Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5G0S7

Protein Details
Accession A0A5C5G0S7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-29TYNVTRFTRQVLKRHRRAPPSLVIHydrophilic
385-422ERVLAERKKAQQVQKKAQAQKRKEKKRLEQQGHDLSVGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
326-338GRPAPAPKKGGGG
391-411RKKAQQVQKKAQAQKRKEKKR
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 9.5, cyto_nucl 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSTGATYNVTRFTRQVLKRHRRAPPSLVIHLYPTHFRFEHQHGNFSYDSPMKCFLEAVREQKLPTDLLDVLDDAGVVYYDGCLIVEVHDHRQSPSAASTSRTSLSSSFSLSLSQARETPATSKAEVYRIVLAPNPASLWTDLGIQSRRLEQEALAEGRDDSAGWTEEEALEIESIVLNRTMPPLCLSPSIQTSRIANSMLRATTLRPPKRKRFCSSGDCDDGDDGAEGEKREREEHEKLMKVGDEGVPRTRGPAFSRLAFIQAYRERQANPSLAAQPGANPTSIRLGGAHGAAAAAAAGPTAAGAARGPTPKPSRAGSPAMSVASGRPAPAPKKGGGGARAAGGDAMSDSGSGIGGQVNTAQQQKKVAKLGVNDPGLPLDSVERERVLAERKKAQQVQKKAQAQKRKEKKRLEQQGHDLSVGTPGSSGVSTPKWA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.52
3 0.56
4 0.65
5 0.72
6 0.81
7 0.84
8 0.82
9 0.83
10 0.8
11 0.79
12 0.76
13 0.72
14 0.67
15 0.58
16 0.52
17 0.48
18 0.43
19 0.39
20 0.33
21 0.33
22 0.29
23 0.3
24 0.34
25 0.38
26 0.46
27 0.43
28 0.48
29 0.43
30 0.47
31 0.46
32 0.4
33 0.38
34 0.33
35 0.31
36 0.27
37 0.32
38 0.28
39 0.28
40 0.28
41 0.23
42 0.27
43 0.32
44 0.34
45 0.35
46 0.36
47 0.36
48 0.38
49 0.39
50 0.31
51 0.26
52 0.25
53 0.19
54 0.18
55 0.19
56 0.16
57 0.14
58 0.13
59 0.11
60 0.07
61 0.06
62 0.05
63 0.04
64 0.04
65 0.03
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.05
72 0.1
73 0.12
74 0.17
75 0.21
76 0.22
77 0.22
78 0.25
79 0.26
80 0.23
81 0.24
82 0.23
83 0.2
84 0.22
85 0.23
86 0.23
87 0.23
88 0.22
89 0.21
90 0.18
91 0.21
92 0.19
93 0.19
94 0.18
95 0.16
96 0.17
97 0.16
98 0.19
99 0.16
100 0.16
101 0.16
102 0.16
103 0.17
104 0.17
105 0.19
106 0.2
107 0.21
108 0.2
109 0.22
110 0.22
111 0.25
112 0.25
113 0.24
114 0.23
115 0.21
116 0.21
117 0.2
118 0.19
119 0.16
120 0.15
121 0.14
122 0.1
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.11
129 0.15
130 0.16
131 0.16
132 0.17
133 0.19
134 0.2
135 0.19
136 0.18
137 0.14
138 0.17
139 0.19
140 0.19
141 0.16
142 0.15
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.09
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.14
173 0.14
174 0.14
175 0.18
176 0.2
177 0.2
178 0.2
179 0.19
180 0.19
181 0.2
182 0.18
183 0.14
184 0.13
185 0.14
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.12
190 0.17
191 0.27
192 0.32
193 0.4
194 0.48
195 0.57
196 0.67
197 0.73
198 0.72
199 0.7
200 0.71
201 0.7
202 0.68
203 0.64
204 0.57
205 0.5
206 0.45
207 0.37
208 0.29
209 0.21
210 0.14
211 0.08
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.08
217 0.09
218 0.1
219 0.13
220 0.18
221 0.21
222 0.28
223 0.33
224 0.34
225 0.33
226 0.33
227 0.31
228 0.25
229 0.23
230 0.19
231 0.15
232 0.14
233 0.16
234 0.17
235 0.17
236 0.18
237 0.17
238 0.17
239 0.18
240 0.23
241 0.23
242 0.22
243 0.24
244 0.23
245 0.24
246 0.21
247 0.19
248 0.19
249 0.2
250 0.23
251 0.22
252 0.24
253 0.23
254 0.25
255 0.29
256 0.24
257 0.22
258 0.21
259 0.22
260 0.2
261 0.2
262 0.17
263 0.15
264 0.17
265 0.16
266 0.13
267 0.11
268 0.11
269 0.14
270 0.14
271 0.13
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.11
276 0.1
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.05
281 0.04
282 0.03
283 0.02
284 0.02
285 0.02
286 0.02
287 0.02
288 0.02
289 0.02
290 0.02
291 0.03
292 0.04
293 0.08
294 0.1
295 0.11
296 0.18
297 0.23
298 0.26
299 0.3
300 0.31
301 0.33
302 0.36
303 0.41
304 0.35
305 0.34
306 0.33
307 0.3
308 0.28
309 0.23
310 0.18
311 0.17
312 0.15
313 0.13
314 0.13
315 0.18
316 0.21
317 0.27
318 0.3
319 0.27
320 0.31
321 0.33
322 0.35
323 0.32
324 0.33
325 0.27
326 0.25
327 0.24
328 0.2
329 0.17
330 0.12
331 0.09
332 0.06
333 0.06
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.07
345 0.08
346 0.11
347 0.18
348 0.19
349 0.2
350 0.28
351 0.32
352 0.36
353 0.41
354 0.42
355 0.4
356 0.42
357 0.48
358 0.48
359 0.46
360 0.41
361 0.36
362 0.33
363 0.3
364 0.25
365 0.19
366 0.13
367 0.14
368 0.16
369 0.17
370 0.17
371 0.16
372 0.17
373 0.2
374 0.27
375 0.31
376 0.35
377 0.42
378 0.49
379 0.58
380 0.65
381 0.71
382 0.72
383 0.75
384 0.8
385 0.81
386 0.84
387 0.84
388 0.85
389 0.86
390 0.86
391 0.86
392 0.87
393 0.88
394 0.88
395 0.89
396 0.91
397 0.92
398 0.93
399 0.92
400 0.91
401 0.89
402 0.89
403 0.81
404 0.7
405 0.6
406 0.49
407 0.43
408 0.33
409 0.23
410 0.14
411 0.11
412 0.12
413 0.11
414 0.12
415 0.12