FuNGI

G4TIC8

Protein Details

Accession

G4TIC8

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
94-114	IAQVCQKVNRRIKIKRARFSA	Hydrophilic
250-271	MATVKKVVKKNTKKWKPYPLTT	Hydrophilic
340-360	QGEFSKPRKGKKNDKAHPPIH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
345-354	KPRKGKKNDK

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto 6.5, cyto_mito 5, cysk 3, mito 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000380 Topo_IA IPR003601 Topo_IA_2 IPR013497 Topo_IA_cen IPR013824 Topo_IA_cen_sub1 IPR013825 Topo_IA_cen_sub2 IPR013826 Topo_IA_cen_sub3 IPR023405 Topo_IA_core_domain IPR003602 Topo_IA_DNA-bd_dom IPR006171 TOPRIM_domain IPR034144 TOPRIM_TopoIII
Gene Ontology	GO:0003677 F:DNA binding GO:0003917 F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity GO:0006265 P:DNA topological change
Pfam	View protein in Pfam PF01131 Topoisom_bac PF01751 Toprim
PROSITE	View protein in PROSITE PS50880 TOPRIM
CDD	cd00186 TOP1Ac cd03362 TOPRIM_TopoIA_TopoIII

Amino Acid Sequences

MGRTSNYCFDYPQTNASFTVTYVAGHITELDFPETHRKWNSCDPFTLFDAPVEVKHPQRVNELVRNIEIRARGSDMLMIWTDCDREGEYIGYEIAQVCQKVNRRIKIKRARFSAIIADQIHRAAQNPTNLDLAQADAVIARQMLDLRLGAAFTRMQCMALQNRFGNLLEGKLVSYGPCQFPTLGFVVSRYEQVKAFVPETFWYIYLALNRPGEQNGRGREDQTVFKWKRGHLFDFDVALMLYEMVLERPMATVKKVVKKNTKKWKPYPLTTVDLQKSGSRLLRMSAKQILDTADALYQRGILSYPRTETDQYDDQFDFGQYIQKQTSSPEWGAFATRLRQGEFSKPRKGKKNDKAHPPIHPTAYAGNLAGNEKKVYEYVTRRFLASCSKDAEGFQTTITVAVNGEEFSASGLLVLERNYLEVFPYDKWSSHELPPFEEGEEFMPTICELREGETTRPSLLTEADLVSLMDKNGIGTDATIAQHINTIVEREYVMERLEGNTKYLVPSTLGVGLVHGYNQIGLEKSLSKPQLRRETERSMVQVCDRIKTKDDMLQESIEQYKEVFILARREFNLIINKDQASLKVHKALKTVADEVEGMVEDEVEDQPAHPHLPTRMMIRGTDRHQLQAPDVE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.32
3	0.33
4	0.3
5	0.24
6	0.25
7	0.17
8	0.14
9	0.13
10	0.14
11	0.11
12	0.11
13	0.12
14	0.09
15	0.11
16	0.12
17	0.14
18	0.13
19	0.15
20	0.25
21	0.26
22	0.32
23	0.37
24	0.38
25	0.42
26	0.53
27	0.6
28	0.54
29	0.58
30	0.56
31	0.53
32	0.55
33	0.53
34	0.43
35	0.34
36	0.33
37	0.28
38	0.24
39	0.23
40	0.23
41	0.22
42	0.29
43	0.32
44	0.32
45	0.37
46	0.43
47	0.48
48	0.52
49	0.53
50	0.49
51	0.48
52	0.47
53	0.42
54	0.39
55	0.33
56	0.27
57	0.25
58	0.25
59	0.22
60	0.21
61	0.22
62	0.19
63	0.19
64	0.18
65	0.16
66	0.13
67	0.14
68	0.14
69	0.12
70	0.13
71	0.11
72	0.11
73	0.13
74	0.12
75	0.12
76	0.12
77	0.12
78	0.11
79	0.1
80	0.09
81	0.1
82	0.11
83	0.11
84	0.12
85	0.18
86	0.25
87	0.34
88	0.43
89	0.49
90	0.56
91	0.64
92	0.74
93	0.79
94	0.82
95	0.81
96	0.8
97	0.77
98	0.7
99	0.65
100	0.62
101	0.53
102	0.49
103	0.41
104	0.35
105	0.31
106	0.29
107	0.27
108	0.18
109	0.18
110	0.16
111	0.19
112	0.23
113	0.24
114	0.25
115	0.27
116	0.26
117	0.25
118	0.21
119	0.18
120	0.12
121	0.1
122	0.08
123	0.06
124	0.06
125	0.06
126	0.06
127	0.05
128	0.05
129	0.06
130	0.06
131	0.07
132	0.07
133	0.08
134	0.08
135	0.08
136	0.07
137	0.08
138	0.1
139	0.09
140	0.12
141	0.11
142	0.12
143	0.13
144	0.17
145	0.23
146	0.24
147	0.29
148	0.26
149	0.27
150	0.28
151	0.27
152	0.26
153	0.19
154	0.16
155	0.13
156	0.12
157	0.11
158	0.11
159	0.11
160	0.08
161	0.1
162	0.13
163	0.14
164	0.15
165	0.16
166	0.15
167	0.15
168	0.18
169	0.17
170	0.15
171	0.13
172	0.12
173	0.14
174	0.14
175	0.18
176	0.15
177	0.15
178	0.15
179	0.16
180	0.2
181	0.19
182	0.2
183	0.17
184	0.18
185	0.17
186	0.19
187	0.18
188	0.14
189	0.13
190	0.12
191	0.13
192	0.15
193	0.16
194	0.18
195	0.18
196	0.18
197	0.19
198	0.2
199	0.21
200	0.21
201	0.25
202	0.25
203	0.3
204	0.3
205	0.3
206	0.32
207	0.32
208	0.32
209	0.3
210	0.37
211	0.32
212	0.36
213	0.39
214	0.37
215	0.43
216	0.44
217	0.44
218	0.37
219	0.41
220	0.38
221	0.35
222	0.33
223	0.25
224	0.2
225	0.16
226	0.11
227	0.06
228	0.05
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.06
237	0.07
238	0.07
239	0.12
240	0.18
241	0.27
242	0.32
243	0.4
244	0.49
245	0.58
246	0.68
247	0.74
248	0.78
249	0.79
250	0.82
251	0.85
252	0.82
253	0.77
254	0.75
255	0.68
256	0.62
257	0.55
258	0.54
259	0.44
260	0.38
261	0.33
262	0.27
263	0.22
264	0.21
265	0.21
266	0.14
267	0.14
268	0.15
269	0.21
270	0.21
271	0.23
272	0.25
273	0.24
274	0.23
275	0.24
276	0.23
277	0.17
278	0.16
279	0.13
280	0.1
281	0.1
282	0.1
283	0.09
284	0.08
285	0.07
286	0.07
287	0.06
288	0.06
289	0.08
290	0.09
291	0.1
292	0.11
293	0.13
294	0.14
295	0.14
296	0.18
297	0.21
298	0.2
299	0.23
300	0.22
301	0.2
302	0.19
303	0.18
304	0.14
305	0.09
306	0.13
307	0.1
308	0.12
309	0.12
310	0.13
311	0.13
312	0.14
313	0.17
314	0.16
315	0.16
316	0.14
317	0.15
318	0.15
319	0.15
320	0.14
321	0.13
322	0.11
323	0.14
324	0.14
325	0.14
326	0.17
327	0.18
328	0.27
329	0.35
330	0.38
331	0.45
332	0.5
333	0.56
334	0.63
335	0.7
336	0.71
337	0.72
338	0.77
339	0.76
340	0.81
341	0.83
342	0.77
343	0.76
344	0.72
345	0.65
346	0.56
347	0.48
348	0.38
349	0.3
350	0.28
351	0.21
352	0.14
353	0.11
354	0.1
355	0.11
356	0.11
357	0.1
358	0.09
