Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FUB3

Protein Details
Accession A0A5C5FUB3    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
195-226RSDSRSRSRSRTPPRKRRARSRSRSRSISRGRBasic
282-313ASRSRSRSGSRSRSRSPPAKRVRRRSEGGDSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-155RRRAKAAAEAAKTHRGRRAR
189-331RSRSRSRSDSRSRSRSRTPPRKRRARSRSRSRSISRGRSHSRRGGSSSRSRSRSRSESPSRGRGRSYDRSRSRSRSRSRSVGSKGRARSGSRSASRSRSRSGSRSRSRSPPAKRVRRRSEGGDSVAAGTRGNDAERKGKRKAR
Subcellular Location(s) nucl 10, extr 9, cyto 6, mito_nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13917  zf-CCHC_3  
Amino Acid Sequences MNSAEEQAAPPWAPPLLLACTLPCATLSTPAMQSNYLGLSSRRGATGPPGGPPGGGQRYGKQPPASASTRCQKCNQLGHWSFECKGQREYKVRPTRTQILKNPKLRPALTEAAPPRTEDMPKEGTAAAILAANEARRRAKAAAEAAKTHRGRRARSDSVSSSGSSRSRSRSSSASSGSYSSGSSRSDSRSRSRSRSDSRSRSRSRTPPRKRRARSRSRSRSISRGRSHSRRGGSSSRSRSRSRSESPSRGRGRSYDRSRSRSRSRSRSVGSKGRARSGSRSASRSRSRSGSRSRSRSPPAKRVRRRSEGGDSVAAGTRGNDAERKGKRKARAVDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.14
3 0.15
4 0.16
5 0.17
6 0.15
7 0.19
8 0.2
9 0.19
10 0.16
11 0.15
12 0.14
13 0.2
14 0.21
15 0.21
16 0.23
17 0.26
18 0.27
19 0.24
20 0.24
21 0.19
22 0.19
23 0.16
24 0.15
25 0.13
26 0.16
27 0.18
28 0.19
29 0.18
30 0.17
31 0.17
32 0.21
33 0.29
34 0.26
35 0.26
36 0.27
37 0.26
38 0.26
39 0.26
40 0.28
41 0.24
42 0.26
43 0.25
44 0.26
45 0.35
46 0.4
47 0.44
48 0.38
49 0.37
50 0.37
51 0.42
52 0.42
53 0.37
54 0.39
55 0.44
56 0.48
57 0.49
58 0.49
59 0.49
60 0.53
61 0.58
62 0.56
63 0.57
64 0.54
65 0.57
66 0.56
67 0.53
68 0.46
69 0.44
70 0.45
71 0.37
72 0.39
73 0.4
74 0.44
75 0.48
76 0.54
77 0.58
78 0.64
79 0.65
80 0.65
81 0.66
82 0.68
83 0.69
84 0.71
85 0.7
86 0.7
87 0.75
88 0.77
89 0.75
90 0.72
91 0.69
92 0.6
93 0.54
94 0.5
95 0.45
96 0.38
97 0.39
98 0.36
99 0.35
100 0.35
101 0.32
102 0.28
103 0.26
104 0.26
105 0.2
106 0.22
107 0.21
108 0.21
109 0.22
110 0.19
111 0.17
112 0.15
113 0.14
114 0.09
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.12
125 0.13
126 0.14
127 0.18
128 0.24
129 0.29
130 0.3
131 0.32
132 0.32
133 0.4
134 0.39
135 0.37
136 0.36
137 0.34
138 0.34
139 0.41
140 0.47
141 0.44
142 0.46
143 0.49
144 0.45
145 0.43
146 0.42
147 0.33
148 0.25
149 0.22
150 0.21
151 0.19
152 0.19
153 0.2
154 0.22
155 0.23
156 0.25
157 0.25
158 0.28
159 0.29
160 0.29
161 0.26
162 0.24
163 0.23
164 0.22
165 0.19
166 0.15
167 0.12
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.16
173 0.2
174 0.23
175 0.28
176 0.36
177 0.41
178 0.45
179 0.5
180 0.55
181 0.58
182 0.64
183 0.68
184 0.7
185 0.73
186 0.78
187 0.77
188 0.74
189 0.75
190 0.75
191 0.76
192 0.77
193 0.79
194 0.8
195 0.85
196 0.9
197 0.9
198 0.91
199 0.91
200 0.91
201 0.91
202 0.91
203 0.92
204 0.89
205 0.9
206 0.82
207 0.82
208 0.8
209 0.79
210 0.74
211 0.72
212 0.72
213 0.71
214 0.74
215 0.71
216 0.66
217 0.59
218 0.58
219 0.56
220 0.55
221 0.57
222 0.6
223 0.6
224 0.61
225 0.61
226 0.61
227 0.62
228 0.63
229 0.6
230 0.6
231 0.61
232 0.66
233 0.7
234 0.75
235 0.73
236 0.68
237 0.63
238 0.58
239 0.58
240 0.58
241 0.6
242 0.6
243 0.63
244 0.68
245 0.73
246 0.77
247 0.78
248 0.78
249 0.79
250 0.79
251 0.78
252 0.8
253 0.77
254 0.78
255 0.76
256 0.75
257 0.72
258 0.69
259 0.65
260 0.63
261 0.63
262 0.57
263 0.56
264 0.54
265 0.57
266 0.54
267 0.57
268 0.55
269 0.59
270 0.64
271 0.62
272 0.6
273 0.59
274 0.6
275 0.63
276 0.68
277 0.69
278 0.71
279 0.75
280 0.76
281 0.77
282 0.8
283 0.81
284 0.79
285 0.79
286 0.8
287 0.83
288 0.87
289 0.89
290 0.89
291 0.89
292 0.85
293 0.83
294 0.81
295 0.77
296 0.71
297 0.62
298 0.53
299 0.46
300 0.42
301 0.34
302 0.24
303 0.18
304 0.16
305 0.15
306 0.16
307 0.17
308 0.18
309 0.28
310 0.37
311 0.43
312 0.5
313 0.56
314 0.63
315 0.7
316 0.76