Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5C5FMQ5

Protein Details
Accession A0A5C5FMQ5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-165IKDAAAEKKRRKGKAKVQDVEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-159EKKRRKGKAK
Subcellular Location(s) cyto 20, nucl 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022712  Beta_Casp  
IPR027075  CPSF2  
IPR025069  Cpsf2_C  
IPR001279  Metallo-B-lactamas  
IPR036866  RibonucZ/Hydroxyglut_hydro  
IPR011108  RMMBL  
Gene Ontology GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF10996  Beta-Casp  
PF13299  CPSF100_C  
PF16661  Lactamase_B_6  
PF07521  RMMBL  
Amino Acid Sequences MSITITPLSASPLPPTYHLTVDGASILLDCGAYDKGSETTLSHDAADAAGAPTAEQVDAYLSTLRALAPSLNLVLLSHPLLTSLGLLPYLRAKCGLRCPVYATLPTREMGRYAVEEWVEARSVAERNDARVEQKLANQHKEQQIKDAAAEKKRRKGKAKVQDVEVGVGEDLVAVKEEELAGAALVKDEEGDTVKAKDPWDQAWKLTTQEIRDAFLAINAVRWTQPIHLTGPLKGYTLVAHRSGHTLGGSLYTLRPSLSSSLSPASSASSFLYAPLFNHVKEHHLDPTSLLNAGNVDDNFRRMGVVVVGAERSKVVNIKRIDRERKLLDLITTTLQSGGSILLPTDPSARLFELLVLLETHWRFAGLGSQFPLCLISRTGKDAVGFVRSLTEWMGGQLSGDAAEKLKFSNLRIFSSLDEIAASIPPTVPKLILTVPSTLSYGFARALFLDFARTPSNLVLLTGLSEPGSLARWLAQEVWEPQQDEGCKYGQGKVGKEIKMDQTIELEMRRKVYLEGEELEAHLEAEREAAELLAKQQAALERSRRMLHADAGGESDSESDSDGEGGNDEEADAAEEAGDADGAAPALRRRRIGGFTGGAGAWDEFLDADALAGSAGGQSFDIYVRGSFGVRSGGGGLQRFRMFPVVERRRRVDAYGEAIDVEGWLRRGQEEDPLAPGADQQVLGKRPREDEPEPAPEEKPEPPHKYVVDRVEVHLQSLLFVVDMEGLSDGRALKTILPQINPRKLVIVDGAPDAIADLASACRSVTSMTEDIYTPALGEKIKVGEETKNFSIRLGDSIMAVLRLSRVDDYEVAYVSGVIHIDPESDLPVLERVTLADATAVPAITAAGESADGEDAAMADVAGVAAPEAADGEEDKKPSPVDEPAESSILPALKPSLFIGDLRLALLKERLSALKVPSEFTGEGILVCGPAPPEAFGFDFTAAATRAGIDVRKGAKYVRDALLAEAMEASGGRCAVRKVGRGRLVIEGAPGETYYVVRKAVYALHAQAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.32
3 0.3
4 0.29
5 0.3
6 0.28
7 0.24
8 0.23
9 0.21
10 0.15
11 0.12
12 0.1
13 0.08
14 0.07
15 0.06
16 0.05
17 0.06
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.09
22 0.1
23 0.11
24 0.13
25 0.11
26 0.16
27 0.19
28 0.2
29 0.18
30 0.17
31 0.17
32 0.16
33 0.15
34 0.11
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.07
43 0.06
44 0.07
45 0.08
46 0.1
47 0.11
48 0.1
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.18
76 0.19
77 0.18
78 0.2
79 0.22
80 0.26
81 0.36
82 0.45
83 0.41
84 0.42
85 0.46
86 0.49
87 0.51
88 0.51
89 0.46
90 0.42
91 0.4
92 0.38
93 0.36
94 0.3
95 0.27
96 0.23
97 0.21
98 0.19
99 0.18
100 0.21
101 0.19
102 0.18
103 0.18
104 0.18
105 0.16
106 0.13
107 0.12
108 0.12
109 0.13
110 0.14
111 0.21
112 0.21
113 0.24
114 0.29
115 0.31
116 0.3
117 0.33
118 0.36
119 0.31
120 0.35
121 0.41
122 0.43
123 0.48
124 0.49
125 0.52
126 0.57
127 0.61
128 0.57
129 0.55
130 0.52
131 0.47
132 0.46
133 0.46
134 0.44
135 0.46
136 0.55
137 0.55
138 0.59
139 0.66
140 0.73
141 0.74
142 0.78
143 0.8
144 0.8
145 0.84
146 0.81
147 0.78
148 0.75
149 0.67
150 0.58
151 0.47
152 0.37
153 0.26
154 0.19
155 0.14
156 0.08
157 0.07
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.07
177 0.09
178 0.1
179 0.13
180 0.16
181 0.18
182 0.19
183 0.24
184 0.25
185 0.3
186 0.36
187 0.36
188 0.35
189 0.35
190 0.36
191 0.32
192 0.34
193 0.31
194 0.25
195 0.3
196 0.29
197 0.28
198 0.27
199 0.26
200 0.21
201 0.18
202 0.18
203 0.11
204 0.13
205 0.11
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.12
210 0.13
211 0.16
212 0.16
213 0.18
214 0.23
215 0.25
216 0.26
217 0.28
218 0.26
219 0.23
220 0.21
221 0.2
222 0.16
223 0.18
224 0.2
225 0.19
226 0.19
227 0.19
228 0.21
229 0.22
230 0.21
231 0.16
232 0.14
233 0.11
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.15
247 0.17
248 0.17
249 0.17
250 0.15
251 0.15
252 0.13
253 0.13
254 0.11
255 0.11
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.1
260 0.1
261 0.16
262 0.17
263 0.15
264 0.18
265 0.18
266 0.2
267 0.22
268 0.24
269 0.23
270 0.23
271 0.23
272 0.22
273 0.24
274 0.22
275 0.21
276 0.18
277 0.12
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.1
282 0.12
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.12
288 0.1
289 0.1
290 0.07
291 0.08
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.12
301 0.13
302 0.2
303 0.23
304 0.31
305 0.39
306 0.48
307 0.56
308 0.56
309 0.61
310 0.57
311 0.57
312 0.52
313 0.44
314 0.36
315 0.29
316 0.27
317 0.21
318 0.18
319 0.14
320 0.12
321 0.11
322 0.09
323 0.08
324 0.07
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.08
351 0.14
352 0.11
353 0.13
354 0.14
355 0.14
356 0.14
357 0.14
358 0.15
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.11
363 0.12
364 0.16
365 0.17
366 0.16
367 0.16
368 0.17
369 0.16
370 0.15
371 0.14
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.09
377 0.09
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.06
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.09
393 0.1
394 0.11
395 0.19
396 0.2
397 0.22
398 0.23
399 0.24
400 0.22
401 0.24
402 0.23
403 0.15
404 0.13
405 0.11
406 0.09
407 0.09
408 0.08
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.08
417 0.09
418 0.12
419 0.13
420 0.13
421 0.14
422 0.14
423 0.15
424 0.13
425 0.13
426 0.1
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.07
431 0.07
432 0.08
433 0.07
434 0.07
435 0.09
436 0.08
437 0.1
438 0.11
439 0.11
440 0.11
441 0.11
442 0.12
443 0.09
444 0.09
445 0.07
446 0.06
447 0.07
448 0.06
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.05
456 0.05
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.08
462 0.09
463 0.11
464 0.14
465 0.15
466 0.15
467 0.15
468 0.17
469 0.17
470 0.15
471 0.15
472 0.12
473 0.12
474 0.12
475 0.15
476 0.17
477 0.2
478 0.2
479 0.26
480 0.32
481 0.31
482 0.31
483 0.3
484 0.29
485 0.29
486 0.29
487 0.22
488 0.16
489 0.16
490 0.16
491 0.15
492 0.15
493 0.12
494 0.13
495 0.13
496 0.12
497 0.12
498 0.13
499 0.13
500 0.13
501 0.13
502 0.14
503 0.14
504 0.13
505 0.13
506 0.1
507 0.09
508 0.07
509 0.06
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.05
519 0.07
520 0.07
521 0.06
522 0.07
523 0.1
524 0.11
525 0.14
526 0.17
527 0.17
528 0.19
529 0.2
530 0.2
531 0.21
532 0.2
533 0.19
534 0.19
535 0.17
536 0.15
537 0.15
538 0.15
539 0.11
540 0.1
541 0.08
542 0.06
543 0.05
544 0.05
545 0.04
546 0.04
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.03
556 0.03
557 0.04
558 0.04
559 0.03
560 0.03
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.02
566 0.02
567 0.03
568 0.03
569 0.03
570 0.03
571 0.06
572 0.11
573 0.13
574 0.13
575 0.15
576 0.19
577 0.22
578 0.24
579 0.26
580 0.23
581 0.21
582 0.22
583 0.19
584 0.16
585 0.14
586 0.11
587 0.06
588 0.05
589 0.05
590 0.03
591 0.04
592 0.04
593 0.03
594 0.03
595 0.03
596 0.03
597 0.03
598 0.03
599 0.02
600 0.03
601 0.03
602 0.03
603 0.03
604 0.03
605 0.04
606 0.04
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.06
611 0.06
612 0.07
613 0.06
614 0.07
615 0.08
616 0.07
