Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0J4E8

Protein Details
Accession A0A4T0J4E8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
393-416VRETKSGKHSKDGKKRADRDDQESBasic
434-453GEDMKVKRKAEGRRTKKKRVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
397-408KSGKHSKDGKKR
438-453KVKRKAEGRRTKKKRV
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 8.5, cyto_nucl 8, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR037379  WDR74/Nsa1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
Amino Acid Sequences MRFITGDSNGLLKSVRVHAAEGDTGDTGDTEITASLLTSDGVEAQRKITQLQYTPATRKLLAARSDGALQQYTLSGNGGALALDAEWTDSRSAERSIGVGVGSAGGTQVNMSVTSSGHLCYTSPPAHSPRFFSLPPRLTCMRTSPSGRYMAVGGVEQEPSVWDVQRVCEMSEDHPTAYAPRIPQGKTKLERRKEKLALHDGELWRARNVPNDNLNLRSPVHVTALEWLDDNTLLTGSASGSVRLYSWREQSEQGEHTGTKGKVGTKSNNSNRPLRSTDTLTASPIRCLARGAHGNVFVADSNCALMNVDTASMHLRNAYRGLGAAVGCVATTSNPLISLSGAIDGFVRVHSTVTPGTHSKAAILASAFVKSTPMAIVWDGEEQGQEVKEKEHVRETKSGKHSKDGKKRADRDDQESDSEGELDDVLRDMETVTGEDMKVKRKAEGRRTKKKRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.22
3 0.21
4 0.22
5 0.24
6 0.27
7 0.28
8 0.24
9 0.21
10 0.17
11 0.16
12 0.15
13 0.12
14 0.09
15 0.07
16 0.07
17 0.05
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.05
22 0.05
23 0.05
24 0.05
25 0.05
26 0.06
27 0.08
28 0.11
29 0.14
30 0.15
31 0.17
32 0.2
33 0.2
34 0.22
35 0.24
36 0.27
37 0.27
38 0.32
39 0.36
40 0.4
41 0.44
42 0.47
43 0.46
44 0.41
45 0.42
46 0.42
47 0.43
48 0.4
49 0.39
50 0.36
51 0.34
52 0.36
53 0.33
54 0.29
55 0.22
56 0.19
57 0.16
58 0.14
59 0.13
60 0.11
61 0.1
62 0.08
63 0.07
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.05
73 0.05
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.09
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.13
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.11
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.15
109 0.16
110 0.18
111 0.22
112 0.27
113 0.33
114 0.34
115 0.37
116 0.35
117 0.38
118 0.37
119 0.38
120 0.42
121 0.44
122 0.44
123 0.45
124 0.43
125 0.4
126 0.41
127 0.41
128 0.36
129 0.33
130 0.36
131 0.34
132 0.36
133 0.37
134 0.35
135 0.3
136 0.27
137 0.22
138 0.19
139 0.15
140 0.12
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.15
157 0.16
158 0.21
159 0.21
160 0.18
161 0.17
162 0.17
163 0.16
164 0.16
165 0.17
166 0.11
167 0.15
168 0.2
169 0.2
170 0.26
171 0.31
172 0.38
173 0.41
174 0.51
175 0.56
176 0.61
177 0.69
178 0.7
179 0.74
180 0.72
181 0.7
182 0.68
183 0.67
184 0.6
185 0.53
186 0.53
187 0.43
188 0.4
189 0.38
190 0.3
191 0.22
192 0.22
193 0.2
194 0.2
195 0.23
196 0.23
197 0.26
198 0.29
199 0.3
200 0.31
201 0.3
202 0.26
203 0.24
204 0.2
205 0.17
206 0.14
207 0.14
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.08
231 0.11
232 0.12
233 0.16
234 0.17
235 0.19
236 0.21
237 0.23
238 0.25
239 0.24
240 0.23
241 0.2
242 0.18
243 0.18
244 0.23
245 0.2
246 0.17
247 0.18
248 0.2
249 0.24
250 0.29
251 0.34
252 0.35
253 0.45
254 0.52
255 0.58
256 0.58
257 0.59
258 0.57
259 0.55
260 0.51
261 0.45
262 0.4
263 0.37
264 0.37
265 0.35
266 0.34
267 0.3
268 0.31
269 0.28
270 0.25
271 0.24
272 0.21
273 0.17
274 0.17
275 0.17
276 0.19
277 0.23
278 0.25
279 0.25
280 0.25
281 0.25
282 0.24
283 0.23
284 0.17
285 0.13
286 0.11
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.06
296 0.05
297 0.06
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.14
305 0.14
306 0.12
307 0.12
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.09
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.04
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.07
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.1
339 0.12
340 0.13
341 0.16
342 0.17
343 0.19
344 0.21
345 0.21
346 0.18
347 0.19
348 0.18
349 0.16
350 0.14
351 0.14
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.11
356 0.11
357 0.09
358 0.1
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.12
366 0.11
367 0.11
368 0.11
369 0.1
370 0.11
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.19
376 0.22
377 0.24
378 0.32
379 0.37
380 0.4
381 0.49
382 0.52
383 0.55
384 0.62
385 0.67
386 0.6
387 0.65
388 0.7
389 0.72
390 0.78
391 0.78
392 0.79
393 0.81
394 0.87
395 0.86
396 0.87
397 0.83
398 0.8
399 0.79
400 0.72
401 0.64
402 0.58
403 0.51
404 0.41
405 0.35
406 0.26
407 0.17
408 0.14
409 0.11
410 0.09
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.07
417 0.08
418 0.08
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.18
423 0.21
424 0.27
425 0.32
426 0.33
427 0.37
428 0.43
429 0.53
430 0.58
431 0.66
432 0.7
433 0.75