FuNGI

A0A5C5G5Y9

Protein Details

Accession

A0A5C5G5Y9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
77-100	SASPSSKHPLKRTRSSVKHPSGAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
86-105	LKRTRSSVKHPSGASEKRIK

Subcellular Location(s)

cyto 6.5, cyto_nucl 6.5, mito 6, nucl 5.5, extr 5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MAPWLQALAHHPVWTLPPPSSSSNPLDPTNHHRAPHLARTPDSRALGRSAPLSHSASSRSLFGLAASTGASSPSPSSASPSSKHPLKRTRSSVKHPSGASEKRIKGGRTTRVVVVRGTDLVVAVGSELRLASLADVKSRCSEDDDDIPADDIDLGDYKVRLPLLALPDVCLPAQVLNTPAITFEIQQLVVNPTSKLLAVVGAHSVVVVVLPRRGWTNSVGKTLECRCLPVGAFYHSLPGSPSFASALWHPLGRDASSLLILTSDSTLREYTVSSSLDEPSQTLSFSRASTSAGPGAAAAATPTRGFGLSGVDRDAQTAVALCVGEGKGDWGPLTLYALMRNGDIVSLCPFLPKKACLSPAYVHALSAFVSTKVDYLSSSADPFASSSTPAASALDKRYSLQQQYVNSLVRQITTLPPSSSASSSSSLGPRALLASVGAGEPLVAGGDDGADEAHDPSAPRSVVAPSRPALAPRLQGPFLLQPAPAELDNGADGAACDLAYLSYVPSSPSSSSAGGDGQGEGEGEGVGVLAVAYRDGKVDLCLEVEKVEARFVGEATTPTPARTGAVVLHRSKRKGRGFGLDSESDDDEAQDDDAAERDEDSAADLPALAVYESLDLGLASAVSPAGDERVVSRALAHNAPTIVRDPLYADTLYVRHALGAHALFMGGWLRPVADALRGADGAEDDALEKDLGAVLKEARGTEVCWVLETAGAPPGADDDDEEEGAAPPPPVEGLALVNDVYLGYSLLLVTAKLQPVGVELALRIDPAAATFQDDPAAAAAPGTPAKPAPAAAAPAEPAYVSLLSTPFTVPALLAPRAPGQLPALPRLPSTKTELRITPDTLRQLGKHVSATQTAVRDLVGAAGNVSARVELQMRELARQVGKLRELEDRRAELGRSVGAAGAGAGGLEARVRAAEDTQQALLARTDRVLQRLVEAHQPQVSAVERKWFDELERLREQVEGGEDEDERQGAGGDSLAGRAQRLEAQMELLRPALEELRRKEDARRGGAWGGTPARAGSGGMGRAQLGKVEGLLSDEAKLLADATRKVERLTSTLAQASFAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.28
3	0.22
4	0.23
5	0.27
6	0.32
7	0.35
8	0.37
9	0.38
10	0.42
11	0.44
12	0.45
13	0.45
14	0.45
15	0.49
16	0.53
17	0.52
18	0.46
19	0.45
20	0.49
21	0.53
22	0.58
23	0.58
24	0.53
25	0.52
26	0.58
27	0.62
28	0.61
29	0.57
30	0.49
31	0.43
32	0.42
33	0.41
34	0.37
35	0.34
36	0.29
37	0.28
38	0.31
39	0.32
40	0.29
41	0.29
42	0.3
43	0.29
44	0.28
45	0.27
46	0.22
47	0.2
48	0.19
49	0.17
50	0.16
51	0.12
52	0.11
53	0.1
54	0.09
55	0.09
56	0.1
57	0.09
58	0.08
59	0.09
60	0.11
61	0.12
62	0.12
63	0.18
64	0.23
65	0.27
66	0.28
67	0.34
68	0.4
69	0.46
70	0.53
71	0.57
72	0.61
73	0.66
74	0.74
75	0.77
76	0.8
77	0.82
78	0.84
79	0.86
80	0.84
81	0.82
82	0.72
83	0.68
84	0.67
85	0.64
86	0.62
87	0.61
88	0.54
89	0.54
90	0.59
91	0.54
92	0.54
93	0.57
94	0.58
95	0.56
96	0.57
97	0.57
98	0.57
99	0.58
100	0.49
101	0.43
102	0.36
103	0.29
104	0.26
105	0.2
106	0.14
107	0.12
108	0.11
109	0.08
110	0.06
111	0.06
112	0.05
113	0.05
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.05
118	0.06
119	0.11
120	0.12
121	0.17
122	0.18
123	0.2
124	0.23
125	0.25
126	0.25
127	0.25
128	0.27
129	0.26
130	0.31
131	0.33
132	0.31
133	0.29
134	0.29
135	0.24
136	0.21
137	0.16
138	0.11
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.09
144	0.09
145	0.11
146	0.11
147	0.1
148	0.1
149	0.15
150	0.18
151	0.23
152	0.22
153	0.21
154	0.23
155	0.24
156	0.23
157	0.18
158	0.14
159	0.1
160	0.11
161	0.11
162	0.11
163	0.11
164	0.12
165	0.11
166	0.11
167	0.12
168	0.12
169	0.11
170	0.12
171	0.13
172	0.13
173	0.13
174	0.15
175	0.16
176	0.18
177	0.18
178	0.16
179	0.14
180	0.14
181	0.14
182	0.13
183	0.09
184	0.1
185	0.09
186	0.1
187	0.1
188	0.09
189	0.09
190	0.08
191	0.08
192	0.05
193	0.05
194	0.06
195	0.06
196	0.07
197	0.08
198	0.09
199	0.12
200	0.13
201	0.15
202	0.19
203	0.27
204	0.3
205	0.35
206	0.35
207	0.33
208	0.38
209	0.4
210	0.41
211	0.32
212	0.31
213	0.26
214	0.28
215	0.28
216	0.26
217	0.25
218	0.22
219	0.24
220	0.21
221	0.24
222	0.22
223	0.21
224	0.18
225	0.17
226	0.16
227	0.14
228	0.15
229	0.11
230	0.12
231	0.13
232	0.12
233	0.15
234	0.14
235	0.15
236	0.14
237	0.16
238	0.17
239	0.17
240	0.17
241	0.13
242	0.13
243	0.12
244	0.12
245	0.09
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.08
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.11
258	0.14
259	0.14
260	0.14
261	0.15
262	0.16
263	0.16
264	0.16
265	0.14
266	0.13
267	0.13
268	0.12
269	0.11
270	0.12
271	0.13
272	0.13
273	0.14
274	0.11
275	0.13
276	0.14
277	0.16
278	0.15
279	0.14
280	0.13
281	0.12
282	0.11
283	0.09
284	0.07
285	0.06
286	0.04
287	0.05
288	0.05
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.11
295	0.12
296	0.13
297	0.15
298	0.16
299	0.15
300	0.16
301	0.16
302	0.1
303	0.09
304	0.09
305	0.07
306	0.07
307	0.06
308	0.05
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.08
314	0.07
315	0.08
316	0.08
317	0.06
318	0.07
319	0.07
320	0.09
321	0.08
322	0.08
323	0.09
324	0.1
325	0.1
326	0.1
327	0.1
328	0.08
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.08
333	0.09
334	0.09
335	0.11
336	0.12
337	0.13
338	0.16
339	0.17
340	0.19
341	0.22
342	0.27
343	0.26
344	0.3
345	0.3
346	0.31
347	0.36
348	0.32
349	0.27
350	0.23
351	0.22
352	0.17
353	0.17
354	0.13
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.08
359	0.07
360	0.07
361	0.06
362	0.07
363	0.09
364	0.1
365	0.1
366	0.1
367	0.1
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.11
380	0.14
381	0.16
382	0.16
383	0.16
384	0.21
385	0.25
386	0.25
387	0.27
388	0.28
389	0.27
390	0.3
391	0.34
392	0.3
393	0.25
394	0.26
395	0.21
396	0.17
397	0.16
398	0.14
399	0.13
400	0.15
401	0.17
402	0.14
403	0.16
404	0.17
405	0.18
406	0.17
407	0.16
408	0.16
409	0.15
410	0.16
411	0.16
412	0.16
413	0.16
414	0.15
415	0.13
416	0.11
417	0.1
418	0.09
419	0.07
420	0.06
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.04
425	0.03
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.03
430	0.02
431	0.02
432	0.02
433	0.02
434	0.02
435	0.02
436	0.02
437	0.02
438	0.03
439	0.03
440	0.04
441	0.04
442	0.05
443	0.05
444	0.09
445	0.09
446	0.09
447	0.1
448	0.12
