Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0HHH8

Protein Details
Accession A0A4T0HHH8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-184SGNYRRVLTKKEKKMKKKGQLPVAGPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
168-177KKEKKMKKKG
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.833, cyto 10, mito_nucl 7.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
CDD cd12374  RRM_UHM_SPF45_PUF60  
Amino Acid Sequences MSLYGGIFFEEEEKKEEKKEPSPEPQPQEPAAPQPAPKPQNWTASLKFAPVARRSKAATKPSLPPVPSAFASASAIPSSSAASSSSSTPKKGDEGAGVERGGLDSHNTQTTGNVNESTLQARAEADTSADTAQITQNTSLKPPPMTISDEELDDAAHMSGNYRRVLTKKEKKMKKKGQLPVAGPNWNDEYDPYKPTDYMEYKRFAEFLKEERMARRAEELSRQHNDYSSSEYSESDDEEGGEERGGRGDKDKFKMFAPPEVYDSDAHAPTAIDKEETGDEVFQRRLAMSSANAQQARMQGENVGGVEGVSEVESKQEVQQQAKQQDEQPDKAQIQPPQPPQPPPPSQTPEDRLKASQAAAASIAAKFSKLVPQKASTEVQTPQLPVQSTQVAPEVSEVDDFLSTIEESTVSKEQQERGENKANFAQRFMAKQGWKEGEGLGAHKTGIKEALSLEKSESGSGEIKSTEESGLDKQAREMFGEPSKTILLRNMVKLHEVDDDLSQEVAEECNKNGIVERVVVHTPQVYMEESDAVKIFVKFSGLVGAYKNVRALNGRYFGGTQIIARYYSDDAFNRGMYDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.3
3 0.38
4 0.4
5 0.46
6 0.53
7 0.57
8 0.64
9 0.72
10 0.76
11 0.76
12 0.75
13 0.72
14 0.65
15 0.62
16 0.54
17 0.52
18 0.49
19 0.44
20 0.4
21 0.4
22 0.48
23 0.47
24 0.46
25 0.48
26 0.48
27 0.54
28 0.56
29 0.58
30 0.51
31 0.54
32 0.53
33 0.46
34 0.42
35 0.37
36 0.39
37 0.4
38 0.44
39 0.39
40 0.43
41 0.45
42 0.52
43 0.57
44 0.58
45 0.59
46 0.57
47 0.62
48 0.66
49 0.69
50 0.62
51 0.57
52 0.52
53 0.47
54 0.42
55 0.38
56 0.29
57 0.23
58 0.25
59 0.21
60 0.19
61 0.14
62 0.14
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.1
70 0.11
71 0.14
72 0.23
73 0.24
74 0.26
75 0.27
76 0.28
77 0.29
78 0.3
79 0.3
80 0.25
81 0.28
82 0.3
83 0.31
84 0.29
85 0.26
86 0.23
87 0.2
88 0.17
89 0.12
90 0.1
91 0.1
92 0.13
93 0.15
94 0.15
95 0.15
96 0.17
97 0.2
98 0.2
99 0.19
100 0.17
101 0.16
102 0.17
103 0.18
104 0.18
105 0.16
106 0.13
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.09
113 0.08
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.1
120 0.11
121 0.12
122 0.13
123 0.17
124 0.17
125 0.2
126 0.22
127 0.22
128 0.22
129 0.21
130 0.22
131 0.22
132 0.25
133 0.25
134 0.27
135 0.25
136 0.24
137 0.23
138 0.2
139 0.17
140 0.12
141 0.11
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.06
146 0.1
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.17
151 0.19
152 0.27
153 0.36
154 0.44
155 0.51
156 0.61
157 0.7
158 0.78
159 0.87
160 0.9
161 0.89
162 0.89
163 0.86
164 0.85
165 0.83
166 0.76
167 0.74
168 0.68
169 0.61
170 0.51
171 0.45
172 0.38
173 0.3
174 0.27
175 0.19
176 0.19
177 0.18
178 0.19
179 0.19
180 0.18
181 0.17
182 0.18
183 0.25
184 0.26
185 0.28
186 0.31
187 0.33
188 0.34
189 0.34
190 0.34
191 0.26
192 0.26
193 0.24
194 0.23
195 0.27
196 0.28
197 0.29
198 0.3
199 0.33
200 0.28
201 0.27
202 0.27
203 0.22
204 0.22
205 0.29
206 0.31
207 0.34
208 0.37
209 0.38
210 0.34
211 0.33
212 0.33
213 0.26
214 0.28
215 0.22
216 0.21
217 0.2
218 0.2
219 0.2
220 0.17
221 0.17
222 0.11
223 0.1
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.05
231 0.07
232 0.08
233 0.07
234 0.1
235 0.17
236 0.23
237 0.27
238 0.3
239 0.29
240 0.29
241 0.36
242 0.34
243 0.33
244 0.31
245 0.28
246 0.28
247 0.27
248 0.28
249 0.21
250 0.22
251 0.19
252 0.14
253 0.13
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.11
258 0.09
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.09
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.07
276 0.11
277 0.14
278 0.18
279 0.18
280 0.18
281 0.19
282 0.21
283 0.22
284 0.18
285 0.15
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.1
290 0.07
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.06
303 0.11
304 0.13
305 0.16
306 0.21
307 0.27
308 0.31
309 0.33
310 0.33
311 0.32
312 0.38
313 0.4
314 0.38
315 0.33
316 0.33
317 0.32
318 0.34
319 0.34
320 0.3
321 0.31
322 0.36
323 0.39
324 0.44
325 0.46
326 0.46
327 0.46
328 0.5
329 0.5
330 0.46
331 0.48
332 0.44
333 0.44
334 0.46
335 0.47
336 0.46
337 0.45
338 0.43
339 0.36
340 0.33
341 0.32
342 0.27
343 0.23
344 0.16
345 0.13
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.08
350 0.08
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.14
356 0.17
357 0.21
358 0.24
359 0.27
360 0.29
361 0.33
362 0.34
363 0.29
364 0.28
365 0.26
366 0.26
367 0.25
368 0.24
369 0.21
370 0.22
371 0.21
372 0.18
373 0.19
374 0.18
375 0.16
376 0.16
377 0.18
378 0.15
379 0.14
380 0.14
381 0.13
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.06
395 0.1
396 0.12
397 0.11
398 0.14
399 0.17
400 0.21
401 0.26
402 0.34
403 0.33
404 0.37
405 0.47
406 0.45
407 0.45
408 0.47
409 0.47
410 0.4
411 0.38
412 0.37
413 0.29
414 0.31
415 0.32
416 0.33
417 0.29
418 0.31
419 0.37
420 0.35
421 0.34
422 0.32
423 0.29
424 0.26
425 0.24
426 0.23
427 0.17
428 0.15
429 0.14
430 0.15
431 0.15
432 0.12
433 0.14
434 0.13
435 0.12
436 0.13
437 0.21
438 0.19
439 0.2
440 0.2
441 0.22
442 0.22
443 0.21
444 0.2
445 0.15
446 0.17
447 0.17
448 0.17
449 0.14
450 0.13
451 0.14
452 0.15
453 0.12
454 0.1
455 0.12
456 0.13
457 0.2
458 0.22
459 0.22
460 0.23
461 0.27
462 0.27
463 0.27
464 0.27
465 0.24
466 0.27
467 0.3
468 0.27
469 0.25
470 0.26
471 0.24
472 0.23
473 0.22
474 0.24
475 0.25
476 0.31
477 0.33
478 0.33
479 0.34
480 0.34
481 0.32
482 0.27
483 0.24
484 0.2
485 0.17
486 0.18
487 0.16
488 0.16
489 0.13
490 0.11
491 0.1
492 0.1
493 0.12
494 0.12
495 0.11
496 0.16
497 0.16
498 0.16
499 0.18
500 0.2
501 0.18
502 0.19
503 0.2
504 0.2
505 0.22
506 0.21
507 0.2
508 0.19
509 0.17
510 0.16
511 0.17
512 0.14
513 0.14
514 0.14
515 0.17
516 0.16
517 0.17
518 0.16
519 0.15
520 0.16
521 0.15
522 0.15
523 0.12
524 0.14
525 0.13
526 0.13
527 0.18
528 0.17
529 0.17
530 0.18
531 0.23
532 0.23
533 0.24
534 0.27
535 0.21
536 0.22
537 0.26
538 0.29
539 0.31
540 0.33
541 0.33
542 0.32
543 0.32
544 0.31
545 0.29
546 0.26
547 0.19
548 0.19
549 0.2
550 0.19
551 0.18
552 0.2
553 0.2
554 0.21
555 0.24
556 0.22
557 0.25
558 0.26
559 0.26