Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FY89

Protein Details
Accession A0A5C5FY89    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
390-417LIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGEITMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
285-293KKPAAKKAR
397-408GFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MASREEAVRQTHLYVLSFLRAHSLPKTAAALIKELDKQPWTARELTLSGKEADEALAREELTGVELVGLVRARLEMRKEKDAEKAATKTDAKGAITLADSSSSSSSDSDSDSSSSSSSDSSSDEEEAKTDVKKADAPAKAASSSSSSSSSSSSDSSDSEEDEKKVASAKPAAATGASSSSSSSSSSSSSDSSDDESDKAVKARNPAAAPAAAAKAASPARSLAPPPTTPAPTTPAAAKTNGKKRKAASSSESSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDSDSDASAAAKKPAAKKARVASPAAAAAAPSPAPAAAPAPASTWSPRPLPPKQGGNGSGSGASTPRGGGGAGTTAERFRRVKAEEVVFVDERLKDNSFAARPAGMSDYGAKASADLIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGEITMASHSIKFNYDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.23
3 0.24
4 0.23
5 0.21
6 0.23
7 0.21
8 0.23
9 0.23
10 0.26
11 0.22
12 0.24
13 0.27
14 0.24
15 0.27
16 0.25
17 0.25
18 0.22
19 0.25
20 0.27
21 0.26
22 0.28
23 0.26
24 0.28
25 0.31
26 0.35
27 0.35
28 0.33
29 0.32
30 0.32
31 0.33
32 0.35
33 0.33
34 0.3
35 0.27
36 0.25
37 0.24
38 0.21
39 0.19
40 0.17
41 0.13
42 0.13
43 0.13
44 0.13
45 0.13
46 0.13
47 0.11
48 0.1
49 0.09
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.08
55 0.08
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.09
60 0.12
61 0.19
62 0.26
63 0.32
64 0.4
65 0.43
66 0.44
67 0.51
68 0.54
69 0.52
70 0.5
71 0.47
72 0.41
73 0.45
74 0.44
75 0.37
76 0.35
77 0.34
78 0.28
79 0.26
80 0.24
81 0.19
82 0.18
83 0.17
84 0.13
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.11
95 0.11
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.13
100 0.12
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.12
109 0.13
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.13
116 0.14
117 0.14
118 0.14
119 0.16
120 0.19
121 0.25
122 0.26
123 0.28
124 0.27
125 0.28
126 0.27
127 0.25
128 0.22
129 0.17
130 0.16
131 0.15
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.15
136 0.16
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.12
141 0.12
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.16
146 0.17
147 0.16
148 0.16
149 0.15
150 0.13
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.16
155 0.17
156 0.17
157 0.18
158 0.17
159 0.14
160 0.13
161 0.11
162 0.09
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.13
187 0.13
188 0.16
189 0.19
190 0.22
191 0.21
192 0.21
193 0.22
194 0.19
195 0.17
196 0.15
197 0.12
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.12
210 0.14
211 0.14
212 0.17
213 0.19
214 0.19
215 0.19
216 0.2
217 0.2
218 0.18
219 0.19
220 0.18
221 0.19
222 0.19
223 0.21
224 0.23
225 0.27
226 0.36
227 0.43
228 0.44
229 0.44
230 0.45
231 0.53
232 0.53
233 0.51
234 0.47
235 0.46
236 0.47
237 0.45
238 0.44
239 0.35
240 0.31
241 0.27
242 0.21
243 0.14
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.11
265 0.11
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.1
270 0.11
271 0.12
272 0.15
273 0.2
274 0.28
275 0.35
276 0.35
277 0.41
278 0.46
279 0.52
280 0.52
281 0.5
282 0.43
283 0.38
284 0.36
285 0.3
286 0.23
287 0.15
288 0.11
289 0.1
290 0.08
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.12
303 0.14
304 0.16
305 0.18
306 0.2
307 0.25
308 0.31
309 0.36
310 0.42
311 0.47
312 0.51
313 0.51
314 0.55
315 0.52
316 0.49
317 0.45
318 0.37
319 0.31
320 0.24
321 0.21
322 0.15
323 0.13
324 0.1
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.11
336 0.13
337 0.18
338 0.18
339 0.19
340 0.26
341 0.28
342 0.34
343 0.39
344 0.43
345 0.42
346 0.44
347 0.47
348 0.4
349 0.38
350 0.33
351 0.27
352 0.25
353 0.24
354 0.22
355 0.18
356 0.19
357 0.25
358 0.25
359 0.25
360 0.24
361 0.22
362 0.2
363 0.21
364 0.22
365 0.16
366 0.15
367 0.16
368 0.17
369 0.17
370 0.17
371 0.15
372 0.12
373 0.12
374 0.13
375 0.11
376 0.09
377 0.1
378 0.13
379 0.14
380 0.15
381 0.16
382 0.15
383 0.21
384 0.26
385 0.35
386 0.43
387 0.53
388 0.63
389 0.73
390 0.82
391 0.85
392 0.9
393 0.91
394 0.9
395 0.9
396 0.87
397 0.86
398 0.86
399 0.79
400 0.68
401 0.58
402 0.49
403 0.4
404 0.34
405 0.25
406 0.18
407 0.17
408 0.18