578 0.29
579 0.29
580 0.27
581 0.28
582 0.26
583 0.23
584 0.22
585 0.17
586 0.16
587 0.15
588 0.13
589 0.15
590 0.19
591 0.18
592 0.2
593 0.22
594 0.27
595 0.33
596 0.34
597 0.34
598 0.36
599 0.41
600 0.4
601 0.39
602 0.33
603 0.28
604 0.23
605 0.23
606 0.18
607 0.19
608 0.19
609 0.21
610 0.25
611 0.27
612 0.3
613 0.28
614 0.29
615 0.28
616 0.33
617 0.32
618 0.27
619 0.26
620 0.23
621 0.23
622 0.2
623 0.14
624 0.08
625 0.06
626 0.05
627 0.04
628 0.03
629 0.02
630 0.02
631 0.02
632 0.02
633 0.04
634 0.04
635 0.04
636 0.04
637 0.05
638 0.08
639 0.1
640 0.12
641 0.18
642 0.23
643 0.29
644 0.36
645 0.38
646 0.44
647 0.46
648 0.52
649 0.48
650 0.5
651 0.47
652 0.45
653 0.46
654 0.4
655 0.39
656 0.32
657 0.29
658 0.23
659 0.2
660 0.16
661 0.13
662 0.1
663 0.06
664 0.05
665 0.03
666 0.03
667 0.02
668 0.03
669 0.03
670 0.04
671 0.06
672 0.1
673 0.11
674 0.14
675 0.21
676 0.26
677 0.3
678 0.38
679 0.42
680 0.47
681 0.55
682 0.6
683 0.54
684 0.49
685 0.46
686 0.44
687 0.39
688 0.3
689 0.21
690 0.19
691 0.18
692 0.17
693 0.18
694 0.14
695 0.15
696 0.19
697 0.2
698 0.16
699 0.25
700 0.33
701 0.39
702 0.43
703 0.44
704 0.43
705 0.47
706 0.49
707 0.43
708 0.39
709 0.32
710 0.26
711 0.24
712 0.23
713 0.2
714 0.18
715 0.17
716 0.13
717 0.15
718 0.15
719 0.15
720 0.13
721 0.11
722 0.11
723 0.09
724 0.09
725 0.06
726 0.05
727 0.04
728 0.04
729 0.03
730 0.03
731 0.02
732 0.02
733 0.02
734 0.02
735 0.03
736 0.02
737 0.03
738 0.04
739 0.04
740 0.04
741 0.05
742 0.05
743 0.05
744 0.08
745 0.08
746 0.07
747 0.07
748 0.07
749 0.07
750 0.07
751 0.07
752 0.04
753 0.04
754 0.04
755 0.04
756 0.05
757 0.05
758 0.05
759 0.06
760 0.06
761 0.06
762 0.07
763 0.07
764 0.06
765 0.05
766 0.06
767 0.05
768 0.05
769 0.06
770 0.05
771 0.06
772 0.08
773 0.1
774 0.1
775 0.11
776 0.12
777 0.11
778 0.12
779 0.11
780 0.12
781 0.11
782 0.12
783 0.14
784 0.14
785 0.15
786 0.18
787 0.18
788 0.17
789 0.18
790 0.17
791 0.17
792 0.19
793 0.18
794 0.16
795 0.16
796 0.15
797 0.13
798 0.12
799 0.1
800 0.09
801 0.09
802 0.08
803 0.08
804 0.08
805 0.08
806 0.08
807 0.07
808 0.06
809 0.06
810 0.06
811 0.07
812 0.07
813 0.07
814 0.07
815 0.1
816 0.1
817 0.1
818 0.09
819 0.09
820 0.09
821 0.11
822 0.11
823 0.11
824 0.11
825 0.17
826 0.18
827 0.22
828 0.26
829 0.27
830 0.34
831 0.39
832 0.41
