Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0JIB1

Protein Details
Accession A0A4T0JIB1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-59FEVKRKGRPPAQCTKCKDQRKDGNSSSKCHydrophilic
78-97KDGPPPRKLKKGERAPLPPQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-91PPPRKLKKGER
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001083  Cu_fist_DNA-bd_dom  
IPR036395  Cu_fist_DNA-bd_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005507  F:copper ion binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00649  Copper-fist  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50073  COPPER_FIST_2  
Amino Acid Sequences MPFINGVKLACATCIKGHRSSSCAHDDRPLFEVKRKGRPPAQCTKCKDQRKDGNSSSKCVCQDRQEPAPKSNCNGNGKDGPPPRKLKKGERAPLPPQAHYPNGLKDAYSSLLPPQAQKEGEPSMISLERLMNPCRCKVGGRCNCSEKKRAFVTDMLPSIADVIGHCSCGPSCACPGCLTHRNPPLPAQTETQAEAPTYTPEESATCGCDEINVHELLKKSECGNLEEFLQKASSLVPFPPQGISSNIDSYVDGGTLGLQSWQQLYDPRNRGITRLPPLETECCGGSCQCQALGVECRCEESCCGCCTSCNCEAEANGNPSSSASAIASTNTLTLPTQSNSLKLDIPKVDAPPSCCSKPAKSENNGQLSPTSLTAAISQPGGLKIPQQLVSPNVAANHWVSVVDAKKTECLTKQVQFPKYIPHDESDPTRTFIDFI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.33
3 0.37
4 0.43
5 0.44
6 0.45
7 0.46
8 0.47
9 0.5
10 0.49
11 0.44
12 0.46
13 0.45
14 0.45
15 0.45
16 0.46
17 0.38
18 0.41
19 0.49
20 0.48
21 0.56
22 0.58
23 0.64
24 0.65
25 0.72
26 0.73
27 0.75
28 0.77
29 0.76
30 0.79
31 0.81
32 0.83
33 0.83
34 0.83
35 0.83
36 0.84
37 0.82
38 0.84
39 0.82
40 0.83
41 0.75
42 0.72
43 0.65
44 0.6
45 0.57
46 0.53
47 0.48
48 0.45
49 0.5
50 0.52
51 0.59
52 0.63
53 0.63
54 0.65
55 0.69
56 0.63
57 0.59
58 0.59
59 0.58
60 0.55
61 0.53
62 0.52
63 0.51
64 0.49
65 0.55
66 0.55
67 0.54
68 0.55
69 0.62
70 0.61
71 0.64
72 0.7
73 0.71
74 0.74
75 0.78
76 0.78
77 0.78
78 0.81
79 0.77
80 0.79
81 0.72
82 0.63
83 0.58
84 0.54
85 0.46
86 0.42
87 0.39
88 0.34
89 0.34
90 0.32
91 0.27
92 0.23
93 0.23
94 0.2
95 0.18
96 0.14
97 0.12
98 0.16
99 0.17
100 0.17
101 0.18
102 0.21
103 0.21
104 0.21
105 0.24
106 0.22
107 0.23
108 0.21
109 0.19
110 0.17
111 0.18
112 0.17
113 0.14
114 0.13
115 0.16
116 0.19
117 0.22
118 0.24
119 0.26
120 0.27
121 0.29
122 0.28
123 0.29
124 0.32
125 0.4
126 0.43
127 0.47
128 0.51
129 0.56
130 0.63
131 0.63
132 0.64
133 0.55
134 0.53
135 0.52
136 0.49
137 0.43
138 0.4
139 0.38
140 0.36
141 0.35
142 0.28
143 0.23
144 0.2
145 0.18
146 0.15
147 0.11
148 0.05
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.11
156 0.11
157 0.08
158 0.11
159 0.12
160 0.13
161 0.14
162 0.16
163 0.21
164 0.28
165 0.3
166 0.35
167 0.42
168 0.43
169 0.43
170 0.45
171 0.44
172 0.4
173 0.39
174 0.33
175 0.27
176 0.27
177 0.27
178 0.24
179 0.19
180 0.15
181 0.13
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.11
207 0.14
208 0.15
209 0.15
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.17
214 0.16
215 0.13
216 0.12
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.14
233 0.14
234 0.13
235 0.13
236 0.12
237 0.1
238 0.08
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.1
251 0.13
252 0.22
253 0.26
254 0.27
255 0.33
256 0.33
257 0.34
258 0.35
259 0.4
260 0.37
261 0.37
262 0.36
263 0.32
264 0.35
265 0.36
266 0.32
267 0.26
268 0.19
269 0.16
270 0.16
271 0.14
272 0.12
273 0.11
274 0.11
275 0.09
276 0.1
277 0.09
278 0.12
279 0.2
280 0.19
281 0.2
282 0.2
283 0.22
284 0.22
285 0.23
286 0.21
287 0.17
288 0.2
289 0.19
290 0.21
291 0.19
292 0.21
293 0.23
294 0.28
295 0.29
296 0.27
297 0.26
298 0.25
299 0.26
300 0.27
301 0.29
302 0.26
303 0.21
304 0.2
305 0.19
306 0.18
307 0.19
308 0.15
309 0.11
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.09
321 0.11
322 0.12
323 0.17
324 0.17
325 0.19
326 0.2
327 0.22
328 0.24
329 0.23
330 0.28
331 0.24
332 0.28
333 0.28
334 0.28
335 0.32
336 0.31
337 0.33
338 0.34
339 0.39
340 0.36
341 0.37
342 0.39
343 0.39
344 0.46
345 0.52
346 0.55
347 0.54
348 0.63
349 0.67
350 0.71
351 0.66
352 0.58
353 0.48
354 0.42
355 0.38
356 0.28
357 0.21
358 0.13
359 0.13
360 0.14
361 0.15
362 0.13
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.13
367 0.14
368 0.12
369 0.14
370 0.17
371 0.22
372 0.23
373 0.23
374 0.25
375 0.26
376 0.3
377 0.28
378 0.25
379 0.21
380 0.19
381 0.2
382 0.18
383 0.16
384 0.13
385 0.12
386 0.11
387 0.15
388 0.18
389 0.2
390 0.21
391 0.21
392 0.25
393 0.27
394 0.32
395 0.29
396 0.33
397 0.37
398 0.41
399 0.5
400 0.54
401 0.57
402 0.58
403 0.56
404 0.59
405 0.6
406 0.6
407 0.53
408 0.48
409 0.46
410 0.45
411 0.5
412 0.47
413 0.42
414 0.38
415 0.37