Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FXK1

Protein Details
Accession A0A5C5FXK1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
479-502PAPKEETKGKSRRRGNKGGGKGTEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-168AHGPKGAAQAKGKGKGKGK
479-499PAPKEETKGKSRRRGNKGGGK
Subcellular Location(s) cyto 12, extr 5, mito 4, nucl 3, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008381  SDHAF3/Sdh7  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005759  C:mitochondrial matrix  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0034553  P:mitochondrial respiratory chain complex II assembly  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF13233  Complex1_LYR_2  
PF06221  zf-C2HC5  
CDD cd20270  Complex1_LYR_SDHAF3_LYRM10  
Amino Acid Sequences MAPPAFAASLAQLTGLDADTAREQLLPHLDSLKSQSDVRNYLDSLLAPGPAAQSFVSAYTAYRFPSAPFSASAAPGPGPGGPASGTSSWASTPASSRPSSPFGAPPGAPRAYVKPRAGDRPAGAAASRAPSVPRAPVAGGIQVRVAPASAHGPKGAAQAKGKGKGKGKEEPEPELELSEEAARELLEIARELRAFDAREAEKSKRSCFCQARQHPLSPYVPLCPSCALVLCTLNSPALRCPSCSHFPLLSSARTASHIAALQSRREDLVAREKRRAAAAREQDARERAAIRFPTLGMDMDGVRRAAEQQQRSYAGHAGGGAGIGERIERTERAQQPGGGRVLRLDGKTGKVKVQTKVVRPAAKGKGTVVAEETTGVIAPDEHDDGLVPFVDEDDDGVRGEAALRSRKGDELAALSRPDAKDGRVFVNVTLDEAERPVWVAQDEVFVTEGGADEDDATTGDAAPSSSYVAPARPAVPGAPAPKEETKGKSRRRGNKGGGKGTEAAAATAPAMAFRASSRLLAAGIQGLSPNATAELAAELLPPLPLYRRLLRVHRKVLPAELRVFGDDYAEFRRTRSTDNPLHIVGFLSEWKKYLDHHEALVDGGQEAAGGAAQAEAEEAPGKALDPSILESLSADQIGQLYELFTATKEVYLSPEELEAKLAAEGHGEEGIPAGSVLPDLGQATRIGGGGGKGEGER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.08
4 0.07
5 0.09
6 0.1
7 0.11
8 0.11
9 0.11
10 0.11
11 0.15
12 0.21
13 0.2
14 0.2
15 0.24
16 0.23
17 0.24
18 0.29
19 0.29
20 0.26
21 0.28
22 0.31
23 0.34
24 0.38
25 0.4
26 0.4
27 0.35
28 0.35
29 0.33
30 0.28
31 0.25
32 0.22
33 0.18
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.12
38 0.13
39 0.09
40 0.09
41 0.1
42 0.11
43 0.12
44 0.1
45 0.11
46 0.13
47 0.15
48 0.15
49 0.17
50 0.16
51 0.16
52 0.23
53 0.25
54 0.23
55 0.23
56 0.25
57 0.26
58 0.26
59 0.25
60 0.2
61 0.17
62 0.16
63 0.15
64 0.12
65 0.11
66 0.1
67 0.11
68 0.09
69 0.1
70 0.13
71 0.13
72 0.15
73 0.14
74 0.15
75 0.14
76 0.15
77 0.15
78 0.13
79 0.15
80 0.18
81 0.22
82 0.22
83 0.25
84 0.28
85 0.32
86 0.33
87 0.33
88 0.32
89 0.31
90 0.35
91 0.32
92 0.32
93 0.34
94 0.32
95 0.3
96 0.29
97 0.33
98 0.37
99 0.44
100 0.43
101 0.43
102 0.48
103 0.55
104 0.57
105 0.54
106 0.47
107 0.45
108 0.43
109 0.37
110 0.31
111 0.24
112 0.22
113 0.19
114 0.18
115 0.13
116 0.13
117 0.15
118 0.17
119 0.18
120 0.18
121 0.17
122 0.17
123 0.19
124 0.2
125 0.22
126 0.21
127 0.19
128 0.18
129 0.16
130 0.16
131 0.13
132 0.12
133 0.07
134 0.07
135 0.14
136 0.15
137 0.15
138 0.16
139 0.16
140 0.18
141 0.25
142 0.27
143 0.25
144 0.25
145 0.32
146 0.38
147 0.46
148 0.48
149 0.48
150 0.51
151 0.53
152 0.57
153 0.58
154 0.57
155 0.58
156 0.57
157 0.56
158 0.52
159 0.49
160 0.43
161 0.35
162 0.3
163 0.22
164 0.19
165 0.15
166 0.11
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.13
181 0.14
182 0.14
183 0.2
184 0.19
185 0.23
186 0.27
187 0.29
188 0.33
189 0.35
190 0.4
191 0.39
192 0.43
193 0.48
194 0.51
195 0.56
196 0.6
197 0.66
198 0.7
199 0.69
200 0.69
201 0.62
202 0.59
203 0.52
204 0.45
205 0.38
206 0.31
207 0.28
208 0.25
209 0.24
210 0.2
211 0.19
212 0.16
213 0.16
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.13
224 0.18
225 0.18
226 0.19
227 0.21
228 0.26
229 0.3
230 0.3
231 0.32
232 0.26
233 0.26
234 0.31
235 0.31
236 0.25
237 0.22
238 0.22
239 0.18
240 0.2
241 0.2
242 0.14
243 0.13
244 0.14
245 0.13
246 0.18
247 0.19
248 0.19
249 0.18
250 0.19
251 0.17
252 0.16
253 0.16
254 0.14
255 0.24
256 0.31
257 0.33
258 0.37
259 0.38
260 0.39
261 0.42
262 0.43
263 0.37
264 0.37
265 0.41
266 0.43
267 0.46
268 0.46
269 0.45
270 0.42
271 0.38
272 0.3
273 0.25
274 0.19
275 0.2
276 0.19
277 0.18
278 0.17
279 0.16
280 0.16
281 0.14
282 0.14
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.13
293 0.19
294 0.22
295 0.23
296 0.26
297 0.29
298 0.29
299 0.3
300 0.25
301 0.19
302 0.16
303 0.14
304 0.11
305 0.08
306 0.07
307 0.06
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.05
315 0.05
316 0.08
317 0.17
318 0.21
319 0.25
320 0.26
321 0.28
322 0.28
323 0.32
324 0.32
325 0.23
326 0.2
327 0.16
328 0.17
329 0.17
330 0.15
331 0.13
332 0.13
333 0.15
334 0.19
335 0.2
336 0.21
337 0.25
338 0.29
339 0.29
340 0.37
341 0.39
342 0.4
343 0.47
344 0.5
345 0.47
346 0.44
347 0.5
348 0.46
349 0.43
350 0.39
351 0.31
352 0.31
353 0.27
354 0.27
355 0.2
356 0.15
357 0.13
358 0.12
359 0.12
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.04
364 0.03
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.05
374 0.04
375 0.03
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.04
386 0.05
387 0.06
388 0.09
389 0.13
390 0.13
391 0.15
392 0.16
393 0.17
394 0.18
395 0.17
396 0.15
397 0.14
398 0.16
399 0.16
400 0.15
401 0.15
402 0.17
403 0.17
404 0.18
405 0.15
406 0.14
407 0.16
408 0.18
409 0.2
410 0.19
411 0.2
412 0.17
413 0.2
414 0.19
415 0.16
416 0.15
417 0.13
418 0.1
419 0.11
420 0.11
421 0.06
422 0.08
423 0.07
424 0.07
425 0.06
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.05
437 0.05
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.06
452 0.06
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.1
457 0.12
458 0.12
459 0.11
460 0.11
461 0.1
462 0.12
463 0.15
464 0.16
465 0.17
466 0.17
467 0.21
468 0.23
469 0.26
470 0.28
471 0.3
472 0.37
473 0.44
474 0.52
475 0.57
476 0.65
477 0.72
478 0.77
479 0.81
480 0.82
481 0.81
482 0.81
483 0.8
484 0.72
485 0.64
486 0.57
487 0.47
488 0.4
489 0.31
490 0.22
491 0.14
492 0.13
493 0.1
494 0.09
495 0.08
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.08
502 0.08
503 0.09
504 0.1
505 0.1
506 0.1
507 0.1
508 0.1
509 0.09
510 0.09
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.08
515 0.07
516 0.07
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.05
526 0.06
527 0.06
528 0.05
529 0.06
530 0.07
531 0.11
532 0.16
533 0.2
534 0.27
535 0.32
536 0.43
537 0.52
538 0.6
539 0.64
540 0.66
541 0.67
542 0.62
543 0.66
544 0.62
545 0.57
546 0.5
547 0.44
548 0.38
549 0.34
550 0.33
551 0.24
552 0.19
553 0.15
554 0.14
555 0.16
556 0.18
557 0.17
558 0.17
559 0.24
560 0.24
561 0.3
562 0.34
563 0.39
564 0.43
565 0.48
566 0.52
567 0.46
568 0.45
569 0.39
570 0.33
571 0.25
572 0.18
573 0.18
574 0.15
575 0.15
576 0.15
577 0.16
578 0.16
579 0.18
580 0.25
581 0.29
582 0.29
583 0.3
584 0.31
585 0.29
586 0.29
587 0.28
588 0.2
589 0.11
590 0.09
591 0.07
592 0.06
593 0.05
594 0.05
595 0.03
596 0.03
597 0.03
598 0.03
599 0.03
600 0.03
601 0.04
602 0.04
603 0.05
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.08
611 0.08
612 0.08
613 0.11
614 0.12
615 0.12
616 0.12
617 0.12
618 0.14
619 0.14
620 0.13
621 0.1
622 0.08
623 0.09
624 0.1
625 0.09
626 0.07
627 0.06
628 0.07
629 0.07
630 0.07
631 0.07
632 0.09
633 0.09
634 0.1
635 0.11
636 0.11
637 0.14
638 0.16
639 0.17
640 0.15
641 0.19
642 0.19
643 0.19
644 0.2
645 0.17
646 0.15
647 0.15
648 0.15
649 0.1
650 0.1
651 0.1
652 0.1
653 0.11
654 0.1
655 0.09
656 0.09
657 0.09
658 0.08
659 0.07
660 0.06
661 0.05
662 0.05
663 0.05
664 0.05
665 0.06
666 0.07
667 0.08
668 0.09
669 0.09
670 0.1
671 0.11
672 0.11
673 0.1
674 0.1
675 0.1
676 0.11
677 0.11