FuNGI

A0A5C5FMD1

Protein Details

Accession

A0A5C5FMD1

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
440-462	GEELEGRRKKRTRQRGRRVAGGG	Basic
666-687	SPDPAPLPPKRRGRPPKAAAAG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
146-175	ARGRGKGKDKEREDGGGDGEMGKVKVKDKL
444-467	EGRRKKRTRQRGRRVAGGGTRRKG
571-600	PAGKPRARVPCAVRPPPSTPAGPRKRGRPR
672-685	LPPKRRGRPPKAAA

Subcellular Location(s)

mito 18, nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000305 GIY-YIG_endonuc IPR035901 GIY-YIG_endonuc_sf IPR027520 Slx1 IPR013083 Znf_RING/FYVE/PHD
Gene Ontology	GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair
Pfam	View protein in Pfam PF01541 GIY-YIG
PROSITE	View protein in PROSITE PS50164 GIY_YIG
CDD	cd10455 GIY-YIG_SLX1

Amino Acid Sequences

MPRARPPSPSRSPSPSSSPRARTPPSPPPRARAAANPTSTLLHHSIPPFYACYLLRSFAARRAGAATYIGSTPDPPRRWRQHMGLVKGGAFKTRLGRPWEMEALVSGFPTKLQALQFEWAWQNPHASRLLRSAPKADSAAPQGGLARGRGKGKDKEREDGGGDGEMGKVKVKDKLKSADKPPAAAAAVAQFPRGALSNRPLSKIQVLQYMLTSAPWRSFPLRVTLLSLDAQAWWDAARRLGPVLRTEAGVRKWEREREREGDGAEDAWGERAQRLDEVRVVLRREGVDGARLVRAGEKAEGEEVERLRVDDGEFFDAHWAKWAALSDDPARLQDTACDLCRKPVDTSDHLSFHLCTASAPGALAPCLAVFHPLCLSAHLLSPHVPSLPPPTSASVSPTAPSSAAPPAVFAPPLLPTTGPCPTCGGALHWADLVRGAYRRGEELEGRRKKRTRQRGRRVAGGGTRRKGEVLPAEKEEDDDDDGEEEEEEEAFRFSGSGSDDPSDAESVDLGPLDDDGADSDAERSFARLDAAAQALGVEAGALSEGEEVRAPWDEDGDAESLLGRPAPPAAPAGKPRARVPCAVRPPPSTPAGPRKRGRPREGEGAATDPDGDGDGASLRTVRSPWSDSDHVFDARLAPGPETGRLDALPPAPPLREPRAAAAVLPSPDPAPLPPKRRGRPPKAAAAGARTLVGAFGSSKAALSTASAAAAGKRGGGGADSSGRATLGRGEVDEEEDALVPPGLLGVGGARPGEARQARTTKREAYIELSD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.67
3	0.66
4	0.69
5	0.68
6	0.68
7	0.72
8	0.71
9	0.68
10	0.68
11	0.7
12	0.71
13	0.75
14	0.71
15	0.68
16	0.71
17	0.69
18	0.63
19	0.61
20	0.6
21	0.58
22	0.57
23	0.53
24	0.47
25	0.44
26	0.41
27	0.37
28	0.31
29	0.24
30	0.25
31	0.25
32	0.26
33	0.26
34	0.27
35	0.24
36	0.21
37	0.24
38	0.2
39	0.23
40	0.23
41	0.23
42	0.22
43	0.25
44	0.26
45	0.28
46	0.34
47	0.3
48	0.29
49	0.3
50	0.3
51	0.27
52	0.26
53	0.2
54	0.15
55	0.16
56	0.15
57	0.13
58	0.14
59	0.19
60	0.27
61	0.31
62	0.36
63	0.46
64	0.54
65	0.62
66	0.68
67	0.69
68	0.7
69	0.74
70	0.74
71	0.71
72	0.63
73	0.57
74	0.54
75	0.46
76	0.39
77	0.31
78	0.28
79	0.28
80	0.31
81	0.35
82	0.37
83	0.42
84	0.42
85	0.47
86	0.48
87	0.42
88	0.36
89	0.31
90	0.27
91	0.22
92	0.19
93	0.13
94	0.1
95	0.09
96	0.11
97	0.1
98	0.11
99	0.12
100	0.15
101	0.17
102	0.2
103	0.21
104	0.23
105	0.25
106	0.23
107	0.25
108	0.23
109	0.27
110	0.25
111	0.28
112	0.29
113	0.28
114	0.28
115	0.32
116	0.39
117	0.38
118	0.4
119	0.41
120	0.38
121	0.39
122	0.39
123	0.35
124	0.3
125	0.29
126	0.29
127	0.25
128	0.24
129	0.21
130	0.21
131	0.21
132	0.19
133	0.17
134	0.18
135	0.22
136	0.26
137	0.32
138	0.39
139	0.47
140	0.56
141	0.57
142	0.59
