Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FND6

Protein Details
Accession A0A5C5FND6    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-37SIRRNGRQLDHEERKRKRQAREAHKASHBasic
135-155VIKTGKTKRKGWKRMVTKATFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-35ERKRKRQAREAHKA
107-123KQKRKEKAGKFAVPLPK
136-148IKTGKTKRKGWKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.833, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039411  NSA2_fam  
IPR022309  Ribosomal_S8e/biogenesis_NSA2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01201  Ribosomal_S8e  
CDD cd11381  NSA2  
Amino Acid Sequences MPQNEYIEESIRRNGRQLDHEERKRKRQAREAHKASHVAQTLHGHKAKLLHQRRYAEKVAMKKTIKAHEERDVKAKDASALPEGALPTYLLDREGQNDAKALSSAVKQKRKEKAGKFAVPLPKVRGIAEDEMFKVIKTGKTKRKGWKRMVTKATFVGEDFTRKPPKLERFIRPSALRVKKANVTHPELKATFQLPIIGVKKNPQSPMLGVITKGTIIEVNVSELGLVTTGGKVVWGKYAQVTNNPELEGCVNSILLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.41
3 0.45
4 0.51
5 0.54
6 0.6
7 0.69
8 0.75
9 0.77
10 0.81
11 0.84
12 0.84
13 0.82
14 0.81
15 0.82
16 0.83
17 0.86
18 0.84
19 0.8
20 0.77
21 0.71
22 0.64
23 0.6
24 0.52
25 0.42
26 0.38
27 0.38
28 0.37
29 0.4
30 0.41
31 0.34
32 0.32
33 0.36
34 0.39
35 0.43
36 0.48
37 0.49
38 0.54
39 0.61
40 0.65
41 0.67
42 0.63
43 0.59
44 0.55
45 0.55
46 0.53
47 0.55
48 0.51
49 0.49
50 0.52
51 0.53
52 0.53
53 0.5
54 0.49
55 0.49
56 0.54
57 0.52
58 0.54
59 0.47
60 0.44
61 0.4
62 0.36
63 0.29
64 0.24
65 0.24
66 0.18
67 0.16
68 0.14
69 0.15
70 0.14
71 0.12
72 0.1
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.09
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.1
89 0.08
90 0.1
91 0.18
92 0.25
93 0.32
94 0.36
95 0.44
96 0.52
97 0.59
98 0.66
99 0.63
100 0.66
101 0.67
102 0.68
103 0.62
104 0.6
105 0.58
106 0.51
107 0.47
108 0.4
109 0.34
110 0.3
111 0.28
112 0.24
113 0.2
114 0.2
115 0.19
116 0.17
117 0.13
118 0.14
119 0.14
120 0.12
121 0.1
122 0.09
123 0.12
124 0.17
125 0.25
126 0.33
127 0.41
128 0.49
129 0.58
130 0.68
131 0.74
132 0.78
133 0.79
134 0.8
135 0.81
136 0.82
137 0.75
138 0.66
139 0.6
140 0.51
141 0.42
142 0.33
143 0.26
144 0.17
145 0.18
146 0.18
147 0.21
148 0.25
149 0.25
150 0.27
151 0.33
152 0.4
153 0.47
154 0.52
155 0.54
156 0.57
157 0.61
158 0.65
159 0.58
160 0.55
161 0.55
162 0.55
163 0.51
164 0.46
165 0.45
166 0.46
167 0.48
168 0.52
169 0.48
170 0.49
171 0.5
172 0.49
173 0.5
174 0.44
175 0.42
176 0.36
177 0.31
178 0.24
179 0.18
180 0.18
181 0.13
182 0.19
183 0.2
184 0.2
185 0.2
186 0.24
187 0.3
188 0.33
189 0.35
190 0.31
191 0.31
192 0.3
193 0.35
194 0.33
195 0.28
196 0.23
197 0.22
198 0.21
199 0.18
200 0.16
201 0.11
202 0.08
203 0.07
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.13
222 0.14
223 0.15
224 0.19
225 0.25
226 0.26
227 0.34
228 0.39
229 0.37
230 0.39
231 0.38
232 0.33
233 0.3
234 0.29
235 0.22
236 0.18
237 0.15