Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C5FM93

Protein Details
Accession A0A5C5FM93    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MARSKTSKKGSKKEPSPEPEEYHydrophilic
99-121DSPKKAKVDPSPKRKARKRASATBasic
129-149EEEQKPKKRGRKSPNGAKKVVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-118AKALKDGDSPKKAKVDPSPKRKARKRA
133-147KPKKRGRKSPNGAKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR008251  Chromo_shadow_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF01393  Chromo_shadow  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MARSKTSKKGSKKEPSPEPEEYTIGRILSHRRKQGGALLEYQIEWAGYEEDKPTWEPEDNVGEGPIVEKYWKKCKTPLDRYTPGSKAYRAAAKALKDGDSPKKAKVDPSPKRKARKRASATSDDEEAAEEEQKPKKRGRKSPNGAKKVVEEVEEQQEEQEQEQEQEQEQEQEQEQEQEPEAEEKQDDDPGVRDDVDGYEHDDERPVCTDWEEKYGDKASWENEVKTIETMVQDDEDTKLRVCVVWNDDSQTWLDADEVRGRCPQKLLDFFISHLKWRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.85
3 0.82
4 0.78
5 0.74
6 0.66
7 0.59
8 0.5
9 0.43
10 0.38
11 0.3
12 0.25
13 0.22
14 0.28
15 0.36
16 0.42
17 0.47
18 0.48
19 0.5
20 0.51
21 0.55
22 0.53
23 0.46
24 0.42
25 0.36
26 0.33
27 0.32
28 0.3
29 0.23
30 0.14
31 0.11
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.09
36 0.1
37 0.1
38 0.12
39 0.13
40 0.14
41 0.16
42 0.17
43 0.17
44 0.19
45 0.23
46 0.23
47 0.22
48 0.2
49 0.17
50 0.15
51 0.14
52 0.11
53 0.07
54 0.08
55 0.12
56 0.17
57 0.27
58 0.33
59 0.35
60 0.41
61 0.51
62 0.6
63 0.67
64 0.71
65 0.7
66 0.71
67 0.72
68 0.73
69 0.65
70 0.58
71 0.5
72 0.42
73 0.35
74 0.32
75 0.32
76 0.27
77 0.29
78 0.28
79 0.27
80 0.29
81 0.28
82 0.26
83 0.22
84 0.27
85 0.3
86 0.33
87 0.34
88 0.33
89 0.37
90 0.37
91 0.4
92 0.45
93 0.48
94 0.5
95 0.59
96 0.67
97 0.69
98 0.78
99 0.81
100 0.83
101 0.81
102 0.82
103 0.8
104 0.79
105 0.79
106 0.76
107 0.73
108 0.64
109 0.56
110 0.45
111 0.37
112 0.28
113 0.21
114 0.14
115 0.1
116 0.08
117 0.1
118 0.15
119 0.2
120 0.22
121 0.28
122 0.35
123 0.43
124 0.53
125 0.59
126 0.65
127 0.71
128 0.79
129 0.83
130 0.82
131 0.74
132 0.65
133 0.57
134 0.5
135 0.41
136 0.31
137 0.23
138 0.19
139 0.22
140 0.21
141 0.19
142 0.15
143 0.16
144 0.14
145 0.13
146 0.13
147 0.08
148 0.09
149 0.1
150 0.11
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.14
161 0.14
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.13
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.1
175 0.11
176 0.12
177 0.13
178 0.12
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.1
184 0.11
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.15
189 0.15
190 0.16
191 0.18
192 0.16
193 0.14
194 0.15
195 0.19
196 0.17
197 0.22
198 0.23
199 0.21
200 0.24
201 0.26
202 0.25
203 0.23
204 0.23
205 0.2
206 0.26
207 0.28
208 0.25
209 0.25
210 0.26
211 0.26
212 0.24
213 0.23
214 0.16
215 0.14
216 0.14
217 0.13
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.13
226 0.13
227 0.14
228 0.15
229 0.2
230 0.22
231 0.26
232 0.27
233 0.3
234 0.3
235 0.3
236 0.29
237 0.24
238 0.19
239 0.14
240 0.14
241 0.11
242 0.14
243 0.21
244 0.21
245 0.22
246 0.28
247 0.3
248 0.31
249 0.33
250 0.37
251 0.38
252 0.43
253 0.48
254 0.49
255 0.48
256 0.48
257 0.54
258 0.49