Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FRA0

Protein Details
Accession A0A5C5FRA0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
721-741IFDTRWPSKRFKNTRRFCYVQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
531-546KAKRQRKGLEKRRARE
996-1005GGRGRGGRGG
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MAQDQLVEEYGALLEQLNAAPFQRDLHEQRIALASRLELADEVEQGRNGLAQYFPLSQAEWTAWLDDRKSALPAPPTDDVTPLLELVELYRRASRDQLSIPLLVSWTQWTIASYYAAQGLSPAPPPAEADDEDAAMEPASRKVGEPDELLGVVFSLEEVRGVCDEVLKIAGAHIAEVWTLWRDFEMDLLKLDPSPDQLLQVEQMYLARLKVPHLDIAETFSAYSSFVTNFDNDNYNKSLPAANKIFSATAKKSDERYAEEEKLKAAGYTPQAYLDYVSWEREVKRPDTPLVKGIFERAVADHPTEIDLWDEYLGFLHKIPEKESNLREVSEKAIRNLPTATSLWTAAMRVAEKLGLGAEEVEALFQRAVATGYFAKDIEAHVALYHARASYYRREMDRNATDDGPDAQLAGLAIGVLQEGIESNKKVNKKGGDPQFRLEKFLIRIYERFQMTAEARAIWEGLCKTRQHSYAVWYGHADFETRMGDYARAHKVYTEGCAIKGLDYPEYLLEAWITFENEYGVLADVDFALVKAKRQRKGLEKRRAREAADAAAKAAAAAPPATDADSFISSAVGQAPMQEGADASKKRERSPQDESAPAQGAKKVRVEAPEPAGEPKRDREHSTVFAISSGEMSEDDVRRLFRDCGEIRELHVKTIDQKSYAQIEFVNKESVLAAQTKDKKRINDLETEVYIAWQSCLYVTNFPESFDKAALEHLFAKYGTIFDTRWPSKRFKNTRRFCYVQFANPAHSQAALELNGTELEPGHALSVLISDPSRKKSRSDAGAHQRELYVASLAKSVKEVDLRKLFEPFGTVLGVRIPQDDKGLCKGFAFVEFENESAAQEALSLNNHELKKRHMSVTVAQARQAGTGKFSQPERRVETENRGVRVRGLANDTQEAVIQQEFEKIAPVRRVNYVAGSSEAVVLLENPADVGKVLMQRDAMLINGQQVTLLAEGRQTRPAAGGAKQGTGATGEGAPNALPMMPRQATRSRGRVGLVGGRGRGGRGGRLGIGAGRSVGSLAAQGQEGASSSGDAPGDASMAAPGDKSAEGKSQDDFRAMLLKGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.06
3 0.07
4 0.08
5 0.08
6 0.09
7 0.11
8 0.11
9 0.13
10 0.15
11 0.22
12 0.26
13 0.32
14 0.38
15 0.36
16 0.38
17 0.43
18 0.41
19 0.35
20 0.31
21 0.25
22 0.22
23 0.22
24 0.2
25 0.13
26 0.14
27 0.13
28 0.14
29 0.16
30 0.15
31 0.15
32 0.15
33 0.15
34 0.14
35 0.13
36 0.13
37 0.1
38 0.11
39 0.15
40 0.16
41 0.17
42 0.17
43 0.18
44 0.16
45 0.18
46 0.17
47 0.15
48 0.14
49 0.15
50 0.17
51 0.2
52 0.21
53 0.22
54 0.24
55 0.23
56 0.25
57 0.25
58 0.27
59 0.3
60 0.32
61 0.35
62 0.35
63 0.38
64 0.35
65 0.34
66 0.31
67 0.27
68 0.25
69 0.19
70 0.16
71 0.12
72 0.11
73 0.12
74 0.17
75 0.15
76 0.16
77 0.2
78 0.21
79 0.23
80 0.28
81 0.3
82 0.3
83 0.32
84 0.37
85 0.36
86 0.36
87 0.34
88 0.3
89 0.27
90 0.21
91 0.19
92 0.14
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.14
100 0.12
101 0.12
102 0.15
103 0.14
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.14
109 0.14
110 0.12
111 0.12
112 0.14
113 0.15
114 0.18
115 0.17
116 0.2
117 0.19
118 0.19
119 0.19
120 0.18
121 0.15
122 0.11
123 0.11
124 0.08
125 0.09
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.15
130 0.19
131 0.21
132 0.21
133 0.21
134 0.21
135 0.21
136 0.2
137 0.16
138 0.12
139 0.09
140 0.07
