Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FLA6

Protein Details
Accession A0A5C5FLA6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-257AGGGGGGHKKKKKRKHDDASGGGGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
138-147GEGKKRKRAK
233-267AGGGGGGHKKKKKRKHDDASGGGGGGGADHKKQRR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Amino Acid Sequences MDPAAPSHHPPPPPPVAPPRPPQEPAWARHLVQLDNPHPSPLSGTDDLISRFRLAPLYDTFLRPYLPPAVTAPSHPPPSLDPAPAPASPSPAPPHHLGLKITLGGVKFGGLGGSGTSAGGDSAEGASGAGGGAGAAGGEGKKRKRAKMDKTYEHMVGDVLGRISLPRSSHPPNPSTSLLHLVSNPDPAPCPPLHPLDAQQLRDALTLRAGQLAGFDMGVWEARSGVGGAGGGAGGGGGGHKKKKKRKHDDASGGGGGGGADHKKQRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.52
3 0.56
4 0.6
5 0.66
6 0.65
7 0.63
8 0.64
9 0.6
10 0.6
11 0.58
12 0.54
13 0.53
14 0.51
15 0.45
16 0.47
17 0.47
18 0.37
19 0.35
20 0.4
21 0.36
22 0.39
23 0.39
24 0.35
25 0.32
26 0.31
27 0.28
28 0.22
29 0.26
30 0.2
31 0.21
32 0.2
33 0.22
34 0.24
35 0.23
36 0.21
37 0.16
38 0.15
39 0.15
40 0.17
41 0.15
42 0.18
43 0.19
44 0.24
45 0.24
46 0.25
47 0.26
48 0.24
49 0.24
50 0.2
51 0.21
52 0.2
53 0.19
54 0.19
55 0.18
56 0.21
57 0.21
58 0.22
59 0.26
60 0.25
61 0.28
62 0.26
63 0.26
64 0.24
65 0.31
66 0.32
67 0.27
68 0.22
69 0.23
70 0.26
71 0.25
72 0.26
73 0.19
74 0.21
75 0.2
76 0.23
77 0.23
78 0.21
79 0.24
80 0.23
81 0.26
82 0.25
83 0.27
84 0.25
85 0.23
86 0.23
87 0.19
88 0.18
89 0.16
90 0.12
91 0.1
92 0.09
93 0.07
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.03
100 0.04
101 0.04
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.02
116 0.02
117 0.02
118 0.02
119 0.02
120 0.01
121 0.01
122 0.01
123 0.02
124 0.02
125 0.04
126 0.07
127 0.09
128 0.17
129 0.21
130 0.25
131 0.36
132 0.46
133 0.55
134 0.63
135 0.72
136 0.71
137 0.72
138 0.72
139 0.62
140 0.52
141 0.42
142 0.31
143 0.21
144 0.15
145 0.1
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.15
155 0.2
156 0.27
157 0.31
158 0.33
159 0.33
160 0.37
161 0.38
162 0.34
163 0.31
164 0.3
165 0.27
166 0.25
167 0.23
168 0.21
169 0.2
170 0.21
171 0.19
172 0.14
173 0.14
174 0.14
175 0.17
176 0.14
177 0.17
178 0.17
179 0.21
180 0.22
181 0.23
182 0.26
183 0.32
184 0.37
185 0.34
186 0.32
187 0.29
188 0.28
189 0.28
190 0.26
191 0.16
192 0.14
193 0.14
194 0.13
195 0.14
196 0.12
197 0.11
198 0.1
199 0.11
200 0.09
201 0.08
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.02
222 0.02
223 0.03
224 0.06
225 0.11
226 0.19
227 0.26
228 0.36
229 0.46
230 0.57
231 0.68
232 0.76
233 0.84
234 0.87
235 0.92
236 0.93
237 0.89
238 0.86
239 0.75
240 0.64
241 0.52
242 0.41
243 0.3
244 0.19
245 0.15
246 0.1
247 0.12