FuNGI

A0A5C5FQU9

Protein Details

Accession

A0A5C5FQU9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
382-401	QAQHRANTRRKRTRDSESDS	Hydrophilic
491-524	EDVKPGKEKGVKKEKKERKDRGEGRKSKKVKAER	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
494-524	KPGKEKGVKKEKKERKDRGEGRKSKKVKAER

Subcellular Location(s)

mito 10, cyto 9.5, cyto_nucl 8, nucl 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MASSATATATATAAASLRLSSVSHPAAASSSSSPAMGSTNNDGEFITFKATMRLPISPRFAASNHPSAYPGHDQGMDGVREVLAAWVMRYLPPLRAVLLSFSPTPRFLHPAASFPASASPFDSSFAAPPHDPRSLLSSPQPHARDGGDDEEETVRFKSLPMVQGTGFTLANVEWEGVGWRPRVGMKLLGTLTLSSPSHVSLLLHNLFNASIPSSHLPTDQWEFDPDCAVPPIVLERRNAHVPLQGAVEGVRRTAEEETEARAGGGGDGLVAEGEEAEADEAVAEEDDDQAAEAEAEEEEDEALYAERGWWVHRTSREPLGGSDGRIEFTLVDLTTTNSLLSCTGSLLSDPFSPDALAALSAHRPSSADATLVKTKVLTTHAQAQHRANTRRKRTRDSESDSGSDSDSSASPAPAPGRGVRDDDDSDDGVDHDDDDGVGTGIPRHGVDAGAGAGGGTGVPRVGRALSTASSRSPTPGEGGRGRGREDAPEVEDVKPGKEKGVKKEKKERKDRGEGRKSKKVKAER

