FuNGI

A0A5C5G1L4

Protein Details

Accession

A0A5C5G1L4

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
31-54	ASDRVLKLVDKRQKRKNADGVTSY	Hydrophilic
576-595	VLDARPRRGKKGREEEQEQE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
581-586	PRRGKK
619-667	KRPRAEPTDDKKARKAAVKAERAARRVEKKGTKDAFSSEVKRQKRIQGR

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MAPSLWKRPGTKTFQLVHRSQRDPLINDPDASDRVLKLVDKRQKRKNADGVTSYAPSEAPGPDDLDDLDDAALAKGDAAAYGIFYDDADDYDYLQHLRQVGAGGSGGEAYLVEAPVQNKQHKGKGKDKAGAGAGAGFQLSEEALARQDARHDAGPAFALPDDALPSHPLDELSYADVMASKAPSRGLQPDLDPSVREVLEALDDEAYAADDGAGTDEEDEFWDGVLRGGEVADVREQHWEEEEEGDVEGAAEGVGRLALEGGEQDEGSWAAVKAFKAAGGRPAAARSDVGSDELNGDDDDEEEDDFASEGGDTIGALRASLARRPARKAQTAASGFSMSSSAMVRNKGLQTLDEQFDQIEKMYDESDDDSWGGSHHSGGSDDDDNDDDDDAAFPHGAARADLERIMDDFLSKYEVIGGKYRPALAPLHGDAGAEDASLGANASRLDRLRAEMARLDVGDGGEGEGEEDPEVRARRREKERILAIVERQEDEAGKGGGRKVPRVTILEEARRDRWDCETVLSTYSNLSNHPRMLRLRDFANRGSSSSNGPGGGAAARQAQIKIDPKTGFPTVDGVSVLDARPRRGKKGREEEQEQEDAIMEEEEEDEDEEEDYVPREVIKRPRAEPTDDKKARKAAVKAERAARRVEKKGTKDAFSSEVKRQKRIQGRRVADGAAADVRSGQEGVRRLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.73
3	0.7
4	0.71
5	0.71
6	0.67
7	0.62
8	0.62
9	0.61
10	0.57
11	0.58
12	0.57
13	0.5
14	0.47
15	0.46
16	0.42
17	0.36
18	0.34
19	0.28
20	0.19
21	0.19
22	0.2
23	0.21
24	0.24
25	0.33
26	0.41
27	0.49
28	0.59
29	0.67
30	0.76
31	0.81
32	0.85
33	0.85
34	0.85
35	0.82
36	0.77
37	0.71
38	0.65
39	0.58
40	0.48
41	0.38
42	0.29
43	0.21
44	0.19
45	0.15
46	0.13
47	0.13
48	0.14
49	0.14
50	0.15
51	0.15
52	0.14
53	0.14
54	0.12
55	0.1
56	0.09
57	0.09
58	0.08
59	0.08
60	0.06
61	0.05
62	0.05
63	0.05
64	0.05
65	0.05
66	0.05
67	0.05
68	0.05
69	0.06
70	0.05
71	0.05
72	0.07
73	0.06
74	0.07
75	0.09
76	0.09
77	0.09
78	0.11
79	0.12
80	0.12
81	0.12
82	0.13
83	0.12
84	0.13
85	0.13
86	0.13
87	0.12
88	0.12
89	0.12
90	0.1
91	0.09
92	0.09
93	0.07
94	0.05
95	0.05
96	0.05
97	0.05
98	0.05
99	0.06
100	0.08
101	0.09
102	0.15
103	0.21
104	0.24
105	0.3
106	0.35
107	0.43
108	0.49
109	0.57
110	0.6
111	0.65
112	0.69
113	0.69
114	0.65
115	0.62
116	0.55
117	0.48
118	0.38
119	0.29
120	0.21
121	0.15
122	0.13
123	0.08
124	0.06
125	0.05
126	0.05
127	0.04
128	0.04
129	0.05
130	0.06
131	0.07
132	0.08
133	0.08
134	0.11
135	0.13
136	0.15
137	0.16
138	0.18
139	0.17
140	0.17
141	0.18
142	0.15
143	0.14
144	0.11
145	0.1
146	0.08
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.08
151	0.09
152	0.09
153	0.1
154	0.1
155	0.1
156	0.09
157	0.1
158	0.1
159	0.11
160	0.1
161	0.09
162	0.08
163	0.09
164	0.09
165	0.09
166	0.09
167	0.08
168	0.09
169	0.1
170	0.11
171	0.13
172	0.17
173	0.19
174	0.19
175	0.2
176	0.24
177	0.27
178	0.26
179	0.24
180	0.21
181	0.22
182	0.2
183	0.19
184	0.14
185	0.11
186	0.11
187	0.11
188	0.1
189	0.07
190	0.07
191	0.07
192	0.06
193	0.06
194	0.05
195	0.04
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.05
204	0.05
205	0.06
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.07
210	0.06
211	0.07
212	0.07
213	0.06
214	0.05
215	0.05
216	0.06
217	0.05
218	0.06
219	0.07
220	0.08
221	0.08
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.14
226	0.14
227	0.13
228	0.13
229	0.13
230	0.1
231	0.1
232	0.09
233	0.07
234	0.06
235	0.05
236	0.04
237	0.03
238	0.02
239	0.02
240	0.02
241	0.02
242	0.02
243	0.02
244	0.02
245	0.02
246	0.02
247	0.03
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.07
259	0.07
260	0.08
261	0.08
262	0.1
263	0.1
264	0.11
265	0.15
266	0.14
267	0.15
268	0.14
269	0.15
270	0.15
271	0.14
272	0.13
273	0.1
274	0.1
275	0.1
276	0.11
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.09
281	0.09
282	0.07
283	0.07
284	0.05
285	0.05
286	0.06
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.03
301	0.05
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.07
306	0.08
307	0.1
308	0.16
309	0.19
310	0.22
311	0.26
312	0.34
313	0.38
314	0.41
315	0.42
316	0.38
317	0.42
318	0.41
319	0.38
320	0.31
321	0.25
322	0.21
323	0.19
324	0.17
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.09
330	0.1
331	0.1
332	0.12
333	0.13
334	0.14
335	0.13
336	0.12
337	0.13
338	0.16
339	0.17
340	0.15
341	0.14
342	0.13
343	0.13
344	0.12
345	0.1
346	0.07
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.1
370	0.1
371	0.1
372	0.1
373	0.09
374	0.07
375	0.06
376	0.06
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.05
382	0.07
383	0.07
384	0.06
385	0.07
386	0.08
387	0.09
388	0.09
389	0.09
390	0.08
391	0.08
392	0.09
393	0.07
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.08
398	0.08
399	0.07
400	0.1
401	0.12
402	0.13
403	0.16
404	0.16
405	0.17
406	0.18
407	0.19
408	0.16
409	0.16
410	0.16
411	0.14
412	0.17
413	0.15
414	0.16
415	0.15
416	0.15
417	0.13
418	0.13
419	0.11
420	0.07
421	0.06
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.03
427	0.04
428	0.04
429	0.05
430	0.08
431	0.08
432	0.1
433	0.11
434	0.13
435	0.17
436	0.18
437	0.19
438	0.19
439	0.19
440	0.19
441	0.18
442	0.16
443	0.12
444	0.11
445	0.09
446	0.07
447	0.06
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.05
455	0.05
456	0.09
457	0.11
458	0.12
459	0.19
460	0.23
461	0.33
462	0.41
463	0.5
464	0.53
465	0.6
466	0.63
467	0.61
468	0.61
469	0.55
470	0.48
471	0.44
472	0.39
473	0.31
474	0.27
475	0.23
476	0.19
477	0.16
478	0.16
479	0.11
480	0.1
481	0.11
482	0.12
483	0.15
484	0.17
485	0.2
486	0.2
487	0.23
488	0.26
489	0.27
490	0.28
491	0.32
492	0.37
493	0.4
494	0.42
495	0.43
496	0.41
497	0.42
498	0.41
499	0.36
500	0.34
501	0.31
502	0.27
503	0.27
504	0.27
505	0.25
506	0.25
507	0.24
508	0.19
509	0.17
510	0.18
511	0.15
512	0.15
513	0.19
514	0.21
515	0.24
516	0.26
517	0.29
518	0.31
519	0.38
520	0.41
521	0.38
522	0.4
523	0.43
524	0.45
525	0.43
526	0.47
527	0.4
528	0.37
529	0.36
530	0.32
531	0.29
532	0.28
533	0.26
534	0.18
535	0.17
536	0.16
537	0.14
538	0.14
539	0.1
540	0.09
541	0.09
542	0.1
543	0.12
544	0.12
545	0.12
546	0.18
547	0.24
548	0.26
549	0.31
550	0.31
551	0.31
552	0.36
553	0.37
554	0.32
555	0.26
556	0.27
557	0.21
558	0.21
559	0.2
560	0.15
561	0.14
562	0.14
563	0.14
564	0.15
565	0.16
566	0.18
567	0.27
568	0.31
569	0.39
570	0.47
571	0.55
572	0.61
573	0.71
574	0.76
575	0.77
576	0.8
577	0.77
578	0.74
579	0.69
580	0.58
581	0.47
582	0.37
583	0.28
584	0.22
585	0.15
586	0.09
587	0.07
588	0.07
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.07
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.08
598	0.09
599	0.09
600	0.09
601	0.1
602	0.12
603	0.19
604	0.28
605	0.36
606	0.42
607	0.44
608	0.54
609	0.57
610	0.62
611	0.66
612	0.65
613	0.68
614	0.69
615	0.71
616	0.67
617	0.69
618	0.67
619	0.64
620	0.62
621	0.61
622	0.63
623	0.67
624	0.67
625	0.69
626	0.71
627	0.65
628	0.67
629	0.66
630	0.63
631	0.63
632	0.66
633	0.66
634	0.66
635	0.74
636	0.73
637	0.67
638	0.62
639	0.58
640	0.54
641	0.52
642	0.51
643	0.5
644	0.53
645	0.54
646	0.58
647	0.6
648	0.64
649	0.68
650	0.74
651	0.74
652	0.75
653	0.77
654	0.77
655	0.74
656	0.65
657	0.56
658	0.45
659	0.39
660	0.31
661	0.26
662	0.18
663	0.16
664	0.15
665	0.15
666	0.15
667	0.12
668	0.14

A0A5C5G1L4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer