FuNGI

A0A5C5FNQ1

Protein Details

Accession

A0A5C5FNQ1

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-43	RAPPPTWHLRHSPRRPLLRHCSCRT	Hydrophilic
56-80	QVDLPQSRRPTRQERRPRRSAAAAN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
70-73	RRPR
400-414	KKEKRHITFSKRKAG

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR033897 MADS_SRF-like IPR002100 TF_MADSbox IPR036879 TF_MADSbox_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0000987 F:cis-regulatory region sequence-specific DNA binding GO:0000981 F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific GO:0046983 F:protein dimerization activity GO:0045944 P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF00319 SRF-TF
PROSITE	View protein in PROSITE PS00350 MADS_BOX_1 PS50066 MADS_BOX_2
CDD	cd00266 MADS_SRF_like

Amino Acid Sequences

MRQFRGEGDQGELTDVLHRAPPPTWHLRHSPRRPLLRHCSCRTAALAHRDPAPRPQVDLPQSRRPTRQERRPRRSAAAANLCSNRRGALAHPRRTPVCLGNLALPTSRPPSSGSHSQARPTSLAAPASPPRPAPPSHPERDSRCPNLSRRGRPRASQHNRKAGVNDGAGQWTSGREHSVALSHLPLSHPTPSWSPSSPCFSSFWEVHPHAPDQQCLSAVPGRTGPVHQPPQQQQQPHANPSPVSPGLTLPEQQLQQQQQPAPPPGASSSAQPLLPALNIDSPGISCSAAASSAPATRSSTRPQRGAAPAIVAFDPNAAGSDDEDDFDEGASPKKKQRTSARGRSGGANASAGAAGGASADGGVRQASVGSGAEGGGGDAAGDGADPDKGRRKIEIEYIQKKEKRHITFSKRKAGIMKKAYELATLTGTEVLLLVVSETGIVYTFTTTKFQPLVGANPDGSPSEGQRLIQRCLPNPNRPPHPLDPYPHPHHSPSSSPHQPRHLPAPPGHYQAAAPRSMQDPYAAERAHYGGPPPPPGEDMHMLSPHQQHLPPPPPHLQHVNNNQPPPNMGLPQPPPELYMQHAPPPPHQGGPPQGHPGQGQQQQQQQQAQMYEGQDTYMRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.18
3	0.14
4	0.16
5	0.16
6	0.17
7	0.19
8	0.24
9	0.28
10	0.38
11	0.41
12	0.42
13	0.52
14	0.6
15	0.69
16	0.74
17	0.78
18	0.77
19	0.83
20	0.84
21	0.84
22	0.84
23	0.85
24	0.85
25	0.79
26	0.78
27	0.7
28	0.67
29	0.6
30	0.56
31	0.52
32	0.52
33	0.52
34	0.46
35	0.52
36	0.52
37	0.51
38	0.52
39	0.52
40	0.43
41	0.42
42	0.44
43	0.46
44	0.51
45	0.59
46	0.58
47	0.61
48	0.67
49	0.68
50	0.7
51	0.7
52	0.73
53	0.74
54	0.78
55	0.79
56	0.82
57	0.86
58	0.89
59	0.88
60	0.84
61	0.82
62	0.78
63	0.77
64	0.76
65	0.7
66	0.67
67	0.66
68	0.6
69	0.52
70	0.45
71	0.35
72	0.25
73	0.23
74	0.21
75	0.27
76	0.36
77	0.44
78	0.48
79	0.53
80	0.53
81	0.55
82	0.55
83	0.48
84	0.44
85	0.39
86	0.35
87	0.34
88	0.35
89	0.33
90	0.29
91	0.25
92	0.22
93	0.23
94	0.22
95	0.18
96	0.19
97	0.22
98	0.29
99	0.37
100	0.39
101	0.44
102	0.45
103	0.49
104	0.5
105	0.48
106	0.42
107	0.35
108	0.32
109	0.27
110	0.26
111	0.21
112	0.23
113	0.24
114	0.25
115	0.25
116	0.23
117	0.23
118	0.26
119	0.27
120	0.29
121	0.34
122	0.41
123	0.45
124	0.5
125	0.53
126	0.57
127	0.65
128	0.66
129	0.63
130	0.61
131	0.62
132	0.62
133	0.66
134	0.69
135	0.69
136	0.72
137	0.76
138	0.73
139	0.73
140	0.76
141	0.77
142	0.79
143	0.79
144	0.78
145	0.78
146	0.76
147	0.71
148	0.64
149	0.58
150	0.53
151	0.42
152	0.35
153	0.26
154	0.24
155	0.22
156	0.2
157	0.15
158	0.11
159	0.11
160	0.1
161	0.1
162	0.09
163	0.1
164	0.11
165	0.12
166	0.12
167	0.11
168	0.12
169	0.11
170	0.11
171	0.11
172	0.13
173	0.13
174	0.15
175	0.14
176	0.16
177	0.18
178	0.19
179	0.22
180	0.23
181	0.23
182	0.24
183	0.3
184	0.29
185	0.28
186	0.28
187	0.27
188	0.29
189	0.27
190	0.27
191	0.28
192	0.28
193	0.29
194	0.3
195	0.28
196	0.3
197	0.3
198	0.29
199	0.24
200	0.23
201	0.21
202	0.19
203	0.2
204	0.17
205	0.16
206	0.15
207	0.14
208	0.14
209	0.14
210	0.16
211	0.17
212	0.22
213	0.28
214	0.32
215	0.38
216	0.43
217	0.52
218	0.55
219	0.53
220	0.49
221	0.53
222	0.53
223	0.52
224	0.49
225	0.41
226	0.37
227	0.36
228	0.37
229	0.26
230	0.23
231	0.17
232	0.15
233	0.15
234	0.16
235	0.16
236	0.12
237	0.15
238	0.14
239	0.15
240	0.2
241	0.2
242	0.22
243	0.26
244	0.26
245	0.25
246	0.28
247	0.28
248	0.24
249	0.22
250	0.2
251	0.17
252	0.19
253	0.16
254	0.14
255	0.15
256	0.15
257	0.15
258	0.14
259	0.13
260	0.1
261	0.1
262	0.09
263	0.07
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.06
269	0.06
270	0.07
271	0.06
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.04
277	0.04
278	0.05
279	0.07
280	0.07
281	0.08
282	0.1
283	0.12
284	0.15
285	0.2
286	0.29
287	0.31
288	0.32
289	0.33
290	0.36
291	0.37
292	0.37
293	0.31
294	0.24
295	0.2
296	0.19
297	0.18
298	0.12
299	0.09
300	0.07
301	0.06
302	0.05
303	0.05
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.07
315	0.05
316	0.09
317	0.1
318	0.12
319	0.17
320	0.24
321	0.26
322	0.33
323	0.43
324	0.51
325	0.59
326	0.68
327	0.72
328	0.7
329	0.69
330	0.63
331	0.55
332	0.45
333	0.35
334	0.25
335	0.16
336	0.12
337	0.11
338	0.08
339	0.06
340	0.04
341	0.03
342	0.03
343	0.02
344	0.02
345	0.02
346	0.02
347	0.02
348	0.02
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.03
363	0.03
364	0.02
365	0.02
366	0.02
367	0.02
368	0.02
369	0.02
370	0.02
371	0.04
372	0.04
373	0.06
374	0.15
375	0.18
376	0.19
377	0.21
378	0.24
379	0.26
380	0.34
381	0.42
382	0.43
383	0.49
384	0.53
385	0.59
386	0.6
387	0.59
388	0.58
389	0.57
390	0.53
391	0.54
392	0.59
393	0.61
394	0.69
395	0.75
396	0.77
397	0.7
398	0.67
399	0.66
400	0.64
401	0.63
402	0.6
403	0.55
404	0.47
405	0.49
406	0.47
407	0.4
408	0.33
409	0.24
410	0.18
411	0.15
412	0.13
413	0.1
414	0.09
415	0.08
416	0.07
417	0.06
418	0.04
419	0.04
420	0.03
421	0.03
422	0.03
423	0.03
424	0.03
425	0.03
426	0.03
427	0.04
428	0.04
429	0.05
430	0.06
431	0.07
432	0.1
433	0.1
434	0.13
435	0.14
436	0.13
437	0.16
438	0.17
439	0.21
440	0.22
441	0.24
442	0.21
443	0.2
444	0.21
445	0.18
446	0.17
447	0.14
448	0.11
449	0.14
450	0.15
451	0.15
452	0.21
453	0.25
454	0.26
455	0.3
456	0.33
457	0.31
458	0.41
459	0.48
460	0.51
461	0.56
462	0.62
463	0.64
464	0.64
465	0.69
466	0.64
467	0.66
468	0.61
469	0.57
470	0.58
471	0.6
472	0.63
473	0.6
474	0.57
475	0.51
476	0.5
477	0.49
478	0.46
479	0.42
480	0.44
481	0.49
482	0.52
483	0.55
484	0.58
485	0.59
486	0.58
487	0.62
488	0.6
489	0.55
490	0.53
491	0.55
492	0.52
493	0.52
494	0.48
495	0.4
496	0.33
497	0.35
498	0.35
499	0.28
500	0.24
501	0.21
502	0.22
503	0.23
504	0.22
505	0.18
506	0.16
507	0.19
508	0.25
509	0.23
510	0.21
511	0.22
512	0.24
513	0.24
514	0.22
515	0.2
516	0.19
517	0.22
518	0.26
519	0.26
520	0.24
521	0.24
522	0.25
523	0.28
524	0.28
525	0.27
526	0.27
527	0.27
528	0.27
529	0.3
530	0.33
531	0.3
532	0.3
533	0.28
534	0.28
535	0.36
536	0.45
537	0.44
538	0.46
539	0.51
540	0.51
541	0.55
542	0.59
543	0.56
544	0.56
545	0.63
546	0.68
547	0.67
548	0.69
549	0.67
550	0.59
551	0.54
552	0.5
553	0.44
554	0.35
555	0.31
556	0.34
557	0.35
558	0.4
559	0.42
560	0.37
561	0.34
562	0.34
563	0.33
564	0.3
565	0.33
566	0.3
567	0.34
568	0.38
569	0.39
570	0.41
571	0.47
572	0.46
573	0.41
574	0.4
575	0.4
576	0.45
577	0.49
578	0.5
579	0.49
580	0.47
581	0.47
582	0.46
583	0.45
584	0.45
585	0.45
586	0.47
587	0.46
588	0.53
589	0.58
590	0.63
591	0.61
592	0.56
593	0.54
594	0.48
595	0.44
596	0.4
597	0.34
598	0.31
599	0.26
600	0.23

A0A5C5FNQ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer