FuNGI

A0A5C5FQ79

Protein Details

Accession

A0A5C5FQ79

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
401-428	SEGGGAKKSSKRRKKRGAARRVKRSSSD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
290-314	KKNKASDSKGKGKARAGSSSSKRRK
330-358	GRRKGSSSKKKASSSKRSANGKARRKRAK
385-392	SKRKKRKG
404-424	GGAKKSSKRRKKRGAARRVKR

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 8.833, mito 8.5, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MPPRASTSGPGAAVASAKKLTPLELKLLNHGLAAPKGEISQHDLLASCGLSANQNVMEAINSLLRKSLLQMLRTDTGSILFRFLGKEEAKAMGSMDADEKLVLDQIKEAGDLGIWSRTLTTKTGLPSGTVTKALKALESRKQVKTVKSVKNPTRKIYMLAGIQPSVELTGGPWFTDNELDTELVEMLKRVVQKFLSDRSIPRSITISDPSSSNPIKFRPIFPVSATPHLPTVTDVLRNISELDVISVQLKAEHVEALLDLMIYDGQVEKILVNRDAANFGAPAAGDSSSKKNKASDSKGKGKARAGSSSSKRRKASSDSSDCDSESDTAGRRKGSSSKKKASSSKRSANGKARRKRAKLASDDDGASSTSESESEDFDSDEEAPSKRKKRKGAASDDDDDSEGGGAKKSSKRRKKRGAARRVKRSSSDPDADTSSESDDGGKAGGKKGSASRGGDEDDDDEDAAAEGAAQTGTQYVYRLVRSYAPTIGWTDMPCGKCPVEDFCSEPPRQRAVAYRRPPGIAANPTNPNAVRPSLATSAGAPKLRVELEGGIEGVGMLGGAGAAIGVSEAKWGEMKGAVGAGIAPVNPRDCPYFAAWVNF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.19
3	0.15
4	0.14
5	0.17
6	0.17
7	0.21
8	0.25
9	0.27
10	0.31
11	0.36
12	0.37
13	0.4
14	0.42
15	0.38
16	0.32
17	0.31
18	0.27
19	0.23
20	0.24
21	0.19
22	0.16
23	0.16
24	0.17
25	0.17
26	0.21
27	0.22
28	0.21
29	0.21
30	0.2
31	0.2
32	0.2
33	0.19
34	0.12
35	0.09
36	0.09
37	0.1
38	0.1
39	0.12
40	0.11
41	0.11
42	0.11
43	0.11
44	0.11
45	0.1
46	0.11
47	0.13
48	0.12
49	0.12
50	0.14
51	0.14
52	0.14
53	0.16
54	0.23
55	0.24
56	0.26
57	0.29
58	0.33
59	0.36
60	0.36
61	0.34
62	0.25
63	0.23
64	0.24
65	0.21
66	0.17
67	0.15
68	0.15
69	0.15
70	0.16
71	0.2
72	0.18
73	0.19
74	0.2
75	0.22
76	0.21
77	0.21
78	0.2
79	0.15
80	0.14
81	0.14
82	0.13
83	0.11
84	0.11
85	0.1
86	0.1
87	0.08
88	0.11
89	0.1
90	0.09
91	0.09
92	0.11
93	0.11
94	0.11
95	0.11
96	0.08
97	0.08
98	0.08
99	0.08
100	0.08
101	0.08
102	0.08
103	0.09
104	0.11
105	0.12
106	0.13
107	0.14
108	0.16
109	0.18
110	0.23
111	0.22
112	0.21
113	0.22
114	0.24
115	0.24
116	0.25
117	0.23
118	0.2
119	0.23
120	0.22
121	0.21
122	0.23
123	0.27
124	0.3
125	0.39
126	0.44
127	0.45
128	0.52
129	0.55
130	0.55
131	0.59
132	0.62
133	0.62
134	0.65
135	0.73
136	0.74
137	0.79
138	0.8
139	0.74
140	0.71
141	0.62
142	0.56
143	0.49
144	0.45
145	0.37
146	0.36
147	0.33
148	0.26
149	0.25
150	0.21
151	0.17
152	0.13
153	0.1
154	0.06
155	0.05
156	0.08
157	0.09
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.1
162	0.12
163	0.12
164	0.09
165	0.1
166	0.1
167	0.1
168	0.1
169	0.1
170	0.08
171	0.08
172	0.06
173	0.06
174	0.08
175	0.11
176	0.11
177	0.13
178	0.14
179	0.18
180	0.22
181	0.26
182	0.29
183	0.29
184	0.3
185	0.34
186	0.38
187	0.35
188	0.32
189	0.29
190	0.25
191	0.27
192	0.28
193	0.24
194	0.19
195	0.2
196	0.2
197	0.23
198	0.23
199	0.21
200	0.2
201	0.2
202	0.26
203	0.28
204	0.28
205	0.3
206	0.33
207	0.32
208	0.32
209	0.38
210	0.34
211	0.36
212	0.35
213	0.28
214	0.26
215	0.25
216	0.23
217	0.15
218	0.15
219	0.13
220	0.13
221	0.12
222	0.13
223	0.13
224	0.13
225	0.13
226	0.1
227	0.09
228	0.07
229	0.08
230	0.06
231	0.07
232	0.07
