Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0JNA5

Protein Details
Accession A0A4T0JNA5    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-36SLLTRPDKSTKNKRLSAKPYNTRQRPLNPHydrophilic
85-107SGLATRQKKNEKKQQSINIRGSSHydrophilic
216-244KSKDTNPKIQSKQSKPRQRKENPPAKPVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
216-240KSKDTNPKIQSKQSKPRQRKENPPA
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSSESIDSLLTRPDKSTKNKRLSAKPYNTRQRPLNPSDSGKWGNDLYIKSIGGELGARMLNPSLFNKQAGNTTDTTHTPLGSRISGLATRQKKNEKKQQSINIRGSSHQPTQIIINNLAPGTSQEDVKVALSPYGNILHTSPNPVNSSDESLAMNIFFERLVDAQSALKAFDGLHADGKVLVVNLVEKTALEDVHSLFSDRKMYADSIAPTPSPRKSKDTNPKIQSKQSKPRQRKENPPAKPVLSILERTQMQPKAKKKENTGVQSGQSGQSGQSLLDRMSVGGGLSTQGTQSNQSTQSARRKAVQSKQPGQPVHTKTLAERLGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.46
3 0.56
4 0.6
5 0.67
6 0.74
7 0.8
8 0.83
9 0.85
10 0.86
11 0.85
12 0.85
13 0.86
14 0.89
15 0.87
16 0.84
17 0.81
18 0.8
19 0.78
20 0.76
21 0.73
22 0.68
23 0.67
24 0.63
25 0.62
26 0.57
27 0.48
28 0.44
29 0.36
30 0.33
31 0.31
32 0.28
33 0.25
34 0.24
35 0.23
36 0.2
37 0.2
38 0.18
39 0.14
40 0.13
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.12
49 0.15
50 0.16
51 0.18
52 0.19
53 0.2
54 0.21
55 0.26
56 0.26
57 0.27
58 0.23
59 0.24
60 0.26
61 0.25
62 0.28
63 0.23
64 0.21
65 0.18
66 0.19
67 0.19
68 0.17
69 0.16
70 0.13
71 0.14
72 0.15
73 0.17
74 0.23
75 0.28
76 0.32
77 0.38
78 0.48
79 0.54
80 0.63
81 0.71
82 0.72
83 0.74
84 0.79
85 0.82
86 0.82
87 0.83
88 0.8
89 0.75
90 0.66
91 0.59
92 0.54
93 0.5
94 0.42
95 0.36
96 0.29
97 0.24
98 0.26
99 0.29
100 0.26
101 0.22
102 0.2
103 0.18
104 0.17
105 0.16
106 0.13
107 0.1
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.08
112 0.09
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.12
126 0.12
127 0.17
128 0.16
129 0.17
130 0.18
131 0.18
132 0.2
133 0.18
134 0.21
135 0.17
136 0.17
137 0.14
138 0.13
139 0.12
140 0.1
141 0.09
142 0.05
143 0.05
144 0.03
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.07
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.08
167 0.06
168 0.05
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.13
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.13
192 0.16
193 0.16
194 0.15
195 0.16
196 0.16
197 0.16
198 0.19
199 0.23
200 0.26
201 0.27
202 0.32
203 0.35
204 0.46
205 0.55
206 0.62
207 0.67
208 0.68
209 0.74
210 0.73
211 0.78
212 0.77
213 0.75
214 0.76
215 0.76
216 0.8
217 0.81
218 0.86
219 0.88
220 0.86
221 0.88
222 0.88
223 0.88
224 0.84
225 0.8
226 0.76
227 0.66
228 0.59
229 0.49
230 0.43
231 0.36
232 0.31
233 0.26
234 0.27
235 0.26
236 0.27
237 0.32
238 0.33
239 0.37
240 0.43
241 0.51
242 0.54
243 0.62
244 0.67
245 0.68
246 0.72
247 0.74
248 0.73
249 0.71
250 0.65
251 0.58
252 0.54
253 0.48
254 0.4
255 0.31
256 0.25
257 0.18
258 0.16
259 0.15
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.14
265 0.13
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.09
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.09
277 0.1
278 0.13
279 0.15
280 0.2
281 0.21
282 0.24
283 0.28
284 0.34
285 0.43
286 0.47
287 0.48
288 0.5
289 0.56
290 0.62
291 0.68
292 0.69
293 0.69
294 0.71
295 0.76
296 0.77
297 0.72
298 0.68
299 0.68
300 0.65
301 0.61
302 0.56
303 0.5
304 0.43
305 0.5