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.08
3	0.07
4	0.07
5	0.08
6	0.09
7	0.1
8	0.17
9	0.17
10	0.18
11	0.18
12	0.18
13	0.19
14	0.19
15	0.2
16	0.15
17	0.16
18	0.15
19	0.15
20	0.15
21	0.14
22	0.15
23	0.14
24	0.15
25	0.18
26	0.22
27	0.22
28	0.23
29	0.22
30	0.21
31	0.21
32	0.19
33	0.17
34	0.14
35	0.14
36	0.18
37	0.19
38	0.23
39	0.24
40	0.29
41	0.3
42	0.36
43	0.41
44	0.38
45	0.38
46	0.36
47	0.34
48	0.36
49	0.38
50	0.39
51	0.35
52	0.34
53	0.34
54	0.32
55	0.37
56	0.35
57	0.31
58	0.25
59	0.25
60	0.24
61	0.26
62	0.31
63	0.25
64	0.2
65	0.18
66	0.15
67	0.14
68	0.14
69	0.11
70	0.07
71	0.07
72	0.07
73	0.08
74	0.08
75	0.09
76	0.12
77	0.13
78	0.14
79	0.17
80	0.18
81	0.17
82	0.18
83	0.19
84	0.18
85	0.18
86	0.19
87	0.18
88	0.19
89	0.2
90	0.2
91	0.22
92	0.21
93	0.25
94	0.22
95	0.29
96	0.28
97	0.31
98	0.33
99	0.33
100	0.3
101	0.26
102	0.3
103	0.22
104	0.21
105	0.19
106	0.17
107	0.15
108	0.17
109	0.17
110	0.13
111	0.14
112	0.15
113	0.17
114	0.15
115	0.18
116	0.22
117	0.23
118	0.22
119	0.21
120	0.27
121	0.26
122	0.28
123	0.3
124	0.32
125	0.32
126	0.4
127	0.4
128	0.34
129	0.34
130	0.32
131	0.28
132	0.25
133	0.26
134	0.2
135	0.18
136	0.19
137	0.19
138	0.18
139	0.16
140	0.14
141	0.11
142	0.09
143	0.1
144	0.13
145	0.16
146	0.21
147	0.21
148	0.23
149	0.23
150	0.24
151	0.25
152	0.21
153	0.17
154	0.12
155	0.11
156	0.08
157	0.09
158	0.07
159	0.07
160	0.04
161	0.05
162	0.06
163	0.06
164	0.09
165	0.09
166	0.09
167	0.1
168	0.11
169	0.13
170	0.14
171	0.17
172	0.15
173	0.2
174	0.2
175	0.2
176	0.19
177	0.17
178	0.16
179	0.15
180	0.14
181	0.09
182	0.1
183	0.09
184	0.1
185	0.09
186	0.1
187	0.08
188	0.14
189	0.15
190	0.15
191	0.14
192	0.14
193	0.13
194	0.13
195	0.12
196	0.07
197	0.05
198	0.07
199	0.09
200	0.1
201	0.1
202	0.11
203	0.11
204	0.13
205	0.16
206	0.15
207	0.15
208	0.16
209	0.16
210	0.16
211	0.17
212	0.14
213	0.11
214	0.11
215	0.1
216	0.07
217	0.06
218	0.11
219	0.12
220	0.14
221	0.15
222	0.17
223	0.2
224	0.23
225	0.23
226	0.2
227	0.19
228	0.18
229	0.18
230	0.16
231	0.13
232	0.11
233	0.11
234	0.12
235	0.09
236	0.09
237	0.08
238	0.07
239	0.08
240	0.09
241	0.08
242	0.08
243	0.09
244	0.11
245	0.12
246	0.11
247	0.1
248	0.09
249	0.09
250	0.07
251	0.06
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.02
257	0.02
258	0.02
259	0.02
260	0.02
261	0.02
262	0.02
263	0.02
264	0.02
265	0.02
266	0.02
267	0.02
268	0.02
269	0.02
270	0.02
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.04
294	0.05
295	0.06
296	0.08
297	0.1
298	0.15
299	0.19
300	0.24
301	0.27
302	0.32
303	0.33
304	0.31
305	0.3
306	0.32
307	0.29
308	0.25
309	0.25
310	0.2
311	0.18
312	0.17
313	0.17
314	0.1
315	0.09
316	0.1
317	0.06
318	0.07
319	0.06
320	0.07
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.06
325	0.07
326	0.06
327	0.07
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.08
335	0.08
336	0.09
337	0.09
338	0.09
339	0.09
340	0.09
341	0.09
342	0.07
343	0.07
344	0.06
345	0.07
346	0.08
347	0.09
348	0.09
349	0.09
350	0.09
351	0.1
352	0.13
353	0.12
354	0.12
355	0.13
356	0.17
357	0.22
358	0.21
359	0.2
360	0.17
361	0.17
362	0.18
363	0.2
364	0.18
365	0.16
366	0.26
367	0.32
368	0.35
369	0.4
370	0.4
371	0.44
372	0.51
373	0.56
374	0.55
375	0.6
376	0.67
377	0.73
378	0.77
379	0.79
380	0.77
381	0.79
382	0.8
383	0.79
384	0.76
385	0.7
386	0.64
387	0.57
388	0.51
389	0.41
390	0.31
391	0.23
392	0.16
393	0.12
394	0.12
395	0.11
396	0.1
397	0.1
398	0.12
399	0.13
400	0.13
401	0.16
402	0.17
403	0.2
404	0.22
405	0.25
406	0.24
407	0.28
408	0.28
409	0.28
410	0.27
411	0.24
412	0.22
413	0.19
414	0.17
415	0.14
416	0.13
417	0.1
418	0.08
419	0.07
420	0.06
421	0.07
422	0.07
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.07
427	0.07
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.09
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.08
436	0.07
437	0.07
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.03
443	0.03
444	0.03
445	0.04
446	0.04
447	0.06
448	0.06
449	0.07
450	0.09
451	0.12
452	0.14
453	0.18
454	0.2
455	0.21
456	0.23
457	0.23
458	0.24
459	0.23
460	0.22
461	0.22
462	0.24
463	0.29
464	0.31
465	0.37
466	0.41
467	0.42
468	0.44
469	0.45
470	0.41
471	0.39
472	0.39
473	0.36
474	0.32
475	0.34
476	0.34
477	0.3
478	0.33
479	0.29
480	0.28
481	0.3
482	0.27
483	0.29
484	0.35
485	0.41
486	0.47
487	0.58
488	0.63
489	0.68
490	0.79
491	0.82
492	0.85
493	0.9
494	0.9
495	0.89
496	0.92
497	0.92
498	0.92
499	0.93
500	0.92
501	0.9
502	0.9
503	0.86
504	0.83

A0A5C5FQU9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer