Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FWY2

Protein Details
Accession A0A5C5FWY2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
139-158VARWLQKRGKWGKGKTKELTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-50RRRGSRSNAGSGKAPK
884-887KKRA
Subcellular Location(s) mito 8cyto 8cyto_mito 8, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MARPPPPPPASLYANPVPFSFFATLVDKVGAVAARRRGSRSNAGSGKAPKEHRLLKAWVEGVRAEHRDGVEPEGTIVLFFRLFFPDEGVRRRYGLQELTLGEALETVYGAKRGTFRGWDEAEVSSATGCASSGSFGEEVARWLQKRGKWGKGKTKELTMGRVDELLDELATLSTWSSADVQLLRLDPRRKLRSATAILADLLLPLSPPETAVMLQIILRDLSPLLYPPPSASGDAALTRYTSLAYSEISVYDAMRVWHEGMPRLFQAVADLDWVAWQAETAIRQRRPLAPPMPRIGLPIKVPKTEKPGSCSRATRHLEGEVAVETKYDGERLQIHIDSSLPPRDQVRIFSKSGRDSTETRHLLIPIIRASLDLPLDPLSRALHPLLYERLLASASSRPPNPFPPTKLILEGEMVPFDESRSRIDEFWKLAFAKGGAAPPPGTGGRPFERPPGKDDRPESHETGATGATPSPRRSRRLPGSSPLVEAEARSKEDDPAKNLHLMVVWFDVLLLDDESLLDEAYVSRRARLDSLIRPIPGFSMLSERVLINFDHKQSALENLRLRFAHIITRRCEGLMLKPLSSAYNDPRASQRMIKLKKDFVPGAGDTLDFHIVGASWQKQRARELLVPPSVYTTFFVGLREDKFGANLSRERKPHYHILFSVSYGLSRTQLAQLCHDIDQGQPERFELEFGADAKRGGAFRPVRECKRMRRGAARGGYTVYDAACASFTFSLADHLRSVASRPSVIFRDPRVMELNGAGFQRSPGCPYYELRFPRLTKPTRSPDSGASPLSLDKLQLVAQEAVGAAPSTAAALVDHIWNAAVRDAAIGSLSEQETSGAGLDSQEKYDREVRGWVERLEKADGVLDGEASTTLVRPRGGDEATREKKRARVDKRVSGSSSTRATSPTVERPQGPNAARLAPPAPTTAAFDTARVPPAASPPPHASSALLRSLSSPCARSSAPSPSQRLRAPAKEPPMQGAKRAPLASTVSCPALHASKKRRKSSSTSSRASLSSALTTLLSPLSPSSSLASAGDTAVSYPSRAFAWSVYPPLRPGTPVPVPRHPFLDDSNFLASPLSVLWVAGLAPASLASSAGAAGAGTRRQGFVFVAPGATVERECVGWLEGEVRKEGGEVVKGGETQVVWVVKDEALDACGLWDLGRGGEVLTVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.46
3 0.41
4 0.38
5 0.3
6 0.31
7 0.26
8 0.2
9 0.19
10 0.22
11 0.23
12 0.21
13 0.21
14 0.17
15 0.15
16 0.16
17 0.15
18 0.14
19 0.19
20 0.25
21 0.3
22 0.33
23 0.37
24 0.41
25 0.46
26 0.54
27 0.55
28 0.57
29 0.57
30 0.57
31 0.59
32 0.6
33 0.6
34 0.57
35 0.55
36 0.51
37 0.55
38 0.6
39 0.58
40 0.59
41 0.57
42 0.54
43 0.57
44 0.55
45 0.49
46 0.44
47 0.39
48 0.37
49 0.39
50 0.36
51 0.31
52 0.3
53 0.29
54 0.33
55 0.33
56 0.33
57 0.27
58 0.24
59 0.23
60 0.21
61 0.2
62 0.14
63 0.13
64 0.1
65 0.08
66 0.09
67 0.1
68 0.11
69 0.13
70 0.14
71 0.18
72 0.23
73 0.29
74 0.34
75 0.37
76 0.36
77 0.36
78 0.38
79 0.37
80 0.36
81 0.34
82 0.31
83 0.32
84 0.32
85 0.33
86 0.32
87 0.28
88 0.21
89 0.18
90 0.15
91 0.1
92 0.09
93 0.06
94 0.06
95 0.08
96 0.08
97 0.1
98 0.13
99 0.16
100 0.2
101 0.24
102 0.26
103 0.33
104 0.35
105 0.35
106 0.34
107 0.31
108 0.29
109 0.24
110 0.21
111 0.13
112 0.11
113 0.09
114 0.07
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.09
121 0.08
122 0.09
123 0.11
124 0.1
125 0.12
126 0.15
127 0.2
128 0.19
129 0.24
130 0.29
131 0.3
132 0.4
133 0.47
134 0.53
135 0.57
136 0.67
137 0.73
138 0.77
139 0.84
140 0.78
141 0.78
142 0.76
143 0.7
144 0.66
145 0.59
146 0.52
147 0.43
148 0.4
149 0.32
150 0.24
151 0.22
152 0.16
153 0.11
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.08
164 0.08
165 0.11
166 0.11
167 0.13
168 0.14
169 0.16
170 0.19
171 0.25
172 0.29
173 0.34
174 0.43
175 0.48
176 0.49
177 0.52
178 0.55
179 0.57
180 0.58
181 0.56
182 0.48
183 0.43
184 0.4
185 0.36
186 0.29
187 0.19
188 0.13
189 0.08
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.15
216 0.15
217 0.16
218 0.15
219 0.15
220 0.15
221 0.16
222 0.16
223 0.13
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.14
245 0.16
246 0.2
247 0.2
248 0.23
249 0.22
250 0.22
251 0.2
252 0.17
253 0.17
254 0.13
255 0.12
256 0.1
257 0.1
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.07
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.09
267 0.15
268 0.23
269 0.24
270 0.27
271 0.31
272 0.38
273 0.41
274 0.46
275 0.49
276 0.49
277 0.54
278 0.56
279 0.55
280 0.48
281 0.47
282 0.41
283 0.36
284 0.32
285 0.35
286 0.34
287 0.36
288 0.39
289 0.39
290 0.45
291 0.49
292 0.47
293 0.44
294 0.5
295 0.49
296 0.52
297 0.54
298 0.49
299 0.52
300 0.53
301 0.5
302 0.44
303 0.41
304 0.35
305 0.3
306 0.29
307 0.19
308 0.16
309 0.13
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.09
317 0.11
318 0.14
319 0.18
320 0.17
321 0.17
322 0.17
323 0.18
324 0.18
325 0.19
326 0.21
327 0.18
328 0.18
329 0.19
330 0.23
331 0.23
332 0.27
333 0.3
334 0.3
335 0.32
336 0.35
337 0.39
338 0.39
339 0.41
340 0.38
341 0.35
342 0.32
343 0.36
344 0.42
345 0.38
346 0.35
347 0.35
348 0.32
349 0.3
350 0.3
351 0.27
352 0.18
353 0.17
354 0.15
355 0.14
356 0.14
357 0.13
358 0.12
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.11
363 0.1
364 0.11
365 0.1
366 0.1
367 0.12
368 0.12
369 0.11
370 0.11
371 0.14
372 0.15
373 0.14
374 0.14
375 0.12
376 0.12
377 0.12
378 0.11
379 0.1
380 0.12
381 0.15
382 0.18
383 0.2
384 0.22
385 0.24
386 0.3
387 0.35
388 0.36
389 0.36
390 0.39
391 0.41
392 0.4
393 0.4
394 0.34
395 0.29
396 0.25
397 0.22
398 0.17
399 0.13
400 0.12
401 0.09
402 0.09
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.1
407 0.13
408 0.14
409 0.15
410 0.18
411 0.22
412 0.22
413 0.22
414 0.23
415 0.21
416 0.2
417 0.19
418 0.17
419 0.14
420 0.13
421 0.14
422 0.12
423 0.12
424 0.12
425 0.11
426 0.13
427 0.12
428 0.11
429 0.11
430 0.14
431 0.16
432 0.2
433 0.21
434 0.27
435 0.32
436 0.32
437 0.36
438 0.41
439 0.42
440 0.44
441 0.48
442 0.45
443 0.46
444 0.5
445 0.47
446 0.39
447 0.36
448 0.3
449 0.27
450 0.22
451 0.15
452 0.11
453 0.1
454 0.11
455 0.13
456 0.16
457 0.23
458 0.28
459 0.32
460 0.36
461 0.45
462 0.51
463 0.57
464 0.58
465 0.56
466 0.59
467 0.55
468 0.52
469 0.42
470 0.34
471 0.25
472 0.21
473 0.19
474 0.13
475 0.13
476 0.14
477 0.14
478 0.16
479 0.22
480 0.24
481 0.24
482 0.26
483 0.26
484 0.27
485 0.26
486 0.23
487 0.17
488 0.15
489 0.13
490 0.1
491 0.08
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.05
496 0.06
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.05
508 0.1
509 0.1
510 0.11
511 0.12
512 0.13
513 0.14
514 0.17
515 0.21
516 0.2
517 0.27
518 0.28
519 0.27
520 0.27
521 0.26
522 0.23
523 0.19
524 0.15
525 0.09
526 0.11
527 0.11
528 0.12
529 0.12
530 0.12
531 0.11
532 0.12
533 0.12
534 0.1
535 0.12
536 0.13
537 0.13
538 0.13
539 0.14
540 0.13
541 0.19
542 0.18
543 0.2
544 0.23
545 0.22
546 0.25
547 0.24
548 0.24
549 0.19
550 0.18
551 0.21
552 0.23
553 0.27
554 0.26
555 0.28
556 0.28
557 0.26
558 0.27
559 0.2
560 0.18
561 0.22
562 0.21
563 0.19
564 0.2
565 0.2
566 0.2
567 0.2
568 0.18
569 0.12
570 0.2
571 0.2
572 0.21
573 0.23
574 0.25
575 0.26
576 0.26
577 0.29
578 0.3
579 0.34
580 0.4
581 0.41
582 0.43
583 0.46
584 0.47
585 0.42
586 0.34
587 0.33
588 0.27
589 0.24
590 0.2
591 0.16
592 0.11
593 0.12
594 0.11
595 0.07
596 0.07
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.07
601 0.1
602 0.11
603 0.15
604 0.17
605 0.19
606 0.21
607 0.24
608 0.26
609 0.28
610 0.3
611 0.33
612 0.33
613 0.31
614 0.29
615 0.28
616 0.24
617 0.2
618 0.16
619 0.11
620 0.1
621 0.1
622 0.1
623 0.09
624 0.11
625 0.11
626 0.13
627 0.12
628 0.11
629 0.12
630 0.13
631 0.13
632 0.14
633 0.18
634 0.2
635 0.25
636 0.26
637 0.31
638 0.32
639 0.35
640 0.41
641 0.39
642 0.39
643 0.35
644 0.38
645 0.34
646 0.32
647 0.29
648 0.2
649 0.17
650 0.14
651 0.13
652 0.09
653 0.09
654 0.09
655 0.11
656 0.15
657 0.16
658 0.17
659 0.18
660 0.19
661 0.19
662 0.19
663 0.15
664 0.12
665 0.17
666 0.18
667 0.17
668 0.15
669 0.15
670 0.16
671 0.16
672 0.16
673 0.1
674 0.09
675 0.09
676 0.1
677 0.11
678 0.09
679 0.09
680 0.09
681 0.1
682 0.09
683 0.08
684 0.16
685 0.17
686 0.2
687 0.3
688 0.37
689 0.4
690 0.47
691 0.52
692 0.53
693 0.61
694 0.65
695 0.6
696 0.63
697 0.64
698 0.65
699 0.66
700 0.58
701 0.49
702 0.43
703 0.38
704 0.29
705 0.24
706 0.15
707 0.1
708 0.08
709 0.07
710 0.06
711 0.06
712 0.06
713 0.06
714 0.06
715 0.06
716 0.06
717 0.11
718 0.11
719 0.13
720 0.11
721 0.12
722 0.12
723 0.12
724 0.13
725 0.12
726 0.12
727 0.12
728 0.12
729 0.15
730 0.17
731 0.19
732 0.21
733 0.2
734 0.26
735 0.26
736 0.28
737 0.28
738 0.26
739 0.25
740 0.22
741 0.22
742 0.16
743 0.16
744 0.14
745 0.1
746 0.1
747 0.12
748 0.11
749 0.13
750 0.12
751 0.14
752 0.16
753 0.18
754 0.22
755 0.27
756 0.29
757 0.3
758 0.35
759 0.35
760 0.41
761 0.48
762 0.49
763 0.48
764 0.55
765 0.59
766 0.59
767 0.6
768 0.55
769 0.5
770 0.51
771 0.48
772 0.4
773 0.31
774 0.27
775 0.23
776 0.23
777 0.18
778 0.12
779 0.09
780 0.09
781 0.09
782 0.09
783 0.12
784 0.1
785 0.1
786 0.1
787 0.1
788 0.09
789 0.08
790 0.07
791 0.04
792 0.03
793 0.03
794 0.03
795 0.03
796 0.03
797 0.03
798 0.04
799 0.05
800 0.05
801 0.05
802 0.05
803 0.06
804 0.06
805 0.06
806 0.06
807 0.06
808 0.05
809 0.05
810 0.05
811 0.05
812 0.05
813 0.05
814 0.05
815 0.07
816 0.08
817 0.07
818 0.07
819 0.08
820 0.08
821 0.08
822 0.08
823 0.05
824 0.05
825 0.05
826 0.09
827 0.09
828 0.11
829 0.14
830 0.14
831 0.17
832 0.23
833 0.23
834 0.22
835 0.26
836 0.27
837 0.31
838 0.33
839 0.32
840 0.32
841 0.33
842 0.34
843 0.32
844 0.29
845 0.22
846 0.21
847 0.18
848 0.14
849 0.12
850 0.1
851 0.07
852 0.07
853 0.07
854 0.06
855 0.06
856 0.05
857 0.07
858 0.09
859 0.09
860 0.1
861 0.12
862 0.16
863 0.17
864 0.18
865 0.23
866 0.32
867 0.4
868 0.44
869 0.44
870 0.42
871 0.46
872 0.53
873 0.58
874 0.56
875 0.59
876 0.64
877 0.71
878 0.75
879 0.76
880 0.69
881 0.63
882 0.57
883 0.51
884 0.46
885 0.37
886 0.31
887 0.27
888 0.26
889 0.25
890 0.27
891 0.31
892 0.34
893 0.36
894 0.39
895 0.41
896 0.44
897 0.48
898 0.44
899 0.39
900 0.35
901 0.35
902 0.32
903 0.31
904 0.28
905 0.22
906 0.21
907 0.19
908 0.18
909 0.15
910 0.18
911 0.17
912 0.21
913 0.19
914 0.19
915 0.2
916 0.21
917 0.22
918 0.19
919 0.18
920 0.14
921 0.2
922 0.26
923 0.24
924 0.27
925 0.3
926 0.33
927 0.34
928 0.34
929 0.29
930 0.27
931 0.3
932 0.3
933 0.25
934 0.22
935 0.23
936 0.24
937 0.28
938 0.26
939 0.23
940 0.19
941 0.22
942 0.22
943 0.23
944 0.25
945 0.3
946 0.36
947 0.41
948 0.46
949 0.48
950 0.54
951 0.54
952 0.57
953 0.55
954 0.53
955 0.52
956 0.54
957 0.56
958 0.57
959 0.55
960 0.53
961 0.55
962 0.5
963 0.48
964 0.47
965 0.44
966 0.43
967 0.42
968 0.37
969 0.32
970 0.35
971 0.32
972 0.29
973 0.27
974 0.23
975 0.22
976 0.23
977 0.21
978 0.23
979 0.27
980 0.33
981 0.41
982 0.5
983 0.6
984 0.68
985 0.73
986 0.73
987 0.76
988 0.78
989 0.79
990 0.79
991 0.74
992 0.67
993 0.63
994 0.57
995 0.5
996 0.41
997 0.31
998 0.23
999 0.19
1000 0.17
1001 0.14
1002 0.13
1003 0.13
1004 0.11
1005 0.09
1006 0.08
1007 0.08
1008 0.1
1009 0.1
1010 0.11
1011 0.12
1012 0.13
1013 0.14
1014 0.13
1015 0.14
1016 0.12
1017 0.12
1018 0.11
1019 0.09
1020 0.08
1021 0.1
1022 0.1
1023 0.09
1024 0.09
1025 0.1
1026 0.1
1027 0.11
1028 0.12
1029 0.1
1030 0.16
1031 0.19
1032 0.25
1033 0.27
1034 0.28
1035 0.29
1036 0.31
1037 0.31
1038 0.28
1039 0.27
1040 0.29
1041 0.34
1042 0.41
1043 0.46
1044 0.53
1045 0.57
1046 0.56
1047 0.57
1048 0.52
1049 0.46
1050 0.43
1051 0.44
1052 0.36
1053 0.35
1054 0.37
1055 0.32
1056 0.3
1057 0.27
1058 0.22
1059 0.15
1060 0.13
1061 0.11
1062 0.07
1063 0.07
1064 0.07
1065 0.07
1066 0.07
1067 0.07
1068 0.07
1069 0.05
1070 0.05
1071 0.05
1072 0.06
1073 0.06
1074 0.06
1075 0.05
1076 0.05
1077 0.05
1078 0.05
1079 0.05
1080 0.04
1081 0.05
1082 0.08
1083 0.09
1084 0.12
1085 0.13
1086 0.14
1087 0.14
1088 0.16
1089 0.17
1090 0.17
1091 0.19
1092 0.18
1093 0.17
1094 0.16
1095 0.16
1096 0.16
1097 0.16
1098 0.13
1099 0.1
1100 0.11
1101 0.1
1102 0.11
1103 0.11
1104 0.11
1105 0.1
1106 0.11
1107 0.16
1108 0.18
1109 0.2
1110 0.2
1111 0.2
1112 0.19
1113 0.19
1114 0.21
1115 0.17
1116 0.17
1117 0.16
1118 0.17
1119 0.19
1120 0.19
1121 0.19
1122 0.18
1123 0.15
1124 0.13
1125 0.18
1126 0.17
1127 0.15
1128 0.16
1129 0.18
1130 0.17
1131 0.17
1132 0.17
1133 0.12
1134 0.12
1135 0.12
1136 0.1
1137 0.09
1138 0.09
1139 0.08
1140 0.07
1141 0.08
1142 0.08
1143 0.08
1144 0.09
1145 0.08
1146 0.08