Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FVN4

Protein Details
Accession A0A5C5FVN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
851-872EDDEAAKKRKKRTEVNASDVLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-264KGK
857-861KKRKK
Subcellular Location(s) cyto 17, nucl 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR011047  Quinoprotein_ADH-like_supfam  
IPR013934  Utp13_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08625  Utp13  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MGAAVFKEFKSYQPIHTGGKATLSGDGTWLVSTLNEQALVTNIETGEQVQELKGDTSAVTTLALTPSPVSPQDGGYLLTCGRSLGIHIYSLPSLALHRNVARAHDAPIITSCADPTGTLFGTGSADGIVKVWDAANGHCTHVFKGHGGVVSAMVFDIASAGDGGRQGRARLITGADDCKVRVWDLRTREGVHVLDGHVSVVRGLDVTKDGKTLVSGGRDKVVNVWDLERGVLRKTLPVFETLEAVGIVDVPEAGAAVDKKGKGKETGRTRKAVFTAGDKGVIRLWDLQTNEQIKKEADDVSAGGKVHEIVDLIHTPAASSLTAVYVDQNIVTRSLPSLATTRQIIGFNDEVIDACFVSSSSSSSSPSADASDEASTSAPESQLAVATNSDLIRVYDLDRFNTSLLEGHDDVVLCLTRTTDGQVLVSGSKDNTARVWQARERRADGTSTWACVARAEGHVESVGAVATSKRSRALLVTASQDRTAKIWDLASVLSEDAAPGGAHGEGGAPVALRAMSTTKIHDKDINSLDISPNDKLLASGSQDRTAKLFAISHTPATKSGPAQATLSLLGTFKGHKRGVWSVKFSPVDQCLATASGDRTVKLWNLHDFACVKTFEGHSNSVLRVDFMTRGMQLVTAASDGLVKVWNVKDEECVETLDNHEEKVWALAVNRDESFVVSGGADSMITIWEDVTEMQELEKEQEQADLVLKEQDYENFLSMKDYSNAIMLALSMDQPRRLLLLFTEVRASAGTNGAEDLLSLTGSRHVDAVLRGLSPAELRQMFRYIKDWNTVSRTADTAQTVLHAILKLHDADALLAVLENRADDVQDGELDLAAMGKRPAKDADEDGDGDDEDDEAAKKRKKRTEVNASDVLGALIPYTERHMTRADKLVRESFIVEHLLGMMEGFDDFDVAGAAGEVDGEADGMDVDEEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.45
4 0.45
5 0.37
6 0.38
7 0.35
8 0.27
9 0.27
10 0.25
11 0.2
12 0.18
13 0.18
14 0.15
15 0.14
16 0.13
17 0.09
18 0.08
19 0.09
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.13
26 0.15
27 0.14
28 0.13
29 0.12
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.1
35 0.11
36 0.09
37 0.1
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.11
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.14
55 0.15
56 0.17
57 0.16
58 0.17
59 0.19
60 0.19
61 0.19
62 0.17
63 0.18
64 0.15
65 0.14
66 0.13
67 0.11
68 0.1
69 0.09
70 0.1
71 0.13
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.17
76 0.16
77 0.17
78 0.15
79 0.1
80 0.12
81 0.14
82 0.17
83 0.18
84 0.2
85 0.25
86 0.26
87 0.28
88 0.32
89 0.29
90 0.3
91 0.31
92 0.29
93 0.25
94 0.26
95 0.26
96 0.21
97 0.2
98 0.16
99 0.12
100 0.13
101 0.11
102 0.11
103 0.13
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.13
110 0.11
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.08
115 0.07
116 0.06
117 0.07
118 0.06
119 0.08
120 0.09
121 0.1
122 0.15
123 0.16
124 0.18
125 0.2
126 0.21
127 0.21
128 0.23
129 0.24
130 0.19
131 0.21
132 0.22
133 0.2
134 0.2
135 0.19
136 0.16
137 0.14
138 0.13
139 0.1
140 0.07
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.03
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.07
150 0.07
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.16
155 0.17
156 0.18
157 0.18
158 0.19
159 0.19
160 0.21
161 0.23
162 0.21
163 0.21
164 0.2
165 0.2
166 0.2
167 0.18
168 0.19
169 0.21
170 0.27
171 0.31
172 0.38
173 0.39
174 0.42
175 0.42
176 0.42
177 0.38
178 0.32
179 0.28
180 0.22
181 0.2
182 0.17
183 0.15
184 0.11
185 0.11
186 0.09
187 0.08
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.09
193 0.11
194 0.11
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.14
200 0.14
201 0.19
202 0.21
203 0.21
204 0.25
205 0.25
206 0.25
207 0.25
208 0.25
209 0.2
210 0.18
211 0.18
212 0.16
213 0.16
214 0.17
215 0.16
216 0.14
217 0.14
218 0.15
219 0.14
220 0.17
221 0.18
222 0.21
223 0.2
224 0.22
225 0.23
226 0.21
227 0.22
228 0.18
229 0.17
230 0.13
231 0.12
232 0.09
233 0.06
234 0.06
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.04
242 0.05
243 0.06
244 0.1
245 0.11
246 0.15
247 0.17
248 0.2
249 0.25
250 0.29
251 0.37
252 0.45
253 0.55
254 0.57
255 0.6
256 0.6
257 0.58
258 0.55
259 0.5
260 0.41
261 0.34
262 0.35
263 0.3
264 0.32
265 0.27
266 0.26
267 0.23
268 0.22
269 0.18
270 0.16
271 0.17
272 0.17
273 0.19
274 0.2
275 0.25
276 0.3
277 0.3
278 0.28
279 0.28
280 0.24
281 0.24
282 0.24
283 0.2
284 0.15
285 0.14
286 0.14
287 0.13
288 0.15
289 0.14
290 0.12
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.07
296 0.05
297 0.08
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.12
325 0.12
326 0.14
327 0.14
328 0.14
329 0.15
330 0.17
331 0.16
332 0.17
333 0.16
334 0.14
335 0.13
336 0.12
337 0.1
338 0.09
339 0.09
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.07
348 0.08
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.05
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.07
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.08
382 0.12
383 0.13
384 0.14
385 0.15
386 0.16
387 0.15
388 0.15
389 0.13
390 0.1
391 0.1
392 0.12
393 0.11
394 0.11
395 0.12
396 0.12
397 0.11
398 0.1
399 0.09
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.08
414 0.06
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.1
420 0.13
421 0.14
422 0.19
423 0.21
424 0.29
425 0.34
426 0.37
427 0.38
428 0.37
429 0.36
430 0.33
431 0.29
432 0.28
433 0.23
434 0.21
435 0.18
436 0.17
437 0.16
438 0.14
439 0.15
440 0.09
441 0.09
442 0.11
443 0.1
444 0.1
445 0.1
446 0.1
447 0.09
448 0.07
449 0.06
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.06
454 0.06
455 0.07
456 0.08
457 0.08
458 0.09
459 0.1
460 0.12
461 0.12
462 0.14
463 0.17
464 0.19
465 0.19
466 0.2
467 0.19
468 0.17
469 0.15
470 0.15
471 0.11
472 0.1
473 0.1
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.08
479 0.07
480 0.06
481 0.05
482 0.05
483 0.04
484 0.04
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.04
495 0.03
496 0.03
497 0.03
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.04
502 0.06
503 0.07
504 0.1
505 0.16
506 0.17
507 0.19
508 0.22
509 0.23
510 0.28
511 0.29
512 0.29
513 0.23
514 0.22
515 0.22
516 0.2
517 0.21
518 0.15
519 0.12
520 0.11
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.09
525 0.09
526 0.15
527 0.16
528 0.2
529 0.21
530 0.21
531 0.21
532 0.21
533 0.19
534 0.14
535 0.14
536 0.1
537 0.16
538 0.16
539 0.17
540 0.18
541 0.18
542 0.18
543 0.19
544 0.2
545 0.14
546 0.19
547 0.19
548 0.19
549 0.18
550 0.18
551 0.17
552 0.15
553 0.15
554 0.1
555 0.08
556 0.08
557 0.08
558 0.09
559 0.1
560 0.17
561 0.17
562 0.17
563 0.22