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.04
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.04
255	0.04
256	0.06
257	0.08
258	0.09
259	0.1
260	0.1
261	0.11
262	0.12
263	0.12
264	0.1
265	0.08
266	0.07
267	0.06
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.07
274	0.13
275	0.17
276	0.18
277	0.19
278	0.2
279	0.25
280	0.33
281	0.4
282	0.44
283	0.48
284	0.56
285	0.64
286	0.65
287	0.63
288	0.58
289	0.56
290	0.48
291	0.45
292	0.38
293	0.37
294	0.42
295	0.49
296	0.53
297	0.55
298	0.53
299	0.51
300	0.52
301	0.51
302	0.53
303	0.52
304	0.53
305	0.48
306	0.5
307	0.48
308	0.44
309	0.38
310	0.3
311	0.2
312	0.13
313	0.12
314	0.11
315	0.13
316	0.15
317	0.15
318	0.15
319	0.16
320	0.24
321	0.34
322	0.42
323	0.48
324	0.56
325	0.62
326	0.68
327	0.75
328	0.77
329	0.77
330	0.76
331	0.75
332	0.74
333	0.73
334	0.74
335	0.75
336	0.75
337	0.74
338	0.73
339	0.75
340	0.76
341	0.74
342	0.75
343	0.74
344	0.73
345	0.7
346	0.67
347	0.61
348	0.54
349	0.51
350	0.42
351	0.34
352	0.26
353	0.18
354	0.13
355	0.08
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.07
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.1
369	0.09
370	0.13
371	0.21
372	0.29
373	0.36
374	0.43
375	0.51
376	0.59
377	0.68
378	0.74
379	0.77
380	0.77
381	0.76
382	0.73
383	0.65
384	0.56
385	0.46
386	0.36
387	0.26
388	0.17
389	0.11
390	0.08
391	0.07
392	0.07
393	0.11
394	0.18
395	0.27
396	0.38
397	0.48
398	0.58
399	0.69
400	0.8
401	0.86
402	0.9
403	0.92
404	0.92
405	0.93
406	0.92
407	0.92
408	0.89
409	0.83
410	0.76
411	0.71
412	0.67
413	0.64
414	0.59
415	0.49
416	0.43
417	0.41
418	0.38
419	0.33
420	0.26
421	0.19
422	0.15
423	0.13
424	0.11
425	0.09
426	0.09
427	0.08
428	0.1
429	0.09
430	0.12
431	0.13
432	0.13
433	0.15
434	0.19
435	0.24
436	0.27
437	0.27
438	0.27
439	0.28
440	0.29
441	0.28
442	0.25
443	0.21
444	0.17
445	0.15
446	0.13
447	0.1
448	0.09
449	0.08
450	0.07
451	0.05
452	0.04
453	0.03
454	0.04
455	0.04
456	0.03
457	0.03
458	0.04
459	0.05
460	0.06
461	0.06
462	0.09
463	0.12
464	0.14
465	0.15
466	0.16
467	0.2
468	0.23
469	0.25
470	0.25
471	0.23
472	0.23
473	0.24
474	0.24
475	0.21
476	0.18
477	0.19
478	0.22
479	0.23
480	0.23
481	0.25
482	0.24
483	0.23
484	0.25
485	0.27
486	0.25
487	0.26
488	0.28
489	0.32
490	0.39
491	0.39
492	0.43
493	0.42
494	0.43
495	0.42
496	0.4
497	0.43
498	0.45
499	0.54
500	0.56
501	0.59
502	0.57
503	0.57
504	0.56
505	0.51
506	0.49
507	0.47
508	0.45
509	0.44
510	0.46
511	0.46
512	0.49
513	0.44
514	0.39
515	0.33
516	0.29
517	0.24
518	0.2
519	0.25
520	0.23
521	0.24
522	0.22
523	0.21
524	0.26
525	0.3
526	0.3
527	0.25
528	0.23
529	0.26
530	0.26
531	0.25
532	0.2
533	0.17
534	0.18
535	0.19
536	0.18
537	0.14
538	0.13
539	0.12
540	0.09
541	0.07
542	0.04
543	0.02
544	0.02
545	0.02
546	0.02
547	0.02
548	0.02
549	0.02
550	0.02
551	0.02
552	0.02
553	0.03
554	0.04
555	0.05
556	0.06
557	0.07
558	0.08
559	0.09
560	0.11
561	0.12
562	0.11
563	0.12
564	0.11
565	0.1
566	0.1
567	0.09
568	0.08
569	0.08
570	0.09
571	0.11
572	0.13
573	0.14
574	0.16
575	0.19
576	0.2
577	0.24
578	0.26
579	0.31

A0A5C5FQ79

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer