Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5G6W1

Protein Details
Accession A0A5C5G6W1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSEPPRKRPRVSPPPATPAPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013961  RAI1  
IPR039039  RAI1-like_fam  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF08652  RAI1  
Amino Acid Sequences MSEPPRKRPRVSPPPATPAPPPPAPAAAAQGPYAGSQPGAGTQPEAPPHAPFASHAVHPPASYLSSPSVPPTAFQQPSHLASFSYSPARDLLLDDAHRDDALAFYREPRIGSDLNWGFERAVWRDGSVDEGLDALLDSLSTWAAKQPQPAADDLLGKIAVMTWRGMLTKLMLAVHEVDNLASGRRGDGWEMNAMVVDGCLYLEESNPPSKLAAKTASESRNALPSYYGYSFESYCTAPSDLPSEFPIPNTNVQWCSVVKTNLGGFRTIVGGEVDCVRQGADPQRIKTDDFVELKTNIAIQSQRDEVNFERQKLLKHYVQSFLLGVPTVTVGFRTRQGQLTALQSFNTLEIPRLVRGKPHAWTPAACLASARELLAFLHGSVSTHPSTLRAEADLRARASAGTGAGAGAGEDDPAAWPVFRVVFSPQEGVSVRELTPREVHDEVLGAKRAVHGGRVGFLLARWVRERH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.79
3 0.73
4 0.67
5 0.64
6 0.61
7 0.52
8 0.47
9 0.4
10 0.39
11 0.37
12 0.33
13 0.3
14 0.27
15 0.26
16 0.23
17 0.21
18 0.19
19 0.18
20 0.18
21 0.13
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.11
26 0.12
27 0.12
28 0.13
29 0.15
30 0.19
31 0.21
32 0.24
33 0.23
34 0.22
35 0.25
36 0.24
37 0.22
38 0.19
39 0.22
40 0.22
41 0.22
42 0.24
43 0.25
44 0.25
45 0.25
46 0.25
47 0.22
48 0.2
49 0.19
50 0.19
51 0.17
52 0.18
53 0.19
54 0.2
55 0.21
56 0.19
57 0.19
58 0.22
59 0.28
60 0.3
61 0.3
62 0.33
63 0.34
64 0.38
65 0.39
66 0.34
67 0.25
68 0.23
69 0.25
70 0.22
71 0.23
72 0.2
73 0.18
74 0.19
75 0.19
76 0.18
77 0.18
78 0.18
79 0.17
80 0.18
81 0.18
82 0.2
83 0.19
84 0.18
85 0.17
86 0.14
87 0.11
88 0.13
89 0.14
90 0.12
91 0.14
92 0.18
93 0.19
94 0.19
95 0.19
96 0.21
97 0.19
98 0.2
99 0.28
100 0.26
101 0.27
102 0.27
103 0.26
104 0.22
105 0.23
106 0.25
107 0.18
108 0.18
109 0.17
110 0.16
111 0.17
112 0.17
113 0.18
114 0.15
115 0.12
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.06
130 0.12
131 0.14
132 0.17
133 0.2
134 0.24
135 0.25
136 0.26
137 0.26
138 0.22
139 0.23
140 0.2
141 0.17
142 0.13
143 0.11
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.1
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.08
182 0.06
183 0.05
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.04
190 0.06
191 0.08
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.14
197 0.14
198 0.16
199 0.17
200 0.16
201 0.18
202 0.24
203 0.26
204 0.24
205 0.25
206 0.23
207 0.25
208 0.23
209 0.21
210 0.16
211 0.14
212 0.17
213 0.16
214 0.17
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.14
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.12
230 0.13
231 0.12
232 0.13
233 0.15
234 0.14
235 0.16
236 0.17
237 0.17
238 0.15
239 0.16
240 0.17
241 0.15
242 0.16
243 0.17
244 0.17
245 0.15
246 0.15
247 0.17
248 0.18
249 0.18
250 0.16
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.11
255 0.1
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.08
266 0.14
267 0.22
268 0.25
269 0.27
270 0.31
271 0.32
272 0.33
273 0.32
274 0.29
275 0.27
276 0.25
277 0.26
278 0.24
279 0.23
280 0.23
281 0.21
282 0.19
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.1
287 0.13
288 0.14
289 0.16
290 0.15
291 0.18
292 0.18
293 0.27
294 0.3
295 0.28
296 0.31
297 0.31
298 0.34
299 0.37
300 0.41
301 0.34
302 0.36
303 0.38
304 0.37
305 0.36
306 0.34
307 0.29
308 0.23
309 0.2
310 0.14
311 0.11
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.05
316 0.06
317 0.07
318 0.09
319 0.12
320 0.14
321 0.17
322 0.2
323 0.21
324 0.22
325 0.23
326 0.28
327 0.28
328 0.25
329 0.23
330 0.2
331 0.19
332 0.18
333 0.17
334 0.12
335 0.1
336 0.13
337 0.15
338 0.17
339 0.2
340 0.2
341 0.22
342 0.27
343 0.31
344 0.3
345 0.34
346 0.37
347 0.36
348 0.36
349 0.37
350 0.39
351 0.34
352 0.32
353 0.26
354 0.22
355 0.23
356 0.22
357 0.17
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.12
362 0.11
363 0.08
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.14
369 0.13
370 0.13
371 0.13
372 0.14
373 0.16
374 0.18
375 0.18
376 0.16
377 0.18
378 0.2
379 0.26
380 0.28
381 0.26
382 0.24
383 0.23
384 0.21
385 0.2
386 0.18
387 0.13
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.05
400 0.07
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.09
405 0.11
406 0.11
407 0.12
408 0.14
409 0.18
410 0.21
411 0.23
412 0.21
413 0.24
414 0.25
415 0.25
416 0.25
417 0.23
418 0.21
419 0.25
420 0.26
421 0.25
422 0.29
423 0.28
424 0.32
425 0.3
426 0.3
427 0.25
428 0.26
429 0.26
430 0.27
431 0.28
432 0.22
433 0.21
434 0.22
435 0.26
436 0.24
437 0.24
438 0.22
439 0.21
440 0.22
441 0.23
442 0.22
443 0.17
444 0.17
445 0.23
446 0.21
447 0.24