564 0.3
565 0.38
566 0.41
567 0.45
568 0.4
569 0.47
570 0.47
571 0.43
572 0.39
573 0.32
574 0.29
575 0.23
576 0.21
577 0.15
578 0.14
579 0.14
580 0.11
581 0.1
582 0.13
583 0.13
584 0.13
585 0.13
586 0.14
587 0.16
588 0.18
589 0.2
590 0.19
591 0.2
592 0.21
593 0.23
594 0.22
595 0.21
596 0.21
597 0.18
598 0.15
599 0.15
600 0.16
601 0.17
602 0.2
603 0.2
604 0.19
605 0.21
606 0.2
607 0.2
608 0.19
609 0.15
610 0.13
611 0.13
612 0.12
613 0.11
614 0.12
615 0.1
616 0.11
617 0.1
618 0.1
619 0.08
620 0.08
621 0.07
622 0.05
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.06
629 0.05
630 0.09
631 0.1
632 0.13
633 0.14
634 0.14
635 0.17
636 0.18
637 0.21
638 0.18
639 0.19
640 0.16
641 0.16
642 0.17
643 0.19
644 0.17
645 0.15
646 0.15
647 0.14
648 0.13
649 0.14
650 0.13
651 0.08
652 0.09
653 0.12
654 0.14
655 0.16
656 0.16
657 0.16
658 0.15
659 0.15
660 0.15
661 0.12
662 0.1
663 0.07
664 0.07
665 0.06
666 0.06
667 0.05
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.04
675 0.04
676 0.05
677 0.06
678 0.06
679 0.06
680 0.06
681 0.08
682 0.08
683 0.11
684 0.13
685 0.12
686 0.12
687 0.13
688 0.13
689 0.13
690 0.15
691 0.13
692 0.11
693 0.14
694 0.13
695 0.13
696 0.14
697 0.14
698 0.14
699 0.15
700 0.16
701 0.13
702 0.13
703 0.14
704 0.14
705 0.16
706 0.14
707 0.14
708 0.13
709 0.13
710 0.13
711 0.11
712 0.1
713 0.08
714 0.07
715 0.06
716 0.08
717 0.09
718 0.1
719 0.11
720 0.12
721 0.12
722 0.13
723 0.13
724 0.12
725 0.1
726 0.18
727 0.18
728 0.18
729 0.2
730 0.19
731 0.19
732 0.18
733 0.18
734 0.11
735 0.12
736 0.11
737 0.1
738 0.1
739 0.1
740 0.09
741 0.08
742 0.08
743 0.06
744 0.06
745 0.06
746 0.06
747 0.1
748 0.11
749 0.11
750 0.1
751 0.11
752 0.13
753 0.13
754 0.16
755 0.13
756 0.13
757 0.13
758 0.13
759 0.13
760 0.12
761 0.12
762 0.15
763 0.16
764 0.18
765 0.2
766 0.27
767 0.27
768 0.28
769 0.31
770 0.29
771 0.3
772 0.35
773 0.35
774 0.34
775 0.39
776 0.4
777 0.39
778 0.36
779 0.34
780 0.29
781 0.31
782 0.26
783 0.21
784 0.18
785 0.16
786 0.15
787 0.13
788 0.14
789 0.12
790 0.11
791 0.12
792 0.14
793 0.13
794 0.13
795 0.13
796 0.11
797 0.1
798 0.11
799 0.09
800 0.07
801 0.07
802 0.07
803 0.06
804 0.06
805 0.05
806 0.06
807 0.06
808 0.06
809 0.06
810 0.08
811 0.08
812 0.09
813 0.09
814 0.08
815 0.08
816 0.08
817 0.07
818 0.07
819 0.06
820 0.07
821 0.09
822 0.13
823 0.13
824 0.16
825 0.19
826 0.21
827 0.25
828 0.27
829 0.29
830 0.29
831 0.29
832 0.28
833 0.26
834 0.23
835 0.19
836 0.16
837 0.12
838 0.08
839 0.08
840 0.08
841 0.11
842 0.2
843 0.25
844 0.32
845 0.41
846 0.5
847 0.59
848 0.68
849 0.75
850 0.78
851 0.82
852 0.83
853 0.8
854 0.73
855 0.64
856 0.53
857 0.42
858 0.31
859 0.21
860 0.14
861 0.07
862 0.06
863 0.06
864 0.1
865 0.15
866 0.15
867 0.18
868 0.24
869 0.28
870 0.33
871 0.43
872 0.45
873 0.46
874 0.51
875 0.54
876 0.5
877 0.47
878 0.44
879 0.35
880 0.31
881 0.28
882 0.22
883 0.17
884 0.16
885 0.14
886 0.12
887 0.1
888 0.07
889 0.05
890 0.05
891 0.05
892 0.05
893 0.04
894 0.04
895 0.05
896 0.05
897 0.05
898 0.05
899 0.04
900 0.04
901 0.04
902 0.04
903 0.04
904 0.04
905 0.03
906 0.04
907 0.03
908 0.03
909 0.04
910 0.04
911 0.04