FuNGI

A0A5C5G5B5

Protein Details

Accession

A0A5C5G5B5

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
25-52	DAYSPSPPRRGNKASRRKRSASNRSTSP	Hydrophilic
154-180	LRTDYVKEKRGRPKDKGKKKSGHVSSD	Basic
237-267	TPHMSKPRDPDRPSKRKKKKLDSDGNEKVPK	Basic
669-692	AATAGPRPEPKKRGRKIQEAVESD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
32-47	PRRGNKASRRKRSASN
160-174	KEKRGRPKDKGKKKS
242-283	KPRDPDRPSKRKKKKLDSDGNEKVPKPHKIRLYGSHPTKKAK
674-684	PRPEPKKRGRK

Subcellular Location(s)

cyto 4.5, cyto_nucl 13.5, nucl 21.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010347 Tdp1
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0008081 F:phosphoric diester hydrolase activity GO:0006281 P:DNA repair

Amino Acid Sequences

MPKKRQRTPELDLTGFSSSDSDSDDAYSPSPPRRGNKASRRKRSASNRSTSPGRGHGQEVPLHAQFAATSAFLAPKSGAFGGPGTGVAARPKIRLRSQDDGKGGTVMVKVVEGEEPAPRQAAPDGVLKFTFLDAGAPSQGDQLAKLEHPEGTLLRTDYVKEKRGRPKDKGKKKSGHVSSDEDDDDASPSVTPALDSDDEDFVNLDSIVGKDAGWSTVRALVAAPSMQIPWLDNRFATPHMSKPRDPDRPSKRKKKKLDSDGNEKVPKPHKIRLYGSHPTKKAKDVKPPLLLVHHEPIKHPLKDTTLSHTPDVDLGKDVNGGMHASFFLIVRKTPLSSRHHLRLAICTASGEEDCWKKTENAIWMQDFPQLAAPVKAVANPTHTDFSRAFLSFLSSPQLGLMSNAQHSVFVNALGGFDFGKSRNVQLVSSLAGTFSGEGGLSEAGGLDSLAQAIDRLEARPSGKWKVEYLTATTDKLPRRFLELLHAAAQGIPPREYELQRSERAQHASRLWHAATKGDKVVVVYPTEAALDEAAGKNKEEKYHVRWEGRCWDELKSRDQRKTVLRKAMMLIVHQPMDSDKGDADDPDAAEQYEAFLLVGSHTPTLASWGEDNLSPSSPSSPSVTIAQHDLSAVYRCAAAPTWAELKEEIDELVPYQRPLKKYAEGDEPAATAGPRPEPKKRGRKIQEAVESD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.39
3	0.31
4	0.21
5	0.14
6	0.13
7	0.15
8	0.12
9	0.11
10	0.14
11	0.15
12	0.15
13	0.16
14	0.19
15	0.2
16	0.26
17	0.32
18	0.36
19	0.41
20	0.5
21	0.58
22	0.65
23	0.72
24	0.77
25	0.82
26	0.86
27	0.89
28	0.86
29	0.87
30	0.87
31	0.87
32	0.86
33	0.84
34	0.8
35	0.77
36	0.76
37	0.7
38	0.64
39	0.61
40	0.54
41	0.48
42	0.45
43	0.44
44	0.43
45	0.42
46	0.4
47	0.38
48	0.34
49	0.32
50	0.28
51	0.23
52	0.18
53	0.16
54	0.14
55	0.08
56	0.08
57	0.08
58	0.1
59	0.1
60	0.11
61	0.1
62	0.09
63	0.12
64	0.13
65	0.12
66	0.11
67	0.12
68	0.12
69	0.12
70	0.12
71	0.09
72	0.09
73	0.1
74	0.12
75	0.16
76	0.17
77	0.21
78	0.27
79	0.33
80	0.39
81	0.47
82	0.52
83	0.57
84	0.62
85	0.66
86	0.63
87	0.59
88	0.53
89	0.45
90	0.37
91	0.29
92	0.23
93	0.15
94	0.12
95	0.1
96	0.09
97	0.09
98	0.1
99	0.08
100	0.09
101	0.11
102	0.13
103	0.13
104	0.14
105	0.13
106	0.13
107	0.14
108	0.14
109	0.13
110	0.19
111	0.19
112	0.2
113	0.2
114	0.2
115	0.19
116	0.17
117	0.16
118	0.09
119	0.09
120	0.08
121	0.1
122	0.1
123	0.1
124	0.1
125	0.1
