Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FY66

Protein Details
Accession A0A5C5FY66    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-86KAQPKQQRDSAPRQQRQPRTQGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-130AKSFARGGGRGGRGGVGRGPGANPRG
272-277KAKKQK
293-328KDTRERTGPTTRGRGGARGRGEGRGRGGAARGGATR
Subcellular Location(s) nucl 12.5cyto_nucl 12.5, cyto 9.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MALRDSTHAESDNSDGVSAPPLRYDPPVRGVAPWVEKGDGDDFAPAAAAPAKAAPAAAAPAAAPKAQPKQQRDSAPRQQRQPRTQGDRELNAAVPAGEDAKEDRAKSFARGGGRGGRGGVGRGPGANPRGNGGTYLGGNRPRRENGGGRPFDRHSQTGRVDSEKAEAAGWGAEDGKKELEAEQLGDADAKAEKPAADGTATPVREAPIEEEDNTQTYEEYLAAQAEKKLSLSLPEARKANEGDESSLGKPLTKKSEAEEEWLFGAPKASSGKAKKQKEGKQFLEVEFTSAPRKDTRERTGPTTRGRGGARGRGEGRGRGGAARGGATRGASSRGAVPAVPDASAFPALA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.16
3 0.15
4 0.19
5 0.2
6 0.17
7 0.16
8 0.17
9 0.19
10 0.25
11 0.28
12 0.27
13 0.3
14 0.35
15 0.34
16 0.34
17 0.36
18 0.36
19 0.38
20 0.37
21 0.33
22 0.28
23 0.27
24 0.29
25 0.27
26 0.22
27 0.17
28 0.15
29 0.12
30 0.11
31 0.11
32 0.08
33 0.07
34 0.08
35 0.08
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.07
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.08
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.14
52 0.2
53 0.27
54 0.35
55 0.39
56 0.46
57 0.54
58 0.63
59 0.66
60 0.69
61 0.73
62 0.76
63 0.77
64 0.78
65 0.8
66 0.81
67 0.8
68 0.8
69 0.79
70 0.77
71 0.76
72 0.75
73 0.72
74 0.64
75 0.59
76 0.52
77 0.42
78 0.33
79 0.28
80 0.19
81 0.13
82 0.1
83 0.08
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.12
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.18
92 0.19
93 0.21
94 0.24
95 0.22
96 0.23
97 0.24
98 0.26
99 0.29
100 0.3
101 0.28
102 0.23
103 0.22
104 0.19
105 0.18
106 0.17
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.13
112 0.16
113 0.17
114 0.16
115 0.17
116 0.18
117 0.18
118 0.17
119 0.15
120 0.13
121 0.11
122 0.13
123 0.14
124 0.2
125 0.23
126 0.25
127 0.27
128 0.28
129 0.3
130 0.33
131 0.35
132 0.37
133 0.44
134 0.45
135 0.43
136 0.45
137 0.43
138 0.43
139 0.41
140 0.34
141 0.27
142 0.3
143 0.31
144 0.31
145 0.31
146 0.29
147 0.27
148 0.25
149 0.24
150 0.18
151 0.17
152 0.12
153 0.1
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.08
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.1
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.15
193 0.13
194 0.12
195 0.14
196 0.15
197 0.16
198 0.16
199 0.17
200 0.17
201 0.14
202 0.1
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.09
216 0.08
217 0.1
218 0.13
219 0.19
220 0.22
221 0.26
222 0.28
223 0.28
224 0.31
225 0.29
226 0.27
227 0.25
228 0.22
229 0.2
230 0.2
231 0.22
232 0.2
233 0.22
234 0.21
235 0.18
236 0.19
237 0.22
238 0.27
239 0.27
240 0.27
241 0.27
242 0.37
243 0.36
244 0.39
245 0.36
246 0.29
247 0.28
248 0.28
249 0.25
250 0.15
251 0.16
252 0.11
253 0.13
254 0.14
255 0.14
256 0.21
257 0.26
258 0.36
259 0.45
260 0.51
261 0.56
262 0.64
263 0.71
264 0.75
265 0.79
266 0.73
267 0.72
268 0.7
269 0.63
270 0.6
271 0.51
272 0.43
273 0.34
274 0.31
275 0.27
276 0.24
277 0.25
278 0.22
279 0.27
280 0.32
281 0.4
282 0.47
283 0.52
284 0.55
285 0.61
286 0.67
287 0.68
288 0.67
289 0.67
290 0.61
291 0.57
292 0.54
293 0.54
294 0.51
295 0.52
296 0.48
297 0.47
298 0.47
299 0.48
300 0.5
301 0.47
302 0.44
303 0.4
304 0.37
305 0.31
306 0.31
307 0.26
308 0.24
309 0.22
310 0.19
311 0.17
312 0.17
313 0.17
314 0.17
315 0.16
316 0.18
317 0.16
318 0.16
319 0.18
320 0.2
321 0.2
322 0.18
323 0.19
324 0.21
325 0.21
326 0.2
327 0.16
328 0.15
329 0.17