Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5G3C3

Protein Details
Accession A0A5C5G3C3    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
767-787PQPPHPHQHQHQHQHQPQQHPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 8.5, extr 8, cyto_mito 8, cyto 6.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MHPKSSSARQGNPQGALSPAQDRFTWILLALVGHSVVATVKDGVRVKGILAAATPDGNDLSLALRHASYLHDPPSTPPKPSVLITGRDLLALEAADAALDFVGGGGAAGQQQAAGASNGASRPASAAGGAAHRDSFRTDTDISGGALGKERQLQAWGAGDATDDSGWGAATGDDALEGGLEDDLRRSGRGGGGGGGGAGAGGKGWDQFAANERRFGLKTDYDDEIYTTKLDRSGSDFKAREARAAQLEKEILKGTSPFANNAHVAEERGEQAPDSMNEEDRYGAVIRGDGAYVPPGARKAALARLSQNGGSVATSTSASAGGASRLPQPTSATSRIPQPPAAAGPGSAAAAAPPSIKAPSGVDSNKGLQHELQNFVTSERVRVEQKKEQMKQAQQQAQAQARKEQDSKLASLLQWSQTFKNPYPLPDDLAVVMGKKPAGEQGQKALSTQSNASPAVSPANTNRTLPAVSPSPSTSTTANAPAKTGSVLQAKAKPFIAEIPPFNPARAKSRQGEQQPSKAEAAAAPTASTSKAAAAPSTAAPAATLQAKAPTTKLSAASAAFVFKPNPGAATFTPGASAPRKPAASPAPPAEPPVPVNPFFGTKVIKKGSSSMHVKEDFTPFKNGVLPEPASIIPNWAGFTGKPYRAIFPQQLHPQGGPLTFADEAAAAAAAAQMGAPPSGMMDPNGAAAIAAAQQAHQAQLQAQAHHQAQQAAAAAAAAMMHGGPHPPPPPPMGLGAPFNPAAAAAMAAAGFRPPPPPPQGGFVPGPQPPHPHQHQHQHQHQPQQHPNAHHGPPRGPGGMPVPPPPFGQFGGPGGGGPPMPPFPPVSGPMFTSPNMQAQSPHAPHAGMPTGPPLPPQQQQPNGQGRPGGGYMPWTPPFVPVAGPGAPGGGVGGPGTPVQNGMGPPPPQFVPPPQQQQQQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.43
3 0.38
4 0.32
5 0.3
6 0.27
7 0.26
8 0.25
9 0.27
10 0.28
11 0.27
12 0.25
13 0.18
14 0.17
15 0.15
16 0.16
17 0.12
18 0.1
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.06
23 0.06
24 0.07
25 0.08
26 0.09
27 0.1
28 0.17
29 0.2
30 0.2
31 0.23
32 0.22
33 0.21
34 0.24
35 0.24
36 0.18
37 0.16
38 0.17
39 0.15
40 0.15
41 0.15
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.14
55 0.17
56 0.22
57 0.24
58 0.25
59 0.26
60 0.31
61 0.41
62 0.4
63 0.38
64 0.35
65 0.35
66 0.36
67 0.37
68 0.42
69 0.37
70 0.39
71 0.39
72 0.4
73 0.36
74 0.33
75 0.32
76 0.23
77 0.18
78 0.13
79 0.1
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.02
89 0.03
90 0.02
91 0.02
92 0.03
93 0.03
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.09
105 0.09
106 0.11
107 0.1
108 0.09
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.12
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.14
121 0.16
122 0.17
123 0.16
124 0.19
125 0.19
126 0.18
127 0.2
128 0.21
129 0.18
130 0.18
131 0.17
132 0.13
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.18
137 0.18
138 0.17
139 0.19
140 0.19
141 0.18
142 0.2
143 0.18
144 0.14
145 0.13
146 0.13
147 0.11
148 0.11
149 0.09
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.11
175 0.13
176 0.14
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.11
182 0.09
183 0.07
184 0.05
185 0.04
186 0.03
187 0.02
188 0.02
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.07
195 0.14
196 0.24
197 0.24
198 0.26
199 0.27
200 0.31
201 0.31
202 0.33
203 0.31
204 0.26
205 0.29
206 0.31
207 0.32
208 0.29
209 0.29
210 0.27
211 0.23
212 0.19
213 0.16
214 0.13
215 0.11
216 0.12
217 0.13
218 0.12
219 0.19
220 0.26
221 0.29
222 0.37