126	0.12
127	0.1
128	0.1
129	0.1
130	0.11
131	0.12
132	0.13
133	0.13
134	0.12
135	0.12
136	0.14
137	0.13
138	0.12
139	0.15
140	0.14
141	0.14
142	0.14
143	0.16
144	0.22
145	0.27
146	0.34
147	0.37
148	0.45
149	0.54
150	0.65
151	0.72
152	0.73
153	0.79
154	0.82
155	0.87
156	0.88
157	0.88
158	0.86
159	0.85
160	0.87
161	0.83
162	0.8
163	0.74
164	0.69
165	0.61
166	0.56
167	0.48
168	0.38
169	0.3
170	0.22
171	0.19
172	0.13
173	0.11
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.06
179	0.05
180	0.09
181	0.09
182	0.1
183	0.12
184	0.13
185	0.13
186	0.13
187	0.13
188	0.09
189	0.09
190	0.08
191	0.06
192	0.05
193	0.05
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.07
199	0.08
200	0.08
201	0.09
202	0.09
203	0.12
204	0.12
205	0.11
206	0.11
207	0.1
208	0.11
209	0.1
210	0.09
211	0.06
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.1
217	0.13
218	0.13
219	0.13
220	0.14
221	0.16
222	0.17
223	0.21
224	0.18
225	0.23
226	0.32
227	0.37
228	0.37
229	0.42
230	0.51
231	0.56
232	0.58
233	0.61
234	0.63
235	0.69
236	0.78
237	0.82
238	0.84
239	0.85
240	0.91
241	0.92
242	0.91
243	0.91
244	0.92
245	0.88
246	0.87
247	0.85
248	0.81
249	0.74
250	0.64
251	0.59
252	0.54
253	0.55
254	0.5
255	0.49
256	0.48
257	0.51
258	0.55
259	0.56
260	0.58
261	0.59
262	0.62
263	0.63
264	0.61
265	0.59
266	0.56
267	0.57
268	0.58
269	0.55
270	0.57
271	0.58
272	0.62
273	0.62
274	0.61
275	0.54
276	0.48
277	0.44
278	0.36
279	0.32
280	0.27
281	0.23
282	0.22
283	0.28
284	0.32
285	0.31
286	0.29
287	0.26
288	0.26
289	0.3
290	0.3
291	0.3
292	0.3
293	0.31
294	0.31
295	0.29
296	0.26
297	0.24
298	0.23
299	0.17
300	0.11
301	0.09
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.05
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.08
318	0.09
319	0.09
320	0.12
321	0.19
322	0.23
323	0.29
324	0.34
325	0.37
326	0.39
327	0.41
328	0.39
329	0.36
330	0.32
331	0.27
332	0.21
333	0.16
334	0.13
335	0.13
336	0.12
337	0.08
338	0.08
339	0.09
340	0.1
341	0.11
342	0.12
343	0.11
344	0.13
345	0.16
346	0.19
347	0.22
348	0.25
349	0.25
350	0.25
351	0.25
352	0.26
353	0.22
354	0.17
355	0.14
356	0.12
357	0.11
358	0.1
359	0.1
360	0.08
361	0.09
362	0.1
363	0.09
364	0.09
365	0.12
366	0.12
367	0.15
368	0.16
369	0.16
370	0.18
371	0.17
372	0.18
373	0.19
374	0.18
375	0.16
376	0.14
377	0.17
378	0.14
379	0.14
380	0.15
381	0.11
382	0.11
383	0.1
384	0.11
385	0.08
386	0.08
387	0.09
388	0.08
389	0.08
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.09
394	0.09
395	0.08
396	0.07
397	0.07
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.05
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.09
407	0.09
408	0.1
409	0.14
410	0.15
411	0.15
412	0.15
413	0.15
414	0.13
415	0.14
416	0.13
417	0.09
418	0.08
419	0.08
420	0.07
421	0.05
422	0.04
423	0.03
424	0.03
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.05
441	0.06
442	0.06
443	0.07
444	0.1
445	0.11
446	0.15
447	0.19
448	0.23
449	0.26
450	0.27
451	0.28
452	0.28
453	0.31
454	0.29
455	0.28
456	0.29
457	0.27
458	0.27
459	0.27
460	0.31
461	0.31
462	0.33
463	0.34
464	0.28
465	0.33
466	0.33
467	0.31
468	0.34
469	0.32
470	0.31
471	0.3
472	0.29
473	0.22
474	0.21
475	0.22
476	0.17
477	0.15
478	0.13
479	0.11
480	0.15
481	0.19
482	0.2
483	0.24
484	0.28
485	0.32
486	0.35
487	0.37
488	0.37
489	0.39
490	0.43
491	0.4
492	0.38
493	0.37
494	0.38
495	0.38
496	0.39
497	0.34
498	0.32
499	0.29
500	0.29
501	0.28
502	0.27
503	0.26
504	0.22
505	0.22
506	0.2
507	0.23
508	0.2
509	0.18
510	0.15
511	0.14
512	0.13
513	0.13
514	0.12
515	0.09
516	0.07
517	0.06
518	0.07
519	0.08
520	0.11
521	0.12
522	0.12
523	0.17
524	0.19
525	0.22
526	0.26
527	0.31
528	0.34
529	0.44
530	0.52
531	0.55
532	0.55
533	0.58
534	0.62
535	0.59
536	0.55
537	0.46
538	0.44
539	0.44
540	0.45
541	0.48
542	0.49
543	0.54
544	0.57
545	0.58
546	0.6
547	0.62
548	0.7
549	0.69
550	0.69
551	0.63
552	0.6
553	0.59
554	0.57
555	0.48
556	0.39
557	0.35
558	0.28
559	0.27
560	0.24
561	0.22
562	0.18
563	0.2
564	0.19
565	0.15
566	0.12
567	0.13
568	0.14
569	0.14
570	0.15
571	0.13
572	0.13
573	0.14
574	0.14
575	0.12
576	0.11
577	0.11
578	0.1
579	0.08
580	0.08
581	0.06
582	0.05
583	0.05
584	0.06
585	0.09
586	0.09
587	0.09
588	0.08
589	0.09
590	0.08
591	0.12
592	0.12
593	0.12
594	0.11
595	0.12
596	0.14
597	0.15
598	0.18
599	0.16
600	0.16
601	0.15
602	0.16
603	0.17
604	0.17
605	0.18
606	0.19
607	0.18
608	0.19
609	0.23
610	0.24
611	0.23
612	0.25
613	0.24
614	0.2
615	0.19
616	0.18
617	0.15
618	0.16
619	0.15
620	0.13
621	0.13
622	0.12
623	0.14
624	0.14
625	0.15
626	0.13
627	0.17
628	0.22
629	0.22
630	0.23
631	0.22
632	0.23
633	0.22
634	0.21
635	0.17
636	0.13
637	0.12
638	0.12
639	0.17
640	0.17
641	0.17
642	0.24
643	0.29
644	0.3
645	0.35
646	0.4
647	0.42
648	0.45
649	0.5
650	0.52
651	0.5
652	0.51
653	0.47
654	0.42
655	0.34
656	0.3
657	0.24
658	0.16
659	0.17
660	0.21
661	0.27
662	0.33
663	0.42
664	0.5
665	0.61
666	0.7
667	0.76
668	0.8
669	0.82
670	0.87
671	0.86
672	0.87

A0A5C5G5B5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer