Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0JCH1

Protein Details
Accession A0A4T0JCH1    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-36SDSSRPQASSRGRRGRGRGGRNRGNQKAHIHydrophilic
58-84STNSNQPDKSKQTRNSKPNRRFNGSLTHydrophilic
171-204RCPGCQTKSTKIPREYRCFCRRQRDPKPGKLAVPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-31SRGRRGRGRGGRNRGN
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR000967  Znf_NFX1  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR001841  Znf_RING  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50016  ZF_PHD_2  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
Amino Acid Sequences MDIPQNSDSSRPQASSRGRRGRGRGGRNRGNQKAHITKQTAQATQAMQTTPPTNGETSTNSNQPDKSKQTRNSKPNRRFNGSLTQFNSESQSPLPIPIVETTGEEDLRTRLERELKTGKVECLICFEVVKTYDKTHSCNTCFNVYHLKCISEWARASYNQPFKEGEAKHWRCPGCQTKSTKIPREYRCFCRRQRDPKPGKLAVPHSCGQSCSQRRLHCKHPCPLPCHPGPCMDCQTPIYCSYATRNPESGKVLAMSCANVCGKALDCGQHSCKAPCHPGPCSPCLEVEKSKCYCDKESSVKPCGTRGYLGKQSCYSKDEFYIALWECSNVCGEFYDCNVHQCQQLCHPPSRQSLICPLSPSVITHCPCGKHPLKDLPDGARKSCQESIASCGRMCGKQQRTCNHACKAQCHTGDCPPCQVDMTTICRCGASKVTRKCHEVQHEGDQVLCERVCHSLRLCGKHECLKRCCPLREFEDRRGKRKAVLDSHVAVPDEVMQMWHTCEIICGKTLSCGRHKCMEPDHKGKCGPCLNASFDELTCSCGSTTLEPPIPCGMQVHCSYPCNRPPSSCGHPRPAHTCHGDDVGCPPCPFLTTRTCQCGRSKIPNVRCSQETVRCGRVCDKVLDCGHKCKKPCHTGECRSGLEKCQSVCGRLRSICAHIDTSTCHGTSPCDESVSCQAAVTVTCKCGTQKAKVCCGASECTSHSKQDDYLECKNSCVTAERNSRLARALGINDTYKRKHDTNYTSEVLQFTHINYGFVSGIQKAFNEFLDSQDRALQLPLMNKSRTQFCLSYADAYGFDSEVFQDLLTVRRKIGSHLPSQLITAVVDESKQKNSGVVEFRKSATSSATPTPQLSRQGSGVSTAQQSDDWEEIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.53
3 0.6
4 0.65
5 0.69
6 0.76
7 0.81
8 0.82
9 0.82
10 0.82
11 0.82
12 0.82
13 0.85
14 0.87
15 0.9
16 0.88
17 0.85
18 0.8
19 0.79
20 0.79
21 0.75
22 0.75
23 0.7
24 0.66
25 0.68
26 0.7
27 0.62
28 0.53
29 0.51
30 0.43
31 0.41
32 0.39
33 0.3
34 0.24
35 0.25
36 0.25
37 0.23
38 0.24
39 0.23
40 0.2
41 0.21
42 0.23
43 0.25
44 0.3
45 0.33
46 0.36
47 0.36
48 0.39
49 0.41
50 0.44
51 0.48
52 0.49
53 0.54
54 0.59
55 0.65
56 0.72
57 0.79
58 0.85
59 0.87
60 0.89
61 0.9
62 0.91
63 0.91
64 0.88
65 0.82
66 0.76
67 0.76
68 0.71
69 0.69
70 0.62
71 0.58
72 0.5
73 0.47
74 0.46
75 0.35
76 0.31
77 0.23
78 0.24
79 0.2
80 0.21
81 0.21
82 0.18
83 0.18
84 0.17
85 0.18
86 0.14
87 0.15
88 0.16
89 0.17
90 0.16
91 0.15
92 0.15
93 0.14
94 0.17
95 0.18
96 0.17
97 0.19
98 0.28
99 0.29
100 0.36
101 0.42
102 0.41
103 0.47
104 0.48
105 0.44
106 0.42
107 0.43
108 0.36
109 0.34
110 0.34
111 0.27
112 0.24
113 0.23
114 0.21
115 0.21
116 0.25
117 0.2
118 0.22
119 0.29
120 0.3
121 0.34
122 0.39
123 0.45
124 0.45
125 0.49
126 0.49
127 0.5
128 0.48
129 0.47
130 0.5
131 0.42
132 0.46
133 0.41
134 0.39
135 0.31
136 0.36
137 0.36
138 0.31
139 0.32
140 0.28
141 0.31
142 0.31
143 0.35
144 0.38
145 0.44
146 0.38
147 0.4
148 0.37
149 0.35
150 0.43
151 0.4
152 0.4
153 0.43
154 0.46
155 0.49
156 0.56
157 0.55
158 0.47
159 0.56
160 0.57
161 0.54
162 0.57
163 0.58
164 0.59
165 0.68
166 0.76
167 0.75
168 0.74
169 0.75
170 0.77
171 0.8
172 0.79
173 0.79
174 0.79
175 0.79
