Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FQ27

Protein Details
Accession A0A5C5FQ27    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-40KEAAYPPNKRQRVKFGPHRLGPDAHydrophilic
357-376ERGNKQLKQAKERSRDSRMWHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 8, nucl 7.5, cyto_nucl 7.5, cyto 6.5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019529  Syntaxin-18_N  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0015031  P:protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10496  Syntaxin-18_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50192  T_SNARE  
Amino Acid Sequences MLAVDRTLEFKEAVKAKEAAYPPNKRQRVKFGPHRLGPDALVDPWTQQADQVATNLRSFLGFLASIRRAYLDLGSSSAAHSNPHHQPARQLDPSKGLAAWEGVRWLTDRERDEIDFAVKVALRKSVDRVRELEALEKARIAAAKRDNPNAGLTRFLGLASSAPALSPEAEALAQHRAQVTLYLNELLAVVSQRQRDQQEARVRRQLERTQTLGGMGGGGALGMDALGREMAARAKSERAAGRGAKGSVDEREGPSVGAVPSMYRPAPIPGEGGDGGDDDDDNPLGSELTAEQVQQFEAEESALLQATQSDLEALKTAESSLLEIASLQSQLAQHLGQQSELTDKLWEEAVTVSGEVERGNKQLKQAKERSRDSRMWLLVLLFGSSFTLLFLDYYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.31
4 0.38
5 0.38
6 0.4
7 0.44
8 0.51
9 0.56
10 0.65
11 0.72
12 0.71
13 0.75
14 0.76
15 0.77
16 0.79
17 0.8
18 0.81
19 0.83
20 0.82
21 0.81
22 0.74
23 0.66
24 0.56
25 0.49
26 0.4
27 0.3
28 0.27
29 0.21
30 0.18
31 0.19
32 0.2
33 0.15
34 0.14
35 0.16
36 0.16
37 0.16
38 0.18
39 0.21
40 0.21
41 0.22
42 0.21
43 0.19
44 0.17
45 0.16
46 0.14
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.16
51 0.17
52 0.17
53 0.17
54 0.18
55 0.16
56 0.16
57 0.18
58 0.13
59 0.12
60 0.13
61 0.14
62 0.13
63 0.13
64 0.15
65 0.13
66 0.13
67 0.14
68 0.2
69 0.25
70 0.33
71 0.35
72 0.33
73 0.4
74 0.46
75 0.53
76 0.53
77 0.5
78 0.44
79 0.46
80 0.47
81 0.42
82 0.34
83 0.26
84 0.19
85 0.18
86 0.17
87 0.12
88 0.12
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.13
93 0.15
94 0.2
95 0.21
96 0.23
97 0.26
98 0.26
99 0.27
100 0.26
101 0.23
102 0.18
103 0.16
104 0.15
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.16
109 0.16
110 0.17
111 0.23
112 0.27
113 0.3
114 0.32
115 0.33
116 0.34
117 0.36
118 0.36
119 0.33
120 0.31
121 0.29
122 0.26
123 0.24
124 0.19
125 0.16
126 0.17
127 0.15
128 0.18
129 0.22
130 0.3
131 0.33
132 0.37
133 0.37
134 0.36
135 0.38
136 0.35
137 0.29
138 0.23
139 0.2
140 0.17
141 0.16
142 0.15
143 0.11
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.09
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.12
166 0.12
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.06
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.14
181 0.15
182 0.19
183 0.21
184 0.28
185 0.35
186 0.41
187 0.44
188 0.46
189 0.47
190 0.46
191 0.5
192 0.47
193 0.45
194 0.42
195 0.4
196 0.35
197 0.34
198 0.31
199 0.24
200 0.19
201 0.11
202 0.07
203 0.05
204 0.03
205 0.03
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.01
210 0.02
211 0.01
212 0.02
213 0.02
214 0.02
215 0.02
216 0.03
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.09
221 0.11
222 0.12
223 0.16
224 0.17
225 0.17
226 0.21
227 0.21
228 0.23
229 0.24
230 0.23
231 0.2
232 0.19
233 0.19
234 0.15
235 0.17
236 0.16
237 0.15
238 0.16
239 0.16
240 0.15
241 0.13
242 0.14
243 0.11
244 0.09
245 0.08
246 0.07
247 0.08
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.1
252 0.12
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.11
257 0.15
258 0.14
259 0.14
260 0.11
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.09
307 0.08
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.06
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.16
322 0.17
323 0.16
324 0.16
325 0.16
326 0.18
327 0.18
328 0.17
329 0.13
330 0.13
331 0.13
332 0.15
333 0.14
334 0.11
335 0.11
336 0.12
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.11
344 0.12
345 0.15
346 0.2
347 0.22
348 0.3
349 0.37
350 0.45
351 0.52
352 0.6
353 0.66
354 0.72
355 0.79
356 0.79
357 0.8
358 0.77
359 0.74
360 0.73
361 0.65
362 0.57
363 0.5
364 0.42
365 0.36
366 0.31
367 0.25
368 0.15
369 0.13
370 0.12
371 0.1
372 0.1
373 0.07
374 0.07
375 0.06