Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5G353

Protein Details
Accession A0A5C5G353    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-221VRNLRHHLPRPRPPRRRSYGRLBasic
264-284LLLRSRVRPDPPRRHHPHSVLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
206-220HLPRPRPPRRRSYGR
229-295VRREHLRPRPRHLPLCRVWHGQRRRRQGLPPQHRGLLLRSRVRPDPPRRHHPHSVLPRPVHPARARA
Subcellular Location(s) plas 19, E.R. 3, extr 2, mito 1, pero 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MAVNVCPPGVWSYYAYDPMRVMTYVALALFFVIFVAQLALTIKYRTRYMIPFVIGMLGESCGYIFRRVSADNSCGRGSALTWYLLQELFLILCPALMCASYYMVRLSARPSPAPPRSLLPAHVPVDPAVLRPHHNLCRREVDAHSEQVGDVHLRHGRHRLVCHSGCWWKPLLFRQPRPVQDGKGHPPRRVHCTDLWLGAVRNLRHHLPRPRPPRRRSYGRLDPLPVDAVRREHLRPRPRHLPLCRVWHGQRRRRQGLPPQHRGLLLRSRVRPDPPRRHHPHSVLPRPVHPARARAHVPALAGGGGCRRAGREPGGEREGVAWGREEEVVEEVVSWRLAGATFLEGCGHIARWSHRFFVGRRVALEKDLGTSMRTGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.29
4 0.27
5 0.27
6 0.27
7 0.23
8 0.21
9 0.13
10 0.14
11 0.13
12 0.12
13 0.1
14 0.08
15 0.08
16 0.07
17 0.06
18 0.05
19 0.04
20 0.04
21 0.04
22 0.04
23 0.04
24 0.05
25 0.06
26 0.08
27 0.09
28 0.12
29 0.14
30 0.17
31 0.19
32 0.21
33 0.25
34 0.27
35 0.32
36 0.36
37 0.35
38 0.32
39 0.31
40 0.3
41 0.24
42 0.2
43 0.15
44 0.09
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.09
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.15
54 0.17
55 0.21
56 0.23
57 0.27
58 0.29
59 0.33
60 0.31
61 0.28
62 0.27
63 0.24
64 0.2
65 0.19
66 0.16
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.16
71 0.15
72 0.14
73 0.1
74 0.09
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.14
94 0.17
95 0.19
96 0.2
97 0.24
98 0.31
99 0.35
100 0.37
101 0.35
102 0.32
103 0.34
104 0.34
105 0.33
106 0.29
107 0.31
108 0.31
109 0.3
110 0.28
111 0.23
112 0.24
113 0.22
114 0.18
115 0.14
116 0.14
117 0.15
118 0.18
119 0.25
120 0.3
121 0.38
122 0.39
123 0.41
124 0.46
125 0.46
126 0.46
127 0.4
128 0.4
129 0.35
130 0.34
131 0.31
132 0.24
133 0.21
134 0.18
135 0.18
136 0.11
137 0.08
138 0.09
139 0.11
140 0.12
141 0.14
142 0.19
143 0.23
144 0.26
145 0.28
146 0.3
147 0.35
148 0.35
149 0.35
150 0.34
151 0.36
152 0.33
153 0.32
154 0.3
155 0.23
156 0.26
157 0.31
158 0.36
159 0.39
160 0.42
161 0.49
162 0.54
163 0.55
164 0.58
165 0.54
166 0.47
167 0.44
168 0.47
169 0.46
170 0.49
171 0.49
172 0.46
173 0.5
174 0.5
175 0.52
176 0.49
177 0.45
178 0.36
179 0.38
180 0.36
181 0.31
182 0.29
183 0.22
184 0.19
185 0.18
186 0.2
187 0.16
188 0.16
189 0.17
190 0.19
191 0.22
192 0.29
193 0.35
194 0.4
195 0.5
196 0.58
197 0.68
198 0.75
199 0.78
200 0.81
201 0.81
202 0.81
203 0.78
204 0.76
205 0.76
206 0.73
207 0.71
208 0.63
209 0.55
210 0.46
211 0.43
212 0.33
213 0.24
214 0.18
215 0.16
216 0.16
217 0.18
218 0.19
219 0.24
220 0.33
221 0.41
222 0.46
223 0.52
224 0.6
225 0.64
226 0.71
227 0.68
228 0.69
229 0.66
230 0.69
231 0.65
232 0.62
233 0.61
234 0.61
235 0.66
236 0.66
237 0.67
238 0.69
239 0.71
240 0.69
241 0.71
242 0.72
243 0.73
244 0.75
245 0.75
246 0.69
247 0.64
248 0.6
249 0.54
250 0.49
251 0.46
252 0.43
253 0.42
254 0.42
255 0.44
256 0.46
257 0.52
258 0.57
259 0.59
260 0.63
261 0.64
262 0.72
263 0.76
264 0.81
265 0.82
266 0.79
267 0.78
268 0.78
269 0.78
270 0.76
271 0.7
272 0.65
273 0.64
274 0.59
275 0.58
276 0.49
277 0.47
278 0.42
279 0.48
280 0.46
281 0.41
282 0.43
283 0.36
284 0.34
285 0.27
286 0.24
287 0.17
288 0.15
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.11
295 0.13
296 0.18
297 0.21
298 0.28
299 0.31
300 0.38
301 0.41
302 0.39
303 0.37
304 0.34
305 0.33
306 0.26
307 0.22
308 0.16
309 0.13
310 0.15
311 0.15
312 0.14
313 0.11
314 0.12
315 0.12
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.12
333 0.13
334 0.12
335 0.11
336 0.15
337 0.19
338 0.26
339 0.28
340 0.3
341 0.33
342 0.38
343 0.38
344 0.45
345 0.5
346 0.46
347 0.46
348 0.48
349 0.45
350 0.42
351 0.44
352 0.34
353 0.27
354 0.27
355 0.24
356 0.2