176 0.78
177 0.79
178 0.8
179 0.81
180 0.85
181 0.86
182 0.86
183 0.86
184 0.88
185 0.82
186 0.76
187 0.71
188 0.69
189 0.64
190 0.6
191 0.52
192 0.46
193 0.43
194 0.4
195 0.36
196 0.39
197 0.37
198 0.39
199 0.44
200 0.47
201 0.55
202 0.6
203 0.67
204 0.67
205 0.7
206 0.7
207 0.73
208 0.73
209 0.7
210 0.73
211 0.7
212 0.65
213 0.61
214 0.55
215 0.53
216 0.49
217 0.48
218 0.46
219 0.39
220 0.35
221 0.33
222 0.34
223 0.28
224 0.27
225 0.23
226 0.18
227 0.18
228 0.21
229 0.25
230 0.27
231 0.28
232 0.31
233 0.3
234 0.33
235 0.35
236 0.31
237 0.25
238 0.23
239 0.2
240 0.18
241 0.17
242 0.14
243 0.1
244 0.13
245 0.12
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.14
254 0.19
255 0.21
256 0.25
257 0.27
258 0.27
259 0.3
260 0.32
261 0.36
262 0.37
263 0.39
264 0.38
265 0.43
266 0.46
267 0.45
268 0.44
269 0.38
270 0.36
271 0.35
272 0.36
273 0.34
274 0.33
275 0.38
276 0.36
277 0.38
278 0.39
279 0.39
280 0.39
281 0.38
282 0.4
283 0.41
284 0.48
285 0.52
286 0.53
287 0.52
288 0.49
289 0.46
290 0.43
291 0.36
292 0.3
293 0.27
294 0.29
295 0.34
296 0.34
297 0.34
298 0.35
299 0.37
300 0.36
301 0.35
302 0.3
303 0.24
304 0.24
305 0.24
306 0.2
307 0.17
308 0.2
309 0.18
310 0.16
311 0.15
312 0.14
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.12
323 0.12
324 0.14
325 0.15
326 0.15
327 0.17
328 0.19
329 0.19
330 0.21
331 0.29
332 0.3
333 0.33
334 0.36
335 0.38
336 0.4
337 0.43
338 0.37
339 0.31
340 0.36
341 0.35
342 0.32
343 0.29
344 0.26
345 0.22
346 0.22
347 0.2
348 0.16
349 0.2
350 0.19
351 0.21
352 0.22
353 0.22
354 0.23
355 0.31
356 0.32
357 0.29
358 0.34
359 0.4
360 0.41
361 0.44
362 0.45
363 0.43
364 0.46
365 0.44
366 0.4
367 0.36
368 0.34
369 0.34
370 0.33
371 0.29
372 0.22
373 0.21
374 0.25
375 0.25
376 0.26
377 0.21
378 0.2
379 0.21
380 0.2
381 0.21
382 0.26
383 0.29
384 0.34
385 0.41
386 0.44
387 0.49
388 0.55
389 0.6
390 0.54
391 0.51
392 0.46
393 0.44
394 0.46
395 0.46
396 0.41
397 0.37
398 0.35
399 0.37
400 0.4
401 0.36
402 0.33
403 0.26
404 0.25
405 0.23
406 0.2
407 0.15
408 0.14
409 0.19
410 0.18
411 0.18
412 0.18
413 0.17
414 0.17
415 0.17
416 0.2
417 0.21
418 0.28
419 0.35
420 0.43
421 0.47
422 0.51
423 0.52
424 0.53
425 0.52
426 0.49
427 0.45
428 0.44
429 0.43
430 0.39
431 0.36
432 0.3
433 0.23
434 0.19
435 0.16
436 0.09
437 0.06
438 0.1
439 0.11
440 0.12
441 0.12
442 0.18
443 0.22
444 0.27
445 0.29
446 0.29
447 0.31
448 0.37
449 0.43
450 0.44
451 0.45
452 0.46
453 0.5
454 0.54
455 0.55
456 0.5
457 0.49
458 0.47
459 0.52
460 0.52
461 0.55
462 0.59
463 0.58
464 0.61
465 0.61
466 0.56
467 0.51
468 0.51
469 0.49
470 0.44
471 0.44
472 0.43
473 0.39
474 0.4
475 0.37
476 0.3
477 0.22
478 0.16
479 0.14
480 0.1
481 0.08
482 0.07
483 0.06
484 0.06
485 0.07
486 0.07
487 0.06
488 0.05
489 0.06
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.09
494 0.08
495 0.13
496 0.16
497 0.19
498 0.25
499 0.28
500 0.3
501 0.37
502 0.38
503 0.37
504 0.43
505 0.5
506 0.5
507 0.55
508 0.56
509 0.52
510 0.54
511 0.51
512 0.49
513 0.44
514 0.38
515 0.33
516 0.33
517 0.32
518 0.31
519 0.32
520 0.26
521 0.21
522 0.21
523 0.17
524 0.16
525 0.13
526 0.12
527 0.1
528 0.1
529 0.11
530 0.11
531 0.14
532 0.15
533 0.19
534 0.18
535 0.2
536 0.21
537 0.2
538 0.17
539 0.17
540 0.14
541 0.14
542 0.16
543 0.18
544 0.18
545 0.2
546 0.23
547 0.28
548 0.33
549 0.33
550 0.33
551 0.31
552 0.32
553 0.37
554 0.42
555 0.46
556 0.45
557 0.49
558 0.52
559 0.54
560 0.58
561 0.54
562 0.53
563 0.46
564 0.43
565 0.35
566 0.35
567 0.31
568 0.25
569 0.25
570 0.23
571 0.21
572 0.2
573 0.18
574 0.15
575 0.16
576 0.17
577 0.16
578 0.2
579 0.24
580 0.28
581 0.35
582 0.37
583 0.4
584 0.43
585 0.47
586 0.46
587 0.51
588 0.56
589 0.58
590 0.64
591 0.68
592 0.68
593 0.63
594 0.58
595 0.54
596 0.52
597 0.5
598 0.47
599 0.44
600 0.47
601 0.44
602 0.45
603 0.44
604 0.43
605 0.38
606 0.37
607 0.34
608 0.35
609 0.37
610 0.43
611 0.41
612 0.45
613 0.51
614 0.51
615 0.52
616 0.52
617 0.58
618 0.6
619 0.65
620 0.65
621 0.67
622 0.71
623 0.77
624 0.76
625 0.68
626 0.61
627 0.55
628 0.5
629 0.44
630 0.39
631 0.31
632 0.33
633 0.32
634 0.32
635 0.36
636 0.36
637 0.37
638 0.35
639 0.38
640 0.33
641 0.35
642 0.35
643 0.32
644 0.29
645 0.24
646 0.24
647 0.22
648 0.23
649 0.22
650 0.19
651 0.17
652 0.15
653 0.17
654 0.19
655 0.22
656 0.18
657 0.18
658 0.18
659 0.2
660 0.26
661 0.27
662 0.24
663 0.19
664 0.18
665 0.17
666 0.18
667 0.17
668 0.13
669 0.11
670 0.12
671 0.13
672 0.13
673 0.21
674 0.25
675 0.33
676 0.39
677 0.45
678 0.53
679 0.58
680 0.58
681 0.52
682 0.51
683 0.45
684 0.38
685 0.34
686 0.29
687 0.3
688 0.31
689 0.31
690 0.29
691 0.27
692 0.27
693 0.31
694 0.35
695 0.35
696 0.41
697 0.46
698 0.44
699 0.43
700 0.42
701 0.35
702 0.3
703 0.27
704 0.23
705 0.26
706 0.35
707 0.37
708 0.42
709 0.43
710 0.43
711 0.41
712 0.38
713 0.32
714 0.26
715 0.25
716 0.22
717 0.24
718 0.26
719 0.29
720 0.33
721 0.33
722 0.34
723 0.37
724 0.37
725 0.39
726 0.46
727 0.49
728 0.51
729 0.55
730 0.53
731 0.49
732 0.48
733 0.43
734 0.34
735 0.28
736 0.21
737 0.15
738 0.21
739 0.2
740 0.19
741 0.18
742 0.2
743 0.17
744 0.18
745 0.18
746 0.12
747 0.14
748 0.14
749 0.14
750 0.14
751 0.15
752 0.15
753 0.18
754 0.17
755 0.19
756 0.25
757 0.25
758 0.24
759 0.27
760 0.27
761 0.22
762 0.22
763 0.21
764 0.17
765 0.23
766 0.29
767 0.31
768 0.32
769 0.34
770 0.37
771 0.4
772 0.41
773 0.42
774 0.36
775 0.33
776 0.39
777 0.38
778 0.37
779 0.32
780 0.29
781 0.23
782 0.23
783 0.21
784 0.14
785 0.13
786 0.1
787 0.09
788 0.09
789 0.09
790 0.08
791 0.09
792 0.09
793 0.16
794 0.21
795 0.22
796 0.21
797 0.25
798 0.26
799 0.29
800 0.38
801 0.38
802 0.4
803 0.46
804 0.48
805 0.45
806 0.45
807 0.42
808 0.33
809 0.26
810 0.2
811 0.14
812 0.11
813 0.12
814 0.16
815 0.18
816 0.21
817 0.23
818 0.22
819 0.24
820 0.26
821 0.33
822 0.37
823 0.4
824 0.43
825 0.44
826 0.45
827 0.45
828 0.44
829 0.37
830 0.34
831 0.31
832 0.3
833 0.33
834 0.36
835 0.35
836 0.37
837 0.41
838 0.4
839 0.45
840 0.43
841 0.4
842 0.37
843 0.37
844 0.35
845 0.34
846 0.31
847 0.26
848 0.25
849 0.23
850 0.22
851 0.2
852 0.22
853 0.22