Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0J9X4

Protein Details
Accession A0A4T0J9X4    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-32ISPEDRPERPRKLQTQTPPPGLSHydrophilic
75-119PLSLKTDVPRTRKRQKACEKEHNAEGSTFKYKKKQPKLESSADPDHydrophilic
449-477AEEAPRRSERSERRKKSKSKSMNNNLSCEHydrophilic
481-503QYENIRFKRTEKRIKRLCASDRTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
454-468RRSERSERRKKSKSK
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MSEIAAATSISPEDRPERPRKLQTQTPPPGLSAQPFCSHCRATQTPLWRRNPDDSASVLCNACGLFLKLKGMPRPLSLKTDVPRTRKRQKACEKEHNAEGSTFKYKKKQPKLESSADPDNDDNDRDGDADSDRLDTKINLDGSPNENSSLKRPDSPKRQAMPKDYDYTAPYMIKRPRKSKYDITEMAPPKSILETLGIEPIPGGQGKLDSQSISKLVGGIAPLNNSQLQNAHAQVQQNEQLGQLGQQEQYEHNEDHDPDQYDEARHLHNSSTSQHDEPQDSHRLTSHPLTIDDVSGSGSHKSLAPFVNHYSSINPASSLATQAAQVPYQSEVSEQVTSRPMLQSHTSSPIIPYQAHTHSRPMSQSLSAILNSHHKSASASNNSYEPVDQLRLLKAQVQELERAYEGALDKLDRCDKCENDHNHDDVKDTSTESSSEGIQCDDSSTHNTAEEAPRRSERSERRKKSKSKSMNNNLSCEDSEQYENIRFKRTEKRIKRLCASDRTGLRMCTWHDAHHSPPLYPPRGAPPGIMSCGCTFDQTLFEETLSRHGVGSIQPGDVTRLDVKMRDNLLGLLEWQYGYVDGDLDKDPSTGALTDLEELGLSSERDTPLRMQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.33
3 0.41
4 0.5
5 0.58
6 0.68
7 0.73
8 0.76
9 0.79
10 0.81
11 0.83
12 0.82
13 0.81
14 0.72
15 0.65
16 0.6
17 0.53
18 0.49
19 0.43
20 0.38
21 0.37
22 0.38
23 0.4
24 0.42
25 0.42
26 0.38
27 0.42
28 0.42
29 0.42
30 0.46
31 0.53
32 0.57
33 0.65
34 0.71
35 0.68
36 0.69
37 0.7
38 0.69
39 0.61
40 0.54
41 0.47
42 0.43
43 0.39
44 0.37
45 0.3
46 0.24
47 0.22
48 0.18
49 0.16
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.14
54 0.18
55 0.21
56 0.27
57 0.31
58 0.36
59 0.36
60 0.39
61 0.44
62 0.44
63 0.46
64 0.45
65 0.46
66 0.44
67 0.52
68 0.55
69 0.57
70 0.64
71 0.67
72 0.74
73 0.75
74 0.8
75 0.8
76 0.84
77 0.86
78 0.86
79 0.88
80 0.86
81 0.84
82 0.82
83 0.75
84 0.65
85 0.56
86 0.47
87 0.4
88 0.4
89 0.38
90 0.35
91 0.39
92 0.46
93 0.55
94 0.65
95 0.71
96 0.71
97 0.79
98 0.84
99 0.83
100 0.82
101 0.78
102 0.75
103 0.66
104 0.59
105 0.48
106 0.42
107 0.36
108 0.3
109 0.24
110 0.16
111 0.15
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.13
122 0.12
123 0.13
124 0.17
125 0.18
126 0.16
127 0.18
128 0.2
129 0.23
130 0.26
131 0.25
132 0.21
133 0.21
134 0.22
135 0.25
136 0.29
137 0.28
138 0.31
139 0.36
140 0.44
141 0.52
142 0.6
143 0.65
144 0.64
145 0.72
146 0.72
147 0.74
148 0.73
149 0.67
150 0.63
151 0.55
152 0.51
153 0.43
154 0.39
155 0.34
156 0.28
157 0.24
158 0.27
159 0.33
160 0.39
161 0.46
162 0.52
163 0.56
164 0.61
165 0.66
166 0.68
167 0.68
168 0.69
169 0.65
170 0.59
171 0.61
172 0.58
173 0.52
174 0.44
175 0.37
176 0.27
177 0.25
178 0.21
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.11
183 0.14
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.1
189 0.08
190 0.08
191 0.05
192 0.06
193 0.07
194 0.09
195 0.1
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.11
201 0.11
202 0.09
203 0.08
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.11
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.11
215 0.11
216 0.12
217 0.13
218 0.15
219 0.15
220 0.17
221 0.18
222 0.2
223 0.22
224 0.2
225 0.2
226 0.17
227 0.15
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.11
236 0.14
237 0.16
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.17
242 0.17
243 0.21
244 0.19
245 0.17
246 0.18
247 0.18
248 0.16
249 0.17
250 0.16
251 0.14
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.13
256 0.14
257 0.14
258 0.19
259 0.2
260 0.2
261 0.23
262 0.24
263 0.24
264 0.24
265 0.27
266 0.28
267 0.25
268 0.24
269 0.22
270 0.21
271 0.22
272 0.22
273 0.2
274 0.15
275 0.15
276 0.17
277 0.16
278 0.15
279 0.13
280 0.11
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.08
288 0.08
289 0.1
290 0.12
291 0.13
292 0.14
293 0.16
294 0.18
295 0.17
296 0.17
297 0.15
298 0.15
299 0.15
300 0.13
301 0.11
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.08
307 0.07
308 0.07
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.08
317 0.07
318 0.08
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.13
324 0.13
325 0.14
326 0.13
327 0.12
328 0.13
329 0.15
330 0.16
331 0.16
332 0.2
333 0.2
334 0.19
335 0.2
336 0.2
337 0.19
338 0.17
339 0.16
340 0.16
341 0.2
342 0.24
343 0.24
344 0.27
345 0.27
346 0.29
347 0.28
348 0.27
349 0.23
350 0.2
351 0.2
352 0.17
353 0.16
354 0.14
355 0.14
356 0.12
357 0.18
358 0.18
359 0.19
360 0.17
361 0.16
362 0.17
363 0.21
364 0.28
365 0.27
366 0.28
367 0.28
368 0.29
369 0.29
370 0.28
371 0.24
372 0.16
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.14
378 0.14
379 0.14
380 0.17
381 0.16
382 0.18
383 0.2
384 0.2
385 0.21
386 0.21
387 0.22
388 0.18
389 0.17
390 0.14
391 0.13
392 0.12
393 0.1
394 0.1
395 0.09
396 0.1
397 0.14
398 0.21
399 0.18
400 0.22
401 0.28
402 0.29
403 0.33
404 0.42
405 0.45
406 0.46
407 0.51
408 0.49
409 0.45
410 0.44
411 0.41
412 0.32
413 0.29
414 0.21
415 0.17
416 0.16
417 0.14
418 0.14
419 0.13
420 0.13
421 0.12
422 0.12
423 0.12
424 0.11
425 0.11
426 0.1
427 0.1
428 0.1
429 0.11
430 0.14
431 0.15
432 0.15
433 0.15
434 0.16
435 0.17
436 0.25
437 0.29
438 0.29
439 0.3
440 0.34
441 0.37
442 0.39
443 0.45
444 0.48
445 0.52
446 0.6
447 0.67
448 0.73
449 0.81
450 0.88
451 0.89
452 0.9
453 0.89
454 0.89
455 0.9
456 0.91
457 0.91
458 0.85
459 0.79
460 0.7
461 0.62
462 0.52
463 0.43
464 0.33
465 0.24
466 0.22
467 0.19
468 0.2
469 0.23
470 0.27
471 0.26
472 0.32
473 0.3
474 0.34
475 0.44
476 0.51
477 0.56
478 0.62
479 0.71
480 0.74
481 0.81
482 0.84
483 0.83
484 0.81
485 0.79
486 0.74
487 0.72
488 0.65
489 0.63
490 0.59
491 0.5
492 0.43
493 0.38
494 0.35
495 0.35
496 0.33
497 0.3
498 0.33
499 0.35
500 0.36
501 0.41
502 0.39
503 0.32
504 0.38
505 0.44
506 0.41
507 0.39
508 0.38
509 0.38
510 0.42
511 0.42
512 0.36
513 0.33
514 0.33
515 0.36
516 0.34
517 0.28
518 0.24
519 0.27
520 0.26
521 0.21
522 0.17
523 0.15
524 0.17
525 0.17
526 0.19
527 0.16
528 0.16
529 0.17
530 0.17
531 0.21
532 0.21
533 0.19
534 0.17
535 0.16
536 0.18
537 0.17
538 0.24
539 0.2
540 0.18
541 0.18
542 0.19
543 0.21
544 0.2
545 0.22
546 0.17
547 0.18
548 0.2
549 0.22
550 0.25
551 0.29
552 0.31
553 0.28
554 0.27
555 0.25
556 0.25
557 0.22
558 0.21
559 0.16
560 0.15
561 0.13
562 0.12
563 0.12
564 0.11
565 0.11
566 0.1
567 0.08
568 0.08
569 0.11
570 0.12
571 0.13
572 0.13
573 0.12
574 0.12
575 0.12
576 0.13
577 0.11
578 0.11
579 0.12
580 0.12
581 0.13
582 0.13
583 0.12
584 0.1
585 0.1
586 0.11
587 0.1
588 0.09
589 0.1
590 0.14
591 0.15
592 0.17