Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0GT98

Protein Details
Accession A0A4T0GT98    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
266-296PQLPPPQTRRSTRSSRKKKKVNFSKDSDSEIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-285RRSTRSSRKKKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 12.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MINKLSFKFSEPLKDVDQVYNRHPFPPPSKLSQNGVEDDLRQLGFGYRAKYVHHVALTLLDEHKTDQGVFDYLCQLRKDPYDVVIPQLTRLMGVGPKVADCVALMSLDQFDSIPVDTHVWQIAIRDYNFLESSYVKLCKGRKVTQSTPMNPSIYAAVGKMFRDLWGPYAGWAHTVLFAADLKAFKDQSPSTKDKESTAEINNIKVEDSKEKVDVVPGVVTTIISPDKQIKVPSKRLAETAKEEKSPSESAQSRESSLSPPPPLPPPQLPPPQTRRSTRSSRKKKKVNFSKDSDSEIN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.41
3 0.44
4 0.47
5 0.41
6 0.43
7 0.47
8 0.45
9 0.43
10 0.45
11 0.44
12 0.45
13 0.5
14 0.5
15 0.49
16 0.56
17 0.58
18 0.59
19 0.59
20 0.56
21 0.49
22 0.47
23 0.41
24 0.34
25 0.31
26 0.29
27 0.21
28 0.17
29 0.15
30 0.13
31 0.16
32 0.18
33 0.19
34 0.19
35 0.2
36 0.22
37 0.26
38 0.28
39 0.28
40 0.26
41 0.24
42 0.21
43 0.23
44 0.23
45 0.2
46 0.18
47 0.14
48 0.13
49 0.14
50 0.15
51 0.13
52 0.11
53 0.1
54 0.11
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.16
59 0.17
60 0.21
61 0.21
62 0.2
63 0.21
64 0.23
65 0.26
66 0.21
67 0.22
68 0.24
69 0.24
70 0.27
71 0.27
72 0.25
73 0.22
74 0.22
75 0.2
76 0.13
77 0.13
78 0.11
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.05
95 0.06
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.12
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.12
118 0.09
119 0.11
120 0.12
121 0.13
122 0.12
123 0.16
124 0.17
125 0.22
126 0.28
127 0.33
128 0.38
129 0.45
130 0.48
131 0.53
132 0.59
133 0.56
134 0.54
135 0.51
136 0.43
137 0.35
138 0.32
139 0.23
140 0.16
141 0.13
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.12
156 0.11
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.06
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.15
173 0.15
174 0.2
175 0.27
176 0.3
177 0.32
178 0.37
179 0.37
180 0.34
181 0.37
182 0.34
183 0.31
184 0.3
185 0.35
186 0.3
187 0.31
188 0.29
189 0.26
190 0.23
191 0.2
192 0.2
193 0.17
194 0.19
195 0.19
196 0.19
197 0.2
198 0.2
199 0.2
200 0.18
201 0.15
202 0.13
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.14
213 0.16
214 0.19
215 0.25
216 0.32
217 0.39
218 0.48
219 0.54
220 0.56
221 0.55
222 0.58
223 0.58
224 0.54
225 0.53
226 0.53
227 0.5
228 0.46
229 0.45
230 0.41
231 0.4
232 0.38
233 0.31
234 0.32
235 0.31
236 0.32
237 0.38
238 0.38
239 0.36
240 0.34
241 0.34
242 0.28
243 0.3
244 0.32
245 0.29
246 0.29
247 0.3
248 0.34
249 0.38
250 0.41
251 0.41
252 0.42
253 0.48
254 0.56
255 0.57
256 0.61
257 0.65
258 0.68
259 0.7
260 0.71
261 0.68
262 0.67
263 0.73
264 0.75
265 0.78
266 0.8
267 0.84
268 0.87
269 0.92
270 0.94
271 0.94
272 0.94
273 0.94
274 0.92
275 0.89
276 0.88
277 0.81