Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FMQ5

Protein Details
Accession A0A5C5FMQ5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-165IKDAAAEKKRRKGKAKVQDVEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-159EKKRRKGKAK
Subcellular Location(s) cyto 20, nucl 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022712  Beta_Casp  
IPR027075  CPSF2  
IPR025069  Cpsf2_C  
IPR001279  Metallo-B-lactamas  
IPR036866  RibonucZ/Hydroxyglut_hydro  
IPR011108  RMMBL  
Gene Ontology GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF10996  Beta-Casp  
PF13299  CPSF100_C  
PF16661  Lactamase_B_6  
PF07521  RMMBL  
Amino Acid Sequences MSITITPLSASPLPPTYHLTVDGASILLDCGAYDKGSETTLSHDAADAAGAPTAEQVDAYLSTLRALAPSLNLVLLSHPLLTSLGLLPYLRAKCGLRCPVYATLPTREMGRYAVEEWVEARSVAERNDARVEQKLANQHKEQQIKDAAAEKKRRKGKAKVQDVEVGVGEDLVAVKEEELAGAALVKDEEGDTVKAKDPWDQAWKLTTQEIRDAFLAINAVRWTQPIHLTGPLKGYTLVAHRSGHTLGGSLYTLRPSLSSSLSPASSASSFLYAPLFNHVKEHHLDPTSLLNAGNVDDNFRRMGVVVVGAERSKVVNIKRIDRERKLLDLITTTLQSGGSILLPTDPSARLFELLVLLETHWRFAGLGSQFPLCLISRTGKDAVGFVRSLTEWMGGQLSGDAAEKLKFSNLRIFSSLDEIAASIPPTVPKLILTVPSTLSYGFARALFLDFARTPSNLVLLTGLSEPGSLARWLAQEVWEPQQDEGCKYGQGKVGKEIKMDQTIELEMRRKVYLEGEELEAHLEAEREAAELLAKQQAALERSRRMLHADAGGESDSESDSDGEGGNDEEADAAEEAGDADGAAPALRRRRIGGFTGGAGAWDEFLDADALAGSAGGQSFDIYVRGSFGVRSGGGGLQRFRMFPVVERRRRVDAYGEAIDVEGWLRRGQEEDPLAPGADQQVLGKRPREDEPEPAPEEKPEPPHKYVVDRVEVHLQSLLFVVDMEGLSDGRALKTILPQINPRKLVIVDGAPDAIADLASACRSVTSMTEDIYTPALGEKIKVGEETKNFSIRLGDSIMAVLRLSRVDDYEVAYVSGVIHIDPESDLPVLERVTLADATAVPAITAAGESADGEDAAMADVAGVAAPEAADGEEDKKPSPVDEPAESSILPALKPSLFIGDLRLALLKERLSALKVPSEFTGEGILVCGPAPPEAFGFDFTAAATRAGIDVRKGAKYVRDALLAEAMEASGGRCAVRKVGRGRLVIEGAPGETYYVVRKAVYALHAQAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.32
3 0.3
4 0.29
5 0.3
6 0.28
7 0.24
8 0.23
9 0.21
10 0.15
11 0.12
12 0.1
13 0.08
14 0.07
15 0.06
16 0.05
17 0.06
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.09
22 0.1
23 0.11
24 0.13
25 0.11
26 0.16
27 0.19
28 0.2
29 0.18
30 0.17
31 0.17
32 0.16
33 0.15
34 0.11
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.07
43 0.06
44 0.07
45 0.08
46 0.1
47 0.11
48 0.1
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.18
76 0.19
77 0.18
78 0.2
79 0.22
80 0.26
81 0.36
82 0.45
83 0.41
84 0.42
85 0.46
86 0.49
87 0.51
88 0.51
89 0.46
90 0.42
91 0.4
92 0.38
93 0.36
94 0.3
95 0.27
96 0.23
97 0.21
98 0.19
99 0.18
100 0.21
101 0.19
102 0.18
103 0.18
104 0.18
105 0.16
106 0.13
107 0.12
108 0.12
109 0.13
110 0.14
111 0.21
112 0.21
113 0.24
114 0.29
115 0.31
116 0.3
117 0.33
118 0.36
119 0.31
120 0.35
121 0.41
122 0.43
123 0.48
124 0.49
125 0.52
126 0.57
127 0.61
128 0.57
129 0.55
130 0.52
131 0.47
132 0.46
133 0.46
134 0.44
135 0.46
136 0.55
137 0.55
138 0.59
139 0.66
140 0.73
141 0.74
142 0.78
143 0.8
144 0.8
145 0.84
146 0.81
147 0.78
148 0.75
149 0.67
150 0.58
151 0.47
152 0.37
153 0.26
154 0.19
155 0.14
156 0.08
157 0.07
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.07
177 0.09
178 0.1
179 0.13
180 0.16
181 0.18
182 0.19
183 0.24
184 0.25
185 0.3
186 0.36
187 0.36
188 0.35
189 0.35
190 0.36
191 0.32
192 0.34
193 0.31
194 0.25
195 0.3
196 0.29
197 0.28
198 0.27
199 0.26
200 0.21
201 0.18
202 0.18
203 0.11
204 0.13
205 0.11
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.12
210 0.13
211 0.16
212 0.16
213 0.18
214 0.23
215 0.25
216 0.26
217 0.28
218 0.26
219 0.23
220 0.21
221 0.2
222 0.16
223 0.18
224 0.2
225 0.19
226 0.19
227 0.19
228 0.21
229 0.22
230 0.21
231 0.16
232 0.14
233 0.11
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.15
247 0.17
248 0.17
249 0.17
250 0.15
251 0.15
252 0.13
253 0.13
254 0.11
255 0.11
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.1
260 0.1
261 0.16
262 0.17
263 0.15
264 0.18
265 0.18
266 0.2
267 0.22
268 0.24
269 0.23
270 0.23
271 0.23
272 0.22
273 0.24
274 0.22
275 0.21
276 0.18
277 0.12
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.1
282 0.12
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.12
288 0.1
289 0.1
290 0.07
291 0.08
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.12
301 0.13
302 0.2
303 0.23
304 0.31
305 0.39
306 0.48
307 0.56
308 0.56
309 0.61
310 0.57
311 0.57
312 0.52
313 0.44
314 0.36
315 0.29
316 0.27
317 0.21
318 0.18
319 0.14
320 0.12
321 0.11
322 0.09
323 0.08
324 0.07
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.08
351 0.14
352 0.11
353 0.13
354 0.14
355 0.14
356 0.14
357 0.14
358 0.15
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.11
363 0.12
364 0.16
365 0.17
366 0.16
367 0.16
368 0.17
369 0.16
370 0.15
371 0.14
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.09
377 0.09
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.06
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.09
393 0.1
394 0.11
395 0.19
396 0.2
397 0.22
398 0.23
399 0.24
400 0.22
401 0.24
402 0.23
403 0.15
404 0.13
405 0.11
406 0.09
407 0.09
408 0.08
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.08
417 0.09
418 0.12
419 0.13
420 0.13
421 0.14
422 0.14
423 0.15
424 0.13
425 0.13
426 0.1
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.07
431 0.07
432 0.08
433 0.07
434 0.07
435 0.09
436 0.08
437 0.1
438 0.11
439 0.11
440 0.11
441 0.11
442 0.12
443 0.09
444 0.09
445 0.07
446 0.06
447 0.07
448 0.06
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.05
456 0.05
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.08
462 0.09
463 0.11
464 0.14
465 0.15
466 0.15
467 0.15
468 0.17
469 0.17
470 0.15
471 0.15
472 0.12
473 0.12
474 0.12
475 0.15
476 0.17
477 0.2
478 0.2
479 0.26
480 0.32
481 0.31
482 0.31
483 0.3
484 0.29
485 0.29
486 0.29
487 0.22
488 0.16
489 0.16
490 0.16
491 0.15
492 0.15
493 0.12
494 0.13
495 0.13
496 0.12
497 0.12
498 0.13
499 0.13
500 0.13
501 0.13
502 0.14
503 0.14
504 0.13
505 0.13
506 0.1
507 0.09
508 0.07
509 0.06
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.05
519 0.07
520 0.07
521 0.06
522 0.07
523 0.1
524 0.11
525 0.14
526 0.17
527 0.17
528 0.19
529 0.2
530 0.2
531 0.21
532 0.2
533 0.19
534 0.19
535 0.17
536 0.15
537 0.15
538 0.15
539 0.11
540 0.1
541 0.08
542 0.06
543 0.05
544 0.05
545 0.04
546 0.04
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.03
556 0.03
557 0.04
558 0.04
559 0.03
560 0.03
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.02
566 0.02
567 0.03
568 0.03
569 0.03
570 0.03
571 0.06
572 0.11
573 0.13
574 0.13
575 0.15
576 0.19
577 0.22
578 0.24
579 0.26
580 0.23
581 0.21
582 0.22
583 0.19
584 0.16
585 0.14
586 0.11
587 0.06
588 0.05
589 0.05
590 0.03
591 0.04
592 0.04
593 0.03
594 0.03
595 0.03
596 0.03
597 0.03
598 0.03
599 0.02
600 0.03
601 0.03
602 0.03
603 0.03
604 0.03
605 0.04
606 0.04
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.06
611 0.06
612 0.07
613 0.06
614 0.07
615 0.08
616 0.07
617 0.08
618 0.08
619 0.09
620 0.1
621 0.12
622 0.13
623 0.15
624 0.16
625 0.15
626 0.15
627 0.17
628 0.15
629 0.18
630 0.29
631 0.36
632 0.42
633 0.46
634 0.49
635 0.51
636 0.52
637 0.48
638 0.42
639 0.35
640 0.34
641 0.31
642 0.28
643 0.22
644 0.21
645 0.19
646 0.14
647 0.11
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.06
652 0.07
653 0.09
654 0.09
655 0.15
656 0.16
657 0.16
658 0.17
659 0.18
660 0.17
661 0.16
662 0.15
663 0.11
664 0.09
665 0.09
666 0.08
667 0.12
668 0.15
669 0.19
670 0.22
671 0.23
672 0.25
673 0.29
674 0.35
675 0.33
676 0.37
677 0.4
678 0.43
679 0.44
680 0.43
681 0.39
682 0.33
683 0.34
684 0.3
685 0.32
686 0.34
687 0.37
688 0.38
689 0.42
690 0.43
691 0.45
692 0.48
693 0.45
694 0.43
695 0.38
696 0.38
697 0.41
698 0.39
699 0.35
700 0.3
701 0.25
702 0.18
703 0.17
704 0.15
705 0.07
706 0.07
707 0.06
708 0.05
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.06
715 0.06
716 0.06
717 0.07
718 0.07
719 0.08
720 0.12
721 0.19
722 0.21
723 0.23
724 0.31
725 0.4
726 0.47
727 0.47
728 0.44
729 0.39
730 0.36
731 0.35
732 0.29
733 0.22
734 0.17
735 0.16
736 0.15
737 0.12
738 0.12
739 0.1
740 0.07
741 0.05
742 0.04
743 0.03
744 0.04
745 0.04
746 0.05
747 0.04
748 0.04
749 0.05
750 0.06
751 0.07
752 0.12
753 0.12
754 0.13
755 0.14
756 0.15
757 0.15
758 0.16
759 0.14
760 0.09
761 0.09
762 0.1
763 0.08
764 0.09
765 0.09
766 0.1
767 0.11
768 0.12
769 0.14
770 0.18
771 0.21
772 0.27
773 0.29
774 0.31
775 0.3
776 0.29
777 0.3
778 0.25
779 0.24
780 0.2
781 0.17
782 0.13
783 0.14
784 0.14
785 0.11
786 0.1
787 0.08
788 0.07
789 0.07
790 0.08
791 0.08
792 0.09
793 0.11
794 0.12
795 0.14
796 0.15
797 0.15
798 0.13
799 0.13
800 0.12
801 0.1
802 0.1
803 0.07
804 0.05
805 0.06
806 0.06
807 0.06
808 0.07
809 0.07
810 0.08
811 0.08
812 0.08
813 0.08
814 0.1
815 0.09
816 0.09
817 0.09
818 0.08
819 0.1
820 0.1
821 0.09
822 0.08
823 0.08
824 0.1
825 0.1
826 0.1
827 0.07
828 0.07
829 0.07
830 0.06
831 0.06
832 0.04
833 0.03
834 0.04
835 0.04
836 0.05
837 0.05
838 0.05
839 0.05
840 0.05
841 0.05
842 0.05
843 0.05
844 0.04
845 0.03
846 0.03
847 0.03
848 0.03
849 0.03
850 0.02
851 0.03
852 0.03
853 0.03
854 0.03
855 0.03
856 0.04
857 0.05
858 0.09
859 0.12
860 0.13
861 0.14
862 0.16
863 0.17
864 0.17
865 0.2
866 0.23
867 0.25
868 0.27
869 0.31
870 0.32
871 0.33
872 0.31
873 0.28
874 0.25
875 0.21
876 0.17
877 0.13
878 0.14
879 0.12
880 0.14
881 0.14
882 0.14
883 0.14
884 0.15
885 0.18
886 0.18
887 0.18
888 0.18
889 0.19
890 0.15
891 0.16
892 0.19
893 0.16
894 0.14
895 0.17
896 0.18
897 0.19
898 0.23
899 0.24
900 0.28
901 0.28
902 0.29
903 0.27
904 0.31
905 0.28
906 0.24
907 0.24
908 0.17
909 0.16
910 0.15
911 0.14
912 0.09
913 0.08
914 0.09
915 0.07
916 0.08
917 0.09
918 0.09
919 0.1
920 0.12
921 0.13
922 0.14
923 0.16
924 0.15
925 0.14
926 0.13
927 0.15
928 0.13
929 0.13
930 0.11
931 0.09
932 0.09
933 0.11
934 0.13
935 0.12
936 0.17
937 0.21
938 0.23
939 0.24
940 0.26
941 0.3
942 0.34
943 0.4
944 0.37
945 0.37
946 0.36
947 0.37
948 0.39
949 0.32
950 0.27
951 0.2
952 0.16
953 0.12
954 0.11
955 0.1
956 0.06
957 0.07
958 0.07
959 0.09
960 0.1
961 0.18
962 0.24
963 0.31
964 0.37
965 0.47
966 0.54
967 0.55
968 0.56
969 0.55
970 0.52
971 0.45
972 0.4
973 0.31
974 0.24
975 0.22
976 0.19
977 0.14
978 0.11
979 0.11
980 0.13
981 0.14
982 0.15
983 0.14
984 0.15
985 0.16
986 0.2
987 0.22
988 0.24