833 0.37
834 0.37
835 0.37
836 0.39
837 0.4
838 0.35
839 0.3
840 0.27
841 0.25
842 0.24
843 0.2
844 0.13
845 0.09
846 0.07
847 0.06
848 0.06
849 0.07
850 0.08
851 0.08
852 0.09
853 0.08
854 0.1
855 0.11
856 0.1
857 0.09
858 0.08
859 0.08
860 0.08
861 0.08
862 0.1
863 0.1
864 0.1
865 0.1
866 0.1
867 0.1
868 0.09
869 0.09
870 0.06
871 0.05
872 0.05
873 0.06
874 0.06
875 0.06
876 0.06
877 0.05
878 0.05
879 0.05
880 0.05
881 0.04
882 0.03
883 0.03
884 0.03
885 0.03
886 0.03
887 0.03
888 0.03
889 0.03
890 0.03
891 0.04
892 0.04
893 0.05
894 0.05
895 0.05
896 0.05
897 0.07
898 0.08
899 0.08
900 0.1
901 0.13
902 0.14
903 0.16
904 0.18
905 0.15
906 0.15
907 0.17
908 0.17
909 0.14
910 0.13
911 0.12
912 0.13
913 0.15
914 0.15
915 0.13
916 0.12
917 0.17
918 0.19
919 0.19
920 0.18
921 0.21
922 0.22
923 0.22
924 0.21
925 0.19
926 0.18
927 0.18
928 0.17
929 0.12
930 0.11
931 0.11
932 0.11
933 0.09
934 0.1
935 0.1
936 0.13
937 0.14
938 0.15
939 0.15
940 0.16
941 0.16
942 0.17
943 0.17
944 0.14
945 0.14
946 0.13
947 0.13
948 0.11
949 0.1
950 0.06
951 0.05
952 0.04
953 0.04
954 0.04
955 0.04
956 0.03
957 0.03
958 0.03
959 0.03
960 0.03
961 0.02
962 0.02
963 0.02
964 0.02
965 0.02
966 0.02
967 0.03
968 0.03
969 0.03
970 0.04
971 0.05
972 0.05
973 0.05
974 0.06
975 0.11
976 0.11
977 0.18
978 0.22
979 0.22
980 0.27
981 0.28
982 0.34
983 0.37
984 0.4
985 0.39
986 0.36
987 0.36
988 0.32
989 0.35
990 0.28
991 0.22
992 0.23
993 0.18
994 0.19
995 0.18
996 0.19
997 0.16
998 0.16
999 0.18
1000 0.15
1001 0.16
1002 0.15
1003 0.18
1004 0.18
1005 0.16
1006 0.18
1007 0.2
1008 0.22
1009 0.23
1010 0.23
1011 0.21
1012 0.23
1013 0.23
1014 0.24
1015 0.2
1016 0.17
1017 0.15
1018 0.16
1019 0.18
1020 0.21
1021 0.21
1022 0.2
1023 0.19
1024 0.2
1025 0.22
1026 0.25
1027 0.26
1028 0.23
1029 0.3
1030 0.37
1031 0.41
1032 0.44
1033 0.44
1034 0.46
1035 0.45
1036 0.45
1037 0.4
1038 0.39
1039 0.36
1040 0.34
1041 0.33
1042 0.3
1043 0.28
1044 0.3
1045 0.29
1046 0.25
1047 0.24
1048 0.3
1049 0.38
1050 0.41
1051 0.46
1052 0.48
1053 0.56
1054 0.65
1055 0.74
1056 0.77
1057 0.77
1058 0.82
1059 0.85
1060 0.92
1061 0.91
1062 0.89
1063 0.89
1064 0.85
1065 0.85
1066 0.85
1067 0.81
1068 0.8
1069 0.77
1070 0.74
1071 0.73
1072 0.69
1073 0.68
1074 0.61
1075 0.61
1076 0.53
1077 0.47
1078 0.41