Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0INN3

Protein Details
Accession A0A4T0INN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
232-258HPMPKNKGKGGKNRRRGKNDNENDKREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-249PKNKGKGGKNRRRGK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 7.5, nucl 7, cyto 6, mito 5, plas 5, pero 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR015847  ExoRNase_PH_dom2  
IPR036345  ExoRNase_PH_dom2_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
IPR006196  RNA-binding_domain_S1_IF1  
IPR001253  TIF_eIF-1A  
IPR018104  TIF_eIF-1A_CS  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01176  eIF-1a  
PF01138  RNase_PH  
PF03725  RNase_PH_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01262  IF1A  
PS50832  S1_IF1_TYPE  
CDD cd05793  S1_IF1A  
Amino Acid Sequences MFKPGNIRLDSRRLDEMRKITYSKQSNTRVDASVQFGFGEVQVLASVTGPLEVSIRDEIVDKSTIEVEFRSLNGVVGVQYTSLANQVEESLKSVIIGEQHPRSLIRFVVQTLSSPMTPTYLVKQAIGAPPFRIPVSEKAAAINGAIMAALEGSIPMSGIVIAVSLAVINNTIILDPTSYEEANATSVHLIAYKYSTSTRAITLMDSVGEFGDDVFEDFILYQMSSILLHNTHPMPKNKGKGGKNRRRGKNDNENDKRELIFKEEGQEYAQVSRMLGNGRLEASCFDGNKRLGHIRGKMRKKVWIGNGDIVLLSLREFEDEKADIIHKYSPDEARALKQYGELPNEARINENEAFGDDDLEGEIEFGEQQDEQGDEDSEESEVDINDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.56
3 0.56
4 0.53
5 0.54
6 0.52
7 0.49
8 0.55
9 0.58
10 0.57
11 0.61
12 0.64
13 0.65
14 0.67
15 0.66
16 0.58
17 0.53
18 0.49
19 0.45
20 0.37
21 0.31
22 0.25
23 0.21
24 0.2
25 0.16
26 0.14
27 0.08
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.05
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.1
44 0.12
45 0.12
46 0.14
47 0.16
48 0.13
49 0.14
50 0.16
51 0.16
52 0.15
53 0.14
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.14
58 0.12
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.08
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.13
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.12
83 0.14
84 0.17
85 0.18
86 0.19
87 0.2
88 0.2
89 0.21
90 0.2
91 0.18
92 0.15
93 0.15
94 0.15
95 0.18
96 0.17
97 0.16
98 0.18
99 0.19
100 0.16
101 0.15
102 0.15
103 0.12
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.17
108 0.17
109 0.17
110 0.18
111 0.2
112 0.24
113 0.25
114 0.22
115 0.18
116 0.19
117 0.2
118 0.19
119 0.16
120 0.14
121 0.18
122 0.23
123 0.24
124 0.23
125 0.23
126 0.24
127 0.22
128 0.19
129 0.14
130 0.07
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.02
143 0.03
144 0.02
145 0.03
146 0.03
147 0.02
148 0.02
149 0.02
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.03
155 0.02
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.04
162 0.04
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.09
217 0.1
218 0.15
219 0.2
220 0.24
221 0.31
222 0.36
223 0.41
224 0.45
225 0.52
226 0.54
227 0.6
228 0.68
229 0.7
230 0.75
231 0.8
232 0.83
233 0.84
234 0.84
235 0.83
236 0.83
237 0.83
238 0.84
239 0.82
240 0.77
241 0.71
242 0.65
243 0.56
244 0.48
245 0.39
246 0.33
247 0.27
248 0.23
249 0.25
250 0.24
251 0.23
252 0.21
253 0.22
254 0.18
255 0.16
256 0.17
257 0.13
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.15
263 0.15
264 0.14
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.13
269 0.16
270 0.16
271 0.15
272 0.16
273 0.21
274 0.23
275 0.23
276 0.27
277 0.27
278 0.29
279 0.35
280 0.42
281 0.46
282 0.54
283 0.62
284 0.66
285 0.65
286 0.68
287 0.68
288 0.68
289 0.66
290 0.64
291 0.6
292 0.56
293 0.53
294 0.46
295 0.39
296 0.31
297 0.23
298 0.15
299 0.1
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.08
304 0.09
305 0.12
306 0.13
307 0.13
308 0.14
309 0.16
310 0.15
311 0.16
312 0.19
313 0.16
314 0.19
315 0.24
316 0.24
317 0.25
318 0.28
319 0.29
320 0.31
321 0.35
322 0.34
323 0.29
324 0.3
325 0.33
326 0.35
327 0.37
328 0.34
329 0.3
330 0.35
331 0.37
332 0.34
333 0.31
334 0.26
335 0.29
336 0.27
337 0.27
338 0.21
339 0.19
340 0.21
341 0.18
342 0.18
343 0.12
344 0.11
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.06
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.11
360 0.12
361 0.11
362 0.12
363 0.12
364 0.11
365 0.1
366 0.1
367 0.09