143	0.59
144	0.57
145	0.52
146	0.45
147	0.37
148	0.27
149	0.23
150	0.17
151	0.15
152	0.13
153	0.11
154	0.11
155	0.11
156	0.13
157	0.2
158	0.25
159	0.29
160	0.34
161	0.44
162	0.5
163	0.57
164	0.61
165	0.64
166	0.6
167	0.57
168	0.51
169	0.45
170	0.36
171	0.28
172	0.22
173	0.15
174	0.17
175	0.15
176	0.14
177	0.11
178	0.1
179	0.11
180	0.13
181	0.12
182	0.12
183	0.17
184	0.26
185	0.28
186	0.31
187	0.32
188	0.32
189	0.35
190	0.36
191	0.33
192	0.31
193	0.3
194	0.27
195	0.27
196	0.25
197	0.21
198	0.17
199	0.16
200	0.1
201	0.11
202	0.11
203	0.14
204	0.15
205	0.18
206	0.18
207	0.23
208	0.25
209	0.24
210	0.27
211	0.24
212	0.24
213	0.22
214	0.21
215	0.15
216	0.12
217	0.12
218	0.09
219	0.08
220	0.06
221	0.08
222	0.08
223	0.08
224	0.09
225	0.09
226	0.11
227	0.13
228	0.15
229	0.15
230	0.19
231	0.18
232	0.18
233	0.19
234	0.22
235	0.23
236	0.28
237	0.27
238	0.29
239	0.33
240	0.41
241	0.45
242	0.46
243	0.51
244	0.48
245	0.5
246	0.47
247	0.42
248	0.35
249	0.3
250	0.24
251	0.17
252	0.13
253	0.09
254	0.08
255	0.08
256	0.07
257	0.07
258	0.08
259	0.08
260	0.1
261	0.12
262	0.12
263	0.14
264	0.16
265	0.18
266	0.2
267	0.21
268	0.19
269	0.2
270	0.19
271	0.18
272	0.18
273	0.15
274	0.14
275	0.13
276	0.14
277	0.13
278	0.12
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.1
283	0.11
284	0.1
285	0.09
286	0.1
287	0.1
288	0.1
289	0.12
290	0.11
291	0.11
292	0.11
293	0.11
294	0.1
295	0.11
296	0.1
297	0.09
298	0.11
299	0.12
300	0.12
301	0.12
302	0.15
303	0.15
304	0.14
305	0.14
306	0.13
307	0.11
308	0.12
309	0.13
310	0.11
311	0.11
312	0.14
313	0.12
314	0.14
315	0.14
316	0.13
317	0.14
318	0.12
319	0.12
320	0.1
321	0.12
322	0.12
323	0.14
324	0.17
325	0.16
326	0.19
327	0.21
328	0.22
329	0.19
330	0.23
331	0.27
332	0.27
333	0.32
334	0.32
335	0.32
336	0.3
337	0.3
338	0.25
339	0.19
340	0.16
341	0.11
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.04
352	0.03
353	0.04
354	0.04
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.07
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.09
363	0.07
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.1
368	0.1
369	0.1
370	0.09
371	0.08
372	0.08
373	0.13
374	0.14
375	0.15
376	0.15
377	0.16
378	0.17
379	0.18
380	0.2
381	0.16
382	0.15
383	0.14
384	0.13
385	0.12
386	0.1
387	0.1
388	0.09
389	0.09
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.07
402	0.07
403	0.1
404	0.15
405	0.15
406	0.14
407	0.15
408	0.15
409	0.16
410	0.16
411	0.14
412	0.15
413	0.15
414	0.15
415	0.14
416	0.13
417	0.12
418	0.13
419	0.12
420	0.08
421	0.08
422	0.08
423	0.09
424	0.1
425	0.11
426	0.11
427	0.13
428	0.16
429	0.22
430	0.32
431	0.4
432	0.43
433	0.5
434	0.52
435	0.6
436	0.66
437	0.7
438	0.71
439	0.74
440	0.82
441	0.85
442	0.84
443	0.83
444	0.75
445	0.68
446	0.62
447	0.6
448	0.56
449	0.47
450	0.44
451	0.37
452	0.35
453	0.31
454	0.28
455	0.27
456	0.26
457	0.26
458	0.27
459	0.29
460	0.28
461	0.29
462	0.25
463	0.19
464	0.14
465	0.12
466	0.1
467	0.08
468	0.09
469	0.08
470	0.07
471	0.06
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.06
482	0.08
483	0.09
484	0.1
485	0.11
486	0.11
487	0.12
488	0.13
489	0.11
490	0.09
491	0.08
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.03
502	0.04
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.06
507	0.06
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.07
512	0.08
513	0.08
514	0.08
515	0.08
516	0.09
517	0.1
518	0.09
519	0.08
520	0.08
521	0.07
522	0.06
523	0.05
524	0.03
525	0.02
526	0.02
527	0.02
528	0.02
529	0.02
530	0.03
531	0.04
532	0.04
533	0.05
534	0.05
535	0.06
536	0.08
537	0.08
538	0.07
539	0.08
540	0.08
541	0.08
542	0.1
543	0.09
544	0.08
545	0.07
546	0.08
547	0.07
548	0.07
549	0.07
550	0.05
551	0.05
552	0.07
553	0.07
554	0.08
555	0.1
556	0.12
557	0.16
558	0.21
559	0.29
560	0.32
561	0.34
562	0.39
563	0.45
564	0.45
565	0.47
566	0.5
567	0.51
568	0.57
569	0.61
570	0.61
571	0.57
572	0.59
573	0.57
574	0.54
575	0.47
576	0.44
577	0.48
578	0.53
579	0.57
580	0.57
581	0.63
582	0.71
583	0.78
584	0.78
585	0.76
586	0.73
587	0.73
588	0.71
589	0.64
590	0.54
591	0.47
592	0.4
593	0.31
594	0.25
595	0.15
596	0.13
597	0.1
598	0.08
599	0.05
600	0.05
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.07
605	0.06
606	0.08
607	0.08
608	0.11
609	0.14
610	0.17
611	0.2
612	0.27
613	0.3
614	0.3
615	0.34
616	0.35
617	0.31
618	0.29
619	0.26
620	0.21
621	0.18
622	0.21
623	0.18
624	0.14
625	0.17
626	0.18
627	0.21
628	0.22
629	0.22
630	0.19
631	0.18
632	0.19
633	0.19
634	0.2
635	0.19
636	0.18
637	0.2
638	0.19
639	0.22
640	0.27
641	0.3
642	0.34
643	0.33
644	0.34
645	0.37
646	0.36
647	0.34
648	0.31
649	0.29
650	0.24
651	0.23
652	0.2
653	0.15
654	0.15
655	0.16
656	0.15
657	0.19
658	0.26
659	0.32
660	0.4
661	0.5
662	0.56
663	0.67
664	0.76
665	0.78
666	0.81
667	0.82
668	0.83
669	0.78
670	0.77
671	0.68
672	0.63
673	0.55
674	0.45
675	0.38
676	0.28
677	0.22
678	0.17
679	0.14
680	0.09
681	0.07
682	0.07
683	0.09
684	0.09
685	0.09
686	0.09
687	0.09
688	0.09
689	0.09
690	0.1
691	0.09
692	0.09
693	0.1
694	0.1
695	0.1
696	0.13
697	0.11
698	0.09
699	0.09
700	0.09
701	0.08
702	0.09
703	0.09
704	0.1
705	0.13
706	0.14
707	0.14
708	0.14
709	0.14
710	0.14
711	0.13
712	0.15
713	0.14
714	0.14
715	0.14
716	0.17
717	0.18
718	0.21
719	0.2
720	0.16
721	0.14
722	0.14
723	0.14
724	0.12
725	0.11
726	0.08
727	0.07
728	0.07
729	0.06
730	0.05
731	0.04
732	0.05
733	0.06
734	0.07
735	0.07
736	0.08
737	0.09
738	0.09
739	0.19
740	0.21
741	0.25
742	0.32
743	0.42
744	0.48
745	0.54
746	0.6
747	0.58
748	0.61
749	0.6
750	0.55

A0A5C5FMD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer