Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FWU6

Protein Details
Accession A0A5C5FWU6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-219AAGKKAAQMERKRNKKRGGKARDDPALBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-70PPPRRKPA
196-214KKAAQMERKRNKKRGGKAR
257-260RRRR
588-599SKKAVKKAKALG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.5, nucl 10, cyto 9, mito 4, extr 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MSLYGGISFKGAAKPAADASAAPAASGAPPATAPAEGTQSPTPAGADDKPKPAAWSAALRFAPPPRRKPAAPSSRPPVAALRSVFGAVDDDAPAVAPANAAGPRIAAVGKASLTAAPDKAPPPSKWSAVSRTAVEIKPFASSSNTSGSSTPVRTASPAASARTTTRVRRVIAVPPAMTLEEDVGDVNGFAQTAAGKKAAQMERKRNKKRGGKARDDPALAFADVPYDPARPCDYSAYKTHVKLAREQRRLEREEEERRRRREGSASGSSYYSEDDERSKENEPVNKKARFFAPPASYDEAGPSGFPPPSSYGPPSAPSRDETADEAYARRVAMSNPAPPRREETGDEAYQRRLAMSQRTAESGDDAYARRVALSRGEAPPAPAARPPAFVSQSTPAPPGFGAGAPMPPPPGFGALPPPPPGFVPPPGFVPPVFPSATSGSPSHAPASAASPAPSFAADPASQPASASGATAAGAPSSEALDAAQAKAREIAARLSKLGGAFAAPPPPQQPGAGAAAAAPPGFAPASTAAGAGGVGPSQPTGPTSEPDGRTFAERMMTKFGWEEGKGLGADESGMTSALSVQRAPSAPSKKAVKKAKALGEEPPPAGPKGMAGRSVVVDATREQRSAEQRAQMGGEASRVVLLTNLCGRDEVDEDLPGEVAEEANRFGVVERCFVYPVPGEARDDEAVRIFLVMSGLAGGYNAVKNFDGRFFGGRTVRARFYDEKAFNAGRHDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.21
4 0.18
5 0.15
6 0.17
7 0.21
8 0.2
9 0.17
10 0.16
11 0.14
12 0.14
13 0.16
14 0.12
15 0.07
16 0.07
17 0.09
18 0.1
19 0.1
20 0.11
21 0.11
22 0.16
23 0.15
24 0.2
25 0.2
26 0.2
27 0.21
28 0.2
29 0.18
30 0.15
31 0.18
32 0.19
33 0.26
34 0.29
35 0.34
36 0.37
37 0.37
38 0.38
39 0.37
40 0.35
41 0.31
42 0.35
43 0.32
44 0.38
45 0.37
46 0.36
47 0.38
48 0.42
49 0.49
50 0.48
51 0.54
52 0.53
53 0.6
54 0.6
55 0.65
56 0.68
57 0.69
58 0.69
59 0.7
60 0.69
61 0.69
62 0.68
63 0.61
64 0.56
65 0.49
66 0.47
67 0.4
68 0.34
69 0.28
70 0.27
71 0.25
72 0.19
73 0.17
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.07
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.08
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.07
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.11
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.16
105 0.17
106 0.23
107 0.28
108 0.27
109 0.32
110 0.36
111 0.38
112 0.4
113 0.44
114 0.44
115 0.45
116 0.47
117 0.41
118 0.42
119 0.45
120 0.41
121 0.37
122 0.31
123 0.25
124 0.25
125 0.23
126 0.19
127 0.17
128 0.17
129 0.18
130 0.22
131 0.24
132 0.22
133 0.23
134 0.25
135 0.26
136 0.25
137 0.24
138 0.2
139 0.19
140 0.19
141 0.21
142 0.19
143 0.21
144 0.23
145 0.23
146 0.22
147 0.23
148 0.24
149 0.29
150 0.32
151 0.31
152 0.37
153 0.4
154 0.4
155 0.43
156 0.45
157 0.45
158 0.47
159 0.47
160 0.38
161 0.33
162 0.33
163 0.28
164 0.25
165 0.18
166 0.11
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.06
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.19
185 0.24
186 0.32
187 0.39
188 0.49
189 0.58
190 0.69
191 0.78
192 0.78
193 0.82
194 0.83
195 0.85
196 0.85
197 0.86
198 0.85
199 0.83
200 0.82
201 0.78
202 0.7
203 0.6
204 0.51
205 0.43
206 0.33
207 0.25
208 0.16
209 0.13
210 0.11
211 0.12
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.12
216 0.15
217 0.15
218 0.16
219 0.21
220 0.23
221 0.26
222 0.29
223 0.33
224 0.35
225 0.34
226 0.4
227 0.38
228 0.37
229 0.42
230 0.49
231 0.53
232 0.56
233 0.59
234 0.6
235 0.64
236 0.65
237 0.59
238 0.54
239 0.52
240 0.56
241 0.63
242 0.65
243 0.65
244 0.66
245 0.69
246 0.65
247 0.61
248 0.58
249 0.54
250 0.51
251 0.5
252 0.49
253 0.44
254 0.42
255 0.39
256 0.31
257 0.25
258 0.18
259 0.11
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.14
264 0.16
265 0.18
266 0.21
267 0.24
268 0.3
269 0.32
270 0.39
271 0.45
272 0.47
273 0.46
274 0.45
275 0.44
276 0.42
277 0.39
278 0.38
279 0.34
280 0.32
281 0.36
282 0.36
283 0.33
284 0.29
285 0.27
286 0.21
287 0.16
288 0.14
289 0.1
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.11
295 0.14
296 0.16
297 0.18
298 0.18
299 0.2
300 0.23
301 0.24
302 0.23
303 0.22
304 0.21
305 0.22
306 0.2
307 0.2
308 0.19
309 0.19
310 0.17
311 0.17
312 0.16
313 0.13
314 0.13
315 0.11
316 0.1
317 0.08
318 0.07
319 0.13
320 0.16
321 0.21
322 0.27
323 0.32
324 0.33
325 0.33
326 0.38
327 0.35
328 0.35
329 0.31
330 0.3
331 0.31
332 0.32
333 0.34
334 0.3
335 0.28
336 0.26
337 0.24
338 0.17
339 0.13
340 0.14
341 0.16
342 0.18
343 0.2
344 0.19
345 0.21
346 0.21
347 0.19
348 0.18
349 0.13
350 0.11
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.11
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.15
365 0.16
366 0.18
367 0.17
368 0.15
369 0.12
370 0.15
371 0.15
372 0.17
373 0.18
374 0.19
375 0.2
376 0.19
377 0.21
378 0.2
379 0.2
380 0.2
381 0.19
382 0.15
383 0.14
384 0.13
385 0.11
386 0.09
387 0.07
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.08
392 0.08
393 0.09
394 0.08
395 0.09
396 0.08
397 0.1
398 0.09
399 0.09
400 0.15
401 0.16
402 0.19
403 0.2
404 0.2
405 0.18
406 0.18
407 0.21
408 0.17
409 0.19
410 0.21
411 0.19
412 0.22
413 0.23
414 0.24
415 0.21
416 0.22
417 0.19
418 0.19
419 0.18
420 0.15
421 0.16
422 0.17
423 0.18
424 0.17
425 0.16
426 0.14
427 0.15
428 0.16
429 0.15
430 0.13
431 0.13
432 0.11
433 0.13
434 0.14
435 0.12
436 0.12
437 0.11
438 0.11
439 0.11
440 0.1
441 0.08
442 0.06
443 0.09
444 0.08
445 0.09
446 0.11
447 0.12
448 0.11
449 0.11
450 0.11
451 0.09
452 0.09
453 0.08
454 0.06
455 0.05
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.06
468 0.06
469 0.07
470 0.09
471 0.09
472 0.09
473 0.11
474 0.11
475 0.11
476 0.11
477 0.16
478 0.18
479 0.19
480 0.19
481 0.18
482 0.19
483 0.18
484 0.17
485 0.12
486 0.08
487 0.09
488 0.09
489 0.13
490 0.12
491 0.13
492 0.15
493 0.17
494 0.17
495 0.15
496 0.15
497 0.14
498 0.16
499 0.15
500 0.13
501 0.11
502 0.11
503 0.11
504 0.1
505 0.07
506 0.04
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.06
512 0.08
513 0.09
514 0.09
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.06
519 0.05
520 0.03
521 0.03
522 0.03
523 0.04
524 0.04
525 0.05
526 0.05
527 0.09
528 0.11
529 0.12
530 0.18
531 0.25
532 0.27
533 0.28
534 0.3
535 0.27
536 0.28
537 0.28
538 0.23
539 0.22
540 0.22
541 0.22
542 0.27
543 0.26
544 0.24
545 0.24
546 0.25
547 0.23
548 0.21
549 0.21
550 0.14
551 0.16
552 0.15
553 0.15
554 0.13
555 0.09
556 0.08
557 0.07
558 0.07
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.04
563 0.07
564 0.09
565 0.1
566 0.09
567 0.1
568 0.13
569 0.14
570 0.17
571 0.24
572 0.28
573 0.29
574 0.36
575 0.45
576 0.48
577 0.57
578 0.64
579 0.63
580 0.66
581 0.71
582 0.73
583 0.7
584 0.65
585 0.62
586 0.6
587 0.56
588 0.49
589 0.43
590 0.37
591 0.31
592 0.3
593 0.23
594 0.19
595 0.21
596 0.23
597 0.22
598 0.21
599 0.22
600 0.22
601 0.23
602 0.2
603 0.14
604 0.13
605 0.13
606 0.18
607 0.18
608 0.18
609 0.18
610 0.24
611 0.3
612 0.36
613 0.39
614 0.38
615 0.38
616 0.39
617 0.39
618 0.34
619 0.29
620 0.22
621 0.19
622 0.13
623 0.12
624 0.11
625 0.1
626 0.09
627 0.09
628 0.09
629 0.11
630 0.15
631 0.16
632 0.16
633 0.16
634 0.17
635 0.17
636 0.19
637 0.19
638 0.16
639 0.16
640 0.16
641 0.16
642 0.16
643 0.13
644 0.12
645 0.08
646 0.07
647 0.07
648 0.08
649 0.08
650 0.09
651 0.09
652 0.08
653 0.09
654 0.15
655 0.15
656 0.18
657 0.19
658 0.2
659 0.22
660 0.21
661 0.24
662 0.2
663 0.22
664 0.24
665 0.24
666 0.25
667 0.26
668 0.3
669 0.28
670 0.28
671 0.25
672 0.21
673 0.2
674 0.17
675 0.16
676 0.12
677 0.1
678 0.1
679 0.08
680 0.06
681 0.06
682 0.06
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.07
687 0.09
688 0.1
689 0.11
690 0.12
691 0.14
692 0.16
693 0.19
694 0.2
695 0.2
696 0.24
697 0.24
698 0.3
699 0.32
700 0.35
701 0.37
702 0.4
703 0.43
704 0.41
705 0.46
706 0.44
707 0.46
708 0.51
709 0.48
710 0.45
711 0.47
712 0.48
713 0.43