Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0J575

Protein Details
Accession A0A4T0J575    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-75FPMTKQFNTRHKLRRKEVDDVLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 16, E.R. 6, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001529  DNA-dir_RNA_pol_M/15kDasu  
IPR009600  PIG-U  
IPR034014  Zn_ribbon_RPC11_C  
IPR001222  Znf_TFIIS  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0042765  C:GPI-anchor transamidase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0016255  P:attachment of GPI anchor to protein  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0042779  P:tRNA 3'-trailer cleavage  
Pfam View protein in Pfam  
PF06728  PIG-U  
PF02150  RNA_POL_M_15KD  
PF01096  TFIIS_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00466  ZF_TFIIS_1  
PS51133  ZF_TFIIS_2  
CDD cd10509  Zn-ribbon_RPC11  
Amino Acid Sequences MVVGMLEKATSLFKHHRKTTRMLFCPTCSNMLISAMDEETTNNKWTCSICPYQFPMTKQFNTRHKLRRKEVDDVLGGEETWKNVDQTDAECPKCSNLRAFFMQIQIRSADEPMTTFYRCTNAKCANQWVCWRCSAVVSLLRYFSAIAAGVPLGAVYALHFNRRRLEALAIGSYEKHSPLLLALLHHLDHPLFWISLDATTAYAVSKLSRPCAAVYMHNPLTLLTTVARSSVSLQNALVLCAVSLAHRGRALPALTFLSLAGALFMYPAALLPPLIMVLLRRECVLGTARLLSIFLATTTAAVSLSRYIAADWTFLSLYTSLVRVDDLTPNTGVFWYLLVEMFEQFKGFFTLVLQLHTVVVTLTNYCTPNTQHSHRPLLAYTFLAGTLAIFKSYPCIGDVGVFVTLLPLFSDLFQHARHPVFVVALTATAAGLLPLFRYLWLRVVTGNANFYYASTLLWTFSNGLVLTELLYAEARRVFVDRTAHEKIDVSKYDIRQV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.54
3 0.62
4 0.65
5 0.74
6 0.78
7 0.78
8 0.77
9 0.75
10 0.71
11 0.66
12 0.68
13 0.61
14 0.54
15 0.44
16 0.39
17 0.31
18 0.29
19 0.26
20 0.19
21 0.18
22 0.15
23 0.14
24 0.13
25 0.13
26 0.14
27 0.16
28 0.2
29 0.18
30 0.18
31 0.21
32 0.22
33 0.25
34 0.29
35 0.34
36 0.33
37 0.39
38 0.44
39 0.5
40 0.53
41 0.52
42 0.54
43 0.54
44 0.56
45 0.56
46 0.6
47 0.61
48 0.62
49 0.69
50 0.7
51 0.72
52 0.78
53 0.8
54 0.82
55 0.78
56 0.8
57 0.77
58 0.73
59 0.65
60 0.57
61 0.5
62 0.39
63 0.33
64 0.26
65 0.21
66 0.14
67 0.14
68 0.13
69 0.11
70 0.11
71 0.13
72 0.12
73 0.14
74 0.23
75 0.28
76 0.28
77 0.29
78 0.29
79 0.32
80 0.35
81 0.35
82 0.33
83 0.31
84 0.35
85 0.37
86 0.41
87 0.38
88 0.41
89 0.42
90 0.35
91 0.32
92 0.28
93 0.25
94 0.22
95 0.21
96 0.15
97 0.11
98 0.11
99 0.13
100 0.15
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.19
105 0.21
106 0.24
107 0.29
108 0.34
109 0.38
110 0.41
111 0.5
112 0.49
113 0.52
114 0.58
115 0.55
116 0.49
117 0.46
118 0.44
119 0.34
120 0.31
121 0.27
122 0.23
123 0.23
124 0.23
125 0.23
126 0.22
127 0.21
128 0.2
129 0.19
130 0.14
131 0.1
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.08
144 0.09
145 0.16
146 0.19
147 0.21
148 0.25
149 0.28
150 0.29
151 0.26
152 0.27
153 0.24
154 0.23
155 0.23
156 0.2
157 0.18
158 0.16
159 0.15
160 0.14
161 0.11
162 0.09
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.1
193 0.1
194 0.12
195 0.14
196 0.15
197 0.15
198 0.18
199 0.18
200 0.17
201 0.19
202 0.25
203 0.24
204 0.23
205 0.22
206 0.19
207 0.19
208 0.16
209 0.14
210 0.07
211 0.08
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.06
216 0.1
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.12
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.07
229 0.04
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.12
237 0.12
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.04
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.11
271 0.13
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.08
279 0.07
280 0.06
281 0.05
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.08
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.09
312 0.12
313 0.13
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.13
319 0.12
320 0.08
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.14
338 0.14
339 0.15
340 0.15
341 0.14
342 0.14
343 0.13
344 0.13
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.1
351 0.11
352 0.11
353 0.14
354 0.15
355 0.22
356 0.27
357 0.31
358 0.36
359 0.41
360 0.48
361 0.48
362 0.48
363 0.42
364 0.39
365 0.36
366 0.28
367 0.23
368 0.16
369 0.14
370 0.12
371 0.1
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.1
379 0.11
380 0.12
381 0.09
382 0.1
383 0.1
384 0.11
385 0.12
386 0.1
387 0.1
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.07
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.08
398 0.09
399 0.12
400 0.13
401 0.15
402 0.19
403 0.2
404 0.21
405 0.2
406 0.19
407 0.18
408 0.18
409 0.16
410 0.12
411 0.1
412 0.1
413 0.08
414 0.07
415 0.06
416 0.05
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.05
422 0.06
423 0.07
424 0.1
425 0.11
426 0.16
427 0.18
428 0.19
429 0.18
430 0.22
431 0.25
432 0.25
433 0.27
434 0.21
435 0.21
436 0.2
437 0.19
438 0.19
439 0.15
440 0.13
441 0.12
442 0.12
443 0.12
444 0.13
445 0.14
446 0.12
447 0.12
448 0.15
449 0.13
450 0.13
451 0.13
452 0.12
453 0.12
454 0.11
455 0.1
456 0.08
457 0.09
458 0.08
459 0.1
460 0.12
461 0.12
462 0.12
463 0.15
464 0.15
465 0.2
466 0.27
467 0.28
468 0.34
469 0.39
470 0.39
471 0.39
472 0.4
473 0.4
474 0.42
475 0.41
476 0.4
477 0.42