Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0IKC9

Protein Details
Accession A0A4T0IKC9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
619-646VLSNPQQPPPKPKRGRRSRGRKGTVTGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
627-641PPKPKRGRRSRGRKG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040351  RAB3IL/RAB3IP/Sec2  
IPR009449  Sec2_N  
Gene Ontology GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF06428  Sec2p  
CDD cd21044  Rab11BD_RAB3IP_like  
Amino Acid Sequences METSSSIPSLIDNGPDYADDNEDYDDNEDHGDHLGEDSEVAHDSEAIQGSPAANDIHVIPSPDDIPAAQPHSSRSTSLLNQDIDKTAARAASNPHALVIAFLRAQIDELTSQLNSLNAKLVHTFDKSDNLQQELDEARTLHHHHQLRITALEKETAAVKTSLDNGTLVERENVMHELTHMVDSIVTETQKATLARQDKAAIEQDLDDLSANLFAEANRMVGVERLLKAQEADRRRVAEERLVEAEEAVRVTQRQMSEWVERGESSNGALQPPAASDSNLKPTLTPVPTLTHTHIPYLEFISYLHTLASAASVRQRASESQTPSQLLPLDLSHAFLRRLLEEDVEPTLRLDLSRAFGLLTRGKVLTAVTEGTLELEPARGAEFAPGTECALSGRVLIPVRDGEGGHKGSASQSSFFSWSGSGRGSSRPASTGAGGNADAGTGESAIHVFRLSASPTATRYPVDAGWAVPRLRAACELWRYVRALQASVVTMQPPFCPPAGCQTREAFDASIGRMGLKSGRKGGDGLSGDTNPSPTIPPPATGRSFWGAFQYARSTPSVSAPPSASPSPLHADKTELPDETKKGVRETQDIAGRVDDHIDEGSRSDHTHTQQDDTHHPHLVLSNPQQPPPKPKRGRRSRGRKGTVTGAPPSIPSQRDKEDEEGSENKNQENIARQNSDDKSDKNVDSNTTLTQNTLDLQLSDTAEKEIETETETWEMARWRQIVELKQNMFWARVNGDPNTSM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.18
4 0.15
5 0.17
6 0.14
7 0.14
8 0.15
9 0.15
10 0.15
11 0.16
12 0.15
13 0.14
14 0.14
15 0.13
16 0.12
17 0.13
18 0.12
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.09
23 0.09
24 0.08
25 0.08
26 0.09
27 0.09
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.12
32 0.12
33 0.11
34 0.1
35 0.11
36 0.11
37 0.12
38 0.13
39 0.1
40 0.08
41 0.09
42 0.1
43 0.12
44 0.13
45 0.15
46 0.13
47 0.15
48 0.16
49 0.15
50 0.15
51 0.12
52 0.14
53 0.16
54 0.19
55 0.2
56 0.2
57 0.23
58 0.29
59 0.3
60 0.28
61 0.27
62 0.3
63 0.32
64 0.37
65 0.39
66 0.35
67 0.36
68 0.37
69 0.35
70 0.3
71 0.27
72 0.22
73 0.18
74 0.19
75 0.17
76 0.17
77 0.21
78 0.26
79 0.29
80 0.28
81 0.27
82 0.25
83 0.24
84 0.23
85 0.19
86 0.15
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.11
92 0.1
93 0.11
94 0.09
95 0.09
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.12
101 0.11
102 0.11
103 0.15
104 0.14
105 0.15
106 0.17
107 0.19
108 0.21
109 0.22
110 0.25
111 0.21
112 0.28
113 0.29
114 0.34
115 0.34
116 0.33
117 0.31
118 0.28
119 0.29
120 0.24
121 0.23
122 0.18
123 0.16
124 0.14
125 0.18
126 0.22
127 0.23
128 0.29
129 0.33
130 0.34
131 0.4
132 0.42
133 0.41
134 0.4
135 0.38
136 0.33
137 0.29
138 0.28
139 0.23
140 0.2
141 0.2
142 0.17
143 0.17
144 0.13
145 0.13
146 0.12
147 0.16
148 0.17
149 0.14
150 0.14
151 0.13
152 0.15
153 0.15
154 0.15
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.13
159 0.13
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.18
180 0.22
181 0.23
182 0.26
183 0.27
184 0.24
185 0.27
186 0.29
187 0.23
188 0.19
189 0.19
190 0.17
191 0.15
192 0.14
193 0.11
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.05
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.13
215 0.16
216 0.22
217 0.24
218 0.28
219 0.3
220 0.32
221 0.33
222 0.36
223 0.34
224 0.32
225 0.3
226 0.28
227 0.27
228 0.25
229 0.23
230 0.2
231 0.18
232 0.13
233 0.11
234 0.08
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.14
242 0.18
243 0.21
244 0.24
245 0.24
246 0.22
247 0.21
248 0.22
249 0.2
250 0.16
251 0.13
252 0.14
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.11
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.08
261 0.08
262 0.11
263 0.14
264 0.2
265 0.21
266 0.21
267 0.18
268 0.2
269 0.26
270 0.24
271 0.23
272 0.18
273 0.19
274 0.22
275 0.25
276 0.25
277 0.25
278 0.24
279 0.24
280 0.24
281 0.21
282 0.2
283 0.19
284 0.16
285 0.1
286 0.1
287 0.12
288 0.12
289 0.11
290 0.1
