Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0J0E1

Protein Details
Accession A0A4T0J0E1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-33LSPPPPSISPPRKRQKGSATNKFMSHydrophilic
35-56STKPPSKSKYRIPKYVKDNCKFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001719  AP_endonuc_2  
IPR018246  AP_endonuc_F2_Zn_BS  
IPR036237  Xyl_isomerase-like_sf  
IPR013022  Xyl_isomerase-like_TIM-brl  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01261  AP_endonuc_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00729  AP_NUCLEASE_F2_1  
PS51432  AP_NUCLEASE_F2_4  
Amino Acid Sequences MGNNSDSSLSPPPPSISPPRKRQKGSATNKFMSDSTKPPSKSKYRIPKYVKDNCKFVQRLDTSHKIGSHCSAAGGVDKAVINAAINGSNAFALFLSNQRQWKSKPLSQDDIDHFNNTLIEHNYDRSLILPHGNYLINLGNPNDDTRQKSLQCFIDELHKCEQLRLPFLNFHPGSTVGLSTVEECCKKIGESISLALNESRNVTILIENMAGQGSTVGKSFDELRMIIDSVKDKSRDTISAHIKHTATHSKASMKLLAFAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.37
3 0.43
4 0.5
5 0.59
6 0.68
7 0.75
8 0.78
9 0.81
10 0.82
11 0.82
12 0.83
13 0.84
14 0.82
15 0.75
16 0.72
17 0.65
18 0.55
19 0.49
20 0.42
21 0.36
22 0.34
23 0.39
24 0.4
25 0.43
26 0.51
27 0.55
28 0.58
29 0.63
30 0.68
31 0.69
32 0.76
33 0.79
34 0.79
35 0.8
36 0.83
37 0.83
38 0.77
39 0.76
40 0.68
41 0.71
42 0.63
43 0.55
44 0.54
45 0.46
46 0.47
47 0.47
48 0.51
49 0.44
50 0.45
51 0.46
52 0.37
53 0.37
54 0.34
55 0.28
56 0.21
57 0.18
58 0.15
59 0.13
60 0.13
61 0.12
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.04
79 0.04
80 0.05
81 0.07
82 0.11
83 0.15
84 0.18
85 0.2
86 0.24
87 0.25
88 0.34
89 0.39
90 0.38
91 0.43
92 0.46
93 0.5
94 0.48
95 0.52
96 0.46
97 0.44
98 0.42
99 0.34
100 0.28
101 0.22
102 0.21
103 0.16
104 0.15
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.12
110 0.11
111 0.11
112 0.09
113 0.1
114 0.08
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.12
131 0.15
132 0.18
133 0.23
134 0.24
135 0.25
136 0.28
137 0.29
138 0.28
139 0.26
140 0.23
141 0.28
142 0.27
143 0.29
144 0.28
145 0.28
146 0.27
147 0.28
148 0.31
149 0.24
150 0.27
151 0.25
152 0.24
153 0.24
154 0.25
155 0.33
156 0.29
157 0.26
158 0.23
159 0.22
160 0.22
161 0.18
162 0.18
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.09
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.15
175 0.16
176 0.17
177 0.18
178 0.19
179 0.21
180 0.21
181 0.21
182 0.19
183 0.17
184 0.14
185 0.14
186 0.12
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.09
206 0.11
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.15
211 0.17
212 0.17
213 0.17
214 0.17
215 0.18
216 0.19
217 0.25
218 0.24
219 0.23
220 0.27
221 0.31
222 0.32
223 0.34
224 0.4
225 0.44
226 0.49
227 0.51
228 0.53
229 0.49
230 0.46
231 0.49
232 0.49
233 0.42
234 0.41
235 0.42
236 0.42
237 0.46
238 0.48
239 0.47
240 0.38