223 0.36
224 0.36
225 0.44
226 0.43
227 0.4
228 0.34
229 0.34
230 0.33
231 0.35
232 0.33
233 0.28
234 0.3
235 0.27
236 0.27
237 0.24
238 0.16
239 0.15
240 0.15
241 0.13
242 0.17
243 0.17
244 0.18
245 0.18
246 0.21
247 0.21
248 0.2
249 0.21
250 0.16
251 0.16
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.11
258 0.11
259 0.13
260 0.12
261 0.14
262 0.13
263 0.14
264 0.15
265 0.15
266 0.15
267 0.13
268 0.14
269 0.11
270 0.1
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.17
288 0.21
289 0.22
290 0.24
291 0.26
292 0.27
293 0.27
294 0.25
295 0.18
296 0.14
297 0.12
298 0.1
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.11
312 0.13
313 0.13
314 0.14
315 0.15
316 0.18
317 0.24
318 0.26
319 0.24
320 0.23
321 0.31
322 0.34
323 0.34
324 0.31
325 0.27
326 0.25
327 0.24
328 0.24
329 0.16
330 0.12
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.07
335 0.06
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.08
346 0.09
347 0.15
348 0.15
349 0.16
350 0.18
351 0.2
352 0.22
353 0.21
354 0.2
355 0.16
356 0.21
357 0.21
358 0.23
359 0.21
360 0.2
361 0.2
362 0.2
363 0.21
364 0.16
365 0.15
366 0.13
367 0.15
368 0.18
369 0.23
370 0.29
371 0.32
372 0.4
373 0.48
374 0.49
375 0.54
376 0.57
377 0.58
378 0.58
379 0.61
380 0.59
381 0.53
382 0.53
383 0.52
384 0.51
385 0.48
386 0.42
387 0.39
388 0.35
389 0.35
390 0.33
391 0.29
392 0.28
393 0.27
394 0.27
395 0.23
396 0.22
397 0.18
398 0.19
399 0.2
400 0.17
401 0.17
402 0.18
403 0.18
404 0.21
405 0.25
406 0.24
407 0.3
408 0.28
409 0.27
410 0.31
411 0.3
412 0.28
413 0.25
414 0.24
415 0.16
416 0.16
417 0.15
418 0.09
419 0.09
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.08
425 0.12
426 0.14
427 0.15
428 0.19
429 0.21
430 0.21
431 0.22
432 0.2
433 0.16
434 0.16
435 0.16
436 0.13
437 0.12
438 0.12
439 0.13
440 0.11
441 0.11
442 0.12
443 0.11
444 0.1
445 0.1
446 0.15
447 0.15
448 0.15
449 0.15
450 0.14
451 0.14
452 0.14
453 0.15
454 0.12
455 0.12
456 0.13
457 0.14
458 0.15
459 0.15
460 0.17
461 0.14
462 0.13
463 0.14
464 0.2
465 0.22
466 0.19
467 0.19
468 0.17
469 0.17
470 0.16
471 0.15
472 0.12
473 0.12
474 0.14
475 0.16
476 0.21
477 0.21
478 0.23
479 0.22
480 0.19
481 0.16
482 0.18
483 0.19
484 0.16
485 0.17
486 0.17
487 0.2
488 0.2
489 0.2
490 0.19
491 0.17
492 0.2
493 0.24
494 0.27
495 0.26
496 0.31
497 0.38
498 0.42
499 0.51
500 0.48
501 0.5
502 0.48
503 0.48
504 0.43
505 0.36
506 0.3
507 0.2
508 0.2
509 0.14
510 0.11
511 0.09
512 0.08
513 0.09
514 0.09
515 0.08
516 0.06
517 0.06
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.09
523 0.09
524 0.1
525 0.09
526 0.07
527 0.06
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.07
532 0.06
533 0.09
534 0.1
535 0.11
536 0.11
537 0.12
538 0.12
539 0.14
540 0.15
541 0.13
542 0.14
543 0.13
544 0.14
545 0.13
546 0.12
547 0.1
548 0.11
549 0.1
550 0.09
551 0.11
552 0.09
553 0.1
554 0.1
555 0.13
556 0.12
557 0.17
558 0.17
559 0.15
560 0.16
561 0.15
562 0.17
563 0.16
564 0.17
565 0.14
566 0.18
567 0.18
568 0.18
569 0.23
570 0.27
571 0.29
572 0.32
573 0.32
574 0.31
575 0.31
576 0.34
577 0.29
578 0.24
579 0.22
580 0.23
581 0.24
582 0.21
583 0.22
584 0.2
585 0.21
586 0.21
587 0.21
588 0.2
589 0.18
590 0.24
591 0.25
592 0.26
593 0.24
594 0.27
595 0.28
596 0.32
597 0.35
598 0.32
599 0.36
600 0.36
601 0.37
602 0.36
603 0.4
604 0.36
605 0.34
606 0.34
607 0.28
608 0.27
609 0.29
610 0.27
611 0.22
612 0.22
613 0.21
614 0.17
615 0.19
616 0.19
617 0.16
618 0.15
619 0.15
620 0.12
621 0.12
622 0.12
623 0.09
624 0.1
625 0.09
626 0.14
627 0.19
628 0.19
629 0.24
630 0.25
631 0.27
632 0.29
633 0.35
634 0.35
635 0.33
636 0.39
637 0.41
638 0.44
639 0.43
640 0.4
641 0.36
642 0.32
643 0.29
644 0.22
645 0.15
646 0.14
647 0.12
648 0.12
649 0.1
650 0.08
651 0.08
652 0.06
653 0.06
654 0.03
655 0.03
656 0.03
657 0.03
658 0.03
659 0.03
660 0.03
661 0.03
662 0.03
663 0.03
664 0.03
665 0.04
666 0.05
667 0.06
668 0.06
669 0.07
670 0.07
671 0.08
672 0.08
673 0.07
674 0.06
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.07
682 0.07
683 0.08
684 0.08
685 0.08
686 0.08
687 0.16
688 0.18
689 0.18
690 0.19
691 0.23
692 0.23
693 0.28
694 0.28
695 0.22
696 0.2
697 0.2
698 0.2
699 0.15
700 0.14
701 0.09
702 0.08
703 0.06
704 0.06
705 0.04
706 0.03
707 0.02
708 0.03
709 0.03
710 0.04
711 0.05
712 0.09
713 0.11
714 0.13
715 0.15
716 0.17
717 0.19
718 0.2
719 0.22
720 0.21
721 0.22
722 0.23
723 0.23
724 0.23
725 0.21
726 0.19
727 0.16
728 0.13
729 0.11
730 0.08
731 0.07
732 0.04
733 0.04
734 0.04
735 0.04
736 0.05
737 0.04
738 0.05
739 0.05
740 0.08
741 0.1
742 0.15
743 0.21
744 0.26
745 0.27
746 0.32
747 0.34
748 0.36
749 0.37
750 0.33
751 0.33
752 0.3
753 0.33
754 0.3
755 0.34
756 0.32
757 0.39
758 0.42
759 0.47
760 0.52
761 0.59
762 0.67
763 0.71
764 0.77
765 0.8
766 0.79
767 0.81
768 0.8
769 0.79
770 0.77
771 0.77
772 0.73
773 0.66
774 0.67
775 0.65
776 0.63
777 0.59
778 0.55
779 0.48
780 0.46
781 0.47
782 0.42
783 0.34
784 0.31
785 0.3
786 0.32
787 0.32
788 0.34
789 0.32
790 0.32
791 0.33
792 0.33
793 0.31
794 0.26
795 0.26
796 0.21
797 0.2
798 0.21
799 0.19
800 0.17
801 0.15
802 0.15
803 0.12
804 0.1
805 0.12
806 0.11
807 0.12
808 0.13
809 0.14
810 0.16
811 0.2
812 0.23
813 0.25
814 0.24
815 0.27
816 0.29
817 0.3
818 0.27
819 0.28
820 0.27
821 0.29
822 0.28
823 0.26
824 0.24
825 0.27
826 0.37
827 0.34
828 0.35
829 0.3
830 0.29
831 0.29
832 0.33
833 0.31
834 0.21
835 0.2
836 0.21
837 0.22
838 0.22
839 0.24
840 0.24
841 0.26
842 0.3
843 0.38
844 0.44
845 0.49
846 0.56
847 0.63
848 0.68
849 0.64
850 0.62
851 0.55
852 0.46
853 0.42
854 0.37
855 0.28
856 0.18
857 0.2
858 0.22
859 0.26
860 0.27
861 0.25
862 0.25
863 0.26
864 0.27
865 0.24
866 0.22
867 0.17
868 0.19
869 0.18
870 0.18
871 0.16
872 0.15
873 0.14
874 0.12
875 0.11
876 0.06
877 0.06
878 0.05
879 0.05
880 0.06
881 0.07
882 0.08
883 0.08
884 0.08
885 0.09
886 0.12
887 0.13
888 0.15
889 0.22
890 0.23
891 0.25
892 0.28
893 0.28
894 0.27
895 0.31
896 0.35
897 0.37
898 0.44
899 0.52
900 0.56