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.06
296 0.06
297 0.08
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.13
302 0.13
303 0.19
304 0.24
305 0.27
306 0.28
307 0.3
308 0.3
309 0.29
310 0.29
311 0.24
312 0.18
313 0.14
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.11
318 0.1
319 0.11
320 0.11
321 0.12
322 0.12
323 0.1
324 0.13
325 0.12
326 0.12
327 0.11
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.11
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.11
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.11
349 0.12
350 0.11
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.07
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.08
381 0.09
382 0.09
383 0.1
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.08
389 0.13
390 0.13
391 0.12
392 0.12
393 0.11
394 0.11
395 0.14
396 0.14
397 0.1
398 0.1
399 0.11
400 0.13
401 0.13
402 0.13
403 0.11
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.12
410 0.14
411 0.15
412 0.15
413 0.15
414 0.16
415 0.16
416 0.16
417 0.15
418 0.13
419 0.12
420 0.12
421 0.1
422 0.09
423 0.08
424 0.06
425 0.05
426 0.04
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.06
437 0.07
438 0.08
439 0.09
440 0.1
441 0.12
442 0.14
443 0.15
444 0.14
445 0.13
446 0.14
447 0.13
448 0.14
449 0.12
450 0.11
451 0.13
452 0.17
453 0.16
454 0.14
455 0.15
456 0.14
457 0.14
458 0.16
459 0.15
460 0.17
461 0.2
462 0.23
463 0.23
464 0.25
465 0.26
466 0.24
467 0.26
468 0.21
469 0.19
470 0.16
471 0.16
472 0.14
473 0.13
474 0.13
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.11
481 0.11
482 0.11
483 0.11
484 0.21
485 0.27
486 0.28
487 0.3
488 0.3
489 0.31
490 0.31
491 0.32
492 0.22
493 0.17
494 0.17
495 0.15
496 0.15
497 0.13
498 0.12
499 0.1
500 0.1
501 0.14
502 0.16
503 0.18
504 0.21
505 0.23
506 0.23
507 0.24
508 0.24
509 0.27
510 0.24
511 0.24
512 0.22
513 0.21
514 0.21
515 0.2
516 0.2
517 0.12
518 0.12
519 0.11
520 0.09
521 0.15
522 0.14
523 0.17
524 0.2
525 0.25
526 0.27
527 0.26
528 0.29
529 0.27
530 0.27
531 0.25
532 0.24
533 0.22
534 0.19
535 0.21
536 0.22
537 0.19
538 0.2
539 0.21
540 0.2
541 0.18
542 0.21
543 0.24
544 0.21
545 0.22
546 0.21
547 0.22
548 0.25
549 0.24
550 0.22
551 0.18
552 0.2
553 0.24
554 0.25
555 0.26
556 0.22
557 0.26
558 0.28
559 0.34
560 0.33
561 0.28
562 0.29
563 0.31
564 0.33
565 0.32
566 0.33
567 0.29
568 0.3
569 0.33
570 0.34
571 0.34
572 0.36
573 0.38
574 0.39
575 0.39
576 0.36
577 0.32
578 0.29
579 0.25
580 0.22
581 0.16
582 0.11
583 0.11
584 0.1
585 0.09
586 0.1
587 0.11
588 0.1
589 0.11
590 0.14
591 0.18
592 0.21
593 0.28
594 0.29
595 0.32
596 0.34
597 0.38
598 0.42
599 0.44
600 0.44
601 0.38
602 0.37
603 0.34
604 0.33
605 0.32
606 0.31
607 0.3
608 0.36
609 0.36
610 0.41
611 0.47
612 0.48
613 0.55
614 0.57
615 0.63
616 0.64
617 0.72
618 0.79
619 0.84
620 0.91
621 0.91
622 0.93
623 0.93
624 0.94
625 0.92
626 0.87
627 0.81
628 0.78
629 0.74
630 0.67
631 0.6
632 0.51
633 0.43
634 0.38
635 0.37
636 0.34
637 0.3
638 0.29
639 0.31
640 0.35
641 0.38
642 0.41
643 0.43
644 0.42
645 0.41
646 0.43
647 0.42
648 0.4
649 0.42
650 0.39
651 0.34
652 0.31
653 0.3
654 0.27
655 0.31
656 0.35
657 0.36
658 0.37
659 0.38
660 0.44
661 0.46
662 0.49
663 0.45
664 0.4
665 0.4
666 0.45
667 0.45
668 0.42
669 0.42
670 0.4
671 0.38
672 0.39
673 0.34
674 0.31
675 0.29
676 0.25
677 0.23
678 0.2
679 0.18
680 0.18
681 0.16
682 0.13
683 0.14
684 0.17
685 0.17
686 0.17
687 0.17
688 0.15
689 0.15
690 0.14
691 0.13
692 0.11
693 0.11
694 0.13
695 0.13
696 0.14
697 0.15
698 0.15
699 0.15
700 0.16
701 0.19
702 0.2
703 0.26
704 0.25
705 0.24
706 0.3
707 0.36
708 0.41
709 0.47
710 0.53
711 0.49
712 0.5
713 0.54
714 0.5
715 0.46
716 0.4
717 0.35
718 0.29
719 0.31
720 0.33
721 0.3