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.07
147 0.07
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.1
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.13
172 0.15
173 0.13
174 0.14
175 0.15
176 0.15
177 0.14
178 0.15
179 0.12
180 0.12
181 0.15
182 0.14
183 0.16
184 0.16
185 0.16
186 0.17
187 0.17
188 0.14
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.12
197 0.17
198 0.19
199 0.21
200 0.21
201 0.23
202 0.2
203 0.24
204 0.23
205 0.18
206 0.17
207 0.13
208 0.12
209 0.11
210 0.11
211 0.08
212 0.07
213 0.08
214 0.1
215 0.11
216 0.13
217 0.14
218 0.2
219 0.19
220 0.22
221 0.25
222 0.24
223 0.23
224 0.22
225 0.25
226 0.21
227 0.28
228 0.27
229 0.25
230 0.25
231 0.26
232 0.26
233 0.24
234 0.29
235 0.23
236 0.27
237 0.31
238 0.32
239 0.34
240 0.39
241 0.4
242 0.39
243 0.42
244 0.42
245 0.44
246 0.44
247 0.41
248 0.36
249 0.34
250 0.28
251 0.23
252 0.17
253 0.16
254 0.17
255 0.19
256 0.19
257 0.19
258 0.2
259 0.2
260 0.2
261 0.15
262 0.16
263 0.15
264 0.16
265 0.15
266 0.17
267 0.19
268 0.23
269 0.27
270 0.25
271 0.29
272 0.31
273 0.35
274 0.38
275 0.38
276 0.39
277 0.37
278 0.36
279 0.31
280 0.31
281 0.26
282 0.21
283 0.2
284 0.15
285 0.16
286 0.15
287 0.16
288 0.13
289 0.12
290 0.13
291 0.12
292 0.11
293 0.09
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.1
304 0.14
305 0.15
306 0.18
307 0.24
308 0.28
309 0.35
310 0.36
311 0.39
312 0.37
313 0.36
314 0.35
315 0.29
316 0.29
317 0.29
318 0.29
319 0.24
320 0.29
321 0.28
322 0.28
323 0.28
324 0.24
325 0.21
326 0.2
327 0.2
328 0.15
329 0.15
330 0.14
331 0.13
332 0.13
333 0.11
334 0.12
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.05
357 0.07
358 0.08
359 0.09
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.09
364 0.1
365 0.1
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.11
377 0.17
378 0.22
379 0.26
380 0.27
381 0.31
382 0.33
383 0.41
384 0.43
385 0.39
386 0.36
387 0.32
388 0.3
389 0.27
390 0.26
391 0.18
392 0.13
393 0.1
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.05
398 0.04
399 0.03
400 0.03
401 0.02
402 0.03
403 0.02
404 0.02
405 0.02
406 0.02
407 0.04
408 0.06
409 0.06
410 0.08
411 0.13
412 0.16
413 0.18
414 0.23
415 0.26
416 0.3
417 0.39
418 0.47
419 0.53
420 0.53
421 0.55
422 0.59
423 0.55
424 0.53
425 0.45
426 0.38
427 0.31
428 0.32
429 0.3
430 0.23
431 0.24
432 0.23
433 0.29
434 0.25
435 0.23
436 0.2
437 0.21
438 0.2
439 0.22
440 0.19
441 0.14
442 0.13
443 0.13
444 0.13
445 0.09
446 0.1
447 0.08
448 0.09
449 0.12
450 0.13
451 0.15
452 0.19
453 0.21
454 0.23
455 0.23
456 0.25
457 0.28
458 0.28
459 0.27
460 0.23
461 0.21
462 0.19
463 0.18
464 0.14
465 0.08
466 0.09
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.07
471 0.08
472 0.09
473 0.15
474 0.17
475 0.17
476 0.17
477 0.17
478 0.18
479 0.18
480 0.19
481 0.17
482 0.14
483 0.13
484 0.15
485 0.14
486 0.13
487 0.14
488 0.13
489 0.1
490 0.09
491 0.09
492 0.08
493 0.09
494 0.09
495 0.06
496 0.06
497 0.05
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.04
507 0.05
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.03
512 0.03
513 0.03
514 0.03
515 0.05
516 0.05
517 0.07
518 0.15
519 0.21
520 0.25
521 0.3
522 0.36
523 0.44
524 0.55
525 0.64
526 0.67
527 0.7
528 0.69
529 0.74
530 0.72
531 0.63
532 0.56
533 0.47
534 0.42
535 0.36
536 0.32
537 0.24
538 0.2
539 0.18
540 0.14
541 0.12
542 0.07
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.04
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.06
552 0.07
553 0.07
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.05
566 0.05
567 0.06
568 0.12
569 0.12
570 0.14
571 0.18
572 0.19
573 0.22
574 0.29
575 0.33
576 0.35
577 0.42
578 0.48
579 0.47
580 0.49
581 0.48
582 0.44
583 0.4
584 0.34
585 0.27
586 0.21
587 0.19
588 0.18
589 0.19
590 0.18
591 0.18
592 0.2
593 0.21
594 0.22
595 0.24
596 0.23
597 0.22
598 0.24
599 0.25
600 0.23
601 0.23
602 0.25
603 0.29
604 0.29
605 0.33
606 0.34
607 0.36
608 0.38
609 0.39
610 0.35
611 0.28
612 0.26
613 0.22
614 0.17
615 0.12
616 0.09
617 0.06
618 0.05
619 0.06
620 0.09
621 0.09
622 0.1
623 0.11
624 0.11
625 0.12
626 0.14
627 0.14
628 0.12
629 0.19
630 0.2
631 0.23
632 0.26
633 0.25
634 0.25
635 0.33
636 0.32
637 0.25
638 0.25
639 0.21
640 0.23
641 0.29
642 0.29
643 0.21
644 0.22
645 0.24
646 0.28
647 0.28
648 0.22
649 0.18
650 0.2
651 0.2
652 0.21
653 0.2
654 0.15
655 0.15
656 0.14
657 0.13
658 0.11
659 0.11
660 0.1
661 0.15
662 0.24
663 0.28
664 0.36
665 0.39
666 0.4
667 0.46
668 0.54
669 0.5
670 0.49
671 0.49
672 0.45
673 0.41
674 0.4
675 0.33
676 0.24
677 0.22
678 0.14
679 0.1
680 0.06
681 0.06
682 0.05
683 0.07
684 0.08
685 0.11
686 0.12
687 0.17
688 0.17
689 0.18
690 0.2
691 0.19
692 0.19
693 0.16
694 0.16
695 0.11
696 0.14
697 0.13
698 0.13
699 0.14
700 0.13
701 0.13
702 0.13
703 0.13
704 0.1
705 0.1
706 0.1
707 0.1
708 0.1
709 0.12
710 0.21
711 0.24
712 0.3
713 0.34
714 0.37
715 0.44
716 0.55
717 0.63
718 0.64
719 0.72
720 0.75
721 0.81
722 0.84
723 0.79
724 0.71
725 0.7
726 0.63
727 0.58
728 0.56
729 0.49
730 0.44
731 0.41
732 0.4
733 0.31
734 0.27
735 0.21
736 0.14
737 0.15
738 0.11
739 0.1
740 0.08
741 0.09
742 0.09
743 0.08
744 0.07
745 0.05
746 0.05
747 0.05
748 0.05
749 0.05
750 0.05
751 0.05
752 0.05
753 0.06
754 0.05
755 0.06
756 0.06
757 0.1
758 0.13
759 0.2
760 0.26
761 0.27
762 0.29
763 0.37
764 0.45
765 0.5
766 0.53
767 0.57
768 0.62
769 0.69
770 0.67
771 0.59
772 0.51
773 0.43
774 0.37
775 0.28
776 0.19
777 0.12
778 0.11
779 0.14
780 0.14
781 0.14
782 0.13
783 0.14
784 0.14
785 0.2
786 0.21
787 0.26
788 0.33
789 0.36
790 0.36
791 0.38
792 0.36
793 0.29
794 0.3
795 0.22
796 0.16
797 0.15
798 0.13
799 0.11
800 0.12
801 0.13
802 0.11
803 0.13
804 0.12
805 0.12
806 0.16
807 0.17
808 0.18
809 0.24
810 0.26
811 0.24
812 0.23
813 0.24
814 0.2
815 0.22
816 0.24
817 0.17
818 0.2
819 0.2
820 0.2
821 0.19
822 0.18
823 0.16
824 0.13
825 0.12
826 0.07
827 0.07
828 0.07
829 0.07
830 0.08
831 0.09
832 0.09
833 0.16
834 0.18
835 0.21
836 0.22
837 0.27
838 0.35
839 0.38
840 0.4
841 0.37
842 0.4
843 0.42
844 0.51
845 0.54
846 0.45
847 0.42
848 0.41
849 0.37
850 0.36
851 0.34
852 0.23
853 0.17
854 0.2
855 0.22
856 0.24
857 0.28
858 0.35
859 0.37
860 0.45
861 0.48
862 0.49
863 0.53
864 0.54
865 0.58
866 0.59
867 0.59
868 0.54
869 0.5
870 0.46
871 0.42
872 0.42
873 0.36
874 0.29
875 0.3
876 0.29
877 0.3
878 0.31
879 0.3
880 0.25
881 0.23
882 0.19
883 0.15
884 0.13
885 0.11
886 0.09
887 0.12
888 0.12
889 0.11
890 0.16
891 0.16
892 0.22
893 0.28
894 0.31
895 0.31
896 0.34
897 0.37
898 0.34
899 0.36
900 0.32
901 0.26
902 0.25
903 0.23
904 0.2
905 0.17
906 0.15
907 0.12
908 0.1
909 0.08
910 0.07
911 0.06
912 0.05
913 0.05
914 0.05
915 0.05
916 0.05
917 0.06
918 0.08
919 0.13
920 0.14
921 0.15
922 0.15
923 0.16
924 0.17
925 0.17
926 0.14
927 0.11
928 0.11
929 0.14
930 0.14
931 0.13
932 0.12
933 0.12
934 0.12
935 0.11
936 0.11
937 0.08
938 0.11
939 0.15
940 0.17
941 0.22
942 0.21
943 0.2
944 0.21
945 0.25
946 0.25
947 0.24
948 0.29
949 0.27
950 0.27
951 0.27
952 0.26
953 0.22
954 0.2
955 0.18
956 0.11
957 0.11
958 0.11
959 0.1
960 0.11
961 0.1
962 0.09
963 0.09
964 0.08
965 0.07
966 0.08
967 0.16
968 0.18
969 0.19
970 0.24
971 0.31
972 0.38
973 0.45
974 0.51
975 0.47
976 0.48
977 0.48
978 0.46
979 0.43
980 0.43
981 0.41
982 0.38
983 0.34
984 0.33
985 0.32
986 0.3
987 0.3
988 0.25
989 0.22
990 0.22
991 0.23
992 0.22
993 0.22
994 0.22
995 0.2
996 0.2
997 0.16
998 0.13
999 0.11
1000 0.1
1001 0.1
1002 0.09
1003 0.07
1004 0.07
1005 0.08
1006 0.08
1007 0.08
1008 0.08
1009 0.08
1010 0.08
1011 0.09
1012 0.09
1013 0.08
1014 0.08
1015 0.09
1016 0.11
1017 0.11
1018 0.11
1019 0.1
1020 0.09
1021 0.1
1022 0.08
1023 0.08
1024 0.06
1025 0.07
1026 0.07
1027 0.07
1028 0.07
1029 0.09
1030 0.09
1031 0.11
1032 0.13
1033 0.19
1034 0.22
1035 0.24
1036 0.27
1037 0.32
1038 0.33
1039 0.34
1040 0.31
1041 0.26
1042 0.3
1043 0.29