449	0.15
450	0.16
451	0.18
452	0.15
453	0.18
454	0.18
455	0.18
456	0.18
457	0.17
458	0.17
459	0.18
460	0.21
461	0.19
462	0.18
463	0.19
464	0.18
465	0.17
466	0.17
467	0.13
468	0.1
469	0.1
470	0.11
471	0.1
472	0.08
473	0.07
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.05
478	0.04
479	0.04
480	0.03
481	0.03
482	0.03
483	0.03
484	0.02
485	0.02
486	0.03
487	0.03
488	0.03
489	0.03
490	0.04
491	0.04
492	0.05
493	0.07
494	0.07
495	0.09
496	0.11
497	0.11
498	0.11
499	0.11
500	0.11
501	0.1
502	0.09
503	0.08
504	0.06
505	0.05
506	0.05
507	0.04
508	0.04
509	0.03
510	0.03
511	0.03
512	0.02
513	0.02
514	0.02
515	0.02
516	0.02
517	0.02
518	0.02
519	0.03
520	0.03
521	0.03
522	0.04
523	0.04
524	0.05
525	0.06
526	0.06
527	0.07
528	0.07
529	0.07
530	0.07
531	0.07
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.06
542	0.07
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.09
547	0.08
548	0.08
549	0.08
550	0.08
551	0.08
552	0.13
553	0.18
554	0.2
555	0.27
556	0.3
557	0.33
558	0.37
559	0.43
560	0.44
561	0.46
562	0.46
563	0.48
564	0.48
565	0.5
566	0.5
567	0.42
568	0.37
569	0.32
570	0.29
571	0.21
572	0.18
573	0.12
574	0.08
575	0.08
576	0.07
577	0.05
578	0.05
579	0.04
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.06
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.04
596	0.03
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.03
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.03
605	0.03
606	0.02
607	0.03
608	0.03
609	0.02
610	0.03
611	0.03
612	0.04
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.07
617	0.07
618	0.07
619	0.08
620	0.11
621	0.13
622	0.15
623	0.15
624	0.14
625	0.14
626	0.15
627	0.14
628	0.13
629	0.11
630	0.1
631	0.1
632	0.1
633	0.11
634	0.13
635	0.11
636	0.1
637	0.11
638	0.11
639	0.12
640	0.11
641	0.1
642	0.08
643	0.08
644	0.08
645	0.09
646	0.09
647	0.08
648	0.07
649	0.07
650	0.07
651	0.06
652	0.07
653	0.04
654	0.04
655	0.04
656	0.04
657	0.04
658	0.05
659	0.05
660	0.06
661	0.07
662	0.08
663	0.09
664	0.09
665	0.09
666	0.08
667	0.08
668	0.07
669	0.06
670	0.05
671	0.04
672	0.04
673	0.05
674	0.05
675	0.05
676	0.04
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.08
683	0.08
684	0.08
685	0.09
686	0.09
687	0.09
688	0.11
689	0.14
690	0.12
691	0.12
692	0.12
693	0.11
694	0.11
695	0.11
696	0.09
697	0.08
698	0.08
699	0.08
700	0.07
701	0.08
702	0.08
703	0.07
704	0.07
705	0.07
706	0.08
707	0.08
708	0.08
709	0.08
710	0.08
711	0.09
712	0.1
713	0.07
714	0.06
715	0.06
716	0.06
717	0.05
718	0.05
719	0.05
720	0.05
721	0.06
722	0.07
723	0.07
724	0.07
725	0.06
726	0.06
727	0.05
728	0.05
729	0.04
730	0.03
731	0.03
732	0.03
733	0.04
734	0.04
735	0.04
736	0.06
737	0.09
738	0.09
739	0.09
740	0.09
741	0.09
742	0.1
743	0.11
744	0.09
745	0.07
746	0.06
747	0.08
748	0.08
749	0.08
750	0.07
751	0.06
752	0.05
753	0.06
754	0.07
755	0.06
756	0.09
757	0.09
758	0.1
759	0.1
760	0.11
761	0.1
762	0.09
763	0.1
764	0.07
765	0.06
766	0.06
767	0.07
768	0.08
769	0.08
770	0.08
771	0.07
772	0.09
773	0.09
774	0.1
775	0.1
776	0.11
777	0.12
778	0.13
779	0.13
780	0.13
781	0.12
782	0.12
783	0.09
784	0.08
785	0.08
786	0.07
787	0.06
788	0.07
789	0.07
790	0.08
791	0.09
792	0.09
793	0.08
794	0.08
795	0.08
796	0.07
797	0.09
798	0.14
799	0.14
800	0.14
801	0.15
802	0.16
803	0.18
804	0.18
805	0.16
806	0.14
807	0.17
808	0.19
809	0.21
810	0.22
811	0.22
812	0.23
813	0.25
814	0.26
815	0.24
816	0.3
817	0.33
818	0.34
819	0.38
820	0.4
821	0.42
822	0.43
823	0.45
824	0.42
825	0.4
826	0.4
827	0.39
828	0.38
829	0.33
830	0.33
831	0.33
832	0.31
833	0.28
834	0.27
835	0.27
836	0.26
837	0.28
838	0.27
839	0.25
840	0.23
841	0.2
842	0.17
843	0.15
844	0.13
845	0.13
846	0.1
847	0.08
848	0.08
849	0.09
850	0.09
851	0.08
852	0.08
853	0.06
854	0.05
855	0.07
856	0.09
857	0.08
858	0.11
859	0.15
860	0.16
861	0.17
862	0.19
863	0.22
864	0.21
865	0.25
866	0.26
867	0.27
868	0.3
869	0.3
870	0.31
871	0.36
872	0.39
873	0.42
874	0.44
875	0.41
876	0.4
877	0.41
878	0.39
879	0.31
880	0.29
881	0.23
882	0.18
883	0.15
884	0.13
885	0.1
886	0.1
887	0.08
888	0.06
889	0.05
890	0.04
891	0.03
892	0.03
893	0.03
894	0.03
895	0.03
896	0.03
897	0.04
898	0.05
899	0.06
900	0.07
901	0.12
902	0.15
903	0.18
904	0.18
905	0.19
906	0.19
907	0.19
908	0.2
909	0.17
910	0.15
911	0.13
912	0.18
913	0.19
914	0.21
915	0.23
916	0.21
917	0.23
918	0.26
919	0.28
920	0.32
921	0.31
922	0.32
923	0.31
924	0.3
925	0.26
926	0.27
927	0.28
928	0.24
929	0.23
930	0.29
931	0.28
932	0.3
933	0.32
934	0.29
935	0.27
936	0.32
937	0.36
938	0.35
939	0.38
940	0.37
941	0.35
942	0.35
943	0.33
944	0.26
945	0.25
946	0.18
947	0.15
948	0.16
949	0.16
950	0.17
951	0.17
952	0.15
953	0.11
954	0.1
955	0.09
956	0.07
957	0.08
958	0.06
959	0.07
960	0.07
961	0.08
962	0.1
963	0.09
964	0.09
965	0.1
966	0.11
967	0.14
968	0.16
969	0.17
970	0.16
971	0.2
972	0.22
973	0.23
974	0.22
975	0.19
976	0.17
977	0.15
978	0.17
979	0.18
980	0.21
981	0.27
982	0.32
983	0.39
984	0.43
985	0.44
986	0.5
987	0.53
988	0.57
989	0.56
990	0.53
991	0.5
992	0.49
993	0.49
994	0.43
995	0.41
996	0.34
997	0.29
998	0.26
999	0.22
1000	0.19
1001	0.18
1002	0.17
1003	0.13
1004	0.14
1005	0.15
1006	0.16
1007	0.17
1008	0.16
1009	0.18
1010	0.18
1011	0.17
1012	0.14
1013	0.13
1014	0.12
1015	0.12
1016	0.11
1017	0.12
1018	0.13
1019	0.12
1020	0.12
1021	0.12
1022	0.12
1023	0.12
1024	0.11
1025	0.09
1026	0.11
1027	0.15
1028	0.16
1029	0.21
1030	0.27
1031	0.28
1032	0.29
1033	0.33
1034	0.32
1035	0.32
1036	0.37
1037	0.34
1038	0.32
1039	0.36
1040	0.35

A0A5C5G5Y9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer