FuNGI

A0A5C5FXQ6

Protein Details

Accession

A0A5C5FXQ6

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-48	ISKIRNKQVRSDLNQKRKKDLRQAKLKKRIARKEAEARGEH	Hydrophilic
469-498	APPAPAPESKKRPRTTPRVRKKPYHALLNP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-45	QKRKKDLRQAKLKKRIARKEAEAR
156-173	PRRSPKFELGRVARWARK
475-490	PESKKRPRTTPRVRKK

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007109 Brix IPR044281 IMP4/RPF1
Gene Ontology	GO:0042134 F:rRNA primary transcript binding GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF04427 Brix
PROSITE	View protein in PROSITE PS50833 BRIX

Amino Acid Sequences

MPIQTKDISKIRNKQVRSDLNQKRKKDLRQAKLKKRIARKEAEARGEHVEKGIPRTIENTREWLGDEDGEDADPRTRPAPVTVDDQTGDVNVDMGSLSNLFPMAPPPQPTPSGFLPPDAKVLITTSPGKPPAPFTKQFLDDLQALLGGKKRADVVPRRSPKFELGRVARWARKRGYGAIMVVGEDHAKPTTMTMSLLPYGPTSHFRLSGITLCKDIPGHASPTSHPPELVLNHFATPLGLSLATLLSQLFLPPGHAEVLQRQGFQGRQVVLAQNSRDFVFVRRYRYMFALKSHRLGKTKKQTDVPRMTDPHPEHDADDTIKTRFQEIGPQMTLKMRWIRRGPLGETGDERTARERFERETGERAEEFGERAEGAGEEEEGAEDGMDVDGEGEANAGAGASDEEGDDEADEDADAAEEAEARRAIGLDASDAAGQPNFPRPAPSASSSAATASTSAHPSASPSTSSPSSAPPAPAPESKKRPRTTPRVRKKPYHALLNPPPSDSPSPEPEEVPLPTVGKKKNPALQSAIETVGKTWHAGKGEGGVREGAKRREWNWEAKMQVSRRKFFL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.75
3	0.77
4	0.75
5	0.76
6	0.76
7	0.79
8	0.85
9	0.8
10	0.8
11	0.78
12	0.8
13	0.8
14	0.8
15	0.8
16	0.83
17	0.9
18	0.91
19	0.93
20	0.91
21	0.89
22	0.89
23	0.89
24	0.87
25	0.85
26	0.83
27	0.83
28	0.83
29	0.82
30	0.74
31	0.66
32	0.64
33	0.58
34	0.48
35	0.39
36	0.35
37	0.29
38	0.31
39	0.33
40	0.26
41	0.25
42	0.3
43	0.34
44	0.36
45	0.36
46	0.37
47	0.33
48	0.33
49	0.34
50	0.32
51	0.28
52	0.23
53	0.21
54	0.17
55	0.16
56	0.15
57	0.14
58	0.12
59	0.13
60	0.13
61	0.14
62	0.13
63	0.15
64	0.15
65	0.19
66	0.23
67	0.23
68	0.29
69	0.3
70	0.31
71	0.3
72	0.29
73	0.25
74	0.2
75	0.18
76	0.12
77	0.09
78	0.06
79	0.06
80	0.06
81	0.06
82	0.06
83	0.06
84	0.06
85	0.06
86	0.06
87	0.06
88	0.06
89	0.09
90	0.12
91	0.14
92	0.18
93	0.21
94	0.25
95	0.28
96	0.29
97	0.31
98	0.31
99	0.35
100	0.32
101	0.32
102	0.32
103	0.31
104	0.32
105	0.27
106	0.24
107	0.17
108	0.18
109	0.15
110	0.15
111	0.19
112	0.18
113	0.22
114	0.25
115	0.26
116	0.25
117	0.3
118	0.36
119	0.4
120	0.41
121	0.41
122	0.44
123	0.46
124	0.47
125	0.42
126	0.36
127	0.29
128	0.26
129	0.21
130	0.16
131	0.14
132	0.13
133	0.15
134	0.13
135	0.12
136	0.13
137	0.15
138	0.16
139	0.25
140	0.33
141	0.38
142	0.47
143	0.56
144	0.59
145	0.6
146	0.6
147	0.6
148	0.59
149	0.55
150	0.53
151	0.49
152	0.5
153	0.54
154	0.57
155	0.55
156	0.52
157	0.54
158	0.48
159	0.49
160	0.47
161	0.44
162	0.43
163	0.4
164	0.35
165	0.31
166	0.28
167	0.22
168	0.19
169	0.15
170	0.11
171	0.08
172	0.09
173	0.06
174	0.06
175	0.06
176	0.07
177	0.08
178	0.08
179	0.09
180	0.09
181	0.1
182	0.11
183	0.12
184	0.11
185	0.1
186	0.11
187	0.12
188	0.14
189	0.16
190	0.17
191	0.17
192	0.17
193	0.18
194	0.18
195	0.23
196	0.23
197	0.2
198	0.2
199	0.19
200	0.19
201	0.18
202	0.17
203	0.15
204	0.13
205	0.15
206	0.16
207	0.17
208	0.17
209	0.24
210	0.28
211	0.24
212	0.22
213	0.2
214	0.22
215	0.23
216	0.24
217	0.2
218	0.16
219	0.16
220	0.16
221	0.15
222	0.12
223	0.1
224	0.08
225	0.05
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.05
239	0.05
240	0.06
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.09
245	0.16
246	0.17
247	0.17
248	0.16
249	0.17
250	0.17
251	0.18
252	0.19
253	0.13
254	0.13
255	0.14
256	0.15
257	0.15
258	0.17
259	0.17
260	0.14
261	0.14
262	0.14
263	0.13
264	0.12
265	0.12
266	0.19
267	0.22
268	0.26
269	0.29
270	0.29
271	0.3
272	0.32
273	0.35
274	0.28
275	0.3
276	0.33
277	0.31
278	0.35
279	0.37
280	0.38
281	0.39
282	0.41
283	0.45
284	0.47
285	0.52
286	0.52
287	0.56
288	0.59
289	0.63
290	0.68
291	0.64
292	0.59
293	0.56
294	0.53
295	0.53
296	0.48
297	0.43
298	0.37
299	0.33
300	0.27
301	0.25
302	0.25
303	0.17
304	0.18
305	0.15
306	0.13
307	0.14
308	0.14
309	0.14
310	0.14
311	0.13
312	0.18
313	0.19
314	0.24
315	0.23
316	0.23
317	0.22
318	0.22
319	0.23
320	0.18
321	0.24
322	0.21
323	0.27
324	0.3
325	0.33
326	0.37
327	0.41
328	0.4
329	0.4
330	0.4
331	0.35
332	0.34
333	0.32
334	0.29
335	0.25
336	0.24
337	0.19
338	0.18
339	0.18
340	0.19
341	0.19
342	0.19
343	0.24
344	0.28
345	0.27
346	0.31
347	0.32
348	0.33
349	0.3
350	0.28
351	0.25
352	0.2
353	0.18
354	0.13
355	0.12
356	0.08
357	0.08
358	0.07
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.04
367	0.04
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.03
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.02
383	0.02
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.03
402	0.03
403	0.05
404	0.05
405	0.07
406	0.07
407	0.07
408	0.07
409	0.07
410	0.08
411	0.07
412	0.08
413	0.06
414	0.07
415	0.08
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.07
420	0.07
421	0.08
422	0.15
423	0.16
424	0.16
425	0.19
426	0.21
427	0.26
428	0.3
429	0.32
430	0.28
431	0.28
432	0.29
433	0.26
434	0.24
435	0.2
436	0.16
437	0.13
438	0.11
439	0.12
440	0.13
441	0.13
442	0.13
443	0.12
444	0.15
445	0.18
446	0.17
447	0.17
448	0.16
449	0.21
450	0.22
451	0.24
452	0.22
453	0.22
454	0.25
455	0.25
456	0.27
457	0.23
458	0.27
459	0.3
460	0.34
461	0.38
462	0.43
463	0.51
464	0.59
465	0.67
466	0.66
467	0.72
468	0.76
469	0.8
470	0.82
471	0.83
472	0.85
473	0.87
474	0.91
475	0.9
476	0.9
477	0.9
478	0.86
479	0.86
480	0.79
481	0.78
482	0.8
483	0.8
484	0.71
485	0.62
486	0.55
487	0.49
488	0.48
489	0.42
490	0.38
491	0.34
492	0.39
493	0.38
494	0.38
495	0.35
496	0.36
497	0.32
498	0.29
499	0.25
500	0.2
501	0.24
502	0.31
503	0.34
504	0.37
505	0.44
506	0.49
507	0.54
508	0.56
509	0.57
510	0.55
511	0.55
512	0.52
513	0.48
514	0.44
515	0.38
516	0.34
517	0.29
518	0.26
519	0.22
520	0.19
521	0.18
522	0.19
523	0.2
524	0.2
525	0.21
526	0.25
527	0.29
528	0.3
529	0.29
530	0.27
531	0.26
532	0.33
533	0.39
534	0.36
535	0.38
536	0.43
537	0.44
538	0.52
539	0.56
540	0.59
541	0.58
542	0.61
543	0.57
544	0.56
545	0.62
546	0.59
547	0.64
548	0.63

A0A5C5FXQ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer