Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5G556

Protein Details
Accession A0A5C5G556    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-91PPGTASARPKKRKAAMPKQKKVPVTPRAKPAAPKQRKGKAKRCTGDHydrophilic
348-372DEERGRRDGLGRRTRRRRRRRRSGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-87ARPKKRKAAMPKQKKVPVTPRAKPAAPKQRKGKAKR
352-372GRRDGLGRRTRRRRRRRRSGR
Subcellular Location(s) cyto 12, nucl 11, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
CDD cd21075  DBD_XPA-like  
Amino Acid Sequences MSTSEHSVATPTIKDEPADFVLAAADPCEESDPPAAEDDSDDDYLPPGTASARPKKRKAAMPKQKKVPVTPRAKPAAPKQRKGKAKRCTGDGEPEAPFSLLSLPGELIDQILFDDALHVADHLALAASCRTLRSCYYTRAPGPSSGRPSAFPSLIWGALLAHRPFTGLGSTWWRKDDEDVVVPEDGDRVIRHLWTREDRVEVDKMAVLQKGVVVRGYEWEVAASRVAKQRITKTTAKSEYKLNDTELRALTPRYKRNPHSRNAAPMQLFVEAAVEALAFRLHGGAAGHAELCVSHPSPLPRRPCVRSLRSHAGDRQAQGARRDPGQGVRDPAGQGRWNVGLTDQEAQDEERGRRDGLGRRTRRRRRRRRSGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.25
4 0.24
5 0.25
6 0.22
7 0.17
8 0.17
9 0.17
10 0.15
11 0.11
12 0.08
13 0.07
14 0.08
15 0.1
16 0.09
17 0.11
18 0.15
19 0.16
20 0.17
21 0.19
22 0.18
23 0.16
24 0.17
25 0.17
26 0.17
27 0.16
28 0.16
29 0.14
30 0.15
31 0.15
32 0.14
33 0.11
34 0.07
35 0.08
36 0.13
37 0.21
38 0.31
39 0.41
40 0.5
41 0.57
42 0.66
43 0.72
44 0.77
45 0.8
46 0.81
47 0.82
48 0.85
49 0.88
50 0.88
51 0.87
52 0.82
53 0.79
54 0.78
55 0.77
56 0.75
57 0.72
58 0.71
59 0.7
60 0.69
61 0.66
62 0.66
63 0.67
64 0.67
65 0.69
66 0.7
67 0.73
68 0.8
69 0.84
70 0.84
71 0.82
72 0.83
73 0.79
74 0.75
75 0.72
76 0.66
77 0.65
78 0.58
79 0.52
80 0.42
81 0.38
82 0.33
83 0.27
84 0.23
85 0.14
86 0.12
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.07
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.04
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.03
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.07
118 0.09
119 0.1
120 0.17
121 0.19
122 0.24
123 0.29
124 0.34
125 0.35
126 0.38
127 0.38
128 0.37
129 0.39
130 0.4
131 0.41
132 0.38
133 0.36
134 0.33
135 0.36
136 0.33
137 0.28
138 0.22
139 0.19
140 0.18
141 0.17
142 0.16
143 0.11
144 0.09
145 0.1
146 0.15
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.06
155 0.08
156 0.15
157 0.18
158 0.18
159 0.2
160 0.2
161 0.2
162 0.21
163 0.22
164 0.17
165 0.18
166 0.18
167 0.18
168 0.17
169 0.16
170 0.15
171 0.12
172 0.09
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.09
179 0.11
180 0.15
181 0.18
182 0.22
183 0.22
184 0.24
185 0.24
186 0.26
187 0.25
188 0.21
189 0.18
190 0.15
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.07
201 0.07
202 0.09
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.09
211 0.1
212 0.15
213 0.16
214 0.18
215 0.22
216 0.28
217 0.33
218 0.39
219 0.41
220 0.41
221 0.49
222 0.56
223 0.55
224 0.5
225 0.5
226 0.48
227 0.47
228 0.44
229 0.37
230 0.35
231 0.32
232 0.35
233 0.29
234 0.27
235 0.24
236 0.24
237 0.28
238 0.3
239 0.37
240 0.41
241 0.48
242 0.55
243 0.65
244 0.71
245 0.7
246 0.72
247 0.68
248 0.68
249 0.64
250 0.63
251 0.52
252 0.46
253 0.4
254 0.32
255 0.27
256 0.18
257 0.15
258 0.08
259 0.07
260 0.06
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.07
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.14
283 0.21
284 0.29
285 0.36
286 0.41
287 0.46
288 0.53
289 0.56
290 0.62
291 0.65
292 0.65
293 0.68
294 0.7
295 0.72
296 0.7
297 0.71
298 0.67
299 0.65
300 0.62
301 0.54
302 0.52
303 0.47
304 0.47
305 0.45
306 0.47
307 0.42
308 0.39
309 0.41
310 0.36
311 0.38
312 0.39
313 0.38
314 0.36
315 0.36
316 0.37
317 0.35
318 0.36
319 0.34
320 0.32
321 0.29
322 0.28
323 0.27
324 0.25
325 0.24
326 0.22
327 0.2
328 0.19
329 0.22
330 0.19
331 0.18
332 0.18
333 0.19
334 0.22
335 0.25
336 0.24
337 0.26
338 0.28
339 0.27
340 0.3
341 0.35
342 0.4
343 0.45
344 0.54
345 0.58
346 0.67
347 0.78
348 0.86
349 0.91
350 0.93
351 0.94
352 0.95