617 0.08
618 0.08
619 0.09
620 0.1
621 0.12
622 0.13
623 0.15
624 0.16
625 0.15
626 0.15
627 0.17
628 0.15
629 0.18
630 0.29
631 0.36
632 0.42
633 0.46
634 0.49
635 0.51
636 0.52
637 0.48
638 0.42
639 0.35
640 0.34
641 0.31
642 0.28
643 0.22
644 0.21
645 0.19
646 0.14
647 0.11
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.06
652 0.07
653 0.09
654 0.09
655 0.15
656 0.16
657 0.16
658 0.17
659 0.18
660 0.17
661 0.16
662 0.15
663 0.11
664 0.09
665 0.09
666 0.08
667 0.12
668 0.15
669 0.19
670 0.22
671 0.23
672 0.25
673 0.29
674 0.35
675 0.33
676 0.37
677 0.4
678 0.43
679 0.44
680 0.43
681 0.39
682 0.33
683 0.34
684 0.3
685 0.32
686 0.34
687 0.37
688 0.38
689 0.42
690 0.43
691 0.45
692 0.48
693 0.45
694 0.43
695 0.38
696 0.38
697 0.41
698 0.39
699 0.35
700 0.3
701 0.25
702 0.18
703 0.17
704 0.15
705 0.07
706 0.07
707 0.06
708 0.05
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.06
715 0.06
716 0.06
717 0.07
718 0.07
719 0.08
720 0.12
721 0.19
722 0.21
723 0.23
724 0.31
725 0.4
726 0.47
727 0.47
728 0.44
729 0.39
730 0.36
731 0.35
732 0.29
733 0.22
734 0.17
735 0.16
736 0.15
737 0.12
738 0.12
739 0.1
740 0.07
741 0.05
742 0.04
743 0.03
744 0.04
745 0.04
746 0.05
747 0.04
748 0.04
749 0.05
750 0.06
751 0.07
752 0.12
753 0.12
754 0.13
755 0.14
756 0.15
757 0.15
758 0.16
759 0.14
760 0.09
761 0.09
762 0.1
763 0.08
764 0.09
765 0.09
766 0.1
767 0.11
768 0.12
769 0.14
770 0.18
771 0.21
772 0.27
773 0.29
774 0.31
775 0.3
776 0.29
777 0.3
778 0.25
779 0.24
780 0.2
781 0.17
782 0.13
783 0.14
784 0.14
785 0.11
786 0.1
787 0.08
788 0.07
789 0.07
790 0.08
791 0.08
792 0.09
793 0.11
794 0.12
795 0.14
796 0.15
797 0.15
798 0.13
799 0.13
800 0.12
801 0.1
802 0.1
803 0.07
804 0.05
805 0.06
806 0.06
807 0.06
808 0.07
809 0.07
810 0.08
811 0.08
812 0.08
813 0.08
814 0.1
815 0.09
816 0.09
817 0.09
818 0.08
819 0.1
820 0.1
821 0.09
822 0.08
823 0.08
824 0.1
825 0.1
826 0.1
827 0.07
828 0.07
829 0.07
830 0.06
831 0.06
832 0.04
833 0.03
834 0.04
835 0.04
836 0.05
837 0.05
838 0.05
839 0.05
840 0.05
841 0.05
842 0.05
843 0.05
844 0.04
845 0.03
846 0.03
847 0.03
848 0.03
849 0.03
850 0.02
851 0.03
852 0.03
853 0.03
854 0.03
855 0.03
856 0.04
857 0.05
858 0.09
859 0.12
860 0.13
861 0.14
862 0.16
863 0.17
864 0.17
865 0.2
866 0.23
867 0.25
868 0.27
869 0.31
870 0.32
871 0.33
872 0.31
873 0.28
874 0.25
875 0.21
876 0.17
877 0.13
878 0.14
879 0.12
880 0.14
881 0.14
882 0.14
883 0.14
884 0.15
885 0.18
886 0.18
887 0.18
888 0.18
889 0.19
890 0.15
891 0.16
892 0.19
893 0.16
894 0.14
895 0.17
896 0.18
897 0.19
898 0.23
899 0.24
900 0.28
901 0.28
902 0.29
903 0.27
904 0.31
905 0.28
906 0.24
907 0.24
908 0.17
909 0.16
910 0.15
911 0.14
912 0.09
913 0.08
914 0.09
915 0.07
916 0.08
917 0.09
918 0.09
919 0.1
920 0.12
921 0.13
922 0.14
923 0.16
924 0.15
925 0.14
926 0.13
927 0.15
928 0.13
929 0.13
930 0.11
931 0.09
932 0.09
933 0.11
934 0.13
935 0.12
936 0.17
937 0.21
938 0.23
939 0.24
940 0.26
941 0.3
942 0.34
943 0.4
944 0.37
945 0.37
946 0.36
947 0.37
948 0.39
949 0.32
950 0.27
951 0.2
952 0.16
953 0.12
954 0.11
955 0.1
956 0.06
957 0.07
958 0.07
959 0.09
960 0.1
961 0.18
962 0.24
963 0.31
964 0.37
965 0.47
966 0.54
967 0.55
968 0.56
969 0.55
970 0.52
971 0.45
972 0.4
973 0.31
974 0.24
975 0.22
976 0.19
977 0.14
978 0.11
979 0.11
980 0.13
981 0.14
982 0.15
983 0.14
984 0.15
985 0.16
986 0.2
987 0.22
988 0.24