359	0.08
360	0.09
361	0.09
362	0.1
363	0.15
364	0.21
365	0.25
366	0.31
367	0.32
368	0.32
369	0.32
370	0.31
371	0.33
372	0.3
373	0.28
374	0.25
375	0.25
376	0.25
377	0.25
378	0.27
379	0.2
380	0.17
381	0.14
382	0.12
383	0.11
384	0.11
385	0.11
386	0.08
387	0.05
388	0.05
389	0.06
390	0.05
391	0.05
392	0.04
393	0.04
394	0.05
395	0.05
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.05
401	0.05
402	0.06
403	0.06
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.07
408	0.07
409	0.09
410	0.09
411	0.15
412	0.15
413	0.16
414	0.19
415	0.24
416	0.26
417	0.3
418	0.34
419	0.3
420	0.31
421	0.32
422	0.3
423	0.26
424	0.22
425	0.17
426	0.14
427	0.14
428	0.12
429	0.09
430	0.09
431	0.08
432	0.09
433	0.08
434	0.08
435	0.06
436	0.09
437	0.15
438	0.17
439	0.2
440	0.23
441	0.24
442	0.23
443	0.23
444	0.21
445	0.16
446	0.14
447	0.13
448	0.11
449	0.1
450	0.1
451	0.1
452	0.09
453	0.09
454	0.09
455	0.08
456	0.07
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.07
461	0.06
462	0.05
463	0.07
464	0.08
465	0.09
466	0.09
467	0.09
468	0.08
469	0.1
470	0.1
471	0.1
472	0.08
473	0.09
474	0.09
475	0.1
476	0.1
477	0.1
478	0.12
479	0.12
480	0.12
481	0.11
482	0.11
483	0.13
484	0.18
485	0.17
486	0.17
487	0.17
488	0.17
489	0.18
490	0.18
491	0.17
492	0.13
493	0.13
494	0.13
495	0.13
496	0.13
497	0.12
498	0.11
499	0.11
500	0.1
501	0.09
502	0.08
503	0.06
504	0.06
505	0.07
506	0.08
507	0.08
508	0.08
509	0.1
510	0.12
511	0.14
512	0.21
513	0.25
514	0.3
515	0.34
516	0.44
517	0.53
518	0.57
519	0.63
520	0.63
521	0.66
522	0.66
523	0.66
524	0.6
525	0.52
526	0.48
527	0.43
528	0.42
529	0.35
530	0.36
531	0.34
532	0.33
533	0.34
534	0.35
535	0.36
536	0.35
537	0.39
538	0.38
539	0.38
540	0.37
541	0.34
542	0.33
543	0.32
544	0.27
545	0.22
546	0.17
547	0.15
548	0.13
549	0.13
550	0.13
551	0.13
552	0.22
553	0.24
554	0.29
555	0.29
556	0.32
557	0.32
558	0.35
559	0.4
560	0.35
561	0.36
562	0.35
563	0.35
564	0.35
565	0.35
566	0.33
567	0.29
568	0.31
569	0.32
570	0.36
571	0.4
572	0.4
573	0.42
574	0.43
575	0.43
576	0.43
577	0.42
578	0.34
579	0.31
580	0.28
581	0.26
582	0.23
583	0.18
584	0.13
585	0.1
586	0.08
587	0.07
588	0.08
589	0.08
590	0.08
591	0.08
592	0.08
593	0.11
594	0.13
595	0.14
596	0.13
597	0.17
598	0.18
599	0.24
600	0.27
601	0.29
602	0.34
603	0.34
604	0.37
605	0.39
606	0.44
607	0.43
608	0.49
609	0.46
610	0.44
611	0.47
612	0.47

G4TIC8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer