Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5G1N8

Protein Details
Accession A0A5C5G1N8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-76NLPQKRASYSHRDPRRRSPNPGARDCRLHydrophilic
181-204GRGAPHSRRRSRSRSPRRVDKGDLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-203RDESPRRRGRESPDVGRGAPHSRRRSRSRSPRRVDKGD
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000684  RNA_pol_II_repeat_euk  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF05001  RNA_pol_Rpb1_R  
Amino Acid Sequences MPSNTYSSRAPSHSRPRAANAAPLPDVPRARAGPSHDRSLTSSVYSRANLPQKRASYSHRDPRRRSPNPGARDCRLDMLDNAGRAPPRLSEHRDAFRGDREGGRDDGVRHRARDNRSRCDEWSQEDVRSDRSRTRTRREGPRDDEHSLRREDSDALIRYWNDRLRRDESPRRRGRESPDVGRGAPHSRRRSRSRSPRRVDKGDLEGEGERRASRGLPSSLPGRERSPLVAPAKLPSATQHSATPPRSPGFSPASPQYSPPSPVFSPTSRGHSPTSPRFSPASPRFSPASPRFSPASPAFSPASPSVSIASPRYSPLSPALSLASPAFSPVSPAFTPASPRSPAFSPASPPPALAAPQQVPRPAGSTQRPQLPQLPQLPPRASASTGTGVGLGAGAVAGARVAVPQLQIRGSASAQGQGQGQGRWGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.64
3 0.66
4 0.7
5 0.65
6 0.64
7 0.57
8 0.53
9 0.47
10 0.45
11 0.42
12 0.39
13 0.38
14 0.31
15 0.33
16 0.29
17 0.3
18 0.32
19 0.36
20 0.41
21 0.44
22 0.5
23 0.46
24 0.47
25 0.47
26 0.47
27 0.42
28 0.34
29 0.33
30 0.28
31 0.29
32 0.28
33 0.28
34 0.32
35 0.4
36 0.41
37 0.44
38 0.49
39 0.49
40 0.54
41 0.55
42 0.54
43 0.55
44 0.6
45 0.65
46 0.67
47 0.73
48 0.74
49 0.81
50 0.85
51 0.82
52 0.82
53 0.82
54 0.81
55 0.81
56 0.85
57 0.81
58 0.74
59 0.73
60 0.65
61 0.58
62 0.5
63 0.42
64 0.32
65 0.33
66 0.32
67 0.26
68 0.25
69 0.23
70 0.22
71 0.21
72 0.21
73 0.16
74 0.19
75 0.26
76 0.32
77 0.38
78 0.44
79 0.49
80 0.5
81 0.51
82 0.48
83 0.46
84 0.42
85 0.37
86 0.33
87 0.3
88 0.31
89 0.29
90 0.28
91 0.25
92 0.24
93 0.29
94 0.35
95 0.35
96 0.34
97 0.38
98 0.44
99 0.49
100 0.56
101 0.57
102 0.58
103 0.62
104 0.64
105 0.61
106 0.62
107 0.58
108 0.52
109 0.52
110 0.45
111 0.39
112 0.38
113 0.36
114 0.35
115 0.35
116 0.33
117 0.31
118 0.37
119 0.45
120 0.49
121 0.57
122 0.61
123 0.66
124 0.75
125 0.78
126 0.79
127 0.77
128 0.78
129 0.76
130 0.69
131 0.66
132 0.59
133 0.54
134 0.46
135 0.4
136 0.32
137 0.27
138 0.25
139 0.22
140 0.24
141 0.21
142 0.2
143 0.22
144 0.21
145 0.21
146 0.25
147 0.27
148 0.25
149 0.28
150 0.32
151 0.35
152 0.41
153 0.49
154 0.55
155 0.61
156 0.67
157 0.71
158 0.71
159 0.7
160 0.69
161 0.67
162 0.67
163 0.63
164 0.58
165 0.56
166 0.52
167 0.48
168 0.44
169 0.38
170 0.34
171 0.34
172 0.37
173 0.39
174 0.45
175 0.53
176 0.59
177 0.66
178 0.71
179 0.75
180 0.78
181 0.8
182 0.81
183 0.84
184 0.84
185 0.81
186 0.74
187 0.67
188 0.61
189 0.52
190 0.44
191 0.35
192 0.29
193 0.24
194 0.21
195 0.17
196 0.11
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.12
202 0.13
203 0.13
204 0.15
205 0.18
206 0.2
207 0.21
208 0.21
209 0.19
210 0.19
211 0.19
212 0.19
213 0.17
214 0.22
215 0.22
216 0.22
217 0.2
218 0.2
219 0.21
220 0.2
221 0.18
222 0.13
223 0.18
224 0.17
225 0.18
226 0.19
227 0.21
228 0.27
229 0.29
230 0.3
231 0.26
232 0.26
233 0.26
234 0.25
235 0.26
236 0.25
237 0.25
238 0.25
239 0.26
240 0.3
241 0.28
242 0.29
243 0.27
244 0.24
245 0.26
246 0.24
247 0.25
248 0.21
249 0.24
250 0.26
251 0.24
252 0.27
253 0.26
254 0.32
255 0.28
256 0.31
257 0.3
258 0.32
259 0.38
260 0.41
261 0.46
262 0.4
263 0.41
264 0.4
265 0.39
266 0.45
267 0.44
268 0.44
269 0.38
270 0.41
271 0.4
272 0.39
273 0.47
274 0.42
275 0.43
276 0.36
277 0.39
278 0.37
279 0.36
280 0.4
281 0.33
282 0.35
283 0.27
284 0.29
285 0.27
286 0.25
287 0.28
288 0.23
289 0.24
290 0.17
291 0.17
292 0.15
293 0.15
294 0.17
295 0.16
296 0.17
297 0.15
298 0.16
299 0.19
300 0.18
301 0.18
302 0.2
303 0.22
304 0.2
305 0.21
306 0.21
307 0.17
308 0.18
309 0.17
310 0.13
311 0.09
312 0.1
313 0.1
314 0.08
315 0.12
316 0.11
317 0.16
318 0.15
319 0.18
320 0.18
321 0.18
322 0.24
323 0.24
324 0.28
325 0.26
326 0.26
327 0.28
328 0.28
329 0.32
330 0.31
331 0.3
332 0.3
333 0.33
334 0.38
335 0.34
336 0.32
337 0.29
338 0.26
339 0.26
340 0.23
341 0.23
342 0.22
343 0.27
344 0.29
345 0.31
346 0.3
347 0.29
348 0.3
349 0.27
350 0.31
351 0.33
352 0.39
353 0.43
354 0.5
355 0.51
356 0.52
357 0.57
358 0.54
359 0.55
360 0.54
361 0.56
362 0.53
363 0.59
364 0.57
365 0.52
366 0.51
367 0.47
368 0.4
369 0.34
370 0.32
371 0.27
372 0.26
373 0.24
374 0.19
375 0.16
376 0.15
377 0.12
378 0.08
379 0.04
380 0.03
381 0.03
382 0.02
383 0.02
384 0.02
385 0.02
386 0.02
387 0.03
388 0.04
389 0.05
390 0.08
391 0.11
392 0.14
393 0.14
394 0.16
395 0.17
396 0.2
397 0.19
398 0.22
399 0.2
400 0.21
401 0.21
402 0.22
403 0.22
404 0.24
405 0.26
406 0.22
407 0.27