FuNGI

A0A5C5FP43

Protein Details

Accession

A0A5C5FP43

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
182-203	ADSSFRSKRGPRPPPRARQDLE	Hydrophilic
554-580	SNGNGKAKSSKSRKKHRRSSSSASSAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-16	KGRGRGRGRR
189-195	KRGPRPP
311-337	VLRTKIRRLQERKAERLKREARNKAKA
558-571	GKAKSSKSRKKHRR
664-673	AAGGKGKGRR

Subcellular Location(s)

mito 13, mito_nucl 10.333, cyto_mito 9.833, nucl 6.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSDHPPKGRGRGRGRRIAATTLSGPLASASASASPSASPAPSAAPSPAPRDATDDAPSDPAPAQPSTSSSKTAPAAPPPQRRASVKRVASVGVGSTRAPSVASSMSRTPSLGPTTTTTTTTTADQPAHRARPVGGLLGSTSEFRAGAGASAAGARPKFKPNMRRTMRVQDDEDDEDVKMEDADSSFRSKRGPRPPPRARQDLEMTASGPMAQGPGGPPRAWGAARPAGASGAAVMAASRAGTLNRMLDDDSDASDLEVDDAGAGGSGGEGEGGAPVRRFKAVDLNDIGAEPGGAGEDEAVTPLTLPRDPKVLRTKIRRLQERKAERLKREARNKAKAEGLVKPEPTDESLPPSTSATPLGGTPAPPAVAAALAGESKEGSLALLSVDEDKEAKDLKDLEEEEKKEISLSEAFDLAPETRGELYMFQFPRKFPVFTPSSASSSPSTAPGAPDPSVKPDPDGAPSPAGAGAGARRPAAPPAWGRFGSRAEKAARWTGHEGRIGQLRVHRSGKVTLRIEGDLRYEVLPAAQPSFLQEVAVLDHREANAPATSAATASNGNGKAKSSKSRKKHRRSSSSASSASSSSSSSSSSSTTTTRPARPLPTESLVVLGQTSKKFLVVPDINDLLAGVALQEKRERDDERRVKMERARGAAAQAGLGGATGAAAAGGKGKGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.79
2	0.78
3	0.74
4	0.7
5	0.61
6	0.55
7	0.48
8	0.4
9	0.36
10	0.27
11	0.23
12	0.18
13	0.15
14	0.1
15	0.09
16	0.07
17	0.08
18	0.09
19	0.1
20	0.1
21	0.09
22	0.11
23	0.12
24	0.12
25	0.1
26	0.11
27	0.13
28	0.14
29	0.16
30	0.16
31	0.21
32	0.23
33	0.28
34	0.33
35	0.33
36	0.32
37	0.37
38	0.37
39	0.35
40	0.36
41	0.32
42	0.28
43	0.29
44	0.28
45	0.24
46	0.22
47	0.2
48	0.2
49	0.18
50	0.19
51	0.17
52	0.21
53	0.25
54	0.27
55	0.28
56	0.26
57	0.3
58	0.3
59	0.35
60	0.35
61	0.37
62	0.44
63	0.5
64	0.59
65	0.6
66	0.65
67	0.65
68	0.68
69	0.67
70	0.67
71	0.67
72	0.62
73	0.6
74	0.56
75	0.51
76	0.45
77	0.38
78	0.32
79	0.24
80	0.21
81	0.16
82	0.15
83	0.14
84	0.13
85	0.13
86	0.1
87	0.11
88	0.14
89	0.15
90	0.18
91	0.21
92	0.23
93	0.23
94	0.24
95	0.23
96	0.23
97	0.25
98	0.22
99	0.22
100	0.23
101	0.28
102	0.29
103	0.29
104	0.26
105	0.25
106	0.25
107	0.25
108	0.25
109	0.23
110	0.25
111	0.24
112	0.29
113	0.35
114	0.37
115	0.36
116	0.35
117	0.32
118	0.34
119	0.34
120	0.29
121	0.22
122	0.18
123	0.17
124	0.18
125	0.17
126	0.12
127	0.11
128	0.09
129	0.08
130	0.08
131	0.08
132	0.06
133	0.06
134	0.06
135	0.06
136	0.05
137	0.06
138	0.06
139	0.08
140	0.09
141	0.11
142	0.13
143	0.19
144	0.26
145	0.33
146	0.43
147	0.5
148	0.6
149	0.65
150	0.69
151	0.7
152	0.73
153	0.74
154	0.69
155	0.63
156	0.55
157	0.53
158	0.48
159	0.43
160	0.33
161	0.25
162	0.2
163	0.17
164	0.14
165	0.1
166	0.07
167	0.06
168	0.06
169	0.08
170	0.09
171	0.14
172	0.15
173	0.16
174	0.2
175	0.26
176	0.34
177	0.44
178	0.53
179	0.58
180	0.69
181	0.78
182	0.84
183	0.86
184	0.85
185	0.76
186	0.71
187	0.67
188	0.6
189	0.53
190	0.43
191	0.36
192	0.28
193	0.26
194	0.19
195	0.13
196	0.09
197	0.06
198	0.05
199	0.05
200	0.06
201	0.1
202	0.12
203	0.12
204	0.13
205	0.14
206	0.17
207	0.16
208	0.16
209	0.18
210	0.21
211	0.21
212	0.21
213	0.2
214	0.17
215	0.17
216	0.15
217	0.1
218	0.05
219	0.04
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.04
228	0.05
229	0.06
230	0.08
231	0.08
232	0.09
233	0.09
234	0.09
235	0.11
236	0.1
237	0.1
238	0.09
239	0.09
240	0.08
241	0.08
242	0.07
243	0.06
244	0.05
245	0.04
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.02
252	0.02
253	0.02
254	0.02
255	0.02
256	0.02
257	0.02
258	0.03
259	0.03
260	0.04
261	0.05
262	0.06
263	0.07
