Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FW52

Protein Details
Accession A0A5C5FW52    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
246-270QSRHSSSPKTPRRRRSSPPRRAPLPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
248-289RHSSSPKTPRRRRSSPPRRAPLPPAPPLVPTPPAPPRPARPP
Subcellular Location(s) plas 16, nucl 5.5, E.R. 4, cyto_nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR002716  PIN_dom  
Gene Ontology GO:0004540  F:RNA nuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13638  PIN_4  
CDD cd18727  PIN_Swt1-like  
Amino Acid Sequences MDEDEPPATQDVLDAVSSLRSGEDGCAQMQLDLPWELDGGAPPGGGGLVVVVVVDTNILIGHLALLRDFVDLASSPSLPEPHRPTLLVPHVVVAELDGLKASSRLAEPTRRGTGVRAQSSIAALARAATNWLLDALAPGRASAIVRGQRKGETLFGSRGPPPGESNDSLVLDAALYHVQRAGRAVLLTDDRNLRLRATIEQVEALGVDDDLDARRLLERLSPAAVNPGSPPRGQAPEPRPPLSPEQSRHSSSPKTPRRRRSSPPRRAPLPPAPPLVPTPPAPPRPARPPRAFSMELDPPTPPPLHASLEPPPLWPVQRPPDIFRNASALLAHFVALPLFRHAFEHLRRTKPAEQGRWQDEMGDWRDWTATECVEAVRRWWDEGDVAGLCRIGLEAAAAAGPPRDATALARRAPQKAAPTSPRAAGASDSRWASAAPFTTRAPLAPTPASPPSTSRRPVPSVDTQLRDLHSSLPILSLSLSVPPDSTSTWSAPRWEVLLEGFAALLLALLGGAVRGDVRDDVGKIVGEWVRDLEGLGIRVQVEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.08
7 0.07
8 0.08
9 0.09
10 0.14
11 0.15
12 0.15
13 0.17
14 0.17
15 0.17
16 0.18
17 0.17
18 0.15
19 0.14
20 0.14
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.1
25 0.11
26 0.1
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.07
32 0.06
33 0.05
34 0.03
35 0.03
36 0.03
37 0.03
38 0.03
39 0.03
40 0.03
41 0.03
42 0.03
43 0.03
44 0.03
45 0.03
46 0.03
47 0.03
48 0.05
49 0.06
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.1
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.13
64 0.17
65 0.17
66 0.25
67 0.29
68 0.33
69 0.35
70 0.35
71 0.35
72 0.41
73 0.46
74 0.41
75 0.34
76 0.3
77 0.28
78 0.28
79 0.25
80 0.17
81 0.13
82 0.09
83 0.09
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.08
91 0.12
92 0.17
93 0.24
94 0.28
95 0.35
96 0.39
97 0.38
98 0.38
99 0.37
100 0.41
101 0.42
102 0.42
103 0.36
104 0.33
105 0.32
106 0.32
107 0.31
108 0.22
109 0.13
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.09
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.06
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.15
131 0.2
132 0.23
133 0.25
134 0.27
135 0.28
136 0.3
137 0.3
138 0.27
139 0.24
140 0.25
141 0.26
142 0.26
143 0.27
144 0.26
145 0.28
146 0.25
147 0.23
148 0.21
149 0.23
150 0.26
151 0.24
152 0.25
153 0.24
154 0.23
155 0.22
156 0.2
157 0.15
158 0.1
159 0.09
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.1
168 0.1
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.12
174 0.13
175 0.14
176 0.15
177 0.15
178 0.19
179 0.19
180 0.17
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.2
185 0.21
186 0.18
187 0.18
188 0.17
189 0.15
190 0.14
191 0.11
192 0.07
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.16
211 0.15
212 0.13
213 0.13
214 0.16
215 0.16
216 0.16
217 0.17
218 0.16
219 0.19
220 0.2
221 0.27
222 0.29
223 0.37
224 0.42
225 0.42
226 0.4
227 0.4
228 0.44
229 0.42
230 0.42
231 0.37
232 0.38
233 0.41
234 0.43
235 0.42
236 0.41
237 0.38
238 0.38
239 0.45
240 0.49
241 0.55
242 0.61
243 0.69
244 0.74
245 0.78
246 0.82
247 0.82
248 0.84
249 0.84
250 0.86
251 0.83
252 0.78
253 0.74
254 0.71
255 0.69
256 0.64
257 0.57
258 0.49
259 0.42
260 0.39
261 0.37
262 0.32
263 0.25
264 0.19
265 0.2
266 0.23
267 0.25
268 0.27
269 0.28
270 0.3
271 0.38
272 0.46
273 0.5
274 0.49
275 0.5
276 0.51
277 0.56
278 0.53
279 0.43
280 0.41
281 0.37
282 0.33
283 0.3
284 0.26
285 0.2
286 0.21
287 0.2
288 0.14
289 0.11
290 0.13
291 0.14
292 0.15
293 0.18
294 0.2
295 0.25
296 0.25
297 0.23
298 0.22
299 0.21
300 0.21
301 0.19
302 0.21
303 0.22
304 0.28
305 0.3
306 0.32
307 0.39
308 0.42
309 0.41
310 0.36
311 0.34
312 0.28
313 0.26
314 0.23
315 0.15
316 0.12
317 0.12
318 0.11
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.11
329 0.17
330 0.2
331 0.3
332 0.34
333 0.38
334 0.39
335 0.45
336 0.49
337 0.52
338 0.57
339 0.55
340 0.56
341 0.6
342 0.62
343 0.58
344 0.52
345 0.44
346 0.37
347 0.35
348 0.31
349 0.24
350 0.2
351 0.17
352 0.18
353 0.17
354 0.18
355 0.14
356 0.1
357 0.09
358 0.1
359 0.1
360 0.13
361 0.13
362 0.12
363 0.16
364 0.16
365 0.17
366 0.17
367 0.17
368 0.15
369 0.15
370 0.16
371 0.11
372 0.11
373 0.1
374 0.09
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.04
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.05
392 0.08
393 0.17
394 0.22
395 0.25
396 0.31
397 0.33
398 0.35
399 0.37
400 0.38
401 0.38
402 0.37
403 0.43
404 0.43
405 0.46
406 0.46
407 0.45
408 0.43
409 0.36
410 0.31
411 0.26
412 0.24
413 0.21
414 0.23
415 0.22
416 0.2
417 0.19
418 0.18
419 0.17
420 0.16
421 0.17
422 0.16
423 0.18
424 0.19
425 0.21
426 0.22
427 0.21
428 0.23
429 0.21
430 0.23
431 0.22
432 0.23
433 0.25
434 0.29
435 0.31
436 0.26
437 0.29
438 0.31
439 0.37
440 0.4
441 0.41
442 0.44
443 0.45
444 0.48
445 0.5
446 0.52
447 0.54
448 0.58
449 0.55
450 0.51
451 0.51
452 0.49
453 0.44
454 0.36
455 0.29
456 0.24
457 0.22
458 0.19
459 0.17
460 0.15
461 0.13
462 0.12
463 0.11
464 0.09
465 0.11
466 0.12
467 0.11
468 0.11
469 0.12
470 0.13
471 0.14
472 0.17
473 0.17
474 0.19
475 0.24
476 0.25
477 0.28
478 0.28
479 0.28
480 0.26
481 0.23
482 0.21
483 0.18
484 0.17
485 0.14
486 0.12
487 0.1
488 0.09
489 0.08
490 0.06
491 0.05
492 0.03
493 0.02
494 0.02
495 0.02
496 0.02
497 0.02
498 0.02
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.05
503 0.06
504 0.09
505 0.12
506 0.13
507 0.14
508 0.16
509 0.16
510 0.14
511 0.2
512 0.19
513 0.17
514 0.17
515 0.17
516 0.17
517 0.17
518 0.17
519 0.14
520 0.16
521 0.16
522 0.16
523 0.16