Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0IE46

Protein Details
Accession A0A4T0IE46    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
311-338PRSPWGLLSKGKRTRRPKDTHGNKYVVRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-46RKTGGR
55-63RHIGGGHKR
300-347GGRGKSKGDKDPRSPWGLLSKGKRTRRPKDTHGNKYVVRQRVRVRGRK
Subcellular Location(s) mito 21, nucl 5, cyto_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR022666  Rbsml_prot_L2_RNA-bd_dom  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR002171  Ribosomal_L2  
IPR005880  Ribosomal_L2_bac/org-type  
IPR022669  Ribosomal_L2_C  
IPR014726  Ribosomal_L2_dom3  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:0015934  C:large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00181  Ribosomal_L2  
PF03947  Ribosomal_L2_C  
Amino Acid Sequences VRISNQFKTFKPLTPSLRHVRIPLTDISNSGPFKPLTISKRKTGGRNSSGRVVSRHIGGGHKRRVRTLDFARIEGGVRRVVRLEYDPNRSAHIALLRGESGASEAHPHSSPWSYIIAPKGLKAGDTVQSFRTLSDAGIAKLTAAASQGDFSGDVLSRGGDSDKSTSTPTPTKVSSLDLGLLRMITVRPGNVLPLRLMPVGTLVHCIGLKVGGNGLLCRSAGSYGQVIALHSGPRSRYAQIRLQSGEVRLVLMECCATVGVVSNEHHHLKSLGKAGRSRWLGRRPSVRGVAMNTVDHPLGGGRGKSKGDKDPRSPWGLLSKGKRTRRPKDTHGNKYVVRQRVRVRGRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.64
3 0.65
4 0.68
5 0.65
6 0.6
7 0.57
8 0.51
9 0.47
10 0.44
11 0.4
12 0.33
13 0.32
14 0.33
15 0.34
16 0.32
17 0.3
18 0.29
19 0.23
20 0.23
21 0.26
22 0.3
23 0.32
24 0.42
25 0.45
26 0.48
27 0.57
28 0.62
29 0.65
30 0.68
31 0.7
32 0.68
33 0.72
34 0.7
35 0.69
36 0.67
37 0.62
38 0.54
39 0.48
40 0.42
41 0.35
42 0.34
43 0.27
44 0.31
45 0.37
46 0.44
47 0.49
48 0.52
49 0.52
50 0.54
51 0.57
52 0.55
53 0.55
54 0.53
55 0.54
56 0.5
57 0.49
58 0.46
59 0.41
60 0.38
61 0.32
62 0.26
63 0.2
64 0.19
65 0.18
66 0.19
67 0.18
68 0.2
69 0.2
70 0.27
71 0.29
72 0.36
73 0.38
74 0.37
75 0.4
76 0.38
77 0.35
78 0.29
79 0.26
80 0.2
81 0.18
82 0.19
83 0.17
84 0.16
85 0.15
86 0.12
87 0.1
88 0.08
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.11
93 0.11
94 0.12
95 0.13
96 0.15
97 0.15
98 0.13
99 0.15
100 0.13
101 0.16
102 0.18
103 0.2
104 0.18
105 0.18
106 0.19
107 0.17
108 0.16
109 0.15
110 0.16
111 0.17
112 0.19
113 0.2
114 0.18
115 0.21
116 0.21
117 0.19
118 0.18
119 0.12
120 0.1
121 0.13
122 0.13
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.05
147 0.06
148 0.08
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.15
154 0.17
155 0.18
156 0.2
157 0.19
158 0.2
159 0.19
160 0.2
161 0.17
162 0.15
163 0.15
164 0.12
165 0.12
166 0.1
167 0.09
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.05
174 0.07
175 0.07
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.1
180 0.11
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.1
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.06
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.11
219 0.1
220 0.14
221 0.16
222 0.17
223 0.22
224 0.26
225 0.32
226 0.35
227 0.39
228 0.37
229 0.37
230 0.37
231 0.33
232 0.3
233 0.23
234 0.19
235 0.14
236 0.13
237 0.11
238 0.09
239 0.08
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.06
246 0.07
247 0.09
248 0.1
249 0.13
250 0.17
251 0.19
252 0.19
253 0.18
254 0.19
255 0.18
256 0.22
257 0.28
258 0.28
259 0.3
260 0.33
261 0.35
262 0.42
263 0.45
264 0.46
265 0.47
266 0.52
267 0.55
268 0.59
269 0.66
270 0.63
271 0.66
272 0.66
273 0.6
274 0.54
275 0.5
276 0.49
277 0.42
278 0.37
279 0.31
280 0.27
281 0.24
282 0.21
283 0.17
284 0.11
285 0.12
286 0.13
287 0.14
288 0.14
289 0.18
290 0.22
291 0.27
292 0.32
293 0.39
294 0.47
295 0.54
296 0.6
297 0.64
298 0.68
299 0.69
300 0.65
301 0.59
302 0.57
303 0.54
304 0.54
305 0.53
306 0.56
307 0.59
308 0.68
309 0.74
310 0.76
311 0.81
312 0.85
313 0.86
314 0.85
315 0.87
316 0.89
317 0.9
318 0.88
319 0.85
320 0.77
321 0.78
322 0.76
323 0.74
324 0.69
325 0.66
326 0.65
327 0.69