FuNGI

A0A4T0JH87

Protein Details

Accession

A0A4T0JH87

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
550-576	AKNSKDKDSDGPPKKKARKQSASGADE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
561-568	PPKKKARK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, mito_nucl 13, mito 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011993 PH-like_dom_sf IPR013719 RTT106/SPT16-like_middle_dom IPR000969 SSRP1/POB3 IPR035417 SSRP1/POB3_N IPR024954 SSRP1_DD IPR038167 SSRP1_sf
Gene Ontology	GO:0005694 C:chromosome GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication
Pfam	View protein in Pfam PF17292 POB3_N PF08512 Rtt106 PF03531 SSrecog
CDD	cd13230 PH1_SSRP1-like cd13231 PH2_SSRP1-like

Amino Acid Sequences

MTRNSRVTLHLQPSSKCIKSFEKIYHNLDPIPGILRLQQGGLGWKSQNNLVTISAEDISHMQWMRVARNFQLKIGFKSDRHREVFDGLVRDDFERLSKTVKEFYGVSIETREISFKGWNWGKTEYRGEDLSFQVSGRTMFDIPVHKIANSNIASKTEVSLEFIDPTASAQGEPTDSSSSSSRKADELVEMRFYIPNSEKSREIIGEKEDDNDQEEHSAAQLFHDQIKDKAEIGQVSGDGLVVFNDILVVTPRGRYEIDMYPTFIRLRGKTYDYKILYSSIRRLFVLPKTDEMHVLLVVALDPPIRQGQTKYPYITMQFPTNEELDATINMEESEISEKYGDRLQKHYDAPAYEVVAQVFRGLSGKDITTPKTFKSYNNQPAIKCNVKANQGDLYVMEKSLLFMTKQPIYIPFNDIQSAQFSRVGGAISSSRTFDLRVVQRSGTENVFSGINREEHEPLEEYLSSRKIKTKNSLNENMIGAPLQAAVDSDSDMDDGDKSARKQPTATAGGGEDEESEEDEDFQASSSDEGSPSESDSEDEDDDGDAKMSTAKNSKDKDSDGPPKKKARKQSASGADEDDAIQVESD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.53
3	0.45
4	0.44
5	0.45
6	0.46
7	0.53
8	0.55
9	0.57
10	0.61
11	0.66
12	0.68
13	0.63
14	0.58
15	0.51
16	0.43
17	0.35
18	0.3
19	0.24
20	0.17
21	0.17
22	0.19
23	0.18
24	0.17
25	0.18
26	0.16
27	0.21
28	0.22
29	0.23
30	0.22
31	0.23
32	0.25
33	0.27
34	0.29
35	0.25
36	0.25
37	0.22
38	0.22
39	0.2
40	0.21
41	0.18
42	0.14
43	0.14
44	0.13
45	0.12
46	0.15
47	0.15
48	0.12
49	0.15
50	0.18
51	0.22
52	0.27
53	0.29
54	0.29
55	0.39
56	0.4
57	0.4
58	0.46
59	0.45
60	0.43
61	0.48
62	0.49
63	0.42
64	0.51
65	0.57
66	0.57
67	0.58
68	0.56
69	0.51
70	0.49
71	0.51
72	0.46
73	0.4
74	0.32
75	0.3
76	0.28
77	0.26
78	0.24
79	0.18
80	0.16
81	0.15
82	0.16
83	0.18
84	0.2
85	0.23
86	0.28
87	0.27
88	0.28
89	0.26
90	0.26
91	0.29
92	0.26
93	0.24
94	0.2
95	0.2
96	0.18
97	0.18
98	0.18
99	0.12
100	0.13
101	0.15
102	0.15
103	0.25
104	0.29
105	0.31
106	0.33
107	0.38
108	0.4
109	0.42
110	0.47
111	0.4
112	0.38
113	0.37
114	0.35
115	0.32
116	0.3
117	0.26
118	0.2
119	0.17
120	0.14
121	0.14
122	0.13
123	0.11
124	0.12
125	0.11
126	0.11
127	0.15
128	0.18
129	0.2
130	0.25
131	0.25
132	0.22
133	0.24
134	0.24
135	0.29
136	0.26
137	0.27
138	0.22
139	0.23
140	0.24
141	0.23
142	0.23
143	0.18
144	0.16
145	0.16
146	0.16
147	0.15
148	0.15
149	0.14
150	0.14
151	0.11
152	0.11
153	0.09
154	0.08
155	0.07
156	0.06
157	0.07
158	0.08
159	0.08
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.13
164	0.15
165	0.17
166	0.19
167	0.21
168	0.2
169	0.19
170	0.2
171	0.19
172	0.22
173	0.24
174	0.22
175	0.23
176	0.22
177	0.22
178	0.22
179	0.2
180	0.19
181	0.18
182	0.24
183	0.27
184	0.29
185	0.29
186	0.3
187	0.32
188	0.3
189	0.28
190	0.23
191	0.2
192	0.21
193	0.2
194	0.2
195	0.19
196	0.17
197	0.18
198	0.16
199	0.14
200	0.11
201	0.11
202	0.1
203	0.09
204	0.1
205	0.07
206	0.07
207	0.1
208	0.1
209	0.12
210	0.13
211	0.14
212	0.14
213	0.17
214	0.17
215	0.15
216	0.17
217	0.17
218	0.15
219	0.15
220	0.14
221	0.11
222	0.1
223	0.1
224	0.07
225	0.05
226	0.05
227	0.04
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.04
235	0.05
236	0.06
237	0.07
238	0.07
239	0.09
240	0.09
241	0.1
242	0.13
243	0.17
244	0.21
245	0.2
246	0.22
247	0.21
248	0.22
249	0.22
250	0.2
251	0.18
252	0.15
253	0.18
254	0.19
255	0.23
256	0.26
257	0.29
258	0.35
259	0.34
260	0.34
261	0.31
262	0.3
263	0.28
264	0.25
265	0.28
266	0.23
267	0.23
268	0.22
269	0.22
270	0.24
271	0.25
272	0.29
273	0.24
274	0.24
275	0.25
276	0.25
277	0.24
278	0.21
279	0.18
280	0.11
281	0.1
282	0.07
283	0.05
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.03
288	0.03
289	0.04
290	0.05
291	0.06
292	0.07
293	0.08
294	0.16
295	0.21
296	0.24
297	0.25
298	0.25
299	0.26
300	0.28
301	0.3
302	0.24
303	0.22
304	0.2
305	0.2
306	0.2
307	0.19
308	0.17
309	0.13
310	0.12
311	0.09
312	0.09
313	0.08
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.05
319	0.05
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.08
324	0.08
325	0.09
326	0.13
327	0.16
328	0.15
329	0.19
330	0.23
331	0.28
332	0.29
333	0.3
334	0.29
335	0.26
336	0.26
337	0.24
338	0.21
339	0.16
340	0.16
341	0.13
342	0.11
343	0.1
344	0.08
345	0.07
346	0.06
347	0.06
348	0.05
349	0.06
350	0.07
351	0.08
352	0.12
353	0.14
354	0.17
355	0.21
356	0.23
357	0.23
358	0.28
359	0.29
360	0.28
361	0.36
362	0.43
363	0.47
364	0.55
365	0.58
366	0.52
367	0.56
368	0.6
369	0.54
370	0.45
371	0.41
372	0.37
373	0.39
374	0.39
375	0.36
376	0.33
377	0.29
378	0.28
379	0.24
380	0.21
381	0.16
382	0.14
383	0.12
384	0.08
385	0.09
386	0.1
387	0.1
388	0.08
389	0.1
390	0.15
391	0.17
392	0.17
393	0.17
394	0.21
395	0.23
396	0.24
397	0.26
398	0.24
399	0.23
400	0.23
401	0.23
402	0.19
403	0.2
404	0.2
405	0.17
406	0.17
407	0.15
408	0.15
409	0.15
410	0.15
411	0.1
412	0.11
413	0.1
414	0.11
415	0.12
416	0.12
417	0.12
418	0.12
419	0.13
420	0.13
421	0.2
422	0.24
423	0.28
424	0.3
425	0.29
426	0.32
427	0.34
428	0.36
429	0.29
430	0.24
431	0.19
432	0.17
433	0.18
434	0.15
435	0.14
436	0.14
437	0.14
438	0.14
439	0.17
440	0.18
441	0.17
442	0.2
443	0.2
444	0.18
445	0.19
446	0.18
447	0.16
448	0.19
449	0.23
450	0.23
451	0.23
452	0.29
453	0.32
454	0.39
455	0.48
456	0.54
457	0.58
458	0.66
459	0.72
460	0.68
461	0.66
462	0.6
463	0.51
464	0.41
465	0.31
466	0.22
467	0.13
468	0.11
469	0.07
470	0.05
471	0.05
472	0.06
473	0.06
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.06
481	0.07
482	0.1
483	0.14
484	0.16
485	0.24
486	0.28
487	0.29
488	0.3
489	0.33
490	0.39
491	0.4
492	0.38
493	0.32
494	0.29
495	0.28
496	0.27
497	0.23
498	0.14
499	0.11
500	0.1
501	0.1
502	0.1
503	0.09
504	0.09
505	0.09
506	0.09
507	0.08
508	0.08
509	0.08
510	0.07
511	0.07
512	0.08
513	0.09
514	0.09
515	0.09
516	0.12
517	0.12
518	0.13
519	0.14
520	0.13
521	0.13
522	0.15
523	0.17
524	0.15
525	0.15
526	0.14
527	0.13
528	0.14
529	0.13
530	0.11
531	0.08
532	0.08
533	0.12
534	0.12
535	0.17
536	0.23
537	0.29
538	0.37
539	0.42
540	0.48
541	0.5
542	0.53
543	0.55
544	0.58
545	0.63
546	0.65
547	0.7
548	0.72
549	0.77
550	0.83
551	0.84
552	0.84
553	0.85
554	0.84
555	0.82
556	0.85
557	0.84
558	0.78
559	0.74
560	0.66
561	0.55
562	0.46
563	0.39
564	0.29
565	0.19

A0A4T0JH87

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer