Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FNR9

Protein Details
Accession A0A5C5FNR9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-26DDAPTFTIKKRSKPRSSAASIRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
60-78RGKKTPAGRVKDREAPKAR
324-344RGGEGRRTARGKAEPGKTKGP
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.333, cyto 9, cyto_mito 7.833, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MEEDDAPTFTIKKRSKPRSSAASIRSSTAAPAASTDQPAGAQPAQDDDEDAGNVAVFRSRGKKTPAGRVKDREAPKARSRVSFGADDDDEGDSDASIVKRSTPTSTPRRLLRPTLPASSASSTSLASPAAGPAAAPPSVPTAEASPASRSVYSKEYLDELKRGQLSAPRAAPAAEGTGEGTGGFDELTKSKFGDEQLEDSTLFPSSDSIARAKARREEMRKAGISAPSRQLGGDDDGFVPLEVGFAHKGGDSRLVREEDELGDGDEDMAAFTDSLSRLPLGKRANAAAARALRAEMGEMIDEAELEVRDEDVEMREWEEAQIRRGGEGRRTARGKAEPGKTKGPYRPAPIPQSSTLPSLAAVSARLPAAITTLSASHTLDTGALAHFEQERADLDKQERELREEVEKVERKSRWFDEFKEQVEDWSAFLDEKFPQLEKIEAEYLSIQRERCSIVSQRRYADDADDVSLFTGAPIPSTFRPPPPSDAPHPAEGDLASQEDTAESPQDLAPRSRARATRRDARSARHSTPSTSSAPSSAYPDPIDSPGYASDTALSPPQRADLSAALTAQQDALASLFADVKAPDFRDPNLGIRARFEEWRERFRDEYDMTFAGLSLVQVWEFWARVEMAAWNPFEIDELPRTVSDLSAYQWHQNLSSYGHRTGARPGGDGEVGDEDDDDDDKPDESAEVVNALVTSVVIPRLERLARAAYDPLSSRQTVAALRVVDEVSYCVETSSPKFESLIHAFLHRLRLSIAHAHSLVLPHLASLALPSLAYDPSTFIARQHFLHRLLKLVRACQRWRRFMRALRVPALPVPVGEGEGGGGAVLEVGAGATFDELVQRELVARTMLPVLEAAWTTGGEEIARKVVDALPKDIPAALRRRLEGEEAVGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.69
3 0.76
4 0.81
5 0.81
6 0.84
7 0.84
8 0.8
9 0.78
10 0.69
11 0.63
12 0.55
13 0.45
14 0.38
15 0.31
16 0.25
17 0.16
18 0.17
19 0.19
20 0.19
21 0.21
22 0.2
23 0.18
24 0.17
25 0.18
26 0.21
27 0.17
28 0.16
29 0.15
30 0.18
31 0.19
32 0.19
33 0.19
34 0.15
35 0.16
36 0.15
37 0.15
38 0.11
39 0.09
40 0.09
41 0.08
42 0.09
43 0.08
44 0.12
45 0.19
46 0.22
47 0.29
48 0.35
49 0.44
50 0.48
51 0.59
52 0.65
53 0.67
54 0.73
55 0.74
56 0.74
57 0.75
58 0.74
59 0.74
60 0.72
61 0.72
62 0.71
63 0.73
64 0.71
65 0.66
66 0.67
67 0.61
68 0.57
69 0.53
70 0.46
71 0.42
72 0.38
73 0.34
74 0.29
75 0.25
76 0.2
77 0.17
78 0.15
79 0.09
80 0.08
81 0.1
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.12
86 0.15
87 0.18
88 0.22
89 0.25
90 0.34
91 0.43
92 0.52
93 0.56
94 0.6
95 0.66
96 0.67
97 0.69
98 0.67
99 0.67
100 0.63
101 0.61
102 0.55
103 0.49
104 0.48
105 0.43
106 0.37
107 0.29
108 0.24
109 0.2
110 0.19
111 0.18
112 0.14
113 0.11
114 0.1
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.12
125 0.13
126 0.14
127 0.13
128 0.12
129 0.15
130 0.17
131 0.18
132 0.17
133 0.18
134 0.2
135 0.21
136 0.2
137 0.2
138 0.22
139 0.23
140 0.21
141 0.21
142 0.22
143 0.26
144 0.28
145 0.29
146 0.26
147 0.3
148 0.3
149 0.29
150 0.28
151 0.28
152 0.3
153 0.33
154 0.33
155 0.28
156 0.27
157 0.27
158 0.26
159 0.21
160 0.18
161 0.11
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.06
173 0.07
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.13
179 0.14
180 0.2
181 0.21
182 0.23
183 0.24
184 0.26
185 0.25
186 0.23
187 0.22
188 0.16
189 0.14
190 0.1
191 0.08
192 0.09
193 0.11
194 0.12
195 0.13
196 0.17
197 0.21
198 0.25
199 0.29
200 0.34
201 0.4
202 0.47
203 0.52
204 0.56
205 0.58
206 0.63
207 0.6
208 0.56
209 0.52
210 0.49
211 0.45
212 0.42
213 0.39
214 0.32
215 0.31
216 0.28
217 0.25
218 0.21
219 0.21
220 0.17
221 0.15
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.13
226 0.11
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.17
238 0.16
239 0.18
240 0.23
241 0.24
242 0.24
243 0.24
244 0.25
245 0.17
246 0.18
247 0.16
248 0.12
249 0.1
250 0.1
251 0.08
252 0.07
253 0.06
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.03
258 0.03
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.1
265 0.1
266 0.17
267 0.18
268 0.2
269 0.21
270 0.22
271 0.27
272 0.26
273 0.26
274 0.24
275 0.23
276 0.21
277 0.2
278 0.19
279 0.14
280 0.12
281 0.12
282 0.08
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.1
305 0.15
306 0.15
307 0.15
308 0.18
309 0.17
310 0.18
311 0.22
312 0.23
313 0.22
314 0.3
315 0.31
316 0.35
317 0.37
318 0.37
319 0.39
320 0.4
321 0.42
322 0.42
323 0.47
324 0.47
325 0.49
326 0.55
327 0.52
328 0.54
329 0.53
330 0.53
331 0.49
332 0.47
333 0.5
334 0.49
335 0.53
336 0.5
337 0.49
338 0.43
339 0.41
340 0.37
341 0.32
342 0.26
343 0.2
344 0.17
345 0.14
346 0.12
347 0.09
348 0.07
349 0.06
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.11
379 0.12
380 0.13
381 0.15
382 0.17
383 0.19
384 0.24
385 0.23
386 0.23
387 0.23
388 0.23
389 0.24
390 0.23
391 0.22
392 0.26
393 0.29
394 0.27
395 0.33
396 0.33
397 0.32
398 0.37
399 0.38
400 0.37
401 0.36
402 0.38
403 0.4
404 0.43
405 0.42
406 0.41
407 0.38
408 0.3
409 0.3
410 0.26
411 0.17
412 0.13
413 0.12
414 0.07
415 0.07
416 0.09
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.09
423 0.11
424 0.09
425 0.11
426 0.12
427 0.11
428 0.11
429 0.11
430 0.12
431 0.13
432 0.14
433 0.12
434 0.11
435 0.12
436 0.13
437 0.12
438 0.15
439 0.19
440 0.26
441 0.33
442 0.35
443 0.36
444 0.36
445 0.37
446 0.34
447 0.29
448 0.21
449 0.15
450 0.13
451 0.12
452 0.1
453 0.09
454 0.08
455 0.07
456 0.05
457 0.07
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.09
462 0.1
463 0.15
464 0.17
465 0.17
466 0.22
467 0.24
468 0.29
469 0.31
470 0.35
471 0.34
472 0.4
473 0.4
474 0.38
475 0.37
476 0.32
477 0.27
478 0.23
479 0.19
480 0.12
481 0.09
482 0.07
483 0.06
484 0.06
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.09
493 0.1
494 0.11
495 0.16
496 0.18
497 0.2
498 0.24
499 0.29
500 0.32
501 0.4
502 0.45
503 0.49
504 0.51
505 0.59
506 0.56
507 0.57
508 0.6
509 0.59
510 0.56
511 0.53
512 0.5
513 0.43
514 0.44
515 0.42
516 0.35
517 0.3
518 0.27
519 0.2
520 0.21
521 0.19
522 0.2
523 0.17
524 0.16
525 0.15
526 0.15
527 0.16
528 0.15
529 0.16
530 0.11
531 0.12
532 0.11
533 0.12
534 0.11
535 0.1
536 0.09
537 0.09
538 0.1
539 0.12
540 0.12
541 0.1
542 0.1
543 0.13
544 0.12
545 0.12
546 0.13
547 0.11
548 0.13
549 0.13
550 0.13
551 0.12
552 0.12
553 0.12
554 0.09
555 0.08
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.05
563 0.05
564 0.06
565 0.06
566 0.07
567 0.09
568 0.1
569 0.12
570 0.13
571 0.14
572 0.19
573 0.2
574 0.22
575 0.27
576 0.28
577 0.26
578 0.27
579 0.3
580 0.26
581 0.27
582 0.27
583 0.3
584 0.32
585 0.39
586 0.4
587 0.4
588 0.4
589 0.39
590 0.43
591 0.34
592 0.32
593 0.29
594 0.26
595 0.23
596 0.21
597 0.19
598 0.13
599 0.11
600 0.09
601 0.05
602 0.05
603 0.05
604 0.05
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.07
609 0.07
610 0.07
611 0.07
612 0.08
613 0.09
614 0.1
615 0.14
616 0.14
617 0.12
618 0.12
619 0.12
620 0.12
621 0.12
622 0.11
623 0.1
624 0.11
625 0.12
626 0.12
627 0.13
628 0.12
629 0.12
630 0.11
631 0.1
632 0.09
633 0.14
634 0.15
635 0.17
636 0.19
637 0.19
638 0.19
639 0.19
640 0.2
641 0.18
642 0.24
643 0.25
644 0.24
645 0.28
646 0.29
647 0.29
648 0.32
649 0.34
650 0.28
651 0.25
652 0.25
653 0.23
654 0.22
655 0.21
656 0.17
657 0.12
658 0.11
659 0.1
660 0.09
661 0.07
662 0.07
663 0.08
664 0.07
665 0.07
666 0.07
667 0.08
668 0.08
669 0.08
670 0.07
671 0.07
672 0.08
673 0.07
674 0.07
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.06
679 0.05
680 0.04
681 0.04
682 0.05
683 0.06
684 0.06
685 0.07
686 0.08
687 0.13
688 0.14
689 0.14
690 0.16
691 0.19
692 0.19
693 0.21
694 0.23
695 0.19
696 0.21
697 0.22
698 0.23
699 0.22
700 0.22
701 0.2
702 0.19
703 0.2
704 0.19
705 0.19
706 0.2
707 0.17
708 0.18
709 0.18
710 0.17
711 0.15
712 0.14
713 0.13
714 0.1
715 0.11
716 0.1
717 0.08
718 0.09
719 0.11
720 0.14
721 0.19
722 0.18
723 0.18
724 0.19
725 0.2
726 0.26
727 0.28
728 0.29
729 0.24
730 0.24
731 0.24
732 0.26
733 0.33
734 0.26
735 0.22
736 0.2
737 0.2
738 0.23
739 0.29
740 0.28
741 0.24
742 0.24
743 0.24
744 0.25
745 0.24
746 0.21
747 0.15
748 0.13
749 0.09
750 0.09
751 0.08
752 0.07
753 0.07
754 0.07
755 0.06
756 0.06
757 0.07
758 0.08
759 0.08
760 0.09
761 0.09
762 0.09
763 0.1
764 0.13
765 0.13
766 0.14
767 0.19
768 0.21
769 0.24
770 0.28
771 0.33
772 0.36
773 0.42
774 0.4
775 0.42
776 0.42
777 0.46
778 0.44
779 0.46
780 0.49
781 0.5
782 0.58
783 0.61
784 0.68
785 0.72
786 0.75
787 0.76
788 0.77
789 0.77
790 0.8
791 0.79
792 0.77
793 0.71
794 0.66
795 0.59
796 0.53
797 0.48
798 0.37
799 0.27
800 0.23
801 0.19
802 0.17
803 0.15
804 0.12
805 0.09
806 0.08
807 0.08
808 0.05
809 0.04
810 0.03
811 0.03
812 0.03
813 0.02
814 0.02
815 0.02
816 0.02
817 0.02
818 0.03
819 0.03
820 0.03
821 0.04
822 0.06
823 0.07
824 0.09
825 0.09
826 0.09
827 0.12
828 0.12
829 0.14
830 0.12
831 0.12
832 0.12
833 0.14
834 0.14
835 0.12
836 0.12
837 0.11
838 0.12
839 0.12
840 0.11
841 0.09
842 0.09
843 0.09
844 0.1
845 0.1
846 0.08
847 0.1
848 0.11
849 0.14
850 0.14
851 0.13
852 0.14
853 0.18
854 0.24
855 0.26
856 0.29
857 0.28
858 0.29
859 0.3
860 0.3
861 0.3
862 0.3
863 0.34
864 0.37
865 0.38
866 0.39
867 0.42
868 0.43
869 0.44
870 0.39
871 0.38