264	0.08
265	0.08
266	0.09
267	0.17
268	0.19
269	0.23
270	0.24
271	0.24
272	0.24
273	0.23
274	0.22
275	0.13
276	0.11
277	0.06
278	0.04
279	0.03
280	0.02
281	0.02
282	0.02
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.04
290	0.06
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.15
295	0.16
296	0.23
297	0.32
298	0.38
299	0.44
300	0.51
301	0.6
302	0.6
303	0.68
304	0.7
305	0.68
306	0.69
307	0.72
308	0.71
309	0.7
310	0.74
311	0.73
312	0.66
313	0.69
314	0.7
315	0.69
316	0.7
317	0.72
318	0.7
319	0.73
320	0.72
321	0.64
322	0.58
323	0.52
324	0.45
325	0.4
326	0.37
327	0.31
328	0.29
329	0.26
330	0.24
331	0.22
332	0.21
333	0.19
334	0.13
335	0.15
336	0.16
337	0.16
338	0.16
339	0.17
340	0.15
341	0.13
342	0.13
343	0.09
344	0.08
345	0.07
346	0.09
347	0.08
348	0.08
349	0.08
350	0.08
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.04
373	0.04
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.07
378	0.08
379	0.08
380	0.09
381	0.1
382	0.11
383	0.16
384	0.17
385	0.2
386	0.25
387	0.26
388	0.26
389	0.25
390	0.24
391	0.19
392	0.18
393	0.16
394	0.12
395	0.12
396	0.1
397	0.11
398	0.11
399	0.1
400	0.11
401	0.09
402	0.09
403	0.07
404	0.08
405	0.07
406	0.08
407	0.09
408	0.09
409	0.1
410	0.16
411	0.17
412	0.19
413	0.21
414	0.21
415	0.27
416	0.28
417	0.28
418	0.21
419	0.28
420	0.28
421	0.28
422	0.34
423	0.3
424	0.31
425	0.3
426	0.31
427	0.24
428	0.23
429	0.22
430	0.18
431	0.17
432	0.14
433	0.15
434	0.14
435	0.16
436	0.15
437	0.18
438	0.17
439	0.22
440	0.24
441	0.23
442	0.22
443	0.22
444	0.23
445	0.23
446	0.26
447	0.21
448	0.19
449	0.19
450	0.18
451	0.15
452	0.14
453	0.1
454	0.08
455	0.08
456	0.1
457	0.11
458	0.11
459	0.11
460	0.12
461	0.14
462	0.15
463	0.17
464	0.19
465	0.22
466	0.28
467	0.28
468	0.29
469	0.3
470	0.34
471	0.35
472	0.32
473	0.32
474	0.3
475	0.31
476	0.33
477	0.37
478	0.33
479	0.33
480	0.38
481	0.38
482	0.4
483	0.41
484	0.38
485	0.34
486	0.39
487	0.36
488	0.31
489	0.31
490	0.3
491	0.33
492	0.35
493	0.34
494	0.3
495	0.36
496	0.4
497	0.44
498	0.42
499	0.39
500	0.39
501	0.39
502	0.38
503	0.32
504	0.28
505	0.21
506	0.2
507	0.16
508	0.14
509	0.12
510	0.12
511	0.12
512	0.11
513	0.12
514	0.1
515	0.1
516	0.12
517	0.15
518	0.14
519	0.12
520	0.11
521	0.1
522	0.12
523	0.16
524	0.14
525	0.12
526	0.14
527	0.14
528	0.16
529	0.16
530	0.15
531	0.13
532	0.13
533	0.13
534	0.12
535	0.11
536	0.1
537	0.1
538	0.09
539	0.09
540	0.09
541	0.15
542	0.16
543	0.18
544	0.18
545	0.2
546	0.24
547	0.28
548	0.38
549	0.42
550	0.5
551	0.59
552	0.7
553	0.79
554	0.85
555	0.91
556	0.92
557	0.92
558	0.91
559	0.9
560	0.89
561	0.87
562	0.78
563	0.69
564	0.6
565	0.5
566	0.42
567	0.33
568	0.23
569	0.16
570	0.14
571	0.14
572	0.13
573	0.14
574	0.14
575	0.14
576	0.16
577	0.17
578	0.18
579	0.25
580	0.31
581	0.35
582	0.39
583	0.43
584	0.48
585	0.51
586	0.54
587	0.53
588	0.5
589	0.47
590	0.41
591	0.38
592	0.31
593	0.26
594	0.21
595	0.17
596	0.17
597	0.16
598	0.18
599	0.16
600	0.17
601	0.18
602	0.18
603	0.26
604	0.26
605	0.28
606	0.32
607	0.33
608	0.32
609	0.31
610	0.3
611	0.19
612	0.14
613	0.11
614	0.05
615	0.09
616	0.1
617	0.12
618	0.16
619	0.17
620	0.21
621	0.28
622	0.33
623	0.35
624	0.46
625	0.53
626	0.58
627	0.65
628	0.65
629	0.66
630	0.68
631	0.7
632	0.66
633	0.62
634	0.57
635	0.5
636	0.49
637	0.45
638	0.38
639	0.29
640	0.22
641	0.16
642	0.12
643	0.1
644	0.08
645	0.04
646	0.03
647	0.03
648	0.03
649	0.03
650	0.03
651	0.03
652	0.06
653	0.07

